MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_014002	TA	3	6	743864	743869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_014002	AAT	2	6	743870	743875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_014002	AT	3	6	743882	743887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_014002	AAT	2	6	743889	743894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_014002	CCAAT	2	10	743928	743937	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14506	NC_014002	TACTTA	2	12	743941	743952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14507	NC_014002	GTTT	2	8	744018	744025	0 %	75 %	25 %	0 %	294495397
14508	NC_014002	CATG	2	8	744078	744085	25 %	25 %	25 %	25 %	294495397
14509	NC_014002	ATC	2	6	744086	744091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495397
14510	NC_014002	GGA	2	6	744190	744195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495397
14511	NC_014002	TGA	2	6	744201	744206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495397
14512	NC_014002	GGAT	2	8	744233	744240	25 %	25 %	50 %	0 %	294495397
14513	NC_014002	AAT	2	6	744282	744287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495397
14514	NC_014002	TGT	2	6	744318	744323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495397
14515	NC_014002	GAA	2	6	744358	744363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495397
14516	NC_014002	GGT	2	6	744477	744482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495397
14517	NC_014002	GACA	2	8	744488	744495	50 %	0 %	25 %	25 %	294495397
14518	NC_014002	GAT	2	6	744496	744501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495397
14519	NC_014002	TGA	2	6	744546	744551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495397
14520	NC_014002	CAAA	2	8	744579	744586	75 %	0 %	0 %	25 %	294495397
14521	NC_014002	TTG	2	6	744659	744664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495397
14522	NC_014002	A	6	6	744745	744750	100 %	0 %	0 %	0 %	294495397
14523	NC_014002	AATTT	2	10	744804	744813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_014002	T	7	7	744811	744817	0 %	100 %	0 %	0 %	294495398
14525	NC_014002	T	6	6	744877	744882	0 %	100 %	0 %	0 %	294495398
14526	NC_014002	CTG	2	6	744903	744908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495398
14527	NC_014002	GCAA	2	8	745132	745139	50 %	0 %	25 %	25 %	294495398
14528	NC_014002	T	6	6	745165	745170	0 %	100 %	0 %	0 %	294495398
14529	NC_014002	ACA	2	6	745237	745242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495398
14530	NC_014002	TTCCAC	2	12	745251	745262	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	294495398
14531	NC_014002	CA	3	6	745278	745283	50 %	0 %	0 %	50 %	294495398
14532	NC_014002	TCC	2	6	745399	745404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495398
14533	NC_014002	TCA	2	6	745457	745462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495398
14534	NC_014002	TAA	2	6	745475	745480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495398
14535	NC_014002	ATT	2	6	745485	745490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495398
14536	NC_014002	ACTC	2	8	745494	745501	25 %	25 %	0 %	50 %	294495398
14537	NC_014002	ATA	2	6	745539	745544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495398
14538	NC_014002	AC	3	6	745566	745571	50 %	0 %	0 %	50 %	294495398
14539	NC_014002	TAT	2	6	745572	745577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495398
14540	NC_014002	CTT	2	6	745592	745597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495398
14541	NC_014002	GTT	2	6	745627	745632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495398
14542	NC_014002	CAA	2	6	745664	745669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495398
14543	NC_014002	T	7	7	745700	745706	0 %	100 %	0 %	0 %	294495398
14544	NC_014002	CTG	2	6	745722	745727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495398
14545	NC_014002	ACC	2	6	745750	745755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495398
14546	NC_014002	TTC	2	6	745764	745769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495398
14547	NC_014002	TCC	2	6	745776	745781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495398
14548	NC_014002	TTC	2	6	745791	745796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495398
14549	NC_014002	AAG	2	6	745797	745802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495398
14550	NC_014002	TTG	2	6	745814	745819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495398
14551	NC_014002	AAG	2	6	745820	745825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495398
14552	NC_014002	ATG	2	6	745852	745857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495398
14553	NC_014002	T	6	6	745924	745929	0 %	100 %	0 %	0 %	294495398
14554	NC_014002	G	6	6	745941	745946	0 %	0 %	100 %	0 %	294495398
14555	NC_014002	ATTT	2	8	746065	746072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_014002	GGAT	2	8	746113	746120	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_014002	ATA	2	6	746253	746258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495399
14558	NC_014002	ATA	2	6	746280	746285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495399
14559	NC_014002	CTT	2	6	746289	746294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495399
14560	NC_014002	GCC	2	6	746322	746327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294495399
14561	NC_014002	A	6	6	746672	746677	100 %	0 %	0 %	0 %	294495399
14562	NC_014002	GAA	2	6	746718	746723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495399
14563	NC_014002	ATT	2	6	746796	746801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495399
14564	NC_014002	A	6	6	746826	746831	100 %	0 %	0 %	0 %	294495399
14565	NC_014002	AT	3	6	746855	746860	50 %	50 %	0 %	0 %	294495399
14566	NC_014002	CGC	2	6	746907	746912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294495399
14567	NC_014002	TAAT	2	8	746983	746990	50 %	50 %	0 %	0 %	294495399
14568	NC_014002	TGCT	2	8	747136	747143	0 %	50 %	25 %	25 %	294495399
14569	NC_014002	ATA	2	6	747171	747176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495399
14570	NC_014002	TGA	2	6	747194	747199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495399
14571	NC_014002	GA	3	6	747208	747213	50 %	0 %	50 %	0 %	294495399
14572	NC_014002	T	7	7	747228	747234	0 %	100 %	0 %	0 %	294495399
14573	NC_014002	GAA	2	6	747273	747278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495399
14574	NC_014002	TCCA	2	8	747322	747329	25 %	25 %	0 %	50 %	294495399
14575	NC_014002	ATT	2	6	747340	747345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495399
14576	NC_014002	TACA	2	8	747378	747385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14577	NC_014002	TTA	2	6	747387	747392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_014002	TTTTAT	2	12	747402	747413	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_014002	AC	3	6	747505	747510	50 %	0 %	0 %	50 %	294495400
14580	NC_014002	GAT	2	6	747531	747536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495400
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14582	NC_014002	AAT	2	6	747570	747575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495400
14583	NC_014002	CCT	2	6	747600	747605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495400
14584	NC_014002	GCC	2	6	747624	747629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294495400
14585	NC_014002	GCC	2	6	747705	747710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294495400
14586	NC_014002	TGA	2	6	747734	747739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495400
14587	NC_014002	GTT	2	6	747847	747852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495400
14588	NC_014002	ATCC	2	8	747861	747868	25 %	25 %	0 %	50 %	294495400
14589	NC_014002	TCC	2	6	747894	747899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495400
14590	NC_014002	GGT	2	6	748019	748024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495400
14591	NC_014002	TAC	2	6	748114	748119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495400
14592	NC_014002	GGA	2	6	748136	748141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495400
14593	NC_014002	CAA	2	6	748187	748192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495400
14594	NC_014002	CA	3	6	748280	748285	50 %	0 %	0 %	50 %	294495400
14595	NC_014002	TCG	2	6	748311	748316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495400
14596	NC_014002	GTT	2	6	748367	748372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495400
14597	NC_014002	TTA	2	6	748407	748412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495400
14598	NC_014002	CATC	2	8	748432	748439	25 %	25 %	0 %	50 %	294495400
14599	NC_014002	GGT	2	6	748496	748501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495400
14600	NC_014002	TAC	2	6	748511	748516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495400
14601	NC_014002	ATG	2	6	748521	748526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495400
14602	NC_014002	G	6	6	748535	748540	0 %	0 %	100 %	0 %	294495400
14603	NC_014002	ATA	2	6	748579	748584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495400
14604	NC_014002	AGG	2	6	748610	748615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495400
14605	NC_014002	ATC	2	6	748749	748754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495400
14606	NC_014002	AGAA	2	8	748796	748803	75 %	0 %	25 %	0 %	294495400
14607	NC_014002	ATT	2	6	748838	748843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495400
14608	NC_014002	GCG	2	6	748924	748929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294495401
14609	NC_014002	AGGG	2	8	749009	749016	25 %	0 %	75 %	0 %	294495401
14610	NC_014002	TGA	2	6	749037	749042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495401
14611	NC_014002	TTG	2	6	749266	749271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495401
14612	NC_014002	AATG	2	8	749317	749324	50 %	25 %	25 %	0 %	294495401
14613	NC_014002	TA	3	6	749451	749456	50 %	50 %	0 %	0 %	294495401
14614	NC_014002	GGT	2	6	749611	749616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495401
14615	NC_014002	ACA	2	6	749624	749629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495401
14616	NC_014002	TCCA	2	8	749704	749711	25 %	25 %	0 %	50 %	294495401
14617	NC_014002	GGA	2	6	749743	749748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495401
14618	NC_014002	CAT	2	6	749878	749883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495401
14619	NC_014002	G	6	6	749892	749897	0 %	0 %	100 %	0 %	294495401
14620	NC_014002	CGC	2	6	749924	749929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294495401
14621	NC_014002	TGGA	2	8	749930	749937	25 %	25 %	50 %	0 %	294495401
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