MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_014002	CAT	2	6	617259	617264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495271
12003	NC_014002	A	6	6	617284	617289	100 %	0 %	0 %	0 %	294495271
12004	NC_014002	T	6	6	617305	617310	0 %	100 %	0 %	0 %	294495271
12005	NC_014002	TGA	2	6	617346	617351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495271
12006	NC_014002	TGG	2	6	617399	617404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495271
12007	NC_014002	AAG	2	6	617434	617439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495271
12008	NC_014002	ATT	2	6	617456	617461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495271
12009	NC_014002	TGG	2	6	617493	617498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495271
12010	NC_014002	CTTTC	2	10	617571	617580	0 %	60 %	0 %	40 %	294495271
12011	NC_014002	T	6	6	617668	617673	0 %	100 %	0 %	0 %	294495271
12012	NC_014002	T	6	6	617724	617729	0 %	100 %	0 %	0 %	294495271
12013	NC_014002	T	6	6	617745	617750	0 %	100 %	0 %	0 %	294495271
12014	NC_014002	CT	3	6	617800	617805	0 %	50 %	0 %	50 %	294495271
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12020	NC_014002	TCAGG	2	10	618111	618120	20 %	20 %	40 %	20 %	294495271
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12033	NC_014002	ACAA	2	8	618725	618732	75 %	0 %	0 %	25 %	294495271
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12043	NC_014002	TAC	2	6	619056	619061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12044	NC_014002	TAT	2	6	619062	619067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_014002	AT	3	6	619066	619071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_014002	TAG	2	6	619082	619087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12058	NC_014002	TTCC	2	8	619561	619568	0 %	50 %	0 %	50 %	294495272
12059	NC_014002	T	7	7	619820	619826	0 %	100 %	0 %	0 %	294495272
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12095	NC_014002	T	6	6	622024	622029	0 %	100 %	0 %	0 %	294495274
12096	NC_014002	TAA	2	6	622115	622120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12097	NC_014002	ATA	2	6	622123	622128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12098	NC_014002	TCATT	2	10	622132	622141	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12099	NC_014002	CA	3	6	622142	622147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12100	NC_014002	AT	4	8	622162	622169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12101	NC_014002	AAAT	2	8	622173	622180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12102	NC_014002	T	7	7	622206	622212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12103	NC_014002	TAT	2	6	622220	622225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12104	NC_014002	AATA	2	8	622288	622295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12105	NC_014002	TAT	2	6	622315	622320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12106	NC_014002	TA	3	6	622353	622358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12107	NC_014002	TA	3	6	622360	622365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12108	NC_014002	AGC	2	6	622421	622426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495275
12109	NC_014002	AGA	2	6	622427	622432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495275
12110	NC_014002	ATG	2	6	622499	622504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495275
12111	NC_014002	A	7	7	622527	622533	100 %	0 %	0 %	0 %	294495275
12112	NC_014002	CTG	2	6	622553	622558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495275
12113	NC_014002	TAA	2	6	622589	622594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495275
12114	NC_014002	GGA	2	6	622684	622689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495275
12115	NC_014002	AT	4	8	622718	622725	50 %	50 %	0 %	0 %	294495275
12116	NC_014002	CTTC	2	8	622825	622832	0 %	50 %	0 %	50 %	294495275
12117	NC_014002	GCA	2	6	622843	622848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495275
12118	NC_014002	GGT	2	6	622948	622953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495275
12119	NC_014002	CA	3	6	623048	623053	50 %	0 %	0 %	50 %	294495275
12120	NC_014002	CAAA	2	8	623056	623063	75 %	0 %	0 %	25 %	294495275
12121	NC_014002	CTG	2	6	623090	623095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495275
12122	NC_014002	TTA	2	6	623156	623161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495275
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12124	NC_014002	CAC	2	6	623206	623211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495275
12125	NC_014002	GGA	2	6	623229	623234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495275
12126	NC_014002	TA	3	6	623254	623259	50 %	50 %	0 %	0 %	294495275
12127	NC_014002	CTT	2	6	623265	623270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495275
12128	NC_014002	GGT	2	6	623323	623328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495275
12129	NC_014002	TCCT	2	8	623333	623340	0 %	50 %	0 %	50 %	294495275
12130	NC_014002	GTA	2	6	623425	623430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495275
12131	NC_014002	GTAA	2	8	623446	623453	50 %	25 %	25 %	0 %	294495275
12132	NC_014002	A	6	6	623474	623479	100 %	0 %	0 %	0 %	294495275
12133	NC_014002	AGT	2	6	623526	623531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495275
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12138	NC_014002	GACT	2	8	623850	623857	25 %	25 %	25 %	25 %	294495275
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12141	NC_014002	AACA	2	8	624038	624045	75 %	0 %	0 %	25 %	294495275
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12154	NC_014002	A	6	6	624493	624498	100 %	0 %	0 %	0 %	294495275
12155	NC_014002	TCCTG	2	10	624520	624529	0 %	40 %	20 %	40 %	294495275
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12157	NC_014002	GGAT	2	8	624632	624639	25 %	25 %	50 %	0 %	294495275
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12226	NC_014002	A	6	6	627541	627546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12227	NC_014002	ATG	2	6	627551	627556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12228	NC_014002	AGGGA	2	10	627559	627568	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12229	NC_014002	CTGG	2	8	627621	627628	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12230	NC_014002	T	6	6	627744	627749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12231	NC_014002	TA	3	6	627831	627836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12232	NC_014002	T	6	6	627851	627856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12233	NC_014002	A	6	6	627887	627892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12234	NC_014002	TGCA	2	8	627974	627981	25 %	25 %	25 %	25 %	294495280
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12236	NC_014002	GGCA	2	8	628062	628069	25 %	0 %	50 %	25 %	294495280
12237	NC_014002	CAT	2	6	628084	628089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495280
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12240	NC_014002	CA	3	6	628362	628367	50 %	0 %	0 %	50 %	294495280
12241	NC_014002	CCCA	2	8	628380	628387	25 %	0 %	0 %	75 %	294495280
12242	NC_014002	TTC	2	6	628514	628519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495280
12243	NC_014002	ATAC	2	8	628558	628565	50 %	25 %	0 %	25 %	294495280
12244	NC_014002	TC	3	6	628620	628625	0 %	50 %	0 %	50 %	294495280
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12369	NC_014002	ATG	2	6	635100	635105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495286
12370	NC_014002	ATT	2	6	635128	635133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495286
12371	NC_014002	TGC	2	6	635136	635141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495286
12372	NC_014002	T	6	6	635163	635168	0 %	100 %	0 %	0 %	294495286
12373	NC_014002	TA	3	6	635222	635227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12374	NC_014002	TAT	2	6	635253	635258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495287
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12405	NC_014002	T	6	6	637707	637712	0 %	100 %	0 %	0 %	294495288
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12409	NC_014002	A	7	7	637816	637822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12410	NC_014002	TAG	2	6	637823	637828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12483	NC_014002	GCGACT	2	12	640840	640851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294495291
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12489	NC_014002	TTTCC	2	10	641174	641183	0 %	60 %	0 %	40 %	294495292
12490	NC_014002	GATG	2	8	641260	641267	25 %	25 %	50 %	0 %	294495292
12491	NC_014002	CAG	2	6	641285	641290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495292
12492	NC_014002	AGGC	2	8	641310	641317	25 %	0 %	50 %	25 %	294495292
12493	NC_014002	AGC	2	6	641371	641376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495292
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