MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014002	CAT	2	6	592411	592416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495245
11502	NC_014002	TCT	2	6	592421	592426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495245
11503	NC_014002	CTT	2	6	592531	592536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495245
11504	NC_014002	TAC	2	6	592538	592543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495245
11505	NC_014002	GGA	2	6	592553	592558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495245
11506	NC_014002	TC	3	6	592597	592602	0 %	50 %	0 %	50 %	294495245
11507	NC_014002	CTT	2	6	592603	592608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495245
11508	NC_014002	CAT	2	6	592706	592711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495245
11509	NC_014002	CTT	2	6	592750	592755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495245
11510	NC_014002	CCA	2	6	592761	592766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495245
11511	NC_014002	T	6	6	592968	592973	0 %	100 %	0 %	0 %	294495245
11512	NC_014002	CTT	2	6	593035	593040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495245
11513	NC_014002	TTC	2	6	593060	593065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495245
11514	NC_014002	GGA	2	6	593102	593107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495245
11515	NC_014002	CTG	2	6	593119	593124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495245
11516	NC_014002	GAT	2	6	593150	593155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495245
11517	NC_014002	TCC	2	6	593166	593171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495245
11518	NC_014002	TGA	2	6	593183	593188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495245
11519	NC_014002	GA	3	6	593193	593198	50 %	0 %	50 %	0 %	294495245
11520	NC_014002	TA	3	6	593203	593208	50 %	50 %	0 %	0 %	294495245
11521	NC_014002	CAGG	2	8	593244	593251	25 %	0 %	50 %	25 %	294495245
11522	NC_014002	TTC	2	6	593291	593296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495245
11523	NC_014002	AAG	2	6	593395	593400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495245
11524	NC_014002	TGCC	2	8	593510	593517	0 %	25 %	25 %	50 %	294495246
11525	NC_014002	GGTC	2	8	593519	593526	0 %	25 %	50 %	25 %	294495246
11526	NC_014002	GTGG	2	8	593564	593571	0 %	25 %	75 %	0 %	294495246
11527	NC_014002	GTG	2	6	593588	593593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495246
11528	NC_014002	TGA	2	6	593633	593638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495246
11529	NC_014002	CAT	2	6	593705	593710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495246
11530	NC_014002	GCA	2	6	593764	593769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495246
11531	NC_014002	CAT	2	6	593783	593788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495246
11532	NC_014002	ATG	2	6	593846	593851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495246
11533	NC_014002	CAT	2	6	593862	593867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495246
11534	NC_014002	CAC	2	6	593969	593974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495246
11535	NC_014002	T	7	7	594007	594013	0 %	100 %	0 %	0 %	294495246
11536	NC_014002	TTG	2	6	594058	594063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495246
11537	NC_014002	CTC	2	6	594119	594124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495246
11538	NC_014002	GGT	2	6	594144	594149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495246
11539	NC_014002	AGC	2	6	594276	594281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495246
11540	NC_014002	CAA	2	6	594302	594307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495246
11541	NC_014002	T	7	7	594325	594331	0 %	100 %	0 %	0 %	294495246
11542	NC_014002	T	9	9	594339	594347	0 %	100 %	0 %	0 %	294495246
11543	NC_014002	GGA	2	6	594350	594355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495246
11544	NC_014002	GCT	2	6	594364	594369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495246
11545	NC_014002	CAA	3	9	594458	594466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495247
11546	NC_014002	T	6	6	594474	594479	0 %	100 %	0 %	0 %	294495247
11547	NC_014002	GTG	2	6	594562	594567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495247
11548	NC_014002	TCCT	2	8	594684	594691	0 %	50 %	0 %	50 %	294495247
11549	NC_014002	CT	3	6	594700	594705	0 %	50 %	0 %	50 %	294495247
11550	NC_014002	CTG	2	6	594715	594720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495247
11551	NC_014002	TTC	2	6	594735	594740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495247
11552	NC_014002	ATG	2	6	594828	594833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495247
11553	NC_014002	CCT	2	6	594945	594950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11554	NC_014002	TGG	2	6	595012	595017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_014002	T	6	6	595062	595067	0 %	100 %	0 %	0 %	294495248
11556	NC_014002	ATC	2	6	595105	595110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495248
11557	NC_014002	TTC	2	6	595166	595171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495248
11558	NC_014002	CTT	2	6	595226	595231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495248
11559	NC_014002	AT	3	6	595310	595315	50 %	50 %	0 %	0 %	294495248
11560	NC_014002	CTG	2	6	595321	595326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495248
11561	NC_014002	TTCTT	2	10	595345	595354	0 %	80 %	0 %	20 %	294495248
11562	NC_014002	TGT	2	6	595355	595360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495248
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11565	NC_014002	GTA	2	6	595413	595418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495248
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11567	NC_014002	TTC	2	6	595443	595448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495248
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11569	NC_014002	TCT	2	6	595519	595524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495248
11570	NC_014002	TCT	2	6	595585	595590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495248
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11572	NC_014002	TA	3	6	595757	595762	50 %	50 %	0 %	0 %	294495248
11573	NC_014002	TTC	2	6	595785	595790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495248
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11575	NC_014002	GTT	2	6	595850	595855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_014002	T	6	6	595854	595859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_014002	AT	3	6	595890	595895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_014002	TTC	2	6	595914	595919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11579	NC_014002	T	6	6	595931	595936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_014002	TTAT	2	8	595990	595997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_014002	T	8	8	596034	596041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_014002	TATATT	2	12	596063	596074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_014002	AGG	2	6	596116	596121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_014002	GAAT	2	8	596126	596133	50 %	25 %	25 %	0 %	294495249
11585	NC_014002	TAT	2	6	596154	596159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495249
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11587	NC_014002	GTTGCA	2	12	596194	596205	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294495249
11588	NC_014002	GAT	2	6	596212	596217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495249
11589	NC_014002	GGAA	2	8	596218	596225	50 %	0 %	50 %	0 %	294495249
11590	NC_014002	TGA	2	6	596268	596273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495249
11591	NC_014002	AGGA	2	8	596277	596284	50 %	0 %	50 %	0 %	294495249
11592	NC_014002	GAA	2	6	596385	596390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495249
11593	NC_014002	AGA	2	6	596544	596549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495249
11594	NC_014002	AT	3	6	596598	596603	50 %	50 %	0 %	0 %	294495249
11595	NC_014002	CAG	2	6	596620	596625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495249
11596	NC_014002	GAT	2	6	596911	596916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495249
11597	NC_014002	CAGT	2	8	596953	596960	25 %	25 %	25 %	25 %	294495249
11598	NC_014002	ATG	2	6	596981	596986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495249
11599	NC_014002	CAGG	2	8	597021	597028	25 %	0 %	50 %	25 %	294495249
11600	NC_014002	AGA	2	6	597045	597050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495249
11601	NC_014002	GCTGT	2	10	597082	597091	0 %	40 %	40 %	20 %	294495249
11602	NC_014002	TTG	2	6	597134	597139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495249
11603	NC_014002	GAA	2	6	597202	597207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495249
11604	NC_014002	GCA	2	6	597229	597234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495249
11605	NC_014002	ATG	2	6	597286	597291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495249
11606	NC_014002	GA	3	6	597299	597304	50 %	0 %	50 %	0 %	294495249
11607	NC_014002	GAAGAT	2	12	597409	597420	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294495249
11608	NC_014002	GAA	2	6	597433	597438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495249
11609	NC_014002	ACC	2	6	597523	597528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495249
11610	NC_014002	ATGA	2	8	597532	597539	50 %	25 %	25 %	0 %	294495249
11611	NC_014002	AAT	2	6	597540	597545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495249
11612	NC_014002	TGA	2	6	597606	597611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495249
11613	NC_014002	GAA	2	6	597634	597639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495249
11614	NC_014002	ACC	2	6	597724	597729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495249
11615	NC_014002	GAT	2	6	597808	597813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495249
11616	NC_014002	AATG	2	8	597837	597844	50 %	25 %	25 %	0 %	294495249
11617	NC_014002	GAAT	2	8	597865	597872	50 %	25 %	25 %	0 %	294495249
11618	NC_014002	TCAT	2	8	597891	597898	25 %	50 %	0 %	25 %	294495250
11619	NC_014002	AGA	2	6	597995	598000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495250
11620	NC_014002	T	6	6	598003	598008	0 %	100 %	0 %	0 %	294495250
11621	NC_014002	AAG	2	6	598012	598017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495250
11622	NC_014002	GAG	2	6	598035	598040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495250
11623	NC_014002	ATC	2	6	598043	598048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495250
11624	NC_014002	GGA	2	6	598118	598123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495250
11625	NC_014002	TA	3	6	598124	598129	50 %	50 %	0 %	0 %	294495250
11626	NC_014002	CTTT	2	8	598139	598146	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11627	NC_014002	TAAA	2	8	598162	598169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_014002	ATG	2	6	598189	598194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11651	NC_014002	T	6	6	599175	599180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11652	NC_014002	ATA	2	6	599210	599215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11653	NC_014002	ATG	2	6	599220	599225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11736	NC_014002	T	7	7	604000	604006	0 %	100 %	0 %	0 %	294495257
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