MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014002	ATT	2	6	567056	567061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_014002	ATT	2	6	567068	567073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_014002	AT	4	8	567085	567092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_014002	TTA	2	6	567129	567134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_014002	AT	4	8	567156	567163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_014002	AGA	2	6	567164	567169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_014002	TA	3	6	567210	567215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_014002	T	6	6	567251	567256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_014002	CAT	2	6	567279	567284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_014002	ATT	2	6	567307	567312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_014002	T	6	6	567320	567325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_014002	TCG	2	6	567358	567363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495222
11013	NC_014002	ATATAA	2	12	567364	567375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495222
11014	NC_014002	ATT	2	6	567502	567507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495222
11015	NC_014002	GTGA	2	8	567519	567526	25 %	25 %	50 %	0 %	294495222
11016	NC_014002	AC	3	6	567538	567543	50 %	0 %	0 %	50 %	294495222
11017	NC_014002	TGAA	2	8	567544	567551	50 %	25 %	25 %	0 %	294495222
11018	NC_014002	TGG	2	6	567565	567570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495222
11019	NC_014002	AAG	2	6	567613	567618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495222
11020	NC_014002	A	6	6	567714	567719	100 %	0 %	0 %	0 %	294495222
11021	NC_014002	TGCTA	2	10	567760	567769	20 %	40 %	20 %	20 %	294495222
11022	NC_014002	TGA	2	6	567821	567826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495222
11023	NC_014002	AGC	2	6	567848	567853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495222
11024	NC_014002	GGGT	2	8	567967	567974	0 %	25 %	75 %	0 %	294495222
11025	NC_014002	TGC	2	6	567980	567985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495222
11026	NC_014002	GAT	2	6	568059	568064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495222
11027	NC_014002	TGT	2	6	568073	568078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495222
11028	NC_014002	GTGC	2	8	568140	568147	0 %	25 %	50 %	25 %	294495222
11029	NC_014002	TGA	2	6	568180	568185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495222
11030	NC_014002	TG	3	6	568335	568340	0 %	50 %	50 %	0 %	294495222
11031	NC_014002	GA	3	6	568467	568472	50 %	0 %	50 %	0 %	294495222
11032	NC_014002	TCT	2	6	568505	568510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495222
11033	NC_014002	TGG	2	6	568603	568608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495222
11034	NC_014002	TGA	2	6	568619	568624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495222
11035	NC_014002	ACT	2	6	568653	568658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495222
11036	NC_014002	ATGA	2	8	568674	568681	50 %	25 %	25 %	0 %	294495222
11037	NC_014002	AAATGC	2	12	568717	568728	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294495222
11038	NC_014002	ATG	2	6	568822	568827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495222
11039	NC_014002	TGC	2	6	568880	568885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495222
11040	NC_014002	TG	3	6	568917	568922	0 %	50 %	50 %	0 %	294495222
11041	NC_014002	AAT	2	6	568926	568931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495222
11042	NC_014002	CTG	2	6	568953	568958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495222
11043	NC_014002	A	6	6	568985	568990	100 %	0 %	0 %	0 %	294495222
11044	NC_014002	ATG	2	6	569002	569007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495222
11045	NC_014002	A	6	6	569173	569178	100 %	0 %	0 %	0 %	294495223
11046	NC_014002	GTGG	2	8	569329	569336	0 %	25 %	75 %	0 %	294495223
11047	NC_014002	GAGG	2	8	569356	569363	25 %	0 %	75 %	0 %	294495223
11048	NC_014002	CGC	2	6	569386	569391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294495223
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11051	NC_014002	GAC	2	6	569719	569724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495223
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11053	NC_014002	AG	3	6	569810	569815	50 %	0 %	50 %	0 %	294495223
11054	NC_014002	GT	3	6	569900	569905	0 %	50 %	50 %	0 %	294495223
11055	NC_014002	AGA	2	6	570020	570025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_014002	AAG	2	6	570041	570046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_014002	AG	3	6	570185	570190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_014002	AATG	2	8	570230	570237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_014002	GTG	2	6	570241	570246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_014002	TAA	2	6	570262	570267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_014002	A	7	7	570277	570283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_014002	T	7	7	570287	570293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_014002	TA	3	6	570303	570308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_014002	AGC	2	6	570317	570322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_014002	CTG	2	6	570348	570353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_014002	AT	3	6	570367	570372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_014002	GCA	2	6	570398	570403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11071	NC_014002	GGA	2	6	570473	570478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_014002	GGA	2	6	570519	570524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_014002	TCCTTC	2	12	570545	570556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11075	NC_014002	GAT	2	6	570614	570619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11083	NC_014002	GAT	2	6	571269	571274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11086	NC_014002	A	7	7	571505	571511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_014002	TGG	2	6	571631	571636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_014002	A	6	6	571729	571734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_014002	ATG	2	6	571749	571754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11092	NC_014002	CTC	2	6	571909	571914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11093	NC_014002	TGT	2	6	571945	571950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_014002	ATT	2	6	572132	572137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495224
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11098	NC_014002	TG	3	6	572270	572275	0 %	50 %	50 %	0 %	294495224
11099	NC_014002	TCA	2	6	572310	572315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495224
11100	NC_014002	AG	3	6	572325	572330	50 %	0 %	50 %	0 %	294495224
11101	NC_014002	CAG	2	6	572467	572472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495224
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11105	NC_014002	T	7	7	572655	572661	0 %	100 %	0 %	0 %	294495225
11106	NC_014002	TCC	2	6	572687	572692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495225
11107	NC_014002	GTTT	2	8	572702	572709	0 %	75 %	25 %	0 %	294495225
11108	NC_014002	T	6	6	572741	572746	0 %	100 %	0 %	0 %	294495225
11109	NC_014002	AT	3	6	572791	572796	50 %	50 %	0 %	0 %	294495225
11110	NC_014002	A	6	6	572828	572833	100 %	0 %	0 %	0 %	294495225
11111	NC_014002	TGA	2	6	572881	572886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495225
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11113	NC_014002	TA	3	6	572972	572977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_014002	AAC	2	6	572987	572992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11115	NC_014002	AT	3	6	573037	573042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_014002	AAT	2	6	573048	573053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_014002	TAT	2	6	573057	573062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_014002	AT	3	6	573096	573101	50 %	50 %	0 %	0 %	294495226
11119	NC_014002	CTT	2	6	573176	573181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495226
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11373	NC_014002	TTC	2	6	585864	585869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495240
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11493	NC_014002	A	6	6	591934	591939	100 %	0 %	0 %	0 %	294495245
11494	NC_014002	AAC	2	6	592024	592029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495245
11495	NC_014002	ACG	2	6	592058	592063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495245
11496	NC_014002	TCT	2	6	592120	592125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495245
11497	NC_014002	ATT	2	6	592182	592187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495245
11498	NC_014002	TGTC	2	8	592257	592264	0 %	50 %	25 %	25 %	294495245
11499	NC_014002	AAC	3	9	592299	592307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495245
11500	NC_014002	TCT	2	6	592310	592315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495245

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