MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_014002	CTA	2	6	538366	538371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495200
10502	NC_014002	TTG	2	6	538383	538388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495200
10503	NC_014002	ATG	2	6	538422	538427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495200
10504	NC_014002	AAC	2	6	538468	538473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495200
10505	NC_014002	TGG	2	6	538479	538484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495200
10506	NC_014002	TATG	2	8	538518	538525	25 %	50 %	25 %	0 %	294495200
10507	NC_014002	ATG	2	6	538541	538546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495200
10508	NC_014002	A	8	8	538564	538571	100 %	0 %	0 %	0 %	294495200
10509	NC_014002	TGAT	2	8	538587	538594	25 %	50 %	25 %	0 %	294495200
10510	NC_014002	AAT	2	6	538626	538631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495200
10511	NC_014002	AGA	2	6	538713	538718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_014002	TATT	2	8	538735	538742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_014002	TAAAA	2	10	538748	538757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_014002	TA	3	6	538758	538763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_014002	AAT	2	6	538787	538792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_014002	AT	3	6	538818	538823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_014002	GTA	2	6	538832	538837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_014002	ATGT	2	8	538996	539003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_014002	TCGG	2	8	539159	539166	0 %	25 %	50 %	25 %	294495201
10520	NC_014002	ATGC	2	8	539217	539224	25 %	25 %	25 %	25 %	294495201
10521	NC_014002	GTT	2	6	539351	539356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495201
10522	NC_014002	CTT	2	6	539384	539389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495201
10523	NC_014002	AT	3	6	539442	539447	50 %	50 %	0 %	0 %	294495201
10524	NC_014002	ATG	2	6	539507	539512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495201
10525	NC_014002	CTC	2	6	539576	539581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495201
10526	NC_014002	TGA	2	6	539713	539718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495201
10527	NC_014002	ATC	2	6	539879	539884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495201
10528	NC_014002	GGA	2	6	539897	539902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495201
10529	NC_014002	ATCC	2	8	539940	539947	25 %	25 %	0 %	50 %	294495201
10530	NC_014002	CAG	2	6	539961	539966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495201
10531	NC_014002	GCA	2	6	540002	540007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495201
10532	NC_014002	AGA	2	6	540103	540108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495201
10533	NC_014002	AGA	2	6	540172	540177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495201
10534	NC_014002	TTG	2	6	540185	540190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495201
10535	NC_014002	CAGG	2	8	540211	540218	25 %	0 %	50 %	25 %	294495201
10536	NC_014002	TCT	2	6	540221	540226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495201
10537	NC_014002	AAC	2	6	540261	540266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495201
10538	NC_014002	CGT	2	6	540307	540312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495201
10539	NC_014002	AAG	2	6	540398	540403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_014002	ACAA	2	8	540432	540439	75 %	0 %	0 %	25 %	294495202
10541	NC_014002	CAT	2	6	540655	540660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495202
10542	NC_014002	AGC	3	9	540686	540694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495202
10543	NC_014002	TGA	2	6	540746	540751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495202
10544	NC_014002	TGG	2	6	540756	540761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495202
10545	NC_014002	GAT	2	6	540816	540821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495202
10546	NC_014002	TGA	2	6	540838	540843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495202
10547	NC_014002	GCA	2	6	540858	540863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495202
10548	NC_014002	TGA	2	6	540884	540889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495202
10549	NC_014002	ACA	2	6	540898	540903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495202
10550	NC_014002	A	6	6	540933	540938	100 %	0 %	0 %	0 %	294495202
10551	NC_014002	GAAG	2	8	540944	540951	50 %	0 %	50 %	0 %	294495202
10552	NC_014002	GT	3	6	540991	540996	0 %	50 %	50 %	0 %	294495202
10553	NC_014002	ACC	2	6	541008	541013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495202
10554	NC_014002	CTT	2	6	541053	541058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495202
10555	NC_014002	TGATG	2	10	541157	541166	20 %	40 %	40 %	0 %	294495202
10556	NC_014002	CAG	3	9	541219	541227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495202
10557	NC_014002	ATT	2	6	541254	541259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495202
10558	NC_014002	ATG	2	6	541306	541311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495202
10559	NC_014002	TA	3	6	541544	541549	50 %	50 %	0 %	0 %	294495202
10560	NC_014002	TGTCA	2	10	541607	541616	20 %	40 %	20 %	20 %	294495202
10561	NC_014002	GATC	2	8	541646	541653	25 %	25 %	25 %	25 %	294495202
10562	NC_014002	CTA	2	6	541826	541831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495202
10563	NC_014002	CAA	2	6	541939	541944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10564	NC_014002	TAC	2	6	541964	541969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10565	NC_014002	AGG	2	6	541983	541988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_014002	GTAT	2	8	542069	542076	25 %	50 %	25 %	0 %	294495203
10567	NC_014002	TTG	2	6	542083	542088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495203
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10569	NC_014002	TGA	2	6	542314	542319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495203
10570	NC_014002	AC	3	6	542403	542408	50 %	0 %	0 %	50 %	294495203
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10572	NC_014002	ATG	2	6	542467	542472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495203
10573	NC_014002	CTT	2	6	542481	542486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495203
10574	NC_014002	ATG	2	6	542500	542505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495203
10575	NC_014002	GAT	2	6	542514	542519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495203
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10577	NC_014002	TGA	2	6	542585	542590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495203
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10582	NC_014002	A	6	6	542785	542790	100 %	0 %	0 %	0 %	294495203
10583	NC_014002	A	6	6	542824	542829	100 %	0 %	0 %	0 %	294495204
10584	NC_014002	TAC	2	6	542853	542858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495204
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10587	NC_014002	TGTGG	2	10	543218	543227	0 %	40 %	60 %	0 %	294495204
10588	NC_014002	AAG	2	6	543274	543279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495204
10589	NC_014002	GTG	2	6	543298	543303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495204
10590	NC_014002	CCGAT	2	10	543319	543328	20 %	20 %	20 %	40 %	294495204
10591	NC_014002	CGA	2	6	543335	543340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495204
10592	NC_014002	A	6	6	543426	543431	100 %	0 %	0 %	0 %	294495204
10593	NC_014002	GAAA	2	8	543500	543507	75 %	0 %	25 %	0 %	294495204
10594	NC_014002	AGTC	2	8	543539	543546	25 %	25 %	25 %	25 %	294495204
10595	NC_014002	AAT	2	6	543558	543563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495204
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10597	NC_014002	A	6	6	543639	543644	100 %	0 %	0 %	0 %	294495204
10598	NC_014002	AAT	2	6	543652	543657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_014002	T	6	6	543662	543667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_014002	ATTT	2	8	543668	543675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_014002	TA	3	6	543676	543681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_014002	TA	4	8	543720	543727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_014002	ATA	2	6	543765	543770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495205
10604	NC_014002	AT	3	6	543822	543827	50 %	50 %	0 %	0 %	294495205
10605	NC_014002	CGT	2	6	543857	543862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495205
10606	NC_014002	TGG	2	6	543868	543873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495205
10607	NC_014002	TGG	2	6	543910	543915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495205
10608	NC_014002	ATGG	2	8	543967	543974	25 %	25 %	50 %	0 %	294495205
10609	NC_014002	ACA	2	6	544043	544048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495205
10610	NC_014002	ATT	2	6	544095	544100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495205
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10612	NC_014002	GGAAG	2	10	544160	544169	40 %	0 %	60 %	0 %	294495205
10613	NC_014002	GAA	2	6	544349	544354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495205
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10615	NC_014002	AT	3	6	544409	544414	50 %	50 %	0 %	0 %	294495205
10616	NC_014002	AAT	2	6	544426	544431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495205
10617	NC_014002	CTG	2	6	544440	544445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495205
10618	NC_014002	TAA	2	6	544515	544520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495205
10619	NC_014002	TAC	2	6	544537	544542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495205
10620	NC_014002	AGGA	2	8	544543	544550	50 %	0 %	50 %	0 %	294495205
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10622	NC_014002	CAT	2	6	544601	544606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495205
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