MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014002	GAT	2	6	510592	510597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495168
10002	NC_014002	TAT	2	6	510675	510680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495168
10003	NC_014002	TGA	2	6	510699	510704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495168
10004	NC_014002	TGG	2	6	510714	510719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495168
10005	NC_014002	TCT	2	6	510720	510725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495168
10006	NC_014002	CTT	2	6	510844	510849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495168
10007	NC_014002	GTT	2	6	510856	510861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495168
10008	NC_014002	GAT	2	6	510868	510873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495168
10009	NC_014002	GAT	2	6	511109	511114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495169
10010	NC_014002	GATGT	2	10	511279	511288	20 %	40 %	40 %	0 %	294495169
10011	NC_014002	GAT	2	6	511311	511316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495169
10012	NC_014002	ACG	2	6	511342	511347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495169
10013	NC_014002	GAAA	2	8	511388	511395	75 %	0 %	25 %	0 %	294495169
10014	NC_014002	TAT	2	6	511406	511411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495169
10015	NC_014002	AAT	2	6	511453	511458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_014002	TA	3	6	511499	511504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_014002	TTG	2	6	511546	511551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495170
10018	NC_014002	CCT	2	6	511574	511579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495170
10019	NC_014002	GAT	2	6	511584	511589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495170
10020	NC_014002	AAACT	2	10	511618	511627	60 %	20 %	0 %	20 %	294495170
10021	NC_014002	TGT	2	6	511658	511663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495170
10022	NC_014002	TGA	2	6	511679	511684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495170
10023	NC_014002	TAT	2	6	511725	511730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495170
10024	NC_014002	GTT	2	6	511791	511796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495170
10025	NC_014002	TCT	2	6	511844	511849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495170
10026	NC_014002	TAAA	2	8	511921	511928	75 %	25 %	0 %	0 %	294495170
10027	NC_014002	AAAT	2	8	512081	512088	75 %	25 %	0 %	0 %	294495170
10028	NC_014002	TCAGG	2	10	512144	512153	20 %	20 %	40 %	20 %	294495171
10029	NC_014002	CAC	2	6	512170	512175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495171
10030	NC_014002	A	6	6	512239	512244	100 %	0 %	0 %	0 %	294495171
10031	NC_014002	A	6	6	512340	512345	100 %	0 %	0 %	0 %	294495172
10032	NC_014002	GAA	2	6	512373	512378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495172
10033	NC_014002	TAC	2	6	512441	512446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495172
10034	NC_014002	ATT	2	6	512469	512474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495172
10035	NC_014002	GAT	2	6	512528	512533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495172
10036	NC_014002	AAT	2	6	512574	512579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495172
10037	NC_014002	CCG	2	6	512581	512586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294495172
10038	NC_014002	GAA	2	6	512598	512603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495172
10039	NC_014002	TGG	2	6	512605	512610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495172
10040	NC_014002	GAA	2	6	512667	512672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495172
10041	NC_014002	AAT	2	6	512693	512698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495172
10042	NC_014002	CGT	2	6	512717	512722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495172
10043	NC_014002	ATG	2	6	512748	512753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495172
10044	NC_014002	GGA	2	6	512851	512856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495172
10045	NC_014002	GAAGA	2	10	512881	512890	60 %	0 %	40 %	0 %	294495172
10046	NC_014002	ACA	2	6	512891	512896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495173
10047	NC_014002	TTA	2	6	513008	513013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495173
10048	NC_014002	AGA	2	6	513150	513155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495173
10049	NC_014002	GAA	2	6	513163	513168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495173
10050	NC_014002	GGT	2	6	513172	513177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_014002	ATA	2	6	513215	513220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495174
10052	NC_014002	T	7	7	513341	513347	0 %	100 %	0 %	0 %	294495175
10053	NC_014002	TTTC	2	8	513351	513358	0 %	75 %	0 %	25 %	294495175
10054	NC_014002	T	6	6	513399	513404	0 %	100 %	0 %	0 %	294495175
10055	NC_014002	GTTT	2	8	513436	513443	0 %	75 %	25 %	0 %	294495175
10056	NC_014002	T	8	8	513441	513448	0 %	100 %	0 %	0 %	294495175
10057	NC_014002	ATC	2	6	513466	513471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495175
10058	NC_014002	AT	3	6	513514	513519	50 %	50 %	0 %	0 %	294495175
10059	NC_014002	GCT	2	6	513527	513532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495175
10060	NC_014002	GCT	2	6	513626	513631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495175
10061	NC_014002	T	8	8	513666	513673	0 %	100 %	0 %	0 %	294495175
10062	NC_014002	CTA	2	6	513684	513689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495175
10063	NC_014002	TCT	2	6	513698	513703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495175
10064	NC_014002	T	6	6	513714	513719	0 %	100 %	0 %	0 %	294495175
10065	NC_014002	CT	3	6	513737	513742	0 %	50 %	0 %	50 %	294495176
10066	NC_014002	T	7	7	513753	513759	0 %	100 %	0 %	0 %	294495176
10067	NC_014002	TCTATT	2	12	513798	513809	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294495176
10068	NC_014002	ATTT	2	8	513932	513939	25 %	75 %	0 %	0 %	294495176
10069	NC_014002	TAT	2	6	513953	513958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495176
10070	NC_014002	TAA	2	6	514012	514017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495176
10071	NC_014002	T	6	6	514090	514095	0 %	100 %	0 %	0 %	294495176
10072	NC_014002	TAT	2	6	514225	514230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495176
10073	NC_014002	CAT	3	9	514246	514254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495176
10074	NC_014002	ATT	2	6	514304	514309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495176
10075	NC_014002	T	6	6	514331	514336	0 %	100 %	0 %	0 %	294495176
10076	NC_014002	AAG	2	6	514355	514360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495176
10077	NC_014002	CTT	2	6	514363	514368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495176
10078	NC_014002	CAT	2	6	514420	514425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495176
10079	NC_014002	TTA	2	6	514473	514478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495176
10080	NC_014002	TATG	2	8	514486	514493	25 %	50 %	25 %	0 %	294495176
10081	NC_014002	ATC	2	6	514637	514642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495176
10082	NC_014002	TGT	2	6	514780	514785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495176
10083	NC_014002	TCT	2	6	514803	514808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495176
10084	NC_014002	CTGG	2	8	514814	514821	0 %	25 %	50 %	25 %	294495176
10085	NC_014002	TCA	2	6	514902	514907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495176
10086	NC_014002	ACC	2	6	515091	515096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495176
10087	NC_014002	TCA	2	6	515205	515210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495176
10088	NC_014002	TTC	2	6	515267	515272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495176
10089	NC_014002	TAC	2	6	515351	515356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495176
10090	NC_014002	GAT	2	6	515365	515370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495176
10091	NC_014002	C	7	7	515386	515392	0 %	0 %	0 %	100 %	294495176
10092	NC_014002	CTT	2	6	515483	515488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495176
10093	NC_014002	AGT	2	6	515532	515537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495176
10094	NC_014002	TCA	2	6	515595	515600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495176
10095	NC_014002	ATCC	2	8	515627	515634	25 %	25 %	0 %	50 %	294495176
10096	NC_014002	CAG	2	6	515693	515698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495176
10097	NC_014002	GCCTG	2	10	515766	515775	0 %	20 %	40 %	40 %	294495176
10098	NC_014002	ATTG	2	8	515835	515842	25 %	50 %	25 %	0 %	294495176
10099	NC_014002	A	6	6	515933	515938	100 %	0 %	0 %	0 %	294495176
10100	NC_014002	ATT	2	6	516082	516087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495177
10101	NC_014002	CATA	2	8	516098	516105	50 %	25 %	0 %	25 %	294495177
10102	NC_014002	CAA	2	6	516203	516208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495177
10103	NC_014002	TTC	2	6	516231	516236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495177
10104	NC_014002	AGTA	2	8	516261	516268	50 %	25 %	25 %	0 %	294495177
10105	NC_014002	ATA	2	6	516303	516308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495177
10106	NC_014002	ATT	2	6	516340	516345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495177
10107	NC_014002	TTC	2	6	516384	516389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495177
10108	NC_014002	TTC	2	6	516465	516470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495177
10109	NC_014002	ATT	2	6	516507	516512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495177
10110	NC_014002	CTC	2	6	516513	516518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495177
10111	NC_014002	CAG	2	6	516537	516542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495177
10112	NC_014002	T	6	6	516553	516558	0 %	100 %	0 %	0 %	294495177
10113	NC_014002	CAT	2	6	516645	516650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495177
10114	NC_014002	TGATC	2	10	516680	516689	20 %	40 %	20 %	20 %	294495177
10115	NC_014002	TAG	2	6	516711	516716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495177
10116	NC_014002	CCTTTT	2	12	516726	516737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495177
10117	NC_014002	T	6	6	516734	516739	0 %	100 %	0 %	0 %	294495177
10118	NC_014002	AG	3	6	516741	516746	50 %	0 %	50 %	0 %	294495177
10119	NC_014002	ATG	2	6	516764	516769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495177
10120	NC_014002	CTT	2	6	516807	516812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_014002	T	7	7	516811	516817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_014002	ATT	2	6	516820	516825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_014002	AGA	2	6	516837	516842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_014002	TA	4	8	516979	516986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_014002	AGG	2	6	517051	517056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_014002	AGA	2	6	517073	517078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_014002	AAGA	2	8	517116	517123	75 %	0 %	25 %	0 %	294495178
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10131	NC_014002	ATGA	2	8	517203	517210	50 %	25 %	25 %	0 %	294495178
10132	NC_014002	TTCC	2	8	517242	517249	0 %	50 %	0 %	50 %	294495178
10133	NC_014002	ATG	2	6	517257	517262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495178
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10141	NC_014002	TTCC	2	8	517986	517993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10142	NC_014002	ATG	2	6	518012	518017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10146	NC_014002	GCA	2	6	518305	518310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10148	NC_014002	CAC	2	6	518529	518534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10150	NC_014002	TCC	2	6	518594	518599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10151	NC_014002	ATGGGT	2	12	518675	518686	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10152	NC_014002	TGG	2	6	518689	518694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10153	NC_014002	CCA	2	6	518714	518719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10154	NC_014002	TA	3	6	518776	518781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_014002	TTG	2	6	518865	518870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10156	NC_014002	CTG	2	6	519085	519090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10158	NC_014002	GTG	2	6	519187	519192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10212	NC_014002	AT	3	6	522830	522835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10213	NC_014002	AGA	2	6	522925	522930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495183
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10235	NC_014002	GA	3	6	523556	523561	50 %	0 %	50 %	0 %	294495183
10236	NC_014002	CCGCAT	2	12	523613	523624	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	294495183
10237	NC_014002	TGC	2	6	523653	523658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495183
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10240	NC_014002	TGTC	2	8	523853	523860	0 %	50 %	25 %	25 %	294495183
10241	NC_014002	GAA	2	6	523871	523876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495183
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10365	NC_014002	T	6	6	530314	530319	0 %	100 %	0 %	0 %	294495192
10366	NC_014002	AT	3	6	530329	530334	50 %	50 %	0 %	0 %	294495192
10367	NC_014002	ACA	2	6	530444	530449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495192
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10382	NC_014002	TG	3	6	531111	531116	0 %	50 %	50 %	0 %	294495193
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10394	NC_014002	TGA	2	6	531744	531749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495194
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10488	NC_014002	GAA	2	6	537587	537592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495200
10489	NC_014002	GAT	2	6	537625	537630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495200
10490	NC_014002	AAC	2	6	537640	537645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495200
10491	NC_014002	GCAG	2	8	537673	537680	25 %	0 %	50 %	25 %	294495200
10492	NC_014002	TGAT	2	8	537732	537739	25 %	50 %	25 %	0 %	294495200
10493	NC_014002	TATG	2	8	537832	537839	25 %	50 %	25 %	0 %	294495200
10494	NC_014002	CTC	2	6	537849	537854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495200
10495	NC_014002	GAT	2	6	537905	537910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495200
10496	NC_014002	CTGAA	2	10	537945	537954	40 %	20 %	20 %	20 %	294495200
10497	NC_014002	T	7	7	538009	538015	0 %	100 %	0 %	0 %	294495200
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10500	NC_014002	AAT	2	6	538208	538213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495200

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