MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_014002	TAA	2	6	460961	460966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495122
9003	NC_014002	TAG	2	6	460975	460980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495122
9004	NC_014002	CTA	2	6	461017	461022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495122
9005	NC_014002	AT	3	6	461131	461136	50 %	50 %	0 %	0 %	294495122
9006	NC_014002	GA	3	6	461140	461145	50 %	0 %	50 %	0 %	294495122
9007	NC_014002	CAC	2	6	461213	461218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495122
9008	NC_014002	GAA	2	6	461232	461237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495122
9009	NC_014002	T	6	6	461305	461310	0 %	100 %	0 %	0 %	294495123
9010	NC_014002	ACT	2	6	461318	461323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495123
9011	NC_014002	TG	3	6	461453	461458	0 %	50 %	50 %	0 %	294495123
9012	NC_014002	GCAG	2	8	461521	461528	25 %	0 %	50 %	25 %	294495123
9013	NC_014002	TAT	2	6	461555	461560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495123
9014	NC_014002	TCT	2	6	461622	461627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495123
9015	NC_014002	GGT	2	6	461891	461896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495123
9016	NC_014002	TGA	2	6	461944	461949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495123
9017	NC_014002	GGT	2	6	462071	462076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495123
9018	NC_014002	AGGG	2	8	462101	462108	25 %	0 %	75 %	0 %	294495123
9019	NC_014002	GCA	2	6	462134	462139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495123
9020	NC_014002	GCA	2	6	462167	462172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495123
9021	NC_014002	AGGA	2	8	462201	462208	50 %	0 %	50 %	0 %	294495123
9022	NC_014002	A	6	6	462248	462253	100 %	0 %	0 %	0 %	294495123
9023	NC_014002	TGA	2	6	462303	462308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495123
9024	NC_014002	GA	3	6	462359	462364	50 %	0 %	50 %	0 %	294495123
9025	NC_014002	TGC	2	6	462369	462374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495123
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9027	NC_014002	GAA	2	6	462428	462433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495123
9028	NC_014002	GGT	2	6	462445	462450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495123
9029	NC_014002	CGATT	2	10	462560	462569	20 %	40 %	20 %	20 %	294495124
9030	NC_014002	GCA	2	6	462612	462617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495124
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9032	NC_014002	TGG	2	6	462682	462687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495124
9033	NC_014002	TCCGG	2	10	462735	462744	0 %	20 %	40 %	40 %	294495124
9034	NC_014002	ATGG	2	8	462747	462754	25 %	25 %	50 %	0 %	294495124
9035	NC_014002	TGA	2	6	462769	462774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495124
9036	NC_014002	TGC	2	6	462917	462922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495124
9037	NC_014002	AGT	2	6	462941	462946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495124
9038	NC_014002	CTG	2	6	462985	462990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495124
9039	NC_014002	TTG	3	9	463105	463113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495124
9040	NC_014002	TGCC	2	8	463171	463178	0 %	25 %	25 %	50 %	294495124
9041	NC_014002	AT	3	6	463193	463198	50 %	50 %	0 %	0 %	294495124
9042	NC_014002	GCT	2	6	463203	463208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495124
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9044	NC_014002	TGC	2	6	463250	463255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495124
9045	NC_014002	AG	3	6	463266	463271	50 %	0 %	50 %	0 %	294495124
9046	NC_014002	GCCA	2	8	463281	463288	25 %	0 %	25 %	50 %	294495124
9047	NC_014002	ATGT	2	8	463399	463406	25 %	50 %	25 %	0 %	294495124
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9051	NC_014002	TTC	2	6	463658	463663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495125
9052	NC_014002	TCA	2	6	463687	463692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495125
9053	NC_014002	CAA	2	6	463742	463747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495125
9054	NC_014002	TGG	2	6	463828	463833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495125
9055	NC_014002	GGC	2	6	463866	463871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294495125
9056	NC_014002	CAT	2	6	463880	463885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495125
9057	NC_014002	TGG	2	6	463905	463910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_014002	A	6	6	463986	463991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_014002	A	7	7	464081	464087	100 %	0 %	0 %	0 %	294495126
9060	NC_014002	TGA	2	6	464090	464095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495126
9061	NC_014002	GCA	2	6	464136	464141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495126
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9063	NC_014002	ATGT	2	8	464446	464453	25 %	50 %	25 %	0 %	294495126
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9065	NC_014002	TATTTT	2	12	464568	464579	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_014002	TAT	2	6	464635	464640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_014002	ATT	2	6	464681	464686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495127
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9069	NC_014002	GAAGTG	2	12	464779	464790	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	294495127
9070	NC_014002	TGA	2	6	464940	464945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495127
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9088	NC_014002	TCTT	2	8	466336	466343	0 %	75 %	0 %	25 %	294495128
9089	NC_014002	GA	3	6	466397	466402	50 %	0 %	50 %	0 %	294495128
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9104	NC_014002	CAGGGT	2	12	467144	467155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294495130
9105	NC_014002	CAG	2	6	467158	467163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495130
9106	NC_014002	GCA	2	6	467220	467225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495130
9107	NC_014002	TC	3	6	467232	467237	0 %	50 %	0 %	50 %	294495130
9108	NC_014002	GAA	2	6	467240	467245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294495130
9109	NC_014002	CAG	2	6	467306	467311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495130
9110	NC_014002	AGGC	2	8	467447	467454	25 %	0 %	50 %	25 %	294495130
9111	NC_014002	TAC	2	6	467543	467548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495130
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9115	NC_014002	TCT	2	6	467758	467763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495130
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9118	NC_014002	TTCC	2	8	467995	468002	0 %	50 %	0 %	50 %	294495130
9119	NC_014002	ACC	2	6	468012	468017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294495130
9120	NC_014002	CTG	2	6	468022	468027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495130
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9499	NC_014002	AGC	3	9	485886	485894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495146
9500	NC_014002	AATT	2	8	485997	486004	50 %	50 %	0 %	0 %	294495147

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