MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014002	TTCCTC	2	12	411912	411923	0 %	50 %	0 %	50 %	294495078
8002	NC_014002	TGC	2	6	411931	411936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495078
8003	NC_014002	ATCT	2	8	412023	412030	25 %	50 %	0 %	25 %	294495078
8004	NC_014002	TGG	2	6	412058	412063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495078
8005	NC_014002	CCTTT	2	10	412143	412152	0 %	60 %	0 %	40 %	294495078
8006	NC_014002	AGC	2	6	412155	412160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495078
8007	NC_014002	TCCTTT	2	12	412162	412173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495078
8008	NC_014002	CTTC	2	8	412181	412188	0 %	50 %	0 %	50 %	294495078
8009	NC_014002	TGC	2	6	412269	412274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495078
8010	NC_014002	CAG	2	6	412281	412286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495078
8011	NC_014002	CGG	2	6	412340	412345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294495078
8012	NC_014002	GCA	2	6	412480	412485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495078
8013	NC_014002	TCA	2	6	412510	412515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495078
8014	NC_014002	GGT	2	6	412518	412523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495078
8015	NC_014002	TGCAG	2	10	412532	412541	20 %	20 %	40 %	20 %	294495078
8016	NC_014002	GCTCCT	2	12	412600	412611	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	294495078
8017	NC_014002	CTT	2	6	412667	412672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495078
8018	NC_014002	CTA	2	6	412724	412729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495078
8019	NC_014002	TTC	2	6	412762	412767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495078
8020	NC_014002	T	6	6	412786	412791	0 %	100 %	0 %	0 %	294495078
8021	NC_014002	CAA	2	6	412814	412819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495078
8022	NC_014002	TTC	2	6	412864	412869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495078
8023	NC_014002	GCG	2	6	412872	412877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294495078
8024	NC_014002	TCC	2	6	412996	413001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495078
8025	NC_014002	GTT	2	6	413060	413065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495078
8026	NC_014002	TCA	2	6	413155	413160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495078
8027	NC_014002	GCA	2	6	413182	413187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495078
8028	NC_014002	GTT	2	6	413279	413284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294495078
8029	NC_014002	TC	3	6	413313	413318	0 %	50 %	0 %	50 %	294495078
8030	NC_014002	AATC	2	8	413378	413385	50 %	25 %	0 %	25 %	294495078
8031	NC_014002	TGA	2	6	413389	413394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495078
8032	NC_014002	GCA	2	6	413404	413409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495078
8033	NC_014002	CCT	2	6	413432	413437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495078
8034	NC_014002	TG	3	6	413446	413451	0 %	50 %	50 %	0 %	294495078
8035	NC_014002	ATT	2	6	413454	413459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495078
8036	NC_014002	TCC	2	6	413474	413479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_014002	ATT	2	6	413480	413485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_014002	TTC	2	6	413536	413541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_014002	A	7	7	413561	413567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_014002	ATT	3	9	413605	413613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495079
8041	NC_014002	ACT	2	6	413716	413721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495079
8042	NC_014002	GGTCG	2	10	413724	413733	0 %	20 %	60 %	20 %	294495079
8043	NC_014002	CTT	2	6	413789	413794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495079
8044	NC_014002	TCCT	2	8	413832	413839	0 %	50 %	0 %	50 %	294495079
8045	NC_014002	TG	3	6	413849	413854	0 %	50 %	50 %	0 %	294495079
8046	NC_014002	TCT	2	6	413914	413919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495079
8047	NC_014002	T	6	6	413930	413935	0 %	100 %	0 %	0 %	294495079
8048	NC_014002	CTC	2	6	413966	413971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495079
8049	NC_014002	ACT	2	6	413980	413985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495079
8050	NC_014002	CGG	2	6	413996	414001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294495079
8051	NC_014002	TCG	2	6	414022	414027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495079
8052	NC_014002	TCT	2	6	414035	414040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495079
8053	NC_014002	TTC	2	6	414042	414047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495079
8054	NC_014002	TTCGGT	2	12	414051	414062	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	294495079
8055	NC_014002	GCA	2	6	414064	414069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495079
8056	NC_014002	GCCAC	2	10	414085	414094	20 %	0 %	20 %	60 %	294495079
8057	NC_014002	TCT	2	6	414113	414118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495079
8058	NC_014002	CTT	3	9	414126	414134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495079
8059	NC_014002	GAT	2	6	414216	414221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495079
8060	NC_014002	AGT	2	6	414222	414227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495079
8061	NC_014002	TCG	2	6	414271	414276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294495079
8062	NC_014002	ACA	2	6	414313	414318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294495079
8063	NC_014002	GGC	2	6	414333	414338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294495079
8064	NC_014002	ATA	2	6	414415	414420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495079
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8073	NC_014002	TCA	2	6	414748	414753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495079
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8081	NC_014002	TAG	2	6	415202	415207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495079
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8084	NC_014002	TCCATT	2	12	415287	415298	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294495080
8085	NC_014002	TCA	2	6	415299	415304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294495080
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8087	NC_014002	GAT	2	6	415322	415327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495080
8088	NC_014002	T	6	6	415337	415342	0 %	100 %	0 %	0 %	294495080
8089	NC_014002	CTT	2	6	415393	415398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495080
8090	NC_014002	T	6	6	415397	415402	0 %	100 %	0 %	0 %	294495080
8091	NC_014002	TCC	2	6	415433	415438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495080
8092	NC_014002	CCT	2	6	415447	415452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495080
8093	NC_014002	TCC	2	6	415510	415515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8094	NC_014002	GACT	2	8	415528	415535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8095	NC_014002	TGG	2	6	415556	415561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_014002	ATA	2	6	415564	415569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_014002	TA	3	6	415642	415647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_014002	ATC	2	6	415662	415667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_014002	ATT	2	6	415684	415689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294495081
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8101	NC_014002	TC	3	6	415881	415886	0 %	50 %	0 %	50 %	294495081
8102	NC_014002	G	7	7	415961	415967	0 %	0 %	100 %	0 %	294495081
8103	NC_014002	GCA	2	6	415978	415983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495081
8104	NC_014002	TGA	2	6	416019	416024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495081
8105	NC_014002	AAT	2	6	416079	416084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294495081
8106	NC_014002	TTC	2	6	416136	416141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_014002	TTTAT	2	10	416152	416161	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_014002	ATT	2	6	416222	416227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_014002	A	6	6	416305	416310	100 %	0 %	0 %	0 %	294495082
8110	NC_014002	AT	3	6	416315	416320	50 %	50 %	0 %	0 %	294495082
8111	NC_014002	TC	3	6	416333	416338	0 %	50 %	0 %	50 %	294495082
8112	NC_014002	A	6	6	416444	416449	100 %	0 %	0 %	0 %	294495082
8113	NC_014002	AT	3	6	416538	416543	50 %	50 %	0 %	0 %	294495082
8114	NC_014002	GTA	3	9	416566	416574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495082
8115	NC_014002	T	7	7	416580	416586	0 %	100 %	0 %	0 %	294495082
8116	NC_014002	AGC	2	6	416587	416592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294495082
8117	NC_014002	ACAGG	2	10	416707	416716	40 %	0 %	40 %	20 %	294495082
8118	NC_014002	AC	3	6	416869	416874	50 %	0 %	0 %	50 %	294495082
8119	NC_014002	GGT	2	6	416907	416912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495082
8120	NC_014002	GAAG	2	8	416923	416930	50 %	0 %	50 %	0 %	294495082
8121	NC_014002	AT	3	6	416984	416989	50 %	50 %	0 %	0 %	294495082
8122	NC_014002	GGT	2	6	417019	417024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294495082
8123	NC_014002	ACTG	2	8	417073	417080	25 %	25 %	25 %	25 %	294495083
8124	NC_014002	CTT	2	6	417159	417164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294495083
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