MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_013946	GCC	2	6	1991184	1991189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296312
44002	NC_013946	AAG	2	6	1991374	1991379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296312
44003	NC_013946	GAG	2	6	1991385	1991390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296312
44004	NC_013946	TGC	2	6	1991443	1991448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296312
44005	NC_013946	AAG	2	6	1991508	1991513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296312
44006	NC_013946	GCC	2	6	1991514	1991519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296312
44007	NC_013946	CAT	2	6	1991552	1991557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296312
44008	NC_013946	CGA	2	6	1991570	1991575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296312
44009	NC_013946	GAA	2	6	1991619	1991624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296312
44010	NC_013946	CCG	2	6	1991635	1991640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296312
44011	NC_013946	TGC	2	6	1991731	1991736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296312
44012	NC_013946	GCAAGG	2	12	1991737	1991748	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	291296312
44013	NC_013946	GAC	2	6	1991790	1991795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296312
44014	NC_013946	CTG	2	6	1991832	1991837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296312
44015	NC_013946	AGGA	2	8	1991857	1991864	50 %	0 %	50 %	0 %	291296312
44016	NC_013946	GCCA	2	8	1991877	1991884	25 %	0 %	25 %	50 %	291296312
44017	NC_013946	ATTG	2	8	1991980	1991987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44018	NC_013946	GCT	2	6	1992139	1992144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296313
44019	NC_013946	GCCAAG	2	12	1992149	1992160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296313
44020	NC_013946	TGG	2	6	1992183	1992188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296313
44021	NC_013946	CCCA	2	8	1992249	1992256	25 %	0 %	0 %	75 %	291296313
44022	NC_013946	C	7	7	1992263	1992269	0 %	0 %	0 %	100 %	291296313
44023	NC_013946	CGG	2	6	1992310	1992315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296313
44024	NC_013946	CCA	2	6	1992321	1992326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44025	NC_013946	GCCA	2	8	1992341	1992348	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44026	NC_013946	CTC	2	6	1992368	1992373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44027	NC_013946	GCC	2	6	1992395	1992400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44028	NC_013946	TTC	2	6	1992472	1992477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296314
44029	NC_013946	TGC	2	6	1992550	1992555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296314
44030	NC_013946	CCG	2	6	1992556	1992561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296314
44031	NC_013946	CAT	2	6	1992746	1992751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296314
44032	NC_013946	CAG	2	6	1992780	1992785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296314
44033	NC_013946	ACC	2	6	1992858	1992863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296314
44034	NC_013946	AGC	2	6	1992880	1992885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296314
44035	NC_013946	GCC	2	6	1992909	1992914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296314
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44037	NC_013946	GAG	2	6	1993080	1993085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296314
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44039	NC_013946	GTG	2	6	1993119	1993124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296314
44040	NC_013946	CGG	2	6	1993172	1993177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296314
44041	NC_013946	TGC	2	6	1993234	1993239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296314
44042	NC_013946	CAGG	2	8	1993329	1993336	25 %	0 %	50 %	25 %	291296314
44043	NC_013946	TTG	2	6	1993353	1993358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296314
44044	NC_013946	CTA	2	6	1993376	1993381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296314
44045	NC_013946	TGG	2	6	1993399	1993404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296314
44046	NC_013946	CTG	3	9	1993434	1993442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296314
44047	NC_013946	GCT	2	6	1993454	1993459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296314
44048	NC_013946	CACCCT	2	12	1993466	1993477	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	291296314
44049	NC_013946	AAG	2	6	1993572	1993577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296314
44050	NC_013946	GGC	2	6	1993596	1993601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296314
44051	NC_013946	CAT	2	6	1993613	1993618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296314
44052	NC_013946	CTG	2	6	1993647	1993652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296314
44053	NC_013946	GCC	2	6	1993659	1993664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296314
44054	NC_013946	GTG	2	6	1993722	1993727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296314
44055	NC_013946	TCT	2	6	1993735	1993740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296314
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44057	NC_013946	CCTC	2	8	1993864	1993871	0 %	25 %	0 %	75 %	291296314
44058	NC_013946	CGG	2	6	1993937	1993942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296314
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44064	NC_013946	CCTC	2	8	1994530	1994537	0 %	25 %	0 %	75 %	291296314
44065	NC_013946	CCA	2	6	1994539	1994544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296314
44066	NC_013946	TGC	2	6	1994545	1994550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296314
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44078	NC_013946	GGCT	2	8	1994782	1994789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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44083	NC_013946	CATAGC	2	12	1994982	1994993	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291296315
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44089	NC_013946	C	6	6	1995299	1995304	0 %	0 %	0 %	100 %	291296315
44090	NC_013946	TGG	2	6	1995311	1995316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296315
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44101	NC_013946	C	6	6	1996180	1996185	0 %	0 %	0 %	100 %	291296315
44102	NC_013946	ACG	2	6	1996325	1996330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296315
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44105	NC_013946	GGCC	2	8	1996679	1996686	0 %	0 %	50 %	50 %	291296316
44106	NC_013946	AGC	2	6	1996690	1996695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296316
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44108	NC_013946	G	6	6	1996767	1996772	0 %	0 %	100 %	0 %	291296316
44109	NC_013946	CTC	2	6	1996782	1996787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296316
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44112	NC_013946	GCTG	2	8	1996812	1996819	0 %	25 %	50 %	25 %	291296316
44113	NC_013946	CAC	2	6	1996952	1996957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296316
44114	NC_013946	AC	3	6	1996956	1996961	50 %	0 %	0 %	50 %	291296316
44115	NC_013946	CAC	2	6	1997027	1997032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296316
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44117	NC_013946	CAC	2	6	1997102	1997107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296316
44118	NC_013946	CAC	2	6	1997129	1997134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296316
44119	NC_013946	GGC	2	6	1997174	1997179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296316
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44471	NC_013946	CGG	2	6	2013135	2013140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296334
44472	NC_013946	CTC	2	6	2013145	2013150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296334
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44475	NC_013946	CCG	2	6	2013271	2013276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296335
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44477	NC_013946	GCT	2	6	2013389	2013394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296335
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44499	NC_013946	G	7	7	2014409	2014415	0 %	0 %	100 %	0 %	291296337
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