MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43502	NC_013946	GTCTT	2	10	1967597	1967606	0 %	60 %	20 %	20 %	291296286
43503	NC_013946	GTA	2	6	1967635	1967640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296286
43504	NC_013946	GCC	2	6	1967677	1967682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43505	NC_013946	A	6	6	1967699	1967704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43506	NC_013946	CTT	2	6	1967737	1967742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296287
43507	NC_013946	CGC	2	6	1967766	1967771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296287
43508	NC_013946	GTT	2	6	1967839	1967844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296287
43509	NC_013946	TGG	2	6	1967850	1967855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296287
43510	NC_013946	GAT	2	6	1967875	1967880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296287
43511	NC_013946	CTC	2	6	1967947	1967952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296287
43512	NC_013946	TAA	2	6	1968024	1968029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291296287
43513	NC_013946	GCT	2	6	1968048	1968053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296287
43514	NC_013946	TCG	2	6	1968077	1968082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296287
43515	NC_013946	ACC	2	6	1968089	1968094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296287
43516	NC_013946	CAGCC	2	10	1968172	1968181	20 %	0 %	20 %	60 %	291296287
43517	NC_013946	CGCC	2	8	1968263	1968270	0 %	0 %	25 %	75 %	291296288
43518	NC_013946	C	6	6	1968313	1968318	0 %	0 %	0 %	100 %	291296288
43519	NC_013946	CCGGG	2	10	1968374	1968383	0 %	0 %	60 %	40 %	291296288
43520	NC_013946	CCT	2	6	1968395	1968400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296288
43521	NC_013946	GTT	2	6	1968564	1968569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296288
43522	NC_013946	GCCATC	2	12	1968642	1968653	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291296288
43523	NC_013946	GCC	2	6	1968688	1968693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296288
43524	NC_013946	TGG	2	6	1968833	1968838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296288
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43526	NC_013946	GGGCTT	2	12	1968879	1968890	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291296288
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43529	NC_013946	CAC	2	6	1969002	1969007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296288
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43533	NC_013946	GTG	2	6	1969152	1969157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296288
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43535	NC_013946	GGGT	2	8	1969213	1969220	0 %	25 %	75 %	0 %	291296288
43536	NC_013946	CCGGG	2	10	1969487	1969496	0 %	0 %	60 %	40 %	291296288
43537	NC_013946	CAC	2	6	1969599	1969604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296288
43538	NC_013946	CCT	2	6	1969610	1969615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296288
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43542	NC_013946	C	6	6	1969870	1969875	0 %	0 %	0 %	100 %	291296288
43543	NC_013946	GGC	3	9	1969926	1969934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296288
43544	NC_013946	CT	3	6	1969946	1969951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43545	NC_013946	C	6	6	1969965	1969970	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43546	NC_013946	G	6	6	1969979	1969984	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43547	NC_013946	C	6	6	1970023	1970028	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43548	NC_013946	GCT	2	6	1970069	1970074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43549	NC_013946	GC	3	6	1970160	1970165	0 %	0 %	50 %	50 %	291296289
43550	NC_013946	AATA	2	8	1970211	1970218	75 %	25 %	0 %	0 %	291296289
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43552	NC_013946	CCAC	2	8	1970423	1970430	25 %	0 %	0 %	75 %	291296289
43553	NC_013946	CCGC	2	8	1970432	1970439	0 %	0 %	25 %	75 %	291296289
43554	NC_013946	TGGA	2	8	1970476	1970483	25 %	25 %	50 %	0 %	291296289
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43557	NC_013946	CGC	2	6	1970579	1970584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296289
43558	NC_013946	GCC	2	6	1970599	1970604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296289
43559	NC_013946	ACC	4	12	1970629	1970640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296289
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43561	NC_013946	GTA	2	6	1970730	1970735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296289
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43564	NC_013946	TCGCGG	2	12	1970782	1970793	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291296289
43565	NC_013946	GGTC	2	8	1970828	1970835	0 %	25 %	50 %	25 %	291296289
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43568	NC_013946	C	6	6	1970943	1970948	0 %	0 %	0 %	100 %	291296289
43569	NC_013946	A	6	6	1970973	1970978	100 %	0 %	0 %	0 %	291296289
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43572	NC_013946	GGC	2	6	1971204	1971209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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43587	NC_013946	GCC	2	6	1972014	1972019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296290
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43600	NC_013946	TGA	2	6	1972821	1972826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296291
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43602	NC_013946	A	6	6	1972916	1972921	100 %	0 %	0 %	0 %	291296291
43603	NC_013946	CA	3	6	1972990	1972995	50 %	0 %	0 %	50 %	291296291
43604	NC_013946	A	6	6	1973064	1973069	100 %	0 %	0 %	0 %	291296292
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43606	NC_013946	CAA	2	6	1973129	1973134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296292
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