MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_013946	CAC	2	6	1943954	1943959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296263
43003	NC_013946	CGG	2	6	1943977	1943982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296263
43004	NC_013946	GCT	2	6	1944046	1944051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296263
43005	NC_013946	GCA	2	6	1944061	1944066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296263
43006	NC_013946	GGCAG	2	10	1944106	1944115	20 %	0 %	60 %	20 %	291296263
43007	NC_013946	CAC	2	6	1944191	1944196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296263
43008	NC_013946	CCA	3	9	1944202	1944210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296263
43009	NC_013946	TCA	2	6	1944393	1944398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296264
43010	NC_013946	GAT	2	6	1944451	1944456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296264
43011	NC_013946	CAGGTT	2	12	1944493	1944504	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291296264
43012	NC_013946	GCT	2	6	1944594	1944599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296264
43013	NC_013946	CCCG	2	8	1944604	1944611	0 %	0 %	25 %	75 %	291296264
43014	NC_013946	CCA	2	6	1944651	1944656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296264
43015	NC_013946	GGCCCT	2	12	1944673	1944684	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291296264
43016	NC_013946	TCA	2	6	1944705	1944710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296264
43017	NC_013946	GCA	2	6	1944720	1944725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296264
43018	NC_013946	CAG	2	6	1944865	1944870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296264
43019	NC_013946	GCA	2	6	1944873	1944878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296264
43020	NC_013946	GGT	2	6	1944880	1944885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296264
43021	NC_013946	TGA	2	6	1944915	1944920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296264
43022	NC_013946	CAT	2	6	1945060	1945065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296264
43023	NC_013946	GCCCA	2	10	1945110	1945119	20 %	0 %	20 %	60 %	291296265
43024	NC_013946	T	6	6	1945175	1945180	0 %	100 %	0 %	0 %	291296265
43025	NC_013946	AGC	2	6	1945264	1945269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296265
43026	NC_013946	GCC	2	6	1945285	1945290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296265
43027	NC_013946	C	6	6	1945289	1945294	0 %	0 %	0 %	100 %	291296265
43028	NC_013946	A	6	6	1945326	1945331	100 %	0 %	0 %	0 %	291296265
43029	NC_013946	ACC	2	6	1945363	1945368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296265
43030	NC_013946	TGC	2	6	1945404	1945409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296265
43031	NC_013946	CT	3	6	1945428	1945433	0 %	50 %	0 %	50 %	291296265
43032	NC_013946	AGCC	2	8	1945434	1945441	25 %	0 %	25 %	50 %	291296265
43033	NC_013946	CGC	2	6	1945599	1945604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296265
43034	NC_013946	GC	3	6	1945603	1945608	0 %	0 %	50 %	50 %	291296265
43035	NC_013946	CCG	2	6	1945643	1945648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296265
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43037	NC_013946	GCATC	2	10	1945715	1945724	20 %	20 %	20 %	40 %	291296265
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43040	NC_013946	CAGCAC	2	12	1945861	1945872	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	291296266
43041	NC_013946	C	7	7	1945894	1945900	0 %	0 %	0 %	100 %	291296266
43042	NC_013946	CGC	2	6	1945949	1945954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296267
43043	NC_013946	CAC	2	6	1946023	1946028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296267
43044	NC_013946	GCCG	2	8	1946034	1946041	0 %	0 %	50 %	50 %	291296267
43045	NC_013946	GTT	2	6	1946074	1946079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296267
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43051	NC_013946	CCACC	2	10	1946469	1946478	20 %	0 %	0 %	80 %	291296267
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43054	NC_013946	CG	3	6	1946642	1946647	0 %	0 %	50 %	50 %	291296267
43055	NC_013946	CAG	2	6	1946716	1946721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296267
43056	NC_013946	TGC	2	6	1946726	1946731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296267
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43059	NC_013946	AAG	2	6	1946834	1946839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296267
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43061	NC_013946	TCG	2	6	1947008	1947013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296267
43062	NC_013946	GCA	2	6	1947025	1947030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296267
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43067	NC_013946	T	6	6	1947290	1947295	0 %	100 %	0 %	0 %	291296267
43068	NC_013946	GA	3	6	1947365	1947370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43069	NC_013946	GCTC	2	8	1947389	1947396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43070	NC_013946	CGCTT	2	10	1947401	1947410	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43071	NC_013946	GTT	2	6	1947426	1947431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43085	NC_013946	CCG	2	6	1948170	1948175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296268
43086	NC_013946	ATG	2	6	1948215	1948220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296268
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43101	NC_013946	GCCA	2	8	1948773	1948780	25 %	0 %	25 %	50 %	291296268
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43109	NC_013946	CA	3	6	1949179	1949184	50 %	0 %	0 %	50 %	291296269
43110	NC_013946	C	6	6	1949204	1949209	0 %	0 %	0 %	100 %	291296269
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43113	NC_013946	T	6	6	1949260	1949265	0 %	100 %	0 %	0 %	291296269
43114	NC_013946	ACTCGT	2	12	1949271	1949282	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291296269
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43117	NC_013946	ACC	3	9	1949396	1949404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296269
43118	NC_013946	GCAGA	2	10	1949418	1949427	40 %	0 %	40 %	20 %	291296269
43119	NC_013946	CTC	2	6	1949476	1949481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296269
43120	NC_013946	AGCCC	2	10	1949508	1949517	20 %	0 %	20 %	60 %	291296269
43121	NC_013946	CGT	2	6	1949535	1949540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296269
43122	NC_013946	CCT	2	6	1949553	1949558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296269
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43125	NC_013946	GCA	2	6	1949658	1949663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296269
43126	NC_013946	GAT	2	6	1949665	1949670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296269
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43128	NC_013946	T	6	6	1949791	1949796	0 %	100 %	0 %	0 %	291296269
43129	NC_013946	ATG	2	6	1949879	1949884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296269
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43131	NC_013946	CTC	2	6	1949926	1949931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296269
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43140	NC_013946	TA	3	6	1950442	1950447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43141	NC_013946	A	6	6	1950480	1950485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43142	NC_013946	CTG	3	9	1950501	1950509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43143	NC_013946	GTT	2	6	1950525	1950530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43144	NC_013946	CTG	3	9	1950537	1950545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43145	NC_013946	GTTC	2	8	1950551	1950558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43146	NC_013946	GCA	2	6	1950603	1950608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296270
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43149	NC_013946	GCTT	2	8	1950838	1950845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43150	NC_013946	AGGC	2	8	1950854	1950861	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43151	NC_013946	TA	3	6	1950944	1950949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43152	NC_013946	CCG	2	6	1950961	1950966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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43155	NC_013946	CAC	3	9	1951064	1951072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296271
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43162	NC_013946	GCCCGG	2	12	1951272	1951283	0 %	0 %	50 %	50 %	291296271
43163	NC_013946	CGA	2	6	1951358	1951363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296271
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43224	NC_013946	CAG	2	6	1954614	1954619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296273
43225	NC_013946	CAG	2	6	1954623	1954628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296273
43226	NC_013946	CCCCCA	2	12	1954634	1954645	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	291296273
43227	NC_013946	CCG	2	6	1954823	1954828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296273
43228	NC_013946	GGC	2	6	1954908	1954913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296273
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43230	NC_013946	ATC	2	6	1954951	1954956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296273
43231	NC_013946	A	6	6	1954983	1954988	100 %	0 %	0 %	0 %	291296273
43232	NC_013946	GCC	2	6	1955002	1955007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296273
43233	NC_013946	ACC	2	6	1955029	1955034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296273
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43235	NC_013946	C	6	6	1955191	1955196	0 %	0 %	0 %	100 %	291296274
43236	NC_013946	C	6	6	1955245	1955250	0 %	0 %	0 %	100 %	291296274
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43335	NC_013946	A	6	6	1959961	1959966	100 %	0 %	0 %	0 %	291296278
43336	NC_013946	TACC	2	8	1959993	1960000	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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43343	NC_013946	CTG	2	6	1960180	1960185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296279
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43469	NC_013946	TGA	2	6	1966054	1966059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296285
43470	NC_013946	GGT	2	6	1966091	1966096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296285
43471	NC_013946	TGG	3	9	1966111	1966119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296285
43472	NC_013946	CGAAGT	2	12	1966156	1966167	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291296285
43473	NC_013946	CGT	2	6	1966201	1966206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296285
43474	NC_013946	TCC	2	6	1966257	1966262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296285
43475	NC_013946	GCA	2	6	1966273	1966278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296285
43476	NC_013946	GCC	2	6	1966347	1966352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296285
43477	NC_013946	CGG	2	6	1966417	1966422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296285
43478	NC_013946	AC	3	6	1966434	1966439	50 %	0 %	0 %	50 %	291296285
43479	NC_013946	GAT	2	6	1966478	1966483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296285
43480	NC_013946	CTG	2	6	1966526	1966531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296285
43481	NC_013946	GGT	2	6	1966574	1966579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296285
43482	NC_013946	CTTC	2	8	1966644	1966651	0 %	50 %	0 %	50 %	291296286
43483	NC_013946	CAT	2	6	1966675	1966680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296286
43484	NC_013946	GGT	2	6	1966713	1966718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296286
43485	NC_013946	AGT	2	6	1966725	1966730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296286
43486	NC_013946	CAC	2	6	1966759	1966764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296286
43487	NC_013946	CTG	2	6	1966798	1966803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296286
43488	NC_013946	GCA	2	6	1966812	1966817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296286
43489	NC_013946	CGG	2	6	1966887	1966892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296286
43490	NC_013946	G	6	6	1966990	1966995	0 %	0 %	100 %	0 %	291296286
43491	NC_013946	CCA	2	6	1967007	1967012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296286
43492	NC_013946	CGG	2	6	1967025	1967030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296286
43493	NC_013946	GGTC	2	8	1967079	1967086	0 %	25 %	50 %	25 %	291296286
43494	NC_013946	GGT	2	6	1967104	1967109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296286
43495	NC_013946	GCC	2	6	1967131	1967136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296286
43496	NC_013946	CCA	2	6	1967199	1967204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296286
43497	NC_013946	CCA	2	6	1967268	1967273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296286
43498	NC_013946	CGCGG	2	10	1967289	1967298	0 %	0 %	60 %	40 %	291296286
43499	NC_013946	CTTC	2	8	1967352	1967359	0 %	50 %	0 %	50 %	291296286
43500	NC_013946	ATC	2	6	1967417	1967422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296286

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