MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_013946	CGGTGG	2	12	1854866	1854877	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	291296184
41002	NC_013946	GCT	2	6	1854905	1854910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296184
41003	NC_013946	GC	3	6	1855104	1855109	0 %	0 %	50 %	50 %	291296184
41004	NC_013946	A	6	6	1855143	1855148	100 %	0 %	0 %	0 %	291296184
41005	NC_013946	GGTC	2	8	1855220	1855227	0 %	25 %	50 %	25 %	291296184
41006	NC_013946	C	6	6	1855250	1855255	0 %	0 %	0 %	100 %	291296184
41007	NC_013946	CGA	2	6	1855340	1855345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296184
41008	NC_013946	CGT	2	6	1855364	1855369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296184
41009	NC_013946	ATG	2	6	1855433	1855438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41010	NC_013946	CTTG	2	8	1855494	1855501	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41011	NC_013946	CAATA	2	10	1855505	1855514	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41012	NC_013946	GCA	2	6	1855591	1855596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41013	NC_013946	CAA	2	6	1855604	1855609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41014	NC_013946	CAA	2	6	1855613	1855618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41015	NC_013946	GTG	2	6	1855682	1855687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41016	NC_013946	CAGC	2	8	1855732	1855739	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41017	NC_013946	AGG	2	6	1855793	1855798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41018	NC_013946	TGAGGT	2	12	1855883	1855894	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291296185
41019	NC_013946	GCACT	2	10	1856029	1856038	20 %	20 %	20 %	40 %	291296185
41020	NC_013946	TGGG	2	8	1856113	1856120	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41021	NC_013946	AG	3	6	1856158	1856163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41022	NC_013946	AGG	2	6	1856194	1856199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41023	NC_013946	TGA	2	6	1856224	1856229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296186
41024	NC_013946	G	6	6	1856311	1856316	0 %	0 %	100 %	0 %	291296186
41025	NC_013946	GACC	2	8	1856399	1856406	25 %	0 %	25 %	50 %	291296186
41026	NC_013946	GCG	3	9	1856466	1856474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296186
41027	NC_013946	TGGCCG	2	12	1856476	1856487	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291296186
41028	NC_013946	GCA	2	6	1856575	1856580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296186
41029	NC_013946	TGA	2	6	1856632	1856637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296186
41030	NC_013946	GATG	2	8	1856762	1856769	25 %	25 %	50 %	0 %	291296186
41031	NC_013946	CGG	3	9	1856788	1856796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296186
41032	NC_013946	GGC	2	6	1856810	1856815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296186
41033	NC_013946	GCT	2	6	1856880	1856885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41034	NC_013946	CGG	2	6	1857031	1857036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296187
41035	NC_013946	AGC	2	6	1857055	1857060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296187
41036	NC_013946	TCCA	2	8	1857072	1857079	25 %	25 %	0 %	50 %	291296187
41037	NC_013946	CTGC	2	8	1857167	1857174	0 %	25 %	25 %	50 %	291296187
41038	NC_013946	TTA	2	6	1857208	1857213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291296187
41039	NC_013946	GAA	2	6	1857231	1857236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296187
41040	NC_013946	GTC	2	6	1857264	1857269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296187
41041	NC_013946	GCA	2	6	1857350	1857355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296187
41042	NC_013946	GCG	2	6	1857357	1857362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296187
41043	NC_013946	CAG	2	6	1857381	1857386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296187
41044	NC_013946	GGC	2	6	1857405	1857410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296187
41045	NC_013946	TCG	2	6	1857421	1857426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296187
41046	NC_013946	CAG	2	6	1857459	1857464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296187
41047	NC_013946	GTG	2	6	1857570	1857575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296187
41048	NC_013946	CGG	2	6	1857602	1857607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296187
41049	NC_013946	GTG	2	6	1857633	1857638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296187
41050	NC_013946	CGC	2	6	1857656	1857661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296187
41051	NC_013946	C	6	6	1857740	1857745	0 %	0 %	0 %	100 %	291296187
41052	NC_013946	ATG	2	6	1857763	1857768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296187
41053	NC_013946	GCTCGG	2	12	1857770	1857781	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291296187
41054	NC_013946	CTTC	2	8	1857812	1857819	0 %	50 %	0 %	50 %	291296187
41055	NC_013946	CCT	2	6	1857848	1857853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296187
41056	NC_013946	TTC	2	6	1857855	1857860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296187
41057	NC_013946	GCC	2	6	1857994	1857999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296187
41058	NC_013946	G	6	6	1858001	1858006	0 %	0 %	100 %	0 %	291296187
41059	NC_013946	TCG	2	6	1858042	1858047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296187
41060	NC_013946	GC	3	6	1858105	1858110	0 %	0 %	50 %	50 %	291296187
41061	NC_013946	CGT	2	6	1858139	1858144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296187
41062	NC_013946	GCG	2	6	1858212	1858217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296187
41063	NC_013946	CGT	2	6	1858223	1858228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296187
41064	NC_013946	GCAG	2	8	1858398	1858405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41065	NC_013946	TGG	2	6	1858429	1858434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41066	NC_013946	CGG	2	6	1858455	1858460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41067	NC_013946	TCG	2	6	1858549	1858554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296188
41068	NC_013946	GCA	2	6	1858589	1858594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296188
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41070	NC_013946	CTC	3	9	1858749	1858757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296188
41071	NC_013946	GCCACG	2	12	1858783	1858794	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	291296188
41072	NC_013946	TGC	2	6	1858811	1858816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296188
41073	NC_013946	GGCC	2	8	1858868	1858875	0 %	0 %	50 %	50 %	291296188
41074	NC_013946	CG	4	8	1858880	1858887	0 %	0 %	50 %	50 %	291296188
41075	NC_013946	TGT	2	6	1858964	1858969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41076	NC_013946	CGG	2	6	1859078	1859083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41077	NC_013946	ACT	2	6	1859200	1859205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41078	NC_013946	AGG	2	6	1859221	1859226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41079	NC_013946	GA	3	6	1859235	1859240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41080	NC_013946	CCGGGA	2	12	1859261	1859272	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41081	NC_013946	ACG	2	6	1859358	1859363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41082	NC_013946	AAAG	2	8	1859368	1859375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41083	NC_013946	GGA	2	6	1859382	1859387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41084	NC_013946	G	6	6	1859411	1859416	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41085	NC_013946	TCC	2	6	1859564	1859569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41086	NC_013946	GGT	2	6	1859587	1859592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41087	NC_013946	AGGAG	2	10	1859635	1859644	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
41088	NC_013946	GGTG	2	8	1859691	1859698	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41089	NC_013946	CTGG	2	8	1859716	1859723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41090	NC_013946	ATTC	2	8	1859885	1859892	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41091	NC_013946	C	6	6	1859902	1859907	0 %	0 %	0 %	100 %	291296189
41092	NC_013946	CCA	2	6	1859910	1859915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296189
41093	NC_013946	CTC	2	6	1859994	1859999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296189
41094	NC_013946	CTGG	2	8	1860109	1860116	0 %	25 %	50 %	25 %	291296189
41095	NC_013946	GCCA	2	8	1860137	1860144	25 %	0 %	25 %	50 %	291296189
41096	NC_013946	CAC	2	6	1860156	1860161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296189
41097	NC_013946	GCCC	2	8	1860174	1860181	0 %	0 %	25 %	75 %	291296189
41098	NC_013946	C	6	6	1860185	1860190	0 %	0 %	0 %	100 %	291296189
41099	NC_013946	ACCGAG	2	12	1860232	1860243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296189
41100	NC_013946	GCA	2	6	1860245	1860250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296189
41101	NC_013946	CAGC	2	8	1860300	1860307	25 %	0 %	25 %	50 %	291296189
41102	NC_013946	GCG	2	6	1860332	1860337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296189
41103	NC_013946	TCC	2	6	1860338	1860343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296189
41104	NC_013946	CGG	2	6	1860364	1860369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296189
41105	NC_013946	TCA	2	6	1860394	1860399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296189
41106	NC_013946	AGC	2	6	1860433	1860438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296189
41107	NC_013946	T	7	7	1860466	1860472	0 %	100 %	0 %	0 %	291296190
41108	NC_013946	CCT	2	6	1860478	1860483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296190
41109	NC_013946	CCAGGC	2	12	1860532	1860543	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	291296190
41110	NC_013946	CGC	2	6	1860564	1860569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296190
41111	NC_013946	CAGC	2	8	1860595	1860602	25 %	0 %	25 %	50 %	291296190
41112	NC_013946	CCG	2	6	1860607	1860612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296190
41113	NC_013946	GGA	2	6	1860652	1860657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296190
41114	NC_013946	G	6	6	1860697	1860702	0 %	0 %	100 %	0 %	291296190
41115	NC_013946	TTC	2	6	1860729	1860734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296190
41116	NC_013946	AGGC	2	8	1860737	1860744	25 %	0 %	50 %	25 %	291296190
41117	NC_013946	CAG	2	6	1860833	1860838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296190
41118	NC_013946	AG	3	6	1860841	1860846	50 %	0 %	50 %	0 %	291296190
41119	NC_013946	GGTCT	2	10	1860866	1860875	0 %	40 %	40 %	20 %	291296190
41120	NC_013946	GCG	2	6	1860941	1860946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296190
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41227	NC_013946	GGCCAG	2	12	1864609	1864620	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41228	NC_013946	TGGG	2	8	1864625	1864632	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41229	NC_013946	CTA	2	6	1864644	1864649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41239	NC_013946	GTG	2	6	1865042	1865047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296193
41240	NC_013946	GGT	2	6	1865126	1865131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296194
41241	NC_013946	CAG	2	6	1865139	1865144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296194
41242	NC_013946	GGC	2	6	1865160	1865165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296194
41243	NC_013946	GCT	2	6	1865201	1865206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296194
41244	NC_013946	GGC	2	6	1865213	1865218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296194
41245	NC_013946	GCG	2	6	1865255	1865260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296194
41246	NC_013946	TGC	3	9	1865329	1865337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296194
41247	NC_013946	TGA	2	6	1865524	1865529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296195
41248	NC_013946	GC	3	6	1865531	1865536	0 %	0 %	50 %	50 %	291296195
41249	NC_013946	GCT	2	6	1865575	1865580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296195
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41251	NC_013946	CAC	2	6	1865678	1865683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296195
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41257	NC_013946	AGGT	2	8	1866024	1866031	25 %	25 %	50 %	0 %	291296195
41258	NC_013946	GCCG	2	8	1866041	1866048	0 %	0 %	50 %	50 %	291296195
41259	NC_013946	CGC	2	6	1866145	1866150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296195
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41274	NC_013946	G	7	7	1866727	1866733	0 %	0 %	100 %	0 %	291296196
41275	NC_013946	GCT	2	6	1866745	1866750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296196
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41285	NC_013946	GCGCC	2	10	1866962	1866971	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41286	NC_013946	CAT	2	6	1866996	1867001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296197
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41309	NC_013946	AGATGC	2	12	1868033	1868044	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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41331	NC_013946	CTG	2	6	1869115	1869120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296198
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41339	NC_013946	TGGGT	2	10	1869472	1869481	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
41340	NC_013946	CCG	2	6	1869503	1869508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41341	NC_013946	GGC	2	6	1869590	1869595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296199
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41345	NC_013946	AAAG	2	8	1869717	1869724	75 %	0 %	25 %	0 %	291296199
41346	NC_013946	GCG	2	6	1869759	1869764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296199
41347	NC_013946	TG	3	6	1869788	1869793	0 %	50 %	50 %	0 %	291296199
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41349	NC_013946	CAA	2	6	1869875	1869880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296199
41350	NC_013946	CTG	3	9	1869888	1869896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296199
41351	NC_013946	G	7	7	1869903	1869909	0 %	0 %	100 %	0 %	291296199
41352	NC_013946	GAAG	2	8	1869935	1869942	50 %	0 %	50 %	0 %	291296199
41353	NC_013946	GC	3	6	1869946	1869951	0 %	0 %	50 %	50 %	291296199
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41355	NC_013946	GCT	2	6	1870031	1870036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296199
41356	NC_013946	GGC	2	6	1870040	1870045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296199
41357	NC_013946	CTG	2	6	1870062	1870067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296199
41358	NC_013946	ACC	2	6	1870074	1870079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296199
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41433	NC_013946	GGTG	2	8	1873262	1873269	0 %	25 %	75 %	0 %	291296202
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41462	NC_013946	GA	3	6	1874638	1874643	50 %	0 %	50 %	0 %	291296202
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41466	NC_013946	CAC	2	6	1874787	1874792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296202
41467	NC_013946	C	6	6	1874868	1874873	0 %	0 %	0 %	100 %	291296202
41468	NC_013946	CGT	2	6	1874890	1874895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296202
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41471	NC_013946	TGCG	2	8	1875025	1875032	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41472	NC_013946	ACAAA	2	10	1875204	1875213	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41473	NC_013946	T	6	6	1875312	1875317	0 %	100 %	0 %	0 %	291296203
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41479	NC_013946	CTG	2	6	1875615	1875620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41480	NC_013946	AAG	2	6	1875658	1875663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296204
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41500	NC_013946	CTGG	2	8	1876433	1876440	0 %	25 %	50 %	25 %	291296204

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