MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013946	GCC	2	6	157863	157868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294579
3502	NC_013946	G	7	7	157872	157878	0 %	0 %	100 %	0 %	291294579
3503	NC_013946	TCG	2	6	157879	157884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294579
3504	NC_013946	CCA	2	6	157889	157894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294579
3505	NC_013946	GGC	2	6	157964	157969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294579
3506	NC_013946	C	7	7	157969	157975	0 %	0 %	0 %	100 %	291294579
3507	NC_013946	TCG	2	6	158116	158121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294579
3508	NC_013946	TGG	3	9	158257	158265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294580
3509	NC_013946	GCC	2	6	158318	158323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294580
3510	NC_013946	CAG	2	6	158351	158356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294580
3511	NC_013946	G	6	6	158506	158511	0 %	0 %	100 %	0 %	291294580
3512	NC_013946	GGGC	2	8	158528	158535	0 %	0 %	75 %	25 %	291294580
3513	NC_013946	G	7	7	158709	158715	0 %	0 %	100 %	0 %	291294580
3514	NC_013946	GTG	2	6	158760	158765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294580
3515	NC_013946	GCC	2	6	158776	158781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294580
3516	NC_013946	GAA	2	6	158787	158792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294580
3517	NC_013946	CG	3	6	158832	158837	0 %	0 %	50 %	50 %	291294580
3518	NC_013946	GC	3	6	158845	158850	0 %	0 %	50 %	50 %	291294580
3519	NC_013946	GGCGG	2	10	158880	158889	0 %	0 %	80 %	20 %	291294580
3520	NC_013946	GGGCG	2	10	158900	158909	0 %	0 %	80 %	20 %	291294580
3521	NC_013946	TGC	2	6	158923	158928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294580
3522	NC_013946	CGG	2	6	158942	158947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294580
3523	NC_013946	GGC	2	6	158954	158959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294580
3524	NC_013946	ACC	2	6	158991	158996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294580
3525	NC_013946	CTG	2	6	159027	159032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294580
3526	NC_013946	CCT	2	6	159068	159073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294580
3527	NC_013946	GGA	2	6	159143	159148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294580
3528	NC_013946	GTG	2	6	159198	159203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294580
3529	NC_013946	TC	3	6	159226	159231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_013946	ATG	2	6	159267	159272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_013946	GC	3	6	159326	159331	0 %	0 %	50 %	50 %	291294581
3532	NC_013946	AAGG	2	8	159386	159393	50 %	0 %	50 %	0 %	291294581
3533	NC_013946	GGT	2	6	159436	159441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294581
3534	NC_013946	GTG	2	6	159464	159469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294581
3535	NC_013946	CG	3	6	159480	159485	0 %	0 %	50 %	50 %	291294581
3536	NC_013946	CGGCG	2	10	159673	159682	0 %	0 %	60 %	40 %	291294581
3537	NC_013946	GCC	2	6	159719	159724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294581
3538	NC_013946	ATC	2	6	159725	159730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294581
3539	NC_013946	GGT	2	6	159787	159792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294581
3540	NC_013946	CCT	2	6	159815	159820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294581
3541	NC_013946	GGA	2	6	159844	159849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294581
3542	NC_013946	C	6	6	159890	159895	0 %	0 %	0 %	100 %	291294581
3543	NC_013946	TCTG	2	8	159927	159934	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_013946	AGG	2	6	160017	160022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_013946	GCA	2	6	160042	160047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294582
3546	NC_013946	CCG	2	6	160094	160099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294582
3547	NC_013946	GAA	3	9	160104	160112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294582
3548	NC_013946	GAA	2	6	160153	160158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294582
3549	NC_013946	TAA	2	6	160173	160178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291294582
3550	NC_013946	CAC	2	6	160248	160253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294582
3551	NC_013946	A	6	6	160256	160261	100 %	0 %	0 %	0 %	291294582
3552	NC_013946	AGG	2	6	160354	160359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_013946	CCT	2	6	160366	160371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_013946	GGC	2	6	160497	160502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_013946	AGC	2	6	160541	160546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_013946	GCC	2	6	160592	160597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294583
3557	NC_013946	CGG	2	6	160676	160681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294583
3558	NC_013946	T	6	6	160683	160688	0 %	100 %	0 %	0 %	291294583
3559	NC_013946	CGG	2	6	160721	160726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294583
3560	NC_013946	A	6	6	160755	160760	100 %	0 %	0 %	0 %	291294583
3561	NC_013946	GTT	2	6	160794	160799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294583
3562	NC_013946	GC	3	6	160802	160807	0 %	0 %	50 %	50 %	291294583
3563	NC_013946	CAG	2	6	160824	160829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294583
3564	NC_013946	CGGCG	2	10	160886	160895	0 %	0 %	60 %	40 %	291294583
3565	NC_013946	CGG	2	6	160898	160903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294583
3566	NC_013946	ATG	2	6	160930	160935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294583
3567	NC_013946	GCG	2	6	160957	160962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294583
3568	NC_013946	AGC	2	6	160963	160968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294583
3569	NC_013946	CCAG	2	8	160970	160977	25 %	0 %	25 %	50 %	291294583
3570	NC_013946	TGT	2	6	160985	160990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294583
3571	NC_013946	AG	3	6	160995	161000	50 %	0 %	50 %	0 %	291294583
3572	NC_013946	GATG	2	8	161034	161041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_013946	AC	3	6	161082	161087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_013946	GC	3	6	161101	161106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_013946	CAC	2	6	161122	161127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294584
3576	NC_013946	GGT	2	6	161145	161150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294584
3577	NC_013946	AGC	2	6	161186	161191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294584
3578	NC_013946	ACCC	2	8	161250	161257	25 %	0 %	0 %	75 %	291294584
3579	NC_013946	CGAG	2	8	161281	161288	25 %	0 %	50 %	25 %	291294584
3580	NC_013946	CAG	2	6	161308	161313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294584
3581	NC_013946	CTC	2	6	161347	161352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294584
3582	NC_013946	GGC	2	6	161386	161391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294584
3583	NC_013946	GTT	2	6	161397	161402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294584
3584	NC_013946	CTC	2	6	161407	161412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294584
3585	NC_013946	TCT	2	6	161435	161440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294584
3586	NC_013946	ACC	2	6	161474	161479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294584
3587	NC_013946	GTT	2	6	161512	161517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294584
3588	NC_013946	GGC	2	6	161518	161523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294584
3589	NC_013946	CAC	4	12	161557	161568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294584
3590	NC_013946	GTT	2	6	161584	161589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294584
3591	NC_013946	CTT	2	6	161634	161639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294584
3592	NC_013946	ACG	2	6	161674	161679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294584
3593	NC_013946	CAAC	2	8	161759	161766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_013946	CTGGG	2	10	161807	161816	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3595	NC_013946	T	6	6	161819	161824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_013946	TATTT	2	10	161889	161898	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_013946	ACC	2	6	161915	161920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294585
3598	NC_013946	GGC	2	6	161955	161960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294585
3599	NC_013946	AGGT	2	8	162017	162024	25 %	25 %	50 %	0 %	291294585
3600	NC_013946	GCG	2	6	162041	162046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294585
3601	NC_013946	GGA	2	6	162081	162086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294585
3602	NC_013946	CTG	2	6	162126	162131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294585
3603	NC_013946	CTCGAG	2	12	162148	162159	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291294585
3604	NC_013946	GGCT	2	8	162201	162208	0 %	25 %	50 %	25 %	291294585
3605	NC_013946	GGT	2	6	162277	162282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294585
3606	NC_013946	AGC	2	6	162284	162289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294585
3607	NC_013946	TTC	2	6	162349	162354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294585
3608	NC_013946	AGG	2	6	162359	162364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294585
3609	NC_013946	TGG	2	6	162393	162398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294585
3610	NC_013946	CGG	2	6	162411	162416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294585
3611	NC_013946	TTG	2	6	162419	162424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294585
3612	NC_013946	AGA	2	6	162435	162440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294585
3613	NC_013946	CTGG	2	8	162484	162491	0 %	25 %	50 %	25 %	291294585
3614	NC_013946	CGA	2	6	162516	162521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294585
3615	NC_013946	AGCC	2	8	162553	162560	25 %	0 %	25 %	50 %	291294585
3616	NC_013946	TAAA	2	8	162630	162637	75 %	25 %	0 %	0 %	291294585
3617	NC_013946	A	6	6	162635	162640	100 %	0 %	0 %	0 %	291294585
3618	NC_013946	AGGA	2	8	162748	162755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_013946	C	6	6	162825	162830	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3620	NC_013946	GGC	2	6	162879	162884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_013946	GCT	2	6	162897	162902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294586
3622	NC_013946	TGG	2	6	162965	162970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294586
3623	NC_013946	CTGG	2	8	163075	163082	0 %	25 %	50 %	25 %	291294587
3624	NC_013946	GA	3	6	163158	163163	50 %	0 %	50 %	0 %	291294587
3625	NC_013946	CAA	2	6	163209	163214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_013946	GCT	2	6	163232	163237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_013946	CAT	2	6	163313	163318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3630	NC_013946	CTC	2	6	163395	163400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3631	NC_013946	GCT	2	6	163412	163417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3657	NC_013946	CTG	2	6	164691	164696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3753	NC_013946	CGA	2	6	169116	169121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294597
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3804	NC_013946	TAC	2	6	171790	171795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294600
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3835	NC_013946	AGC	2	6	172949	172954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3842	NC_013946	CGGTGG	2	12	173307	173318	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	291294601
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3859	NC_013946	CGA	2	6	173967	173972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294602
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3862	NC_013946	GGC	2	6	174237	174242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294602
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3866	NC_013946	CGG	2	6	174318	174323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294602
3867	NC_013946	GGT	2	6	174348	174353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294602
3868	NC_013946	GAT	2	6	174370	174375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294602
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