MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_013946	CCAC	2	8	1710501	1710508	25 %	0 %	0 %	75 %	291296056
38003	NC_013946	CCG	2	6	1710552	1710557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296056
38004	NC_013946	CTT	2	6	1710623	1710628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296057
38005	NC_013946	GGTG	2	8	1710675	1710682	0 %	25 %	75 %	0 %	291296057
38006	NC_013946	TGG	2	6	1710758	1710763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296057
38007	NC_013946	GCCGGG	2	12	1710798	1710809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296057
38008	NC_013946	ACCT	2	8	1710850	1710857	25 %	25 %	0 %	50 %	291296057
38009	NC_013946	ACCA	2	8	1710937	1710944	50 %	0 %	0 %	50 %	291296057
38010	NC_013946	GAG	2	6	1710988	1710993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296057
38011	NC_013946	AGG	2	6	1711011	1711016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38012	NC_013946	A	6	6	1711025	1711030	100 %	0 %	0 %	0 %	291296058
38013	NC_013946	TTC	2	6	1711041	1711046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296058
38014	NC_013946	TGGCCC	2	12	1711071	1711082	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291296058
38015	NC_013946	GGGT	2	8	1711095	1711102	0 %	25 %	75 %	0 %	291296058
38016	NC_013946	CGG	2	6	1711180	1711185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296058
38017	NC_013946	TGG	4	12	1711203	1711214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296058
38018	NC_013946	ACG	2	6	1711215	1711220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296058
38019	NC_013946	TGA	2	6	1711260	1711265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296058
38020	NC_013946	CGG	2	6	1711291	1711296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296058
38021	NC_013946	CAG	2	6	1711375	1711380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296058
38022	NC_013946	GTG	2	6	1711382	1711387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296058
38023	NC_013946	CTT	2	6	1711414	1711419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296058
38024	NC_013946	ACC	2	6	1711425	1711430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296058
38025	NC_013946	GGC	3	9	1711450	1711458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296058
38026	NC_013946	TTC	2	6	1711466	1711471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296058
38027	NC_013946	CGG	2	6	1711536	1711541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296058
38028	NC_013946	CAG	2	6	1711559	1711564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296058
38029	NC_013946	TCGGGT	2	12	1711607	1711618	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291296058
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38031	NC_013946	C	7	7	1711755	1711761	0 %	0 %	0 %	100 %	291296058
38032	NC_013946	AAC	2	6	1711787	1711792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296058
38033	NC_013946	CAA	2	6	1711840	1711845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296058
38034	NC_013946	GCC	2	6	1711851	1711856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296058
38035	NC_013946	CGA	2	6	1711897	1711902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296058
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38037	NC_013946	GCC	2	6	1711988	1711993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296058
38038	NC_013946	ACT	2	6	1712178	1712183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296058
38039	NC_013946	TCA	2	6	1712201	1712206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38040	NC_013946	TGC	2	6	1712320	1712325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296059
38041	NC_013946	TCA	2	6	1712335	1712340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296059
38042	NC_013946	GCC	2	6	1712352	1712357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296059
38043	NC_013946	GTG	2	6	1712403	1712408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296059
38044	NC_013946	CTTT	2	8	1712495	1712502	0 %	75 %	0 %	25 %	291296059
38045	NC_013946	GGC	2	6	1712513	1712518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296059
38046	NC_013946	ACCT	2	8	1712547	1712554	25 %	25 %	0 %	50 %	291296059
38047	NC_013946	GCC	2	6	1712577	1712582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296059
38048	NC_013946	TGC	2	6	1712599	1712604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296059
38049	NC_013946	TGC	2	6	1712644	1712649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296059
38050	NC_013946	CCA	2	6	1712677	1712682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296059
38051	NC_013946	CCG	2	6	1712730	1712735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296059
38052	NC_013946	CTG	2	6	1712736	1712741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296059
38053	NC_013946	CTG	2	6	1712880	1712885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296059
38054	NC_013946	CGG	2	6	1712899	1712904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296059
38055	NC_013946	CAT	2	6	1712993	1712998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296059
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38069	NC_013946	TGG	2	6	1713420	1713425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296060
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38101	NC_013946	CCG	2	6	1715005	1715010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296062
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38105	NC_013946	CCTGG	2	10	1715092	1715101	0 %	20 %	40 %	40 %	291296062
38106	NC_013946	AGG	2	6	1715112	1715117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296062
38107	NC_013946	G	8	8	1715188	1715195	0 %	0 %	100 %	0 %	291296062
38108	NC_013946	AGC	2	6	1715196	1715201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296062
38109	NC_013946	TGG	2	6	1715250	1715255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296062
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38112	NC_013946	GGGGGT	2	12	1715329	1715340	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	291296062
38113	NC_013946	GCT	2	6	1715341	1715346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296062
38114	NC_013946	TCA	2	6	1715536	1715541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296063
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38233	NC_013946	AAT	2	6	1721842	1721847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291296066
38234	NC_013946	TCA	2	6	1722042	1722047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296066
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38468	NC_013946	GAT	2	6	1735581	1735586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38469	NC_013946	TTC	2	6	1735664	1735669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296071
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38492	NC_013946	CTG	2	6	1736738	1736743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296072
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38499	NC_013946	CCA	2	6	1737294	1737299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38500	NC_013946	TGC	2	6	1737473	1737478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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