MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_013946	TCA	2	6	1569376	1569381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295918
35002	NC_013946	CAC	2	6	1569407	1569412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295918
35003	NC_013946	GGC	2	6	1569415	1569420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295918
35004	NC_013946	GCA	2	6	1569421	1569426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295918
35005	NC_013946	CTGGG	2	10	1569437	1569446	0 %	20 %	60 %	20 %	291295918
35006	NC_013946	GTG	2	6	1569447	1569452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295918
35007	NC_013946	TGT	2	6	1569469	1569474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291295918
35008	NC_013946	AAG	2	6	1569492	1569497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295918
35009	NC_013946	GGCG	2	8	1569505	1569512	0 %	0 %	75 %	25 %	291295918
35010	NC_013946	CTG	2	6	1569513	1569518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295918
35011	NC_013946	GCC	2	6	1569527	1569532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295918
35012	NC_013946	C	6	6	1569531	1569536	0 %	0 %	0 %	100 %	291295918
35013	NC_013946	AGC	2	6	1569552	1569557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295918
35014	NC_013946	GGC	2	6	1569574	1569579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295918
35015	NC_013946	CCA	2	6	1569664	1569669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295918
35016	NC_013946	CCG	2	6	1569819	1569824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295918
35017	NC_013946	CAC	2	6	1569848	1569853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295918
35018	NC_013946	AGCGA	2	10	1569894	1569903	40 %	0 %	40 %	20 %	291295918
35019	NC_013946	CGG	3	9	1569916	1569924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295918
35020	NC_013946	TCC	2	6	1570086	1570091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295918
35021	NC_013946	GCC	2	6	1570094	1570099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295918
35022	NC_013946	ACCCC	2	10	1570116	1570125	20 %	0 %	0 %	80 %	291295918
35023	NC_013946	AGG	2	6	1570130	1570135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295918
35024	NC_013946	GGGTGG	2	12	1570138	1570149	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	291295918
35025	NC_013946	GGC	2	6	1570172	1570177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295918
35026	NC_013946	CTT	2	6	1570277	1570282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291295918
35027	NC_013946	GCG	2	6	1570292	1570297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295918
35028	NC_013946	TCG	2	6	1570326	1570331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295918
35029	NC_013946	CCA	2	6	1570417	1570422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295918
35030	NC_013946	CCA	2	6	1570426	1570431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295918
35031	NC_013946	CCA	2	6	1570474	1570479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295918
35032	NC_013946	CGG	2	6	1570507	1570512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295918
35033	NC_013946	GGT	2	6	1570529	1570534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295918
35034	NC_013946	GTT	2	6	1570547	1570552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291295918
35035	NC_013946	GAT	2	6	1570556	1570561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295918
35036	NC_013946	AGC	2	6	1570640	1570645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295918
35037	NC_013946	CTTG	2	8	1570702	1570709	0 %	50 %	25 %	25 %	291295918
35038	NC_013946	GGT	2	6	1570822	1570827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295918
35039	NC_013946	T	6	6	1570895	1570900	0 %	100 %	0 %	0 %	291295918
35040	NC_013946	GGC	2	6	1570924	1570929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295918
35041	NC_013946	CAC	2	6	1570949	1570954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295918
35042	NC_013946	CCA	2	6	1570957	1570962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295918
35043	NC_013946	GGC	2	6	1570973	1570978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295918
35044	NC_013946	CTT	2	6	1571054	1571059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291295918
35045	NC_013946	CTC	2	6	1571069	1571074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295918
35046	NC_013946	TGG	2	6	1571100	1571105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295918
35047	NC_013946	T	8	8	1571109	1571116	0 %	100 %	0 %	0 %	291295918
35048	NC_013946	CAC	2	6	1571174	1571179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295918
35049	NC_013946	TCG	2	6	1571184	1571189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295918
35050	NC_013946	CGG	2	6	1571275	1571280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295918
35051	NC_013946	AAG	2	6	1571316	1571321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295918
35052	NC_013946	G	6	6	1571336	1571341	0 %	0 %	100 %	0 %	291295918
35053	NC_013946	GCG	2	6	1571345	1571350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295918
35054	NC_013946	A	8	8	1571427	1571434	100 %	0 %	0 %	0 %	291295918
35055	NC_013946	TGG	2	6	1571494	1571499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295918
35056	NC_013946	CCG	2	6	1571536	1571541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295918
35057	NC_013946	T	7	7	1571556	1571562	0 %	100 %	0 %	0 %	291295918
35058	NC_013946	CTA	2	6	1571641	1571646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35059	NC_013946	A	7	7	1571658	1571664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35060	NC_013946	GCG	2	6	1571719	1571724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295919
35061	NC_013946	GCG	2	6	1571738	1571743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295919
35062	NC_013946	C	7	7	1571747	1571753	0 %	0 %	0 %	100 %	291295919
35063	NC_013946	GTG	2	6	1571814	1571819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295919
35064	NC_013946	T	6	6	1571825	1571830	0 %	100 %	0 %	0 %	291295919
35065	NC_013946	CAG	2	6	1571835	1571840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295919
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35067	NC_013946	GC	3	6	1572047	1572052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35068	NC_013946	CTC	2	6	1572096	1572101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35069	NC_013946	T	6	6	1572111	1572116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35070	NC_013946	CAAA	2	8	1572139	1572146	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35071	NC_013946	CAG	2	6	1572198	1572203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295920
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35086	NC_013946	GGCC	2	8	1572840	1572847	0 %	0 %	50 %	50 %	291295921
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35088	NC_013946	GCCG	2	8	1572921	1572928	0 %	0 %	50 %	50 %	291295921
35089	NC_013946	CG	3	6	1572947	1572952	0 %	0 %	50 %	50 %	291295921
35090	NC_013946	T	6	6	1573053	1573058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35091	NC_013946	CAT	2	6	1573097	1573102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295922
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35094	NC_013946	GCA	2	6	1573160	1573165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295922
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35097	NC_013946	CG	3	6	1573263	1573268	0 %	0 %	50 %	50 %	291295922
35098	NC_013946	CCAGCC	2	12	1573275	1573286	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	291295922
35099	NC_013946	CACCTA	2	12	1573382	1573393	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	291295922
35100	NC_013946	CCA	2	6	1573408	1573413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295922
35101	NC_013946	AGCC	2	8	1573475	1573482	25 %	0 %	25 %	50 %	291295922
35102	NC_013946	CCGT	2	8	1573509	1573516	0 %	25 %	25 %	50 %	291295922
35103	NC_013946	T	7	7	1573529	1573535	0 %	100 %	0 %	0 %	291295922
35104	NC_013946	CTG	3	9	1573602	1573610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295923
35105	NC_013946	AGC	2	6	1573682	1573687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295923
35106	NC_013946	GCC	2	6	1573719	1573724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295923
35107	NC_013946	ACTGG	2	10	1573736	1573745	20 %	20 %	40 %	20 %	291295923
35108	NC_013946	TGC	2	6	1573747	1573752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295923
35109	NC_013946	CTG	2	6	1573773	1573778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295923
35110	NC_013946	GAG	2	6	1573845	1573850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295923
35111	NC_013946	CG	3	6	1573922	1573927	0 %	0 %	50 %	50 %	291295923
35112	NC_013946	CTG	2	6	1573938	1573943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295923
35113	NC_013946	CGG	2	6	1574043	1574048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295923
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35115	NC_013946	GCT	2	6	1574108	1574113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295923
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35117	NC_013946	GGC	2	6	1574286	1574291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295924
35118	NC_013946	GGT	2	6	1574313	1574318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295924
35119	NC_013946	GGT	2	6	1574337	1574342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295924
35120	NC_013946	CTG	2	6	1574368	1574373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295924
35121	NC_013946	CTG	2	6	1574407	1574412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295924
35122	NC_013946	TGC	3	9	1574516	1574524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295924
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35222	NC_013946	CCGA	2	8	1579606	1579613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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35230	NC_013946	G	6	6	1580003	1580008	0 %	0 %	100 %	0 %	291295930
35231	NC_013946	TC	3	6	1580017	1580022	0 %	50 %	0 %	50 %	291295930
35232	NC_013946	GAG	2	6	1580085	1580090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295930
35233	NC_013946	CAGC	2	8	1580200	1580207	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35234	NC_013946	GTT	2	6	1580215	1580220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35235	NC_013946	GTA	2	6	1580241	1580246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35236	NC_013946	CCA	3	9	1580397	1580405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295931
35237	NC_013946	GAG	2	6	1580435	1580440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295931
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35241	NC_013946	TCA	2	6	1580794	1580799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295931
35242	NC_013946	AT	3	6	1580864	1580869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35243	NC_013946	CA	3	6	1580871	1580876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35244	NC_013946	GC	3	6	1580945	1580950	0 %	0 %	50 %	50 %	291295932
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35352	NC_013946	C	6	6	1585779	1585784	0 %	0 %	0 %	100 %	291295935
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35462	NC_013946	CCCCT	2	10	1590625	1590634	0 %	20 %	0 %	80 %	291295940
35463	NC_013946	CGG	2	6	1590641	1590646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295940
35464	NC_013946	GTG	2	6	1590743	1590748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295940
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35466	NC_013946	ACC	2	6	1590810	1590815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295940
35467	NC_013946	GAC	2	6	1590823	1590828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295940
35468	NC_013946	TCC	2	6	1590830	1590835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295940
35469	NC_013946	GCC	2	6	1590845	1590850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295940
35470	NC_013946	ATA	2	6	1590938	1590943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291295940
35471	NC_013946	T	6	6	1590959	1590964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35472	NC_013946	CAT	2	6	1591090	1591095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295941
35473	NC_013946	GAT	2	6	1591168	1591173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295941
35474	NC_013946	CCA	2	6	1591191	1591196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295941
35475	NC_013946	GGGT	2	8	1591212	1591219	0 %	25 %	75 %	0 %	291295941
35476	NC_013946	ATC	2	6	1591278	1591283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295941
35477	NC_013946	TGC	2	6	1591302	1591307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295941
35478	NC_013946	AGC	2	6	1591437	1591442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295941
35479	NC_013946	CTGC	2	8	1591454	1591461	0 %	25 %	25 %	50 %	291295941
35480	NC_013946	CTA	2	6	1591475	1591480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295941
35481	NC_013946	GCA	2	6	1591582	1591587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295941
35482	NC_013946	GCCAG	2	10	1591600	1591609	20 %	0 %	40 %	40 %	291295941
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35484	NC_013946	G	6	6	1591644	1591649	0 %	0 %	100 %	0 %	291295941
35485	NC_013946	TGGC	2	8	1591660	1591667	0 %	25 %	50 %	25 %	291295941
35486	NC_013946	CGA	2	6	1591723	1591728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295941
35487	NC_013946	T	6	6	1591790	1591795	0 %	100 %	0 %	0 %	291295941
35488	NC_013946	CGA	2	6	1591912	1591917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295941
35489	NC_013946	TGC	2	6	1591920	1591925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295941
35490	NC_013946	CTGGC	2	10	1591997	1592006	0 %	20 %	40 %	40 %	291295941
35491	NC_013946	TGC	2	6	1592098	1592103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295941
35492	NC_013946	TGG	2	6	1592175	1592180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295941
35493	NC_013946	CG	3	6	1592196	1592201	0 %	0 %	50 %	50 %	291295941
35494	NC_013946	GTG	2	6	1592219	1592224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295941
35495	NC_013946	GCT	2	6	1592296	1592301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295941
35496	NC_013946	GCC	2	6	1592414	1592419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295941
35497	NC_013946	G	6	6	1592467	1592472	0 %	0 %	100 %	0 %	291295941
35498	NC_013946	GGC	2	6	1592488	1592493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295941
35499	NC_013946	GGCCT	2	10	1592567	1592576	0 %	20 %	40 %	40 %	291295941
35500	NC_013946	TGCC	2	8	1592642	1592649	0 %	25 %	25 %	50 %	291295941

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