MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013946	CTA	2	6	136090	136095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294558
3002	NC_013946	TGG	2	6	136096	136101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294558
3003	NC_013946	CCTCA	2	10	136143	136152	20 %	20 %	0 %	60 %	291294558
3004	NC_013946	CCT	2	6	136277	136282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294559
3005	NC_013946	GCC	2	6	136298	136303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294559
3006	NC_013946	GGT	2	6	136317	136322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294559
3007	NC_013946	TGT	2	6	136343	136348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294559
3008	NC_013946	GGCC	2	8	136418	136425	0 %	0 %	50 %	50 %	291294559
3009	NC_013946	TCA	2	6	136520	136525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294559
3010	NC_013946	CCT	2	6	136526	136531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294559
3011	NC_013946	GCC	2	6	136618	136623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294559
3012	NC_013946	GCC	2	6	136639	136644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294559
3013	NC_013946	GCC	2	6	136650	136655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294559
3014	NC_013946	CCG	2	6	136660	136665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294559
3015	NC_013946	G	6	6	136677	136682	0 %	0 %	100 %	0 %	291294559
3016	NC_013946	CCG	2	6	136701	136706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294559
3017	NC_013946	GGC	2	6	136731	136736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294559
3018	NC_013946	GCC	2	6	136809	136814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294559
3019	NC_013946	CCG	2	6	136820	136825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294559
3020	NC_013946	GCG	2	6	136866	136871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294559
3021	NC_013946	TGA	2	6	136891	136896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294559
3022	NC_013946	TCA	2	6	136931	136936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294559
3023	NC_013946	GCC	2	6	136954	136959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294559
3024	NC_013946	CTT	2	6	136979	136984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294559
3025	NC_013946	TTCCA	2	10	137002	137011	20 %	40 %	0 %	40 %	291294559
3026	NC_013946	TGG	2	6	137018	137023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294559
3027	NC_013946	GGC	2	6	137060	137065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294559
3028	NC_013946	CCAG	2	8	137084	137091	25 %	0 %	25 %	50 %	291294559
3029	NC_013946	AGC	2	6	137120	137125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294559
3030	NC_013946	GCG	2	6	137235	137240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294559
3031	NC_013946	CTC	2	6	137247	137252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294559
3032	NC_013946	GCA	2	6	137279	137284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294559
3033	NC_013946	TGG	2	6	137285	137290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294559
3034	NC_013946	GCG	3	9	137329	137337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294559
3035	NC_013946	C	6	6	137449	137454	0 %	0 %	0 %	100 %	291294559
3036	NC_013946	AGG	2	6	137491	137496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294559
3037	NC_013946	CGG	2	6	137509	137514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294559
3038	NC_013946	TGC	2	6	137536	137541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294559
3039	NC_013946	GCT	3	9	137552	137560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294559
3040	NC_013946	TTG	2	6	137584	137589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294559
3041	NC_013946	GC	3	6	137679	137684	0 %	0 %	50 %	50 %	291294560
3042	NC_013946	TGG	2	6	137692	137697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294560
3043	NC_013946	CGG	2	6	137765	137770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294560
3044	NC_013946	GCT	2	6	137847	137852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294560
3045	NC_013946	GCC	2	6	137903	137908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294560
3046	NC_013946	GGT	2	6	137942	137947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294560
3047	NC_013946	GGA	2	6	138008	138013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294560
3048	NC_013946	CCAG	2	8	138077	138084	25 %	0 %	25 %	50 %	291294561
3049	NC_013946	GGC	2	6	138111	138116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294561
3050	NC_013946	GCC	2	6	138262	138267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294561
3051	NC_013946	TTG	2	6	138370	138375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294561
3052	NC_013946	CAG	2	6	138393	138398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294561
3053	NC_013946	GCC	2	6	138645	138650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294561
3054	NC_013946	CGAG	2	8	138658	138665	25 %	0 %	50 %	25 %	291294561
3055	NC_013946	GTT	2	6	138684	138689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294561
3056	NC_013946	AGA	2	6	138761	138766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294561
3057	NC_013946	GGC	2	6	138783	138788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294561
3058	NC_013946	CAC	2	6	138977	138982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294562
3059	NC_013946	TCG	2	6	139026	139031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294562
3060	NC_013946	CCA	2	6	139099	139104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294562
3061	NC_013946	GGC	2	6	139118	139123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294562
3062	NC_013946	CTG	2	6	139148	139153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294562
3063	NC_013946	CAC	2	6	139154	139159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294562
3064	NC_013946	AGC	2	6	139219	139224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294562
3065	NC_013946	GC	3	6	139223	139228	0 %	0 %	50 %	50 %	291294562
3066	NC_013946	GGCC	2	8	139339	139346	0 %	0 %	50 %	50 %	291294562
3067	NC_013946	CGGGC	2	10	139373	139382	0 %	0 %	60 %	40 %	291294562
3068	NC_013946	CG	3	6	139466	139471	0 %	0 %	50 %	50 %	291294562
3069	NC_013946	AGC	2	6	139494	139499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294562
3070	NC_013946	AGG	2	6	139518	139523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294562
3071	NC_013946	G	7	7	139531	139537	0 %	0 %	100 %	0 %	291294562
3072	NC_013946	GCC	2	6	139566	139571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294562
3073	NC_013946	A	6	6	139598	139603	100 %	0 %	0 %	0 %	291294562
3074	NC_013946	CGCAG	2	10	139615	139624	20 %	0 %	40 %	40 %	291294562
3075	NC_013946	GCG	2	6	139679	139684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294562
3076	NC_013946	CGC	2	6	139717	139722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294562
3077	NC_013946	GGCC	2	8	139813	139820	0 %	0 %	50 %	50 %	291294562
3078	NC_013946	CTGG	2	8	139844	139851	0 %	25 %	50 %	25 %	291294562
3079	NC_013946	AGG	2	6	139896	139901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294562
3080	NC_013946	CGC	2	6	139921	139926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294562
3081	NC_013946	AGC	2	6	140010	140015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294562
3082	NC_013946	G	6	6	140026	140031	0 %	0 %	100 %	0 %	291294562
3083	NC_013946	CAG	2	6	140075	140080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294562
3084	NC_013946	TCC	2	6	140160	140165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294562
3085	NC_013946	C	6	6	140176	140181	0 %	0 %	0 %	100 %	291294562
3086	NC_013946	GTG	2	6	140196	140201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294562
3087	NC_013946	CGT	2	6	140236	140241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294562
3088	NC_013946	GCA	2	6	140251	140256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294562
3089	NC_013946	CGC	2	6	140327	140332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294562
3090	NC_013946	GAG	2	6	140354	140359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294562
3091	NC_013946	AGG	2	6	140427	140432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294562
3092	NC_013946	GGC	2	6	140518	140523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_013946	GCC	2	6	140539	140544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_013946	AAG	2	6	140619	140624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294563
3095	NC_013946	CGG	2	6	140634	140639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294563
3096	NC_013946	GCTC	2	8	140731	140738	0 %	25 %	25 %	50 %	291294563
3097	NC_013946	CGC	2	6	140751	140756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294563
3098	NC_013946	GAG	2	6	140814	140819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294563
3099	NC_013946	GTC	2	6	140843	140848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294563
3100	NC_013946	ACTC	2	8	140890	140897	25 %	25 %	0 %	50 %	291294563
3101	NC_013946	CGG	2	6	140986	140991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294563
3102	NC_013946	GGCC	2	8	141052	141059	0 %	0 %	50 %	50 %	291294563
3103	NC_013946	GCT	2	6	141070	141075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294563
3104	NC_013946	TGG	2	6	141139	141144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294563
3105	NC_013946	GCC	2	6	141161	141166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294563
3106	NC_013946	T	6	6	141197	141202	0 %	100 %	0 %	0 %	291294563
3107	NC_013946	GTT	2	6	141239	141244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294563
3108	NC_013946	GTG	2	6	141258	141263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294563
3109	NC_013946	GCCC	2	8	141295	141302	0 %	0 %	25 %	75 %	291294563
3110	NC_013946	ACC	3	9	141303	141311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294563
3111	NC_013946	CGG	3	9	141343	141351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294563
3112	NC_013946	CGGCCC	2	12	141373	141384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294563
3113	NC_013946	GCG	2	6	141402	141407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294563
3114	NC_013946	GGC	2	6	141454	141459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294563
3115	NC_013946	CAC	2	6	141497	141502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294563
3116	NC_013946	TTG	2	6	141561	141566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294563
3117	NC_013946	GTT	2	6	141572	141577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294563
3118	NC_013946	CAG	2	6	141635	141640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294563
3119	NC_013946	G	6	6	141640	141645	0 %	0 %	100 %	0 %	291294563
3120	NC_013946	TGA	2	6	141664	141669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294563
3121	NC_013946	GTT	3	9	141677	141685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294563
3122	NC_013946	TGG	2	6	141736	141741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294563
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3124	NC_013946	TGG	2	6	141961	141966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294563
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3244	NC_013946	AGGGG	2	10	146863	146872	20 %	0 %	80 %	0 %	291294569
3245	NC_013946	AGC	2	6	146907	146912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294569
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3252	NC_013946	A	6	6	147278	147283	100 %	0 %	0 %	0 %	291294569
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3260	NC_013946	GAAAAG	2	12	147654	147665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3333	NC_013946	CAA	2	6	150705	150710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3360	NC_013946	CCCGG	2	10	151714	151723	0 %	0 %	40 %	60 %	291294574
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3369	NC_013946	TCT	2	6	151910	151915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294574
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3384	NC_013946	GTG	2	6	152618	152623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3386	NC_013946	TGC	2	6	152725	152730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3473	NC_013946	A	7	7	156633	156639	100 %	0 %	0 %	0 %	291294578
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3478	NC_013946	A	6	6	156930	156935	100 %	0 %	0 %	0 %	291294578
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3484	NC_013946	CGG	2	6	157067	157072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294578
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3487	NC_013946	CAG	2	6	157200	157205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294578
3488	NC_013946	GCC	2	6	157209	157214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294578
3489	NC_013946	AGGT	2	8	157264	157271	25 %	25 %	50 %	0 %	291294578
3490	NC_013946	TGGCCG	2	12	157439	157450	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291294579
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3492	NC_013946	CCAG	2	8	157553	157560	25 %	0 %	25 %	50 %	291294579
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3499	NC_013946	CAGC	2	8	157824	157831	25 %	0 %	25 %	50 %	291294579
3500	NC_013946	CCA	2	6	157839	157844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294579

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