MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33502	NC_013946	CAC	3	9	1501370	1501378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295858
33503	NC_013946	GCTG	2	8	1501397	1501404	0 %	25 %	50 %	25 %	291295858
33504	NC_013946	CAG	2	6	1501412	1501417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295858
33505	NC_013946	CAATG	2	10	1501442	1501451	40 %	20 %	20 %	20 %	291295858
33506	NC_013946	ACC	3	9	1501539	1501547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295858
33507	NC_013946	TAC	2	6	1501595	1501600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295858
33508	NC_013946	GC	3	6	1501623	1501628	0 %	0 %	50 %	50 %	291295858
33509	NC_013946	GGGT	2	8	1501686	1501693	0 %	25 %	75 %	0 %	291295858
33510	NC_013946	AGG	2	6	1501725	1501730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295858
33511	NC_013946	AATA	2	8	1501733	1501740	75 %	25 %	0 %	0 %	291295858
33512	NC_013946	GTA	2	6	1501805	1501810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33513	NC_013946	G	6	6	1501837	1501842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33514	NC_013946	CCAT	2	8	1501860	1501867	25 %	25 %	0 %	50 %	291295859
33515	NC_013946	TTA	2	6	1501909	1501914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291295859
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33517	NC_013946	GCT	2	6	1502009	1502014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295859
33518	NC_013946	G	7	7	1502020	1502026	0 %	0 %	100 %	0 %	291295859
33519	NC_013946	ATT	2	6	1502064	1502069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291295859
33520	NC_013946	GGA	2	6	1502118	1502123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295859
33521	NC_013946	TGA	2	6	1502248	1502253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295859
33522	NC_013946	GTT	2	6	1502265	1502270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291295859
33523	NC_013946	TGT	2	6	1502381	1502386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291295859
33524	NC_013946	TA	3	6	1502416	1502421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33525	NC_013946	TTC	2	6	1502427	1502432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33527	NC_013946	CCCT	2	8	1502513	1502520	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33528	NC_013946	GGC	2	6	1502565	1502570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33529	NC_013946	TGG	2	6	1502588	1502593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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33531	NC_013946	GGA	2	6	1502790	1502795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33532	NC_013946	GTT	2	6	1502858	1502863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33533	NC_013946	AC	3	6	1502924	1502929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33534	NC_013946	AGC	2	6	1503012	1503017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33535	NC_013946	CTG	2	6	1503089	1503094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33536	NC_013946	CAG	2	6	1503097	1503102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33537	NC_013946	CG	3	6	1503139	1503144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33538	NC_013946	GGCT	2	8	1503169	1503176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33539	NC_013946	GTAT	2	8	1503307	1503314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33540	NC_013946	AG	3	6	1503362	1503367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33541	NC_013946	CTG	2	6	1503386	1503391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33542	NC_013946	GTTT	3	12	1503460	1503471	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33543	NC_013946	GCGT	2	8	1503517	1503524	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33544	NC_013946	C	7	7	1503558	1503564	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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33546	NC_013946	C	6	6	1503650	1503655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33547	NC_013946	CTTG	2	8	1503668	1503675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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33569	NC_013946	GGCG	2	8	1504664	1504671	0 %	0 %	75 %	25 %	291295861
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33604	NC_013946	GCT	2	6	1506254	1506259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295863
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33609	NC_013946	TC	3	6	1506433	1506438	0 %	50 %	0 %	50 %	291295863
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33974	NC_013946	CAA	2	6	1522159	1522164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33989	NC_013946	GC	3	6	1522943	1522948	0 %	0 %	50 %	50 %	291295875
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