MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_013946	GGCCGA	2	12	1455416	1455427	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291295812
32503	NC_013946	CTGGGT	2	12	1455479	1455490	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291295812
32504	NC_013946	GCC	2	6	1455498	1455503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295812
32505	NC_013946	TGC	2	6	1455529	1455534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295812
32506	NC_013946	G	6	6	1455576	1455581	0 %	0 %	100 %	0 %	291295813
32507	NC_013946	TGG	2	6	1455665	1455670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295813
32508	NC_013946	GGA	2	6	1455708	1455713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295813
32509	NC_013946	AGG	2	6	1455752	1455757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295813
32510	NC_013946	CTA	2	6	1455777	1455782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295813
32511	NC_013946	CAGGC	2	10	1455803	1455812	20 %	0 %	40 %	40 %	291295813
32512	NC_013946	TGT	2	6	1455895	1455900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291295814
32513	NC_013946	GCC	2	6	1455917	1455922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295814
32514	NC_013946	CCCA	2	8	1455995	1456002	25 %	0 %	0 %	75 %	291295814
32515	NC_013946	A	7	7	1456101	1456107	100 %	0 %	0 %	0 %	291295814
32516	NC_013946	TGG	2	6	1456214	1456219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295814
32517	NC_013946	ACCA	2	8	1456238	1456245	50 %	0 %	0 %	50 %	291295814
32518	NC_013946	AGC	2	6	1456296	1456301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295814
32519	NC_013946	A	6	6	1456313	1456318	100 %	0 %	0 %	0 %	291295814
32520	NC_013946	GCC	2	6	1456379	1456384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295814
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32522	NC_013946	GAA	2	6	1456439	1456444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295814
32523	NC_013946	GCA	2	6	1456450	1456455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295814
32524	NC_013946	CAA	2	6	1456459	1456464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291295814
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32529	NC_013946	TTGC	2	8	1456715	1456722	0 %	50 %	25 %	25 %	291295816
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32532	NC_013946	AGC	2	6	1456815	1456820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295816
32533	NC_013946	CCGGCT	2	12	1456821	1456832	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291295816
32534	NC_013946	ACG	2	6	1456836	1456841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295816
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32539	NC_013946	TGG	2	6	1456988	1456993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32540	NC_013946	ACC	3	9	1457049	1457057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32541	NC_013946	CAA	2	6	1457065	1457070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32542	NC_013946	ACT	2	6	1457080	1457085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32543	NC_013946	CTG	2	6	1457099	1457104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32544	NC_013946	G	6	6	1457200	1457205	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32545	NC_013946	CGG	2	6	1457213	1457218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32546	NC_013946	GAAA	2	8	1457236	1457243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32547	NC_013946	CTTG	2	8	1457251	1457258	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32548	NC_013946	GGC	2	6	1457361	1457366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32549	NC_013946	G	6	6	1457380	1457385	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32550	NC_013946	CGG	2	6	1457393	1457398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32551	NC_013946	CTTG	2	8	1457428	1457435	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32552	NC_013946	GACT	2	8	1457493	1457500	25 %	25 %	25 %	25 %	291295817
32553	NC_013946	GCT	2	6	1457532	1457537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295817
32554	NC_013946	TAA	2	6	1457561	1457566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291295817
32555	NC_013946	CAT	2	6	1457643	1457648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295817
32556	NC_013946	GCTG	2	8	1457666	1457673	0 %	25 %	50 %	25 %	291295817
32557	NC_013946	GGT	2	6	1457703	1457708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295817
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32560	NC_013946	GGA	2	6	1457775	1457780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295817
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32563	NC_013946	CTGGT	2	10	1457958	1457967	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32564	NC_013946	GCA	3	9	1458019	1458027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295818
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32567	NC_013946	GCCCTG	2	12	1458103	1458114	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291295818
32568	NC_013946	CCCA	2	8	1458157	1458164	25 %	0 %	0 %	75 %	291295818
32569	NC_013946	AGGA	2	8	1458173	1458180	50 %	0 %	50 %	0 %	291295818
32570	NC_013946	CTA	2	6	1458185	1458190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295818
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32575	NC_013946	GCCT	2	8	1458273	1458280	0 %	25 %	25 %	50 %	291295819
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32578	NC_013946	GAGTAC	2	12	1458315	1458326	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291295819
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32582	NC_013946	AT	3	6	1458551	1458556	50 %	50 %	0 %	0 %	291295819
32583	NC_013946	CAG	2	6	1458568	1458573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295819
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32585	NC_013946	ATC	2	6	1458774	1458779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32586	NC_013946	GGC	2	6	1458803	1458808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32587	NC_013946	CTGGCC	2	12	1458818	1458829	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32588	NC_013946	GGC	2	6	1458838	1458843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32589	NC_013946	CTC	2	6	1458849	1458854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32590	NC_013946	GTG	2	6	1458855	1458860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32591	NC_013946	GCC	2	6	1458877	1458882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32592	NC_013946	AGTG	2	8	1459007	1459014	25 %	25 %	50 %	0 %	291295820
32593	NC_013946	CGCT	2	8	1459022	1459029	0 %	25 %	25 %	50 %	291295820
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32600	NC_013946	TGC	2	6	1459368	1459373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295820
32601	NC_013946	GGA	2	6	1459556	1459561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32602	NC_013946	GGC	2	6	1459589	1459594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32603	NC_013946	TGA	2	6	1459659	1459664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32604	NC_013946	GCC	2	6	1459699	1459704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32605	NC_013946	GCCT	2	8	1459909	1459916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32606	NC_013946	CCA	2	6	1460104	1460109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32607	NC_013946	T	6	6	1460154	1460159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32608	NC_013946	GGGC	2	8	1460186	1460193	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32609	NC_013946	ACA	2	6	1460326	1460331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291295821
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32611	NC_013946	GTTTC	2	10	1460391	1460400	0 %	60 %	20 %	20 %	291295821
32612	NC_013946	TTTTTG	2	12	1460433	1460444	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	291295821
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32615	NC_013946	ACA	2	6	1460519	1460524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291295821
32616	NC_013946	AGA	2	6	1460675	1460680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295821
32617	NC_013946	GGT	3	9	1460804	1460812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295821
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