MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_013946	GT	3	6	1385337	1385342	0 %	50 %	50 %	0 %	291295737
31003	NC_013946	GT	3	6	1385346	1385351	0 %	50 %	50 %	0 %	291295737
31004	NC_013946	ACG	2	6	1385404	1385409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295737
31005	NC_013946	GTG	2	6	1385472	1385477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295737
31006	NC_013946	AAG	2	6	1385482	1385487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295737
31007	NC_013946	T	6	6	1385512	1385517	0 %	100 %	0 %	0 %	291295738
31008	NC_013946	G	6	6	1385526	1385531	0 %	0 %	100 %	0 %	291295738
31009	NC_013946	GCA	2	6	1385547	1385552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295738
31010	NC_013946	C	6	6	1385567	1385572	0 %	0 %	0 %	100 %	291295738
31011	NC_013946	TGAG	2	8	1385574	1385581	25 %	25 %	50 %	0 %	291295738
31012	NC_013946	TAGGGT	2	12	1385614	1385625	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291295738
31013	NC_013946	GCG	2	6	1385626	1385631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295738
31014	NC_013946	CTGG	2	8	1385670	1385677	0 %	25 %	50 %	25 %	291295738
31015	NC_013946	CCA	2	6	1385757	1385762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295738
31016	NC_013946	TCA	2	6	1385783	1385788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295738
31017	NC_013946	CCG	2	6	1385799	1385804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295738
31018	NC_013946	CCG	2	6	1385839	1385844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295738
31019	NC_013946	TCG	2	6	1385852	1385857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295738
31020	NC_013946	GCT	2	6	1385859	1385864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295738
31021	NC_013946	ATGGTC	2	12	1385906	1385917	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291295738
31022	NC_013946	CTGCC	2	10	1385965	1385974	0 %	20 %	20 %	60 %	291295739
31023	NC_013946	CAT	2	6	1385975	1385980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295739
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31025	NC_013946	GGAT	2	8	1386091	1386098	25 %	25 %	50 %	0 %	291295739
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31030	NC_013946	CG	3	6	1386282	1386287	0 %	0 %	50 %	50 %	291295739
31031	NC_013946	GCAT	2	8	1386298	1386305	25 %	25 %	25 %	25 %	291295739
31032	NC_013946	GCCCGA	2	12	1386311	1386322	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	291295739
31033	NC_013946	TCG	2	6	1386352	1386357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295739
31034	NC_013946	GC	3	6	1386395	1386400	0 %	0 %	50 %	50 %	291295739
31035	NC_013946	CGT	2	6	1386438	1386443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295739
31036	NC_013946	TGC	2	6	1386463	1386468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295739
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31039	NC_013946	GCTG	2	8	1386629	1386636	0 %	25 %	50 %	25 %	291295739
31040	NC_013946	AGG	2	6	1386679	1386684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295739
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31042	NC_013946	CGG	2	6	1386818	1386823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295739
31043	NC_013946	CGA	2	6	1386824	1386829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295739
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31051	NC_013946	CCT	2	6	1387142	1387147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295740
31052	NC_013946	ATC	2	6	1387213	1387218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295740
31053	NC_013946	CGC	2	6	1387253	1387258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295740
31054	NC_013946	CGG	2	6	1387262	1387267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295740
31055	NC_013946	ACC	2	6	1387372	1387377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295740
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31062	NC_013946	GCA	3	9	1387746	1387754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295741
31063	NC_013946	ACC	2	6	1387809	1387814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295741
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31066	NC_013946	GCG	2	6	1387922	1387927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295741
31067	NC_013946	GC	3	6	1387937	1387942	0 %	0 %	50 %	50 %	291295741
31068	NC_013946	AGGCC	2	10	1387954	1387963	20 %	0 %	40 %	40 %	291295741
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31077	NC_013946	GCT	2	6	1388520	1388525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295742
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31079	NC_013946	TGC	2	6	1388625	1388630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295742
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31084	NC_013946	GAA	2	6	1388833	1388838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295742
31085	NC_013946	GCC	2	6	1388924	1388929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295742
31086	NC_013946	CGG	2	6	1388963	1388968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295742
31087	NC_013946	TGG	2	6	1388991	1388996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295742
31088	NC_013946	AGC	2	6	1389098	1389103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295742
31089	NC_013946	GGC	2	6	1389154	1389159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295742
31090	NC_013946	A	6	6	1389277	1389282	100 %	0 %	0 %	0 %	291295742
31091	NC_013946	GCAA	2	8	1389302	1389309	50 %	0 %	25 %	25 %	291295742
31092	NC_013946	GAT	2	6	1389447	1389452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31093	NC_013946	GCT	2	6	1389463	1389468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31094	NC_013946	TGGGC	2	10	1389483	1389492	0 %	20 %	60 %	20 %	291295743
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31097	NC_013946	GAC	2	6	1389597	1389602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295743
31098	NC_013946	CTA	2	6	1389609	1389614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295743
31099	NC_013946	TGC	2	6	1389653	1389658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295743
31100	NC_013946	TGG	2	6	1389659	1389664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295743
31101	NC_013946	CTC	2	6	1389717	1389722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295743
31102	NC_013946	GCA	2	6	1389744	1389749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295743
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31105	NC_013946	GGCT	2	8	1389847	1389854	0 %	25 %	50 %	25 %	291295743
31106	NC_013946	GCA	3	9	1389869	1389877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295743
31107	NC_013946	ACCT	2	8	1389964	1389971	25 %	25 %	0 %	50 %	291295743
31108	NC_013946	G	6	6	1390101	1390106	0 %	0 %	100 %	0 %	291295743
31109	NC_013946	GGC	2	6	1390113	1390118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295743
31110	NC_013946	GGTGA	2	10	1390123	1390132	20 %	20 %	60 %	0 %	291295743
31111	NC_013946	T	6	6	1390170	1390175	0 %	100 %	0 %	0 %	291295743
31112	NC_013946	TGCT	2	8	1390192	1390199	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31113	NC_013946	CGCGG	2	10	1390214	1390223	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31114	NC_013946	T	6	6	1390237	1390242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31115	NC_013946	ATG	2	6	1390257	1390262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31117	NC_013946	CAG	2	6	1390352	1390357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31467	NC_013946	GCG	2	6	1407614	1407619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295757
31468	NC_013946	GAG	2	6	1407661	1407666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295757
31469	NC_013946	ACCA	2	8	1407723	1407730	50 %	0 %	0 %	50 %	291295757
31470	NC_013946	GAGC	2	8	1407735	1407742	25 %	0 %	50 %	25 %	291295757
31471	NC_013946	CGG	2	6	1407821	1407826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295758
31472	NC_013946	AGGGC	2	10	1407845	1407854	20 %	0 %	60 %	20 %	291295758
31473	NC_013946	GCG	2	6	1407922	1407927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295758
31474	NC_013946	T	6	6	1407941	1407946	0 %	100 %	0 %	0 %	291295758
31475	NC_013946	TACAAT	2	12	1407999	1408010	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	291295758
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31478	NC_013946	CTG	2	6	1408038	1408043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295758
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31482	NC_013946	CTGC	2	8	1408451	1408458	0 %	25 %	25 %	50 %	291295758
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31489	NC_013946	G	7	7	1408692	1408698	0 %	0 %	100 %	0 %	291295758
31490	NC_013946	GTC	2	6	1408752	1408757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295758
31491	NC_013946	GCT	2	6	1408779	1408784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295758
31492	NC_013946	CCT	2	6	1408814	1408819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295758
31493	NC_013946	GC	4	8	1408847	1408854	0 %	0 %	50 %	50 %	291295758
31494	NC_013946	GTG	2	6	1408897	1408902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295758
31495	NC_013946	CCA	2	6	1408925	1408930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295758
31496	NC_013946	GGC	2	6	1408966	1408971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295758
31497	NC_013946	CAGC	2	8	1408989	1408996	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31498	NC_013946	GAC	2	6	1409009	1409014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295759
31499	NC_013946	CCA	2	6	1409044	1409049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295759
31500	NC_013946	GTC	2	6	1409057	1409062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295759

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