MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013946	TTC	2	6	114772	114777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294539
2502	NC_013946	CGA	2	6	114816	114821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294539
2503	NC_013946	GCC	2	6	114898	114903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294539
2504	NC_013946	TGG	2	6	114917	114922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294539
2505	NC_013946	CGG	2	6	114980	114985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294539
2506	NC_013946	TGGAC	2	10	114996	115005	20 %	20 %	40 %	20 %	291294539
2507	NC_013946	GGT	2	6	115020	115025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294539
2508	NC_013946	GGA	2	6	115027	115032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294539
2509	NC_013946	ATC	2	6	115036	115041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294539
2510	NC_013946	TGG	2	6	115100	115105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294539
2511	NC_013946	G	6	6	115104	115109	0 %	0 %	100 %	0 %	291294539
2512	NC_013946	TGC	2	6	115139	115144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294539
2513	NC_013946	GAG	2	6	115186	115191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294539
2514	NC_013946	AGGG	2	8	115233	115240	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_013946	CCT	2	6	115283	115288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294540
2516	NC_013946	ACC	2	6	115300	115305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294540
2517	NC_013946	GGT	2	6	115335	115340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294540
2518	NC_013946	GCT	2	6	115341	115346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294540
2519	NC_013946	TGG	2	6	115349	115354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294540
2520	NC_013946	CAC	2	6	115449	115454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294540
2521	NC_013946	GGC	2	6	115485	115490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294540
2522	NC_013946	TGGGGG	2	12	115496	115507	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	291294540
2523	NC_013946	G	6	6	115563	115568	0 %	0 %	100 %	0 %	291294540
2524	NC_013946	CGG	2	6	115574	115579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294540
2525	NC_013946	CAT	2	6	115581	115586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294540
2526	NC_013946	GTG	2	6	115675	115680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294540
2527	NC_013946	GGC	2	6	115707	115712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294540
2528	NC_013946	ACT	2	6	115769	115774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294540
2529	NC_013946	TGATGG	2	12	115808	115819	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	291294540
2530	NC_013946	CG	3	6	115882	115887	0 %	0 %	50 %	50 %	291294540
2531	NC_013946	GCGG	2	8	115989	115996	0 %	0 %	75 %	25 %	291294540
2532	NC_013946	TGG	3	9	115997	116005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294540
2533	NC_013946	GGC	2	6	116056	116061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294540
2534	NC_013946	GGT	2	6	116070	116075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294540
2535	NC_013946	TGG	2	6	116272	116277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294540
2536	NC_013946	AGG	2	6	116378	116383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_013946	AGCG	2	8	116392	116399	25 %	0 %	50 %	25 %	291294541
2538	NC_013946	GGCT	2	8	116428	116435	0 %	25 %	50 %	25 %	291294541
2539	NC_013946	CTG	2	6	116460	116465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294541
2540	NC_013946	GGA	2	6	116525	116530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294541
2541	NC_013946	CGA	2	6	116594	116599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294541
2542	NC_013946	TGC	2	6	116692	116697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294541
2543	NC_013946	TCA	2	6	116710	116715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294541
2544	NC_013946	CCA	2	6	116731	116736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294541
2545	NC_013946	ACCC	2	8	116767	116774	25 %	0 %	0 %	75 %	291294541
2546	NC_013946	AAC	2	6	116775	116780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294541
2547	NC_013946	AGC	2	6	116802	116807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294541
2548	NC_013946	GGT	2	6	116819	116824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294541
2549	NC_013946	CAC	2	6	116849	116854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294541
2550	NC_013946	GGGC	2	8	116898	116905	0 %	0 %	75 %	25 %	291294541
2551	NC_013946	GGT	2	6	116906	116911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294541
2552	NC_013946	GCT	2	6	116928	116933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294541
2553	NC_013946	ACA	2	6	116989	116994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294541
2554	NC_013946	GCT	2	6	116999	117004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294541
2555	NC_013946	ATC	2	6	117036	117041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294541
2556	NC_013946	GCCGG	2	10	117054	117063	0 %	0 %	60 %	40 %	291294541
2557	NC_013946	CAG	2	6	117194	117199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294541
2558	NC_013946	CTA	2	6	117200	117205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294541
2559	NC_013946	AAC	2	6	117244	117249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294541
2560	NC_013946	CCA	2	6	117289	117294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294541
2561	NC_013946	CCG	2	6	117301	117306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294541
2562	NC_013946	GGC	3	9	117314	117322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294541
2563	NC_013946	GCCGG	2	10	117343	117352	0 %	0 %	60 %	40 %	291294541
2564	NC_013946	CCA	2	6	117448	117453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294541
2565	NC_013946	CTTCA	2	10	117557	117566	20 %	40 %	0 %	40 %	291294541
2566	NC_013946	AGG	2	6	117597	117602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_013946	CTG	2	6	117695	117700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294542
2568	NC_013946	CAA	2	6	117706	117711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294542
2569	NC_013946	GGT	2	6	117718	117723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294542
2570	NC_013946	CAT	2	6	117733	117738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294542
2571	NC_013946	TGC	2	6	117744	117749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294542
2572	NC_013946	ACC	3	9	117818	117826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294542
2573	NC_013946	GGT	2	6	117868	117873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294542
2574	NC_013946	CAA	2	6	117910	117915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294542
2575	NC_013946	GCC	2	6	117916	117921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294542
2576	NC_013946	GCG	2	6	117964	117969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294542
2577	NC_013946	GAG	2	6	117992	117997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294542
2578	NC_013946	GGGT	2	8	118005	118012	0 %	25 %	75 %	0 %	291294542
2579	NC_013946	CGG	2	6	118022	118027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294542
2580	NC_013946	AG	3	6	118043	118048	50 %	0 %	50 %	0 %	291294542
2581	NC_013946	ACT	2	6	118068	118073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294542
2582	NC_013946	CTGG	2	8	118103	118110	0 %	25 %	50 %	25 %	291294542
2583	NC_013946	G	8	8	118120	118127	0 %	0 %	100 %	0 %	291294542
2584	NC_013946	AGC	2	6	118128	118133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294542
2585	NC_013946	GGGC	2	8	118148	118155	0 %	0 %	75 %	25 %	291294542
2586	NC_013946	CTG	2	6	118157	118162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294542
2587	NC_013946	TGC	2	6	118179	118184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294542
2588	NC_013946	C	6	6	118209	118214	0 %	0 %	0 %	100 %	291294542
2589	NC_013946	GAG	2	6	118259	118264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294542
2590	NC_013946	TGG	3	9	118278	118286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294542
2591	NC_013946	CAT	2	6	118330	118335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294542
2592	NC_013946	AACC	2	8	118381	118388	50 %	0 %	0 %	50 %	291294542
2593	NC_013946	CGGG	2	8	118425	118432	0 %	0 %	75 %	25 %	291294542
2594	NC_013946	CCG	2	6	118462	118467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294542
2595	NC_013946	GCTC	2	8	118506	118513	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2596	NC_013946	T	8	8	118514	118521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_013946	CAGCT	2	10	118528	118537	20 %	20 %	20 %	40 %	291294543
2598	NC_013946	TG	3	6	118538	118543	0 %	50 %	50 %	0 %	291294543
2599	NC_013946	CCA	2	6	118589	118594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294543
2600	NC_013946	GTG	2	6	118651	118656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294543
2601	NC_013946	AAGG	2	8	118687	118694	50 %	0 %	50 %	0 %	291294543
2602	NC_013946	TGGG	2	8	118909	118916	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_013946	CTT	2	6	119085	119090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294544
2604	NC_013946	CGC	2	6	119110	119115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294544
2605	NC_013946	CTT	2	6	119139	119144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294544
2606	NC_013946	GC	3	6	119388	119393	0 %	0 %	50 %	50 %	291294544
2607	NC_013946	CAA	2	6	119403	119408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294544
2608	NC_013946	CCA	2	6	119418	119423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294544
2609	NC_013946	TG	4	8	119455	119462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_013946	CTTA	2	8	119537	119544	25 %	50 %	0 %	25 %	291294545
2611	NC_013946	GAG	2	6	119577	119582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294545
2612	NC_013946	GTG	2	6	119583	119588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294545
2613	NC_013946	CCA	2	6	119651	119656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294545
2614	NC_013946	TGG	2	6	119740	119745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294545
2615	NC_013946	GCTC	2	8	119749	119756	0 %	25 %	25 %	50 %	291294545
2616	NC_013946	GGA	2	6	119816	119821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294545
2617	NC_013946	GCC	2	6	119824	119829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294545
2618	NC_013946	CAG	2	6	119877	119882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294545
2619	NC_013946	GAA	2	6	119922	119927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294545
2620	NC_013946	CTG	2	6	120024	120029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294546
2621	NC_013946	GACCA	2	10	120051	120060	40 %	0 %	20 %	40 %	291294546
2622	NC_013946	CTG	2	6	120138	120143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294546
2623	NC_013946	GCC	2	6	120172	120177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294546
2624	NC_013946	TGG	2	6	120211	120216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294546
2625	NC_013946	CTG	2	6	120231	120236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294546
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