MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_013946	CGC	2	6	89531	89536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294514
2002	NC_013946	CAG	2	6	89562	89567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294514
2003	NC_013946	ACA	3	9	89651	89659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294514
2004	NC_013946	CTGG	2	8	89728	89735	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2005	NC_013946	CGC	2	6	89900	89905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294515
2006	NC_013946	CGGG	2	8	89906	89913	0 %	0 %	75 %	25 %	291294515
2007	NC_013946	CTC	2	6	90021	90026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294515
2008	NC_013946	CAT	2	6	90072	90077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294515
2009	NC_013946	GGTG	2	8	90150	90157	0 %	25 %	75 %	0 %	291294515
2010	NC_013946	ACCGCC	2	12	90205	90216	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	291294515
2011	NC_013946	CAG	2	6	90330	90335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294515
2012	NC_013946	TCC	2	6	90358	90363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294515
2013	NC_013946	G	6	6	90408	90413	0 %	0 %	100 %	0 %	291294515
2014	NC_013946	GGGT	2	8	90449	90456	0 %	25 %	75 %	0 %	291294515
2015	NC_013946	CCG	2	6	90464	90469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294515
2016	NC_013946	TGC	2	6	90496	90501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294515
2017	NC_013946	CTG	2	6	90549	90554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294515
2018	NC_013946	AGA	2	6	90607	90612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294515
2019	NC_013946	GCCGCT	2	12	90623	90634	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291294515
2020	NC_013946	TGG	2	6	90683	90688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294516
2021	NC_013946	GTTT	2	8	90728	90735	0 %	75 %	25 %	0 %	291294516
2022	NC_013946	TTG	2	6	90746	90751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294516
2023	NC_013946	TATT	2	8	90761	90768	25 %	75 %	0 %	0 %	291294516
2024	NC_013946	ATTT	2	8	90784	90791	25 %	75 %	0 %	0 %	291294516
2025	NC_013946	TAAA	2	8	90811	90818	75 %	25 %	0 %	0 %	291294516
2026	NC_013946	A	7	7	90835	90841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2031	NC_013946	CTTT	2	8	91040	91047	0 %	75 %	0 %	25 %	291294517
2032	NC_013946	G	6	6	91051	91056	0 %	0 %	100 %	0 %	291294517
2033	NC_013946	A	6	6	91068	91073	100 %	0 %	0 %	0 %	291294517
2034	NC_013946	ATG	3	9	91087	91095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294517
2035	NC_013946	TGTGGC	2	12	91116	91127	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291294517
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2039	NC_013946	CGGTG	2	10	91314	91323	0 %	20 %	60 %	20 %	291294517
2040	NC_013946	TCA	2	6	91358	91363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294517
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2055	NC_013946	GATG	2	8	91884	91891	25 %	25 %	50 %	0 %	291294517
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2059	NC_013946	TGG	2	6	92090	92095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294517
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2062	NC_013946	GGGT	2	8	92135	92142	0 %	25 %	75 %	0 %	291294517
2063	NC_013946	CGG	2	6	92240	92245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294517
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2073	NC_013946	TAC	2	6	92688	92693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2093	NC_013946	CGG	2	6	93528	93533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2099	NC_013946	TCCA	2	8	93714	93721	25 %	25 %	0 %	50 %	291294520
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2102	NC_013946	GA	3	6	93857	93862	50 %	0 %	50 %	0 %	291294520
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2110	NC_013946	TCC	2	6	94174	94179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294520
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2122	NC_013946	T	6	6	94779	94784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_013946	G	7	7	94794	94800	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_013946	AGGG	2	8	94890	94897	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2125	NC_013946	GTA	2	6	94933	94938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294521
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2257	NC_013946	CAC	2	6	101348	101353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294526
2258	NC_013946	CCG	2	6	101402	101407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294526
2259	NC_013946	GGT	2	6	101460	101465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294526
2260	NC_013946	GGCT	2	8	101509	101516	0 %	25 %	50 %	25 %	291294526
2261	NC_013946	GAC	2	6	101527	101532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294526
2262	NC_013946	TGG	2	6	101567	101572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294526
2263	NC_013946	GTT	2	6	101590	101595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294526
2264	NC_013946	ACA	2	6	101726	101731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294526
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2267	NC_013946	AAAG	2	8	101862	101869	75 %	0 %	25 %	0 %	291294526
2268	NC_013946	GAA	2	6	102049	102054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294526
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2270	NC_013946	CTA	2	6	102261	102266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294526
2271	NC_013946	C	7	7	102359	102365	0 %	0 %	0 %	100 %	291294526
2272	NC_013946	GACC	2	8	102417	102424	25 %	0 %	25 %	50 %	291294526
2273	NC_013946	TTC	2	6	102433	102438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294526
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2279	NC_013946	ACC	3	9	102892	102900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294526
2280	NC_013946	TGC	2	6	102920	102925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294526
2281	NC_013946	C	6	6	103064	103069	0 %	0 %	0 %	100 %	291294526
2282	NC_013946	CTA	2	6	103074	103079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294526
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2285	NC_013946	AACG	2	8	103236	103243	50 %	0 %	25 %	25 %	291294526
2286	NC_013946	GCA	2	6	103286	103291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294526
2287	NC_013946	TACGC	2	10	103338	103347	20 %	20 %	20 %	40 %	291294526
2288	NC_013946	GAA	2	6	103425	103430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2289	NC_013946	GCA	2	6	103495	103500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294527
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2293	NC_013946	GCG	2	6	103678	103683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294527
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2295	NC_013946	GCG	2	6	103761	103766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294527
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2302	NC_013946	CGGC	2	8	104154	104161	0 %	0 %	50 %	50 %	291294528
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2331	NC_013946	CAG	2	6	106297	106302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294530
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2338	NC_013946	C	6	6	106664	106669	0 %	0 %	0 %	100 %	291294530
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2352	NC_013946	CCT	2	6	107391	107396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294531
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2366	NC_013946	G	7	7	108119	108125	0 %	0 %	100 %	0 %	291294532
2367	NC_013946	CCG	2	6	108179	108184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294532
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2371	NC_013946	GCCGA	2	10	108240	108249	20 %	0 %	40 %	40 %	291294532
2372	NC_013946	C	6	6	108333	108338	0 %	0 %	0 %	100 %	291294532
2373	NC_013946	TCC	2	6	108363	108368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294532
2374	NC_013946	CAA	2	6	108404	108409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294532
2375	NC_013946	CCA	2	6	108415	108420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294532
2376	NC_013946	CCT	4	12	108484	108495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294532
2377	NC_013946	TCG	2	6	108552	108557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294532
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2379	NC_013946	A	6	6	108651	108656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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