MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013946	GTA	2	6	68492	68497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294487
1502	NC_013946	TCC	2	6	68517	68522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294487
1503	NC_013946	TCC	2	6	68562	68567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294487
1504	NC_013946	CCA	2	6	68605	68610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294487
1505	NC_013946	C	6	6	68694	68699	0 %	0 %	0 %	100 %	291294487
1506	NC_013946	GCA	2	6	68741	68746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294488
1507	NC_013946	GCG	2	6	68770	68775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294488
1508	NC_013946	CAC	2	6	68781	68786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294488
1509	NC_013946	TCGGCC	2	12	68848	68859	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291294488
1510	NC_013946	TTCGGC	2	12	68874	68885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294488
1511	NC_013946	CAG	2	6	68895	68900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294488
1512	NC_013946	GCC	2	6	68967	68972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294488
1513	NC_013946	GCG	2	6	68990	68995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294488
1514	NC_013946	GTT	2	6	69021	69026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294488
1515	NC_013946	TACGC	2	10	69071	69080	20 %	20 %	20 %	40 %	291294488
1516	NC_013946	CCT	2	6	69081	69086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294489
1517	NC_013946	CCCG	2	8	69093	69100	0 %	0 %	25 %	75 %	291294489
1518	NC_013946	CGG	2	6	69153	69158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294489
1519	NC_013946	GCCC	2	8	69185	69192	0 %	0 %	25 %	75 %	291294489
1520	NC_013946	GTG	2	6	69219	69224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294489
1521	NC_013946	CTG	2	6	69266	69271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294489
1522	NC_013946	GGCCA	2	10	69273	69282	20 %	0 %	40 %	40 %	291294489
1523	NC_013946	GTT	2	6	69296	69301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294489
1524	NC_013946	CCCG	2	8	69365	69372	0 %	0 %	25 %	75 %	291294489
1525	NC_013946	GTA	2	6	69416	69421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294489
1526	NC_013946	TGG	3	9	69436	69444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294489
1527	NC_013946	CCG	2	6	69451	69456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294489
1528	NC_013946	GCC	2	6	69476	69481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294489
1529	NC_013946	TAA	2	6	69499	69504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291294489
1530	NC_013946	CACCC	2	10	69518	69527	20 %	0 %	0 %	80 %	291294489
1531	NC_013946	GGT	2	6	69553	69558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294489
1532	NC_013946	CTG	2	6	69659	69664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294489
1533	NC_013946	TCC	2	6	69792	69797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294489
1534	NC_013946	GCC	2	6	69864	69869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294489
1535	NC_013946	TCC	2	6	69965	69970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_013946	G	6	6	70099	70104	0 %	0 %	100 %	0 %	291294490
1537	NC_013946	GTA	2	6	70148	70153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294490
1538	NC_013946	GTA	2	6	70187	70192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294490
1539	NC_013946	CAC	2	6	70310	70315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294490
1540	NC_013946	CAC	2	6	70355	70360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294490
1541	NC_013946	CTGC	2	8	70382	70389	0 %	25 %	25 %	50 %	291294490
1542	NC_013946	GCC	2	6	70412	70417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294490
1543	NC_013946	GGGC	2	8	70434	70441	0 %	0 %	75 %	25 %	291294490
1544	NC_013946	CCT	2	6	70474	70479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294490
1545	NC_013946	TCC	2	6	70487	70492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_013946	CAG	2	6	70511	70516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294491
1547	NC_013946	CCA	2	6	70570	70575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294491
1548	NC_013946	TTG	3	9	70593	70601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294491
1549	NC_013946	CGC	2	6	70624	70629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294491
1550	NC_013946	CAG	3	9	70637	70645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294491
1551	NC_013946	GTG	3	9	70674	70682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294491
1552	NC_013946	GTA	2	6	70706	70711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294491
1553	NC_013946	CAC	2	6	70838	70843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294491
1554	NC_013946	CGC	2	6	70898	70903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294491
1555	NC_013946	CTC	2	6	70918	70923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_013946	AAGC	2	8	70960	70967	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_013946	GCT	2	6	71024	71029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_013946	TTG	2	6	71049	71054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_013946	GCA	2	6	71108	71113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294492
1560	NC_013946	C	6	6	71119	71124	0 %	0 %	0 %	100 %	291294492
1561	NC_013946	CGT	2	6	71168	71173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294492
1562	NC_013946	CGGG	2	8	71175	71182	0 %	0 %	75 %	25 %	291294492
1563	NC_013946	CGT	2	6	71237	71242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294492
1564	NC_013946	C	6	6	71304	71309	0 %	0 %	0 %	100 %	291294492
1565	NC_013946	C	6	6	71364	71369	0 %	0 %	0 %	100 %	291294492
1566	NC_013946	C	6	6	71402	71407	0 %	0 %	0 %	100 %	291294492
1567	NC_013946	GAA	2	6	71412	71417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294492
1568	NC_013946	CCA	2	6	71432	71437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294492
1569	NC_013946	CAA	2	6	71439	71444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294492
1570	NC_013946	GC	3	6	71491	71496	0 %	0 %	50 %	50 %	291294492
1571	NC_013946	GAA	2	6	71517	71522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294492
1572	NC_013946	CTG	2	6	71527	71532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294492
1573	NC_013946	CGC	2	6	71536	71541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294492
1574	NC_013946	CTT	2	6	71561	71566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294492
1575	NC_013946	CCA	2	6	71645	71650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294492
1576	NC_013946	CCCCGA	2	12	71685	71696	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	291294492
1577	NC_013946	GTCT	2	8	71722	71729	0 %	50 %	25 %	25 %	291294492
1578	NC_013946	CTTTTT	2	12	71769	71780	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1579	NC_013946	T	7	7	71776	71782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_013946	A	6	6	71812	71817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_013946	GGC	2	6	71851	71856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_013946	T	6	6	71911	71916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_013946	AAGA	2	8	71969	71976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_013946	T	8	8	71982	71989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_013946	CTT	2	6	72084	72089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_013946	GT	3	6	72128	72133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_013946	ACA	2	6	72161	72166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_013946	CGT	2	6	72174	72179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_013946	T	6	6	72206	72211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_013946	T	6	6	72244	72249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_013946	ACA	2	6	72270	72275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_013946	TTTGG	2	10	72315	72324	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_013946	TGC	2	6	72375	72380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294493
1594	NC_013946	GGC	2	6	72401	72406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294493
1595	NC_013946	GCCCT	2	10	72452	72461	0 %	20 %	20 %	60 %	291294493
1596	NC_013946	GGC	2	6	72478	72483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294493
1597	NC_013946	GTT	2	6	72530	72535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294493
1598	NC_013946	CAC	2	6	72556	72561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294493
1599	NC_013946	CCT	2	6	72564	72569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294494
1600	NC_013946	CCA	2	6	72654	72659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294494
1601	NC_013946	CCG	2	6	72663	72668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294494
1602	NC_013946	GTC	2	6	72679	72684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294494
1603	NC_013946	GTG	2	6	72826	72831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294494
1604	NC_013946	TC	3	6	72877	72882	0 %	50 %	0 %	50 %	291294494
1605	NC_013946	CCA	2	6	72939	72944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294494
1606	NC_013946	TGAGGG	2	12	72954	72965	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	291294494
1607	NC_013946	TCA	2	6	73086	73091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294494
1608	NC_013946	CAG	2	6	73102	73107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294494
1609	NC_013946	CAG	2	6	73190	73195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294495
1610	NC_013946	G	6	6	73208	73213	0 %	0 %	100 %	0 %	291294495
1611	NC_013946	GGC	2	6	73265	73270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294495
1612	NC_013946	GGGA	2	8	73310	73317	25 %	0 %	75 %	0 %	291294495
1613	NC_013946	C	6	6	73332	73337	0 %	0 %	0 %	100 %	291294495
1614	NC_013946	CTT	2	6	73363	73368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294495
1615	NC_013946	GATG	2	8	73445	73452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013946	G	6	6	73460	73465	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_013946	TCT	2	6	73497	73502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_013946	GAT	2	6	73527	73532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294496
1619	NC_013946	CCG	2	6	73558	73563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294496
1620	NC_013946	CCG	2	6	73573	73578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294496
1621	NC_013946	GTT	2	6	73594	73599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294496
1622	NC_013946	CCT	2	6	73609	73614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294496
1623	NC_013946	GCACC	2	10	73646	73655	20 %	0 %	20 %	60 %	291294496
1624	NC_013946	GTTTTC	2	12	73746	73757	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	291294496
1625	NC_013946	CCG	2	6	73760	73765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294496
1626	NC_013946	CCT	2	6	73941	73946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294497
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1628	NC_013946	TGG	2	6	74066	74071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294497
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