MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_013946	AGG	2	6	848970	848975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295254
19003	NC_013946	AGA	3	9	848985	848993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295254
19004	NC_013946	CCA	2	6	849024	849029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295254
19005	NC_013946	AGC	2	6	849053	849058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295254
19006	NC_013946	CAG	2	6	849124	849129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295254
19007	NC_013946	CCA	2	6	849138	849143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295254
19008	NC_013946	GAA	2	6	849145	849150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295254
19009	NC_013946	CCG	2	6	849188	849193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295254
19010	NC_013946	AGC	3	9	849242	849250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295254
19011	NC_013946	GTA	2	6	849334	849339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295254
19012	NC_013946	GCCACC	3	18	849386	849403	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	291295254
19013	NC_013946	GGT	2	6	849435	849440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295254
19014	NC_013946	CAG	2	6	849541	849546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295254
19015	NC_013946	GGT	2	6	849616	849621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295254
19016	NC_013946	CAG	2	6	849646	849651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295254
19017	NC_013946	CTC	2	6	849669	849674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295255
19018	NC_013946	GGGGCC	2	12	849697	849708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295255
19019	NC_013946	AGA	2	6	849770	849775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295255
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19021	NC_013946	ACCGT	2	10	849865	849874	20 %	20 %	20 %	40 %	291295255
19022	NC_013946	GCA	2	6	849878	849883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295255
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19024	NC_013946	CACC	2	8	850022	850029	25 %	0 %	0 %	75 %	291295255
19025	NC_013946	CCT	2	6	850081	850086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295256
19026	NC_013946	AGC	2	6	850107	850112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295256
19027	NC_013946	CAG	2	6	850175	850180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295256
19028	NC_013946	CAG	2	6	850214	850219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295256
19029	NC_013946	CAG	2	6	850250	850255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295256
19030	NC_013946	CCCCA	2	10	850257	850266	20 %	0 %	0 %	80 %	291295256
19031	NC_013946	CCA	2	6	850351	850356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295256
19032	NC_013946	CCCG	2	8	850373	850380	0 %	0 %	25 %	75 %	291295256
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19037	NC_013946	A	6	6	850668	850673	100 %	0 %	0 %	0 %	291295257
19038	NC_013946	CCA	2	6	850751	850756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295257
19039	NC_013946	CCAG	2	8	850763	850770	25 %	0 %	25 %	50 %	291295257
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19050	NC_013946	C	6	6	851088	851093	0 %	0 %	0 %	100 %	291295257
19051	NC_013946	GCA	2	6	851132	851137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295257
19052	NC_013946	CGC	2	6	851151	851156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295257
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19054	NC_013946	ACCCC	2	10	851258	851267	20 %	0 %	0 %	80 %	291295257
19055	NC_013946	CAG	2	6	851268	851273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295257
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19087	NC_013946	CAGC	2	8	852717	852724	25 %	0 %	25 %	50 %	291295257
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19089	NC_013946	A	6	6	852754	852759	100 %	0 %	0 %	0 %	291295257
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19092	NC_013946	GCC	2	6	852856	852861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19093	NC_013946	CGGG	2	8	852902	852909	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19094	NC_013946	GCCC	2	8	853011	853018	0 %	0 %	25 %	75 %	291295258
19095	NC_013946	GGCCC	2	10	853034	853043	0 %	0 %	40 %	60 %	291295258
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19119	NC_013946	GGC	2	6	854174	854179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295258
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19242	NC_013946	G	6	6	860427	860432	0 %	0 %	100 %	0 %	291295262
19243	NC_013946	CCT	2	6	860456	860461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295262
19244	NC_013946	GCGGCC	2	12	860482	860493	0 %	0 %	50 %	50 %	291295262
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19247	NC_013946	GGGAG	2	10	860561	860570	20 %	0 %	80 %	0 %	291295262
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19344	NC_013946	TACGT	2	10	864882	864891	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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19355	NC_013946	CAT	2	6	865398	865403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295266
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19358	NC_013946	GGT	3	9	865473	865481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295266
19359	NC_013946	TTC	2	6	865482	865487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291295266
19360	NC_013946	TGG	2	6	865529	865534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295266
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19363	NC_013946	GTT	2	6	865623	865628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291295267
19364	NC_013946	TGG	2	6	865646	865651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295267
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19375	NC_013946	AATC	2	8	866462	866469	50 %	25 %	0 %	25 %	291295267
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19400	NC_013946	GCC	2	6	867435	867440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295268
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19411	NC_013946	TGC	3	9	868002	868010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295269
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19422	NC_013946	GCC	2	6	868397	868402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295269
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19426	NC_013946	GAA	2	6	868552	868557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295269
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19460	NC_013946	GGC	2	6	869977	869982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295270
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19465	NC_013946	CCA	2	6	870160	870165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19466	NC_013946	CAT	2	6	870202	870207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295271
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19468	NC_013946	GTC	2	6	870276	870281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295271
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19470	NC_013946	CCT	2	6	870428	870433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295271
19471	NC_013946	CTC	2	6	870456	870461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295271
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19476	NC_013946	CATAC	2	10	870591	870600	40 %	20 %	0 %	40 %	291295271
19477	NC_013946	GCA	2	6	870611	870616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295271
19478	NC_013946	CAC	2	6	870648	870653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295271
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19480	NC_013946	GTA	2	6	870717	870722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295271
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19482	NC_013946	GCT	2	6	870759	870764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295271
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