MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_013946	CGG	2	6	803825	803830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295202
18003	NC_013946	GGGCC	2	10	803852	803861	0 %	0 %	60 %	40 %	291295202
18004	NC_013946	TGA	2	6	803879	803884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295202
18005	NC_013946	GT	3	6	803993	803998	0 %	50 %	50 %	0 %	291295202
18006	NC_013946	CCCGA	2	10	804009	804018	20 %	0 %	20 %	60 %	291295202
18007	NC_013946	CTG	2	6	804040	804045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295202
18008	NC_013946	CAG	2	6	804132	804137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295202
18009	NC_013946	GCAC	2	8	804172	804179	25 %	0 %	25 %	50 %	291295202
18010	NC_013946	TGT	2	6	804271	804276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_013946	AGG	3	9	804307	804315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18012	NC_013946	GT	3	6	804333	804338	0 %	50 %	50 %	0 %	291295203
18013	NC_013946	TGC	2	6	804342	804347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295203
18014	NC_013946	TGG	2	6	804348	804353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295203
18015	NC_013946	TGG	2	6	804363	804368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295203
18016	NC_013946	TGG	2	6	804411	804416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295203
18017	NC_013946	G	6	6	804427	804432	0 %	0 %	100 %	0 %	291295203
18018	NC_013946	AGA	2	6	804589	804594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295203
18019	NC_013946	GTC	2	6	804656	804661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295203
18020	NC_013946	CGC	2	6	804674	804679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295203
18021	NC_013946	GCCCA	2	10	804695	804704	20 %	0 %	20 %	60 %	291295203
18022	NC_013946	CCTG	2	8	804778	804785	0 %	25 %	25 %	50 %	291295203
18023	NC_013946	GTG	2	6	804821	804826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295203
18024	NC_013946	CGATGG	2	12	804922	804933	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291295203
18025	NC_013946	ACA	2	6	804939	804944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291295203
18026	NC_013946	GCG	2	6	805031	805036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295203
18027	NC_013946	CCA	2	6	805038	805043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295203
18028	NC_013946	AAT	2	6	805046	805051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291295203
18029	NC_013946	G	6	6	805074	805079	0 %	0 %	100 %	0 %	291295203
18030	NC_013946	CTG	2	6	805085	805090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295203
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18032	NC_013946	TGCC	2	8	805179	805186	0 %	25 %	25 %	50 %	291295203
18033	NC_013946	CGG	3	9	805197	805205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295203
18034	NC_013946	G	6	6	805222	805227	0 %	0 %	100 %	0 %	291295203
18035	NC_013946	GCC	3	9	805271	805279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295203
18036	NC_013946	CAT	2	6	805294	805299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295203
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18038	NC_013946	CTA	2	6	805405	805410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295203
18039	NC_013946	TGA	2	6	805605	805610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295203
18040	NC_013946	GC	3	6	805613	805618	0 %	0 %	50 %	50 %	291295203
18041	NC_013946	GACCT	2	10	805625	805634	20 %	20 %	20 %	40 %	291295203
18042	NC_013946	CGG	2	6	805665	805670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295203
18043	NC_013946	GCC	2	6	805698	805703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295203
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18045	NC_013946	GCC	2	6	805778	805783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295203
18046	NC_013946	GCA	2	6	805863	805868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295203
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18050	NC_013946	CAG	2	6	805990	805995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295203
18051	NC_013946	GGC	2	6	806063	806068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295203
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18053	NC_013946	CAA	2	6	806239	806244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291295203
18054	NC_013946	TGT	2	6	806263	806268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291295203
18055	NC_013946	GAC	3	9	806294	806302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295203
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18060	NC_013946	CCGGC	2	10	806585	806594	0 %	0 %	40 %	60 %	291295204
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18064	NC_013946	AGC	3	9	806780	806788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295204
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18107	NC_013946	ATG	2	6	808645	808650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295205
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18109	NC_013946	ACC	2	6	808701	808706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295206
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18112	NC_013946	G	6	6	808820	808825	0 %	0 %	100 %	0 %	291295206
18113	NC_013946	GGA	2	6	808877	808882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295206
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18120	NC_013946	GCGA	2	8	809239	809246	25 %	0 %	50 %	25 %	291295207
18121	NC_013946	GCA	2	6	809249	809254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295207
18122	NC_013946	CAG	2	6	809430	809435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295207
18123	NC_013946	CCA	2	6	809444	809449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295207
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18125	NC_013946	CCA	2	6	809519	809524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295207
18126	NC_013946	GAGC	2	8	809541	809548	25 %	0 %	50 %	25 %	291295207
18127	NC_013946	CCAG	2	8	809564	809571	25 %	0 %	25 %	50 %	291295207
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18131	NC_013946	GCA	2	6	809849	809854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295207
18132	NC_013946	AGGCC	2	10	809900	809909	20 %	0 %	40 %	40 %	291295207
18133	NC_013946	CAAA	2	8	809915	809922	75 %	0 %	0 %	25 %	291295207
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18137	NC_013946	GCG	2	6	810199	810204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295208
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18140	NC_013946	GAG	2	6	810261	810266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295208
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18150	NC_013946	TACA	2	8	810719	810726	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18151	NC_013946	AGATTT	2	12	810732	810743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18152	NC_013946	GCT	2	6	810817	810822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295209
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18183	NC_013946	TGGC	2	8	812186	812193	0 %	25 %	50 %	25 %	291295212
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18221	NC_013946	CTG	2	6	813989	813994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295214
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18229	NC_013946	CACT	2	8	814375	814382	25 %	25 %	0 %	50 %	291295214
18230	NC_013946	GCC	2	6	814412	814417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18231	NC_013946	GGGC	2	8	814426	814433	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18232	NC_013946	AC	3	6	814458	814463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18233	NC_013946	AGC	2	6	814547	814552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18234	NC_013946	AGG	2	6	814566	814571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18235	NC_013946	CGC	2	6	814618	814623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18236	NC_013946	ATA	2	6	814644	814649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18237	NC_013946	AGC	2	6	814669	814674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18238	NC_013946	CCTGGC	2	12	814699	814710	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291295215
18239	NC_013946	T	7	7	814725	814731	0 %	100 %	0 %	0 %	291295215
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18246	NC_013946	CTG	2	6	815039	815044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295215
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18250	NC_013946	CCGA	2	8	815228	815235	25 %	0 %	25 %	50 %	291295215
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18351	NC_013946	TAC	2	6	819745	819750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18353	NC_013946	A	6	6	819852	819857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18354	NC_013946	CAA	2	6	819971	819976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291295219
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18357	NC_013946	C	7	7	820103	820109	0 %	0 %	0 %	100 %	291295219
18358	NC_013946	CGG	2	6	820126	820131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295219
18359	NC_013946	GGC	2	6	820136	820141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295219
18360	NC_013946	AGC	2	6	820157	820162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295219
18361	NC_013946	GCC	3	9	820182	820190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295219
18362	NC_013946	AGGCC	2	10	820201	820210	20 %	0 %	40 %	40 %	291295219
18363	NC_013946	CAC	2	6	820214	820219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295219
18364	NC_013946	GTC	2	6	820238	820243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295219
18365	NC_013946	GCA	2	6	820291	820296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295219
18366	NC_013946	GAA	2	6	820298	820303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295219
18367	NC_013946	GT	3	6	820335	820340	0 %	50 %	50 %	0 %	291295219
18368	NC_013946	GCA	2	6	820360	820365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295219
18369	NC_013946	TGG	2	6	820510	820515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295219
18370	NC_013946	AGCACC	2	12	820524	820535	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	291295219
18371	NC_013946	CCA	2	6	820537	820542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295219
18372	NC_013946	GGC	2	6	820553	820558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295219
18373	NC_013946	GAA	2	6	820574	820579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295219
18374	NC_013946	GC	3	6	820603	820608	0 %	0 %	50 %	50 %	291295219
18375	NC_013946	CAG	2	6	820637	820642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295219
18376	NC_013946	AGC	3	9	820737	820745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295219
18377	NC_013946	C	7	7	820745	820751	0 %	0 %	0 %	100 %	291295219
18378	NC_013946	CAG	3	9	820760	820768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295219
18379	NC_013946	CTG	2	6	820814	820819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295219
18380	NC_013946	GGA	2	6	820867	820872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295219
18381	NC_013946	GCA	2	6	820909	820914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295219
18382	NC_013946	AGC	2	6	820950	820955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295219
18383	NC_013946	GCACC	2	10	820963	820972	20 %	0 %	20 %	60 %	291295219
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18385	NC_013946	CAG	2	6	821078	821083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295219
18386	NC_013946	AGAA	2	8	821094	821101	75 %	0 %	25 %	0 %	291295219
18387	NC_013946	GCA	2	6	821146	821151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295219
18388	NC_013946	CAG	2	6	821153	821158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295219
18389	NC_013946	GGT	2	6	821174	821179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295219
18390	NC_013946	GGCT	2	8	821215	821222	0 %	25 %	50 %	25 %	291295219
18391	NC_013946	CAC	2	6	821300	821305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295219
18392	NC_013946	CCA	2	6	821347	821352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295219
18393	NC_013946	TGC	2	6	821398	821403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295219
18394	NC_013946	GGC	2	6	821444	821449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295219
18395	NC_013946	CAA	2	6	821480	821485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291295219
18396	NC_013946	CCA	2	6	821488	821493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295219
18397	NC_013946	CCAG	2	8	821571	821578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18398	NC_013946	GGC	2	6	821696	821701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295220
18399	NC_013946	ACC	2	6	821704	821709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295220
18400	NC_013946	TGC	2	6	821713	821718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295220
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18404	NC_013946	GAT	2	6	821768	821773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295220
18405	NC_013946	ACCG	2	8	821775	821782	25 %	0 %	25 %	50 %	291295220
18406	NC_013946	GGCT	2	8	821791	821798	0 %	25 %	50 %	25 %	291295220
18407	NC_013946	GCCCA	2	10	821823	821832	20 %	0 %	20 %	60 %	291295220
18408	NC_013946	GAG	2	6	821898	821903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295220
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18410	NC_013946	TGG	2	6	821965	821970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295220
18411	NC_013946	CTG	2	6	821991	821996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295220
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18417	NC_013946	CTG	2	6	822126	822131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295220
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18421	NC_013946	GTC	2	6	822278	822283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295221
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18424	NC_013946	GCT	2	6	822467	822472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295221
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18427	NC_013946	G	6	6	822571	822576	0 %	0 %	100 %	0 %	291295221
18428	NC_013946	GGGC	2	8	822637	822644	0 %	0 %	75 %	25 %	291295221
18429	NC_013946	ACG	2	6	822792	822797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295221
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18431	NC_013946	TGG	2	6	823002	823007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295221
18432	NC_013946	GCG	2	6	823014	823019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295221
18433	NC_013946	CTG	2	6	823055	823060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295221
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18439	NC_013946	CCTGCC	2	12	823210	823221	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	291295221
18440	NC_013946	ACC	2	6	823224	823229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295221
18441	NC_013946	GGC	2	6	823404	823409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18442	NC_013946	TGC	2	6	823418	823423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18443	NC_013946	AT	3	6	823430	823435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18444	NC_013946	TAC	2	6	823509	823514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295222
18445	NC_013946	GAG	2	6	823548	823553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295222
18446	NC_013946	G	6	6	823676	823681	0 %	0 %	100 %	0 %	291295222
18447	NC_013946	CTGG	2	8	823748	823755	0 %	25 %	50 %	25 %	291295223
18448	NC_013946	CCT	2	6	823796	823801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295223
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18450	NC_013946	T	6	6	823812	823817	0 %	100 %	0 %	0 %	291295223
18451	NC_013946	TTTTA	2	10	823832	823841	20 %	80 %	0 %	0 %	291295223
18452	NC_013946	TCGAGG	2	12	823951	823962	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291295223
18453	NC_013946	GAC	2	6	823974	823979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295223
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18455	NC_013946	GCT	2	6	824024	824029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295223
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18460	NC_013946	GCT	3	9	824222	824230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295223
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18462	NC_013946	GCTG	2	8	824255	824262	0 %	25 %	50 %	25 %	291295223
18463	NC_013946	TTA	2	6	824328	824333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291295223
18464	NC_013946	TTA	2	6	824410	824415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18465	NC_013946	GAT	2	6	824494	824499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18466	NC_013946	AGA	2	6	824547	824552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18467	NC_013946	GCTC	2	8	824579	824586	0 %	25 %	25 %	50 %	291295224
18468	NC_013946	AACC	2	8	824593	824600	50 %	0 %	0 %	50 %	291295224
18469	NC_013946	GTG	2	6	824639	824644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295224
18470	NC_013946	GGT	2	6	824650	824655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295224
18471	NC_013946	C	8	8	824679	824686	0 %	0 %	0 %	100 %	291295224
18472	NC_013946	GCG	2	6	824797	824802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295224
18473	NC_013946	CAC	2	6	824810	824815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295224
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18475	NC_013946	GTG	2	6	824834	824839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295224
18476	NC_013946	GCT	2	6	824869	824874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295224
18477	NC_013946	G	6	6	824904	824909	0 %	0 %	100 %	0 %	291295224
18478	NC_013946	ACTGGG	2	12	824913	824924	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291295224
18479	NC_013946	CAC	3	9	824935	824943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295224
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18481	NC_013946	GGC	3	9	825019	825027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295224
18482	NC_013946	GTG	2	6	825082	825087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295224
18483	NC_013946	ACC	2	6	825122	825127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295224
18484	NC_013946	GGC	2	6	825178	825183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295224
18485	NC_013946	CTG	2	6	825191	825196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295224
18486	NC_013946	GCA	2	6	825219	825224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295224
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18491	NC_013946	GAG	2	6	825385	825390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295225
18492	NC_013946	TGT	2	6	825420	825425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291295226
18493	NC_013946	CTG	2	6	825430	825435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295226
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