MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_013946	GTC	2	6	715022	715027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295131
16002	NC_013946	GC	3	6	715064	715069	0 %	0 %	50 %	50 %	291295131
16003	NC_013946	CTG	2	6	715114	715119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_013946	CAC	2	6	715168	715173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295132
16005	NC_013946	CAG	2	6	715237	715242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295132
16006	NC_013946	GCT	2	6	715356	715361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295132
16007	NC_013946	CGG	2	6	715394	715399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295132
16008	NC_013946	CGG	4	12	715428	715439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295132
16009	NC_013946	GTG	3	9	715477	715485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295132
16010	NC_013946	GCA	2	6	715596	715601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295132
16011	NC_013946	GCCCG	2	10	715602	715611	0 %	0 %	40 %	60 %	291295132
16012	NC_013946	GCG	2	6	715622	715627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295132
16013	NC_013946	CGG	2	6	715641	715646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295132
16014	NC_013946	ATG	2	6	715649	715654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295132
16015	NC_013946	AGG	2	6	715704	715709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295132
16016	NC_013946	CAC	2	6	715759	715764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295132
16017	NC_013946	CCT	2	6	715782	715787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295132
16018	NC_013946	CGC	2	6	715788	715793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295132
16019	NC_013946	CCA	2	6	715833	715838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295132
16020	NC_013946	CCT	2	6	715839	715844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295132
16021	NC_013946	GCT	2	6	715881	715886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295132
16022	NC_013946	GCG	2	6	715909	715914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295132
16023	NC_013946	AGC	2	6	715934	715939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295132
16024	NC_013946	GTC	2	6	715954	715959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295132
16025	NC_013946	GAT	2	6	715960	715965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295132
16026	NC_013946	GAT	2	6	716020	716025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295132
16027	NC_013946	CAC	2	6	716056	716061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295132
16028	NC_013946	GCG	2	6	716078	716083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295132
16029	NC_013946	GGC	2	6	716104	716109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295132
16030	NC_013946	TCC	2	6	716192	716197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295132
16031	NC_013946	CCT	2	6	716235	716240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295132
16032	NC_013946	CCT	2	6	716259	716264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295132
16033	NC_013946	TCT	2	6	716325	716330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291295132
16034	NC_013946	TCC	2	6	716348	716353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295132
16035	NC_013946	TCG	2	6	716357	716362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295132
16036	NC_013946	CG	3	6	716371	716376	0 %	0 %	50 %	50 %	291295132
16037	NC_013946	GCT	2	6	716385	716390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295132
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16039	NC_013946	TGGA	2	8	716486	716493	25 %	25 %	50 %	0 %	291295132
16040	NC_013946	GC	3	6	716495	716500	0 %	0 %	50 %	50 %	291295132
16041	NC_013946	TCA	2	6	716505	716510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295132
16042	NC_013946	TCC	2	6	716555	716560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295132
16043	NC_013946	GCT	2	6	716565	716570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295132
16044	NC_013946	CTC	2	6	716581	716586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295132
16045	NC_013946	GCTCGA	2	12	716604	716615	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291295132
16046	NC_013946	GGC	2	6	716686	716691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295132
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16049	NC_013946	GGC	2	6	716752	716757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295132
16050	NC_013946	CTG	2	6	716767	716772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295132
16051	NC_013946	CGG	2	6	716780	716785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295132
16052	NC_013946	TGC	2	6	716826	716831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295132
16053	NC_013946	CAC	5	15	716842	716856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295132
16054	NC_013946	CGGA	2	8	717180	717187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16055	NC_013946	AGCA	2	8	717237	717244	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16056	NC_013946	CGG	2	6	717378	717383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295133
16057	NC_013946	ATCA	2	8	717442	717449	50 %	25 %	0 %	25 %	291295133
16058	NC_013946	GTTT	2	8	717546	717553	0 %	75 %	25 %	0 %	291295133
16059	NC_013946	CGT	2	6	717588	717593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295133
16060	NC_013946	GCCC	2	8	717659	717666	0 %	0 %	25 %	75 %	291295133
16061	NC_013946	GGT	2	6	717673	717678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295133
16062	NC_013946	TGA	2	6	717723	717728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295133
16063	NC_013946	GCC	2	6	717758	717763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295133
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16068	NC_013946	AGG	2	6	717956	717961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295133
16069	NC_013946	TCG	2	6	717962	717967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295133
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16071	NC_013946	C	7	7	718035	718041	0 %	0 %	0 %	100 %	291295133
16072	NC_013946	CTG	2	6	718045	718050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295133
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16078	NC_013946	CTG	2	6	718192	718197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295133
16079	NC_013946	AC	3	6	718297	718302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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16086	NC_013946	GCG	2	6	718661	718666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295134
16087	NC_013946	GCT	2	6	718690	718695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295134
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16090	NC_013946	G	8	8	718804	718811	0 %	0 %	100 %	0 %	291295134
16091	NC_013946	A	6	6	718822	718827	100 %	0 %	0 %	0 %	291295134
16092	NC_013946	CTCA	2	8	718840	718847	25 %	25 %	0 %	50 %	291295135
16093	NC_013946	GC	3	6	718874	718879	0 %	0 %	50 %	50 %	291295135
16094	NC_013946	GGCC	2	8	718941	718948	0 %	0 %	50 %	50 %	291295135
16095	NC_013946	GGCC	2	8	718995	719002	0 %	0 %	50 %	50 %	291295135
16096	NC_013946	GGT	2	6	719008	719013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295135
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16101	NC_013946	C	7	7	719214	719220	0 %	0 %	0 %	100 %	291295135
16102	NC_013946	CCT	2	6	719298	719303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295135
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16104	NC_013946	CCGGG	2	10	719358	719367	0 %	0 %	60 %	40 %	291295135
16105	NC_013946	C	6	6	719370	719375	0 %	0 %	0 %	100 %	291295135
16106	NC_013946	CAC	3	9	719377	719385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295135
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16112	NC_013946	CCAG	2	8	719733	719740	25 %	0 %	25 %	50 %	291295135
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16120	NC_013946	ATT	2	6	720014	720019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291295135
16121	NC_013946	ATA	2	6	720032	720037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291295135
16122	NC_013946	ACA	2	6	720051	720056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16123	NC_013946	TTA	2	6	720059	720064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_013946	TCA	2	6	720087	720092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16125	NC_013946	GCA	2	6	720200	720205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295136
16126	NC_013946	CGG	2	6	720242	720247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295136
16127	NC_013946	AGC	2	6	720386	720391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295136
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16129	NC_013946	CTGG	2	8	720555	720562	0 %	25 %	50 %	25 %	291295136
16130	NC_013946	TCG	2	6	720589	720594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295136
16131	NC_013946	CG	3	6	720593	720598	0 %	0 %	50 %	50 %	291295136
16132	NC_013946	G	6	6	720637	720642	0 %	0 %	100 %	0 %	291295136
16133	NC_013946	GCT	2	6	720653	720658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295136
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16137	NC_013946	GAT	2	6	721170	721175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16139	NC_013946	GCA	2	6	721275	721280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295137
16140	NC_013946	CCG	2	6	721298	721303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295137
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16145	NC_013946	GCTG	2	8	721494	721501	0 %	25 %	50 %	25 %	291295137
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16152	NC_013946	GCC	2	6	721772	721777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295137
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16360	NC_013946	CACCCG	2	12	730520	730531	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	291295139
16361	NC_013946	CACCC	2	10	730613	730622	20 %	0 %	0 %	80 %	291295139
16362	NC_013946	CGG	2	6	730720	730725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295139
16363	NC_013946	CAG	2	6	730769	730774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295139
16364	NC_013946	GGC	2	6	730972	730977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295139
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16366	NC_013946	CACC	2	8	731113	731120	25 %	0 %	0 %	75 %	291295139
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16374	NC_013946	CCT	2	6	731839	731844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295139
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16467	NC_013946	G	7	7	735865	735871	0 %	0 %	100 %	0 %	291295141
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16469	NC_013946	GC	3	6	735943	735948	0 %	0 %	50 %	50 %	291295141
16470	NC_013946	GGT	2	6	735965	735970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295141
16471	NC_013946	G	6	6	735971	735976	0 %	0 %	100 %	0 %	291295141
16472	NC_013946	ACCTG	2	10	736050	736059	20 %	20 %	20 %	40 %	291295141
16473	NC_013946	GGGC	2	8	736072	736079	0 %	0 %	75 %	25 %	291295141
16474	NC_013946	ACGGT	2	10	736092	736101	20 %	20 %	40 %	20 %	291295141
16475	NC_013946	CTG	2	6	736155	736160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295141
16476	NC_013946	TCA	2	6	736225	736230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295141
16477	NC_013946	CTC	2	6	736239	736244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16478	NC_013946	A	7	7	736245	736251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16479	NC_013946	CGAC	2	8	736256	736263	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16480	NC_013946	A	7	7	736266	736272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16481	NC_013946	TCA	2	6	736332	736337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16482	NC_013946	GC	3	6	736428	736433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16483	NC_013946	ATAG	2	8	736759	736766	50 %	25 %	25 %	0 %	291295142
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