MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_013946	GGC	2	6	670993	670998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295085
15003	NC_013946	GCC	2	6	671017	671022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295085
15004	NC_013946	C	6	6	671042	671047	0 %	0 %	0 %	100 %	291295085
15005	NC_013946	CCG	2	6	671071	671076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295085
15006	NC_013946	TTGGT	2	10	671081	671090	0 %	60 %	40 %	0 %	291295085
15007	NC_013946	GCA	2	6	671109	671114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295085
15008	NC_013946	CTG	2	6	671149	671154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295085
15009	NC_013946	CAC	2	6	671179	671184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295085
15010	NC_013946	GCC	2	6	671299	671304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295085
15011	NC_013946	G	6	6	671308	671313	0 %	0 %	100 %	0 %	291295085
15012	NC_013946	GTAG	2	8	671325	671332	25 %	25 %	50 %	0 %	291295085
15013	NC_013946	CCA	2	6	671474	671479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295086
15014	NC_013946	GCG	3	9	671605	671613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295086
15015	NC_013946	TGG	2	6	671636	671641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295086
15016	NC_013946	TGG	2	6	671677	671682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295086
15017	NC_013946	CCG	2	6	671699	671704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295086
15018	NC_013946	AGC	2	6	671731	671736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295086
15019	NC_013946	CAT	2	6	671867	671872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295087
15020	NC_013946	GGC	2	6	671939	671944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295087
15021	NC_013946	CTG	2	6	671966	671971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295087
15022	NC_013946	CTG	2	6	672125	672130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295087
15023	NC_013946	CAC	2	6	672188	672193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295087
15024	NC_013946	GTA	2	6	672266	672271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295087
15025	NC_013946	CGG	2	6	672289	672294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295087
15026	NC_013946	CTG	2	6	672326	672331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295087
15027	NC_013946	AGGGCC	2	12	672369	672380	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291295087
15028	NC_013946	TCG	2	6	672381	672386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295087
15029	NC_013946	GCC	2	6	672413	672418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295087
15030	NC_013946	CGG	2	6	672424	672429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295087
15031	NC_013946	CG	3	6	672450	672455	0 %	0 %	50 %	50 %	291295087
15032	NC_013946	TGA	2	6	672460	672465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295087
15033	NC_013946	CGG	2	6	672493	672498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295087
15034	NC_013946	GCA	2	6	672514	672519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295087
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15036	NC_013946	GAA	2	6	672629	672634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295087
15037	NC_013946	CGG	2	6	672736	672741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295087
15038	NC_013946	CCGAGA	2	12	672769	672780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295087
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15040	NC_013946	CGGG	2	8	672850	672857	0 %	0 %	75 %	25 %	291295087
15041	NC_013946	GCC	2	6	672911	672916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295087
15042	NC_013946	T	6	6	672938	672943	0 %	100 %	0 %	0 %	291295087
15043	NC_013946	GGC	3	9	672947	672955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295087
15044	NC_013946	GGT	2	6	673004	673009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295087
15045	NC_013946	GCT	2	6	673058	673063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295087
15046	NC_013946	CGG	2	6	673168	673173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295087
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15049	NC_013946	CGG	2	6	673207	673212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295087
15050	NC_013946	C	6	6	673273	673278	0 %	0 %	0 %	100 %	291295087
15051	NC_013946	TA	3	6	673480	673485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_013946	AGG	2	6	673502	673507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_013946	CAT	2	6	673574	673579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_013946	CTG	2	6	673634	673639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_013946	AGG	2	6	673673	673678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_013946	CTGG	2	8	673773	673780	0 %	25 %	50 %	25 %	291295088
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15059	NC_013946	GGC	2	6	673876	673881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295088
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15062	NC_013946	CAA	2	6	673971	673976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291295088
15063	NC_013946	TGG	2	6	674015	674020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295088
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15065	NC_013946	CTT	2	6	674061	674066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291295088
15066	NC_013946	CTG	2	6	674092	674097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295088
15067	NC_013946	CTGG	2	8	674142	674149	0 %	25 %	50 %	25 %	291295088
15068	NC_013946	CTGGC	2	10	674152	674161	0 %	20 %	40 %	40 %	291295088
15069	NC_013946	ACT	2	6	674186	674191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295088
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15073	NC_013946	CG	3	6	674279	674284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15074	NC_013946	GTG	2	6	674316	674321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295089
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15079	NC_013946	CCCCA	2	10	674428	674437	20 %	0 %	0 %	80 %	291295089
15080	NC_013946	AGA	2	6	674451	674456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295089
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15082	NC_013946	GCCC	2	8	674527	674534	0 %	0 %	25 %	75 %	291295089
15083	NC_013946	CAG	2	6	674546	674551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295089
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15085	NC_013946	GCA	2	6	674587	674592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295089
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15090	NC_013946	G	6	6	674767	674772	0 %	0 %	100 %	0 %	291295089
15091	NC_013946	AGG	2	6	674805	674810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295089
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15093	NC_013946	A	6	6	674897	674902	100 %	0 %	0 %	0 %	291295089
15094	NC_013946	TCGA	2	8	674925	674932	25 %	25 %	25 %	25 %	291295089
15095	NC_013946	GGCC	2	8	674955	674962	0 %	0 %	50 %	50 %	291295089
15096	NC_013946	G	7	7	674978	674984	0 %	0 %	100 %	0 %	291295089
15097	NC_013946	ATCC	2	8	674987	674994	25 %	25 %	0 %	50 %	291295089
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15102	NC_013946	GCTC	2	8	675142	675149	0 %	25 %	25 %	50 %	291295089
15103	NC_013946	GAG	2	6	675150	675155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295089
15104	NC_013946	CTG	2	6	675197	675202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295089
15105	NC_013946	GCC	2	6	675225	675230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295089
15106	NC_013946	TTGA	2	8	675317	675324	25 %	50 %	25 %	0 %	291295089
15107	NC_013946	CCA	2	6	675325	675330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295089
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15109	NC_013946	GCCGG	3	15	675381	675395	0 %	0 %	60 %	40 %	291295089
15110	NC_013946	CGG	2	6	675436	675441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295089
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15113	NC_013946	C	6	6	675600	675605	0 %	0 %	0 %	100 %	291295089
15114	NC_013946	AGC	2	6	675675	675680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295089
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15116	NC_013946	GCGCC	2	10	675751	675760	0 %	0 %	40 %	60 %	291295089
15117	NC_013946	TC	3	6	675803	675808	0 %	50 %	0 %	50 %	291295090
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15243	NC_013946	CGG	2	6	681597	681602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15244	NC_013946	TGGGCC	2	12	681604	681615	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15245	NC_013946	G	7	7	681685	681691	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15246	NC_013946	CTA	2	6	681722	681727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295096
15247	NC_013946	G	6	6	681733	681738	0 %	0 %	100 %	0 %	291295096
15248	NC_013946	TGG	2	6	681739	681744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295096
15249	NC_013946	TGG	2	6	681754	681759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295096
15250	NC_013946	TGC	2	6	681841	681846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295096
15251	NC_013946	GCT	2	6	681908	681913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295096
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15253	NC_013946	TGG	2	6	682018	682023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295096
15254	NC_013946	GGA	2	6	682055	682060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295096
15255	NC_013946	TCA	2	6	682099	682104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295096
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15261	NC_013946	GGGC	2	8	682308	682315	0 %	0 %	75 %	25 %	291295096
15262	NC_013946	GGT	3	9	682373	682381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295096
15263	NC_013946	GCT	2	6	682418	682423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295096
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15265	NC_013946	TGC	2	6	682507	682512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295096
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15270	NC_013946	GC	3	6	682688	682693	0 %	0 %	50 %	50 %	291295097
15271	NC_013946	TCA	2	6	682732	682737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295097
15272	NC_013946	CTG	3	9	682740	682748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295097
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15274	NC_013946	GGC	2	6	682760	682765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295097
15275	NC_013946	GGGT	2	8	682781	682788	0 %	25 %	75 %	0 %	291295097
15276	NC_013946	TGG	2	6	682810	682815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295097
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15283	NC_013946	GGGCT	2	10	683037	683046	0 %	20 %	60 %	20 %	291295097
15284	NC_013946	TTGG	3	12	683133	683144	0 %	50 %	50 %	0 %	291295097
15285	NC_013946	GCT	2	6	683145	683150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295097
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15290	NC_013946	GCT	3	9	683402	683410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295097
15291	NC_013946	GGCT	2	8	683415	683422	0 %	25 %	50 %	25 %	291295097
15292	NC_013946	GGATA	2	10	683569	683578	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15293	NC_013946	GGA	2	6	683648	683653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15294	NC_013946	TGC	2	6	683663	683668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295098
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15296	NC_013946	GCTG	2	8	683712	683719	0 %	25 %	50 %	25 %	291295098
15297	NC_013946	G	6	6	683737	683742	0 %	0 %	100 %	0 %	291295098
15298	NC_013946	GCT	2	6	683799	683804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295098
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15302	NC_013946	TGG	2	6	684067	684072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295098
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15306	NC_013946	TGG	2	6	684209	684214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295098
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15318	NC_013946	CTG	2	6	684809	684814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295099
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15350	NC_013946	CTT	2	6	686029	686034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291295099
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15353	NC_013946	G	8	8	686250	686257	0 %	0 %	100 %	0 %	291295099
15354	NC_013946	CCT	2	6	686277	686282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295099
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15358	NC_013946	TGGC	3	12	686524	686535	0 %	25 %	50 %	25 %	291295099
15359	NC_013946	TTTA	2	8	686552	686559	25 %	75 %	0 %	0 %	291295099
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15481	NC_013946	CCA	2	6	692557	692562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15482	NC_013946	ATTG	2	8	692570	692577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15483	NC_013946	AAGTT	2	10	692604	692613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15484	NC_013946	GCT	2	6	692641	692646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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