MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_013946	GTA	2	6	647382	647387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295056
14502	NC_013946	TGA	2	6	647444	647449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295056
14503	NC_013946	CGG	2	6	647482	647487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295056
14504	NC_013946	CGG	2	6	647494	647499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295056
14505	NC_013946	T	6	6	647511	647516	0 %	100 %	0 %	0 %	291295056
14506	NC_013946	TGGG	2	8	647573	647580	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_013946	GCT	2	6	647668	647673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295057
14508	NC_013946	GATG	2	8	647689	647696	25 %	25 %	50 %	0 %	291295057
14509	NC_013946	TGG	2	6	647781	647786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295057
14510	NC_013946	CAG	2	6	647831	647836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295057
14511	NC_013946	GGT	2	6	647837	647842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295057
14512	NC_013946	GGT	2	6	648034	648039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295057
14513	NC_013946	G	6	6	648072	648077	0 %	0 %	100 %	0 %	291295057
14514	NC_013946	CGG	2	6	648156	648161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295057
14515	NC_013946	GAG	2	6	648162	648167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295057
14516	NC_013946	ACC	2	6	648183	648188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295057
14517	NC_013946	CAC	2	6	648194	648199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295057
14518	NC_013946	CGG	2	6	648249	648254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295057
14519	NC_013946	ACC	2	6	648330	648335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295057
14520	NC_013946	GCG	2	6	648336	648341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295057
14521	NC_013946	GA	3	6	648366	648371	50 %	0 %	50 %	0 %	291295057
14522	NC_013946	A	7	7	648406	648412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_013946	GTTA	2	8	648463	648470	25 %	50 %	25 %	0 %	291295058
14524	NC_013946	CAG	2	6	648473	648478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295058
14525	NC_013946	CAGC	2	8	648547	648554	25 %	0 %	25 %	50 %	291295058
14526	NC_013946	AGCC	2	8	648576	648583	25 %	0 %	25 %	50 %	291295058
14527	NC_013946	TCA	2	6	648598	648603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295058
14528	NC_013946	GAA	2	6	648605	648610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295058
14529	NC_013946	ATC	2	6	648651	648656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295058
14530	NC_013946	TACCC	2	10	648696	648705	20 %	20 %	0 %	60 %	291295058
14531	NC_013946	CAC	3	9	648710	648718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295058
14532	NC_013946	GAA	2	6	648737	648742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295058
14533	NC_013946	CCA	2	6	648892	648897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295058
14534	NC_013946	AGC	2	6	648912	648917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295058
14535	NC_013946	CAG	3	9	649049	649057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295058
14536	NC_013946	GCCA	2	8	649173	649180	25 %	0 %	25 %	50 %	291295058
14537	NC_013946	GCT	2	6	649202	649207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295058
14538	NC_013946	GTA	2	6	649274	649279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295058
14539	NC_013946	GCT	2	6	649362	649367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295058
14540	NC_013946	GCT	2	6	649411	649416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295058
14541	NC_013946	CTG	2	6	649425	649430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295058
14542	NC_013946	CTT	2	6	649447	649452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291295058
14543	NC_013946	GGCC	2	8	649455	649462	0 %	0 %	50 %	50 %	291295058
14544	NC_013946	AGC	2	6	649578	649583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295058
14545	NC_013946	GC	3	6	649613	649618	0 %	0 %	50 %	50 %	291295058
14546	NC_013946	GCC	2	6	649633	649638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295058
14547	NC_013946	CAG	2	6	649643	649648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295058
14548	NC_013946	GC	3	6	649655	649660	0 %	0 %	50 %	50 %	291295058
14549	NC_013946	CAG	2	6	649664	649669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295058
14550	NC_013946	GAAG	2	8	649711	649718	50 %	0 %	50 %	0 %	291295058
14551	NC_013946	GTT	2	6	649736	649741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291295058
14552	NC_013946	CAG	2	6	649763	649768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295058
14553	NC_013946	CCA	2	6	649798	649803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295058
14554	NC_013946	GTA	2	6	649871	649876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295058
14555	NC_013946	GCC	2	6	649991	649996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14556	NC_013946	TG	3	6	650041	650046	0 %	50 %	50 %	0 %	291295059
14557	NC_013946	GGA	2	6	650058	650063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295059
14558	NC_013946	GAG	2	6	650070	650075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295059
14559	NC_013946	GAC	2	6	650149	650154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295059
14560	NC_013946	GGC	2	6	650217	650222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295059
14561	NC_013946	GGC	2	6	650226	650231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295059
14562	NC_013946	GGCCG	2	10	650284	650293	0 %	0 %	60 %	40 %	291295059
14563	NC_013946	GCC	3	9	650296	650304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295059
14564	NC_013946	GCCGAT	2	12	650320	650331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291295059
14565	NC_013946	GCC	2	6	650369	650374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295059
14566	NC_013946	GCCTGG	2	12	650402	650413	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291295059
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14568	NC_013946	GCTG	2	8	650525	650532	0 %	25 %	50 %	25 %	291295059
14569	NC_013946	CAT	2	6	650598	650603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295059
14570	NC_013946	GGC	2	6	650631	650636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295059
14571	NC_013946	AAGA	2	8	650644	650651	75 %	0 %	25 %	0 %	291295059
14572	NC_013946	GCT	2	6	650701	650706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295059
14573	NC_013946	AAGG	2	8	650770	650777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_013946	GAAG	2	8	650883	650890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_013946	TAT	2	6	650941	650946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14577	NC_013946	CAG	2	6	651013	651018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295060
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14585	NC_013946	TGAT	2	8	651449	651456	25 %	50 %	25 %	0 %	291295060
14586	NC_013946	GGAGCG	2	12	651513	651524	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	291295060
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14588	NC_013946	C	6	6	651590	651595	0 %	0 %	0 %	100 %	291295061
14589	NC_013946	CCA	2	6	651768	651773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295061
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14592	NC_013946	CGG	2	6	652086	652091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295061
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14599	NC_013946	G	6	6	652351	652356	0 %	0 %	100 %	0 %	291295061
14600	NC_013946	CTG	2	6	652460	652465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295061
14601	NC_013946	TGA	2	6	652497	652502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295061
14602	NC_013946	GGC	2	6	652623	652628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295062
14603	NC_013946	G	6	6	652686	652691	0 %	0 %	100 %	0 %	291295062
14604	NC_013946	ACC	2	6	652705	652710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295062
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14606	NC_013946	CAC	2	6	652758	652763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295062
14607	NC_013946	AGC	2	6	652777	652782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295062
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14615	NC_013946	GCC	2	6	653098	653103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295062
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14619	NC_013946	TCG	2	6	653326	653331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295063
14620	NC_013946	GCA	2	6	653357	653362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295063
14621	NC_013946	GGCTCA	2	12	653381	653392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291295063
14622	NC_013946	GGC	2	6	653544	653549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295063
14623	NC_013946	GGC	2	6	653556	653561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295063
14624	NC_013946	CGC	2	6	653593	653598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295063
14625	NC_013946	TTG	2	6	653647	653652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291295063
14626	NC_013946	TGCGGT	2	12	653678	653689	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291295063
14627	NC_013946	GAT	2	6	653709	653714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295063
14628	NC_013946	CCACC	2	10	653717	653726	20 %	0 %	0 %	80 %	291295063
14629	NC_013946	TCG	3	9	653770	653778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295063
14630	NC_013946	CCG	2	6	653779	653784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295063
14631	NC_013946	TGT	2	6	653810	653815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291295063
14632	NC_013946	GGC	2	6	653838	653843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295063
14633	NC_013946	GCT	2	6	653872	653877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295063
14634	NC_013946	GGC	2	6	653961	653966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295063
14635	NC_013946	T	6	6	653967	653972	0 %	100 %	0 %	0 %	291295063
14636	NC_013946	TTGC	2	8	654073	654080	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14637	NC_013946	GCG	2	6	654114	654119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14638	NC_013946	GCGTC	2	10	654141	654150	0 %	20 %	40 %	40 %	291295064
14639	NC_013946	CCG	2	6	654237	654242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295064
14640	NC_013946	CATA	2	8	654311	654318	50 %	25 %	0 %	25 %	291295064
14641	NC_013946	GCC	2	6	654335	654340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295064
14642	NC_013946	AGA	2	6	654414	654419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295064
14643	NC_013946	GAGCA	2	10	654478	654487	40 %	0 %	40 %	20 %	291295064
14644	NC_013946	GGC	2	6	654505	654510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295064
14645	NC_013946	ATG	2	6	654538	654543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295064
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14648	NC_013946	AGCC	2	8	654783	654790	25 %	0 %	25 %	50 %	291295064
14649	NC_013946	GGTGCT	2	12	654840	654851	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291295064
14650	NC_013946	TGG	2	6	654902	654907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295064
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14652	NC_013946	GGGCGC	2	12	654957	654968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295064
14653	NC_013946	GGC	2	6	654984	654989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295064
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14657	NC_013946	GCC	2	6	655218	655223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295064
14658	NC_013946	GATCCC	2	12	655240	655251	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291295064
14659	NC_013946	CTCGAC	2	12	655255	655266	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291295064
14660	NC_013946	CGG	2	6	655408	655413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14661	NC_013946	T	7	7	655473	655479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14662	NC_013946	CGCC	2	8	655565	655572	0 %	0 %	25 %	75 %	291295065
14663	NC_013946	TAC	2	6	655612	655617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295065
14664	NC_013946	CGGCC	2	10	655620	655629	0 %	0 %	40 %	60 %	291295065
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14666	NC_013946	GCG	2	6	655653	655658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295065
14667	NC_013946	TGA	2	6	655800	655805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295065
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14674	NC_013946	GATC	2	8	656226	656233	25 %	25 %	25 %	25 %	291295065
14675	NC_013946	CTG	2	6	656269	656274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295065
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14685	NC_013946	TGG	3	9	656666	656674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295065
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14689	NC_013946	TGC	2	6	656735	656740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295065
14690	NC_013946	CTG	3	9	656782	656790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295066
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14712	NC_013946	ACCC	2	8	657911	657918	25 %	0 %	0 %	75 %	291295066
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14716	NC_013946	ACA	2	6	658094	658099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14717	NC_013946	GCT	2	6	658112	658117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14720	NC_013946	G	7	7	658239	658245	0 %	0 %	100 %	0 %	291295067
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14728	NC_013946	GAA	2	6	658759	658764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295068
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14734	NC_013946	GCT	2	6	658998	659003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295068
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14737	NC_013946	GAG	2	6	659206	659211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295068
14738	NC_013946	CAG	2	6	659233	659238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295068
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14981	NC_013946	C	6	6	670269	670274	0 %	0 %	0 %	100 %	291295084
14982	NC_013946	CTG	2	6	670287	670292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295084
14983	NC_013946	TGG	2	6	670357	670362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295084
14984	NC_013946	GCC	2	6	670375	670380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295084
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14988	NC_013946	AAG	2	6	670551	670556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295084
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14993	NC_013946	CGG	2	6	670680	670685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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