MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013946	GCG	2	6	46007	46012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294458
1002	NC_013946	G	7	7	46098	46104	0 %	0 %	100 %	0 %	291294458
1003	NC_013946	GTT	2	6	46118	46123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294458
1004	NC_013946	GCG	2	6	46281	46286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294458
1005	NC_013946	CAC	2	6	46339	46344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294458
1006	NC_013946	GCA	2	6	46386	46391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294458
1007	NC_013946	GTA	2	6	46453	46458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_013946	CTT	2	6	46476	46481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_013946	TGA	2	6	46484	46489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_013946	GC	3	6	46532	46537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_013946	CGG	2	6	46605	46610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294459
1012	NC_013946	GGC	2	6	46677	46682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294459
1013	NC_013946	CCGC	2	8	46701	46708	0 %	0 %	25 %	75 %	291294459
1014	NC_013946	CGGG	2	8	46732	46739	0 %	0 %	75 %	25 %	291294459
1015	NC_013946	GAT	2	6	46786	46791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294459
1016	NC_013946	G	6	6	46854	46859	0 %	0 %	100 %	0 %	291294459
1017	NC_013946	CAC	2	6	46963	46968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294459
1018	NC_013946	TGGG	2	8	46986	46993	0 %	25 %	75 %	0 %	291294459
1019	NC_013946	G	6	6	46991	46996	0 %	0 %	100 %	0 %	291294459
1020	NC_013946	CAT	2	6	47029	47034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294459
1021	NC_013946	TGC	2	6	47088	47093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294459
1022	NC_013946	GT	3	6	47140	47145	0 %	50 %	50 %	0 %	291294459
1023	NC_013946	TCC	2	6	47186	47191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294459
1024	NC_013946	CAC	2	6	47251	47256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294459
1025	NC_013946	CGC	2	6	47259	47264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294459
1026	NC_013946	CTC	2	6	47287	47292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294459
1027	NC_013946	GCG	2	6	47368	47373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294459
1028	NC_013946	CACT	2	8	47521	47528	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_013946	AATC	2	8	47674	47681	50 %	25 %	0 %	25 %	291294460
1030	NC_013946	CGG	2	6	47878	47883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294460
1031	NC_013946	CGT	2	6	48034	48039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294460
1032	NC_013946	CCT	2	6	48046	48051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294460
1033	NC_013946	CTC	2	6	48209	48214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294460
1034	NC_013946	CAT	2	6	48311	48316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294460
1035	NC_013946	ACG	2	6	48421	48426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294460
1036	NC_013946	CAC	2	6	48434	48439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294460
1037	NC_013946	CCA	2	6	48457	48462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294460
1038	NC_013946	GGC	2	6	48463	48468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294460
1039	NC_013946	TCG	2	6	48495	48500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294460
1040	NC_013946	CGG	2	6	48577	48582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294460
1041	NC_013946	TCGAA	2	10	48593	48602	40 %	20 %	20 %	20 %	291294460
1042	NC_013946	GTCC	2	8	48664	48671	0 %	25 %	25 %	50 %	291294461
1043	NC_013946	GCT	2	6	48678	48683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294461
1044	NC_013946	GTT	2	6	48724	48729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294461
1045	NC_013946	AGGGCC	2	12	48797	48808	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291294461
1046	NC_013946	CGG	2	6	48818	48823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294461
1047	NC_013946	CGG	2	6	48830	48835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294461
1048	NC_013946	GTA	2	6	48946	48951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294461
1049	NC_013946	AGT	2	6	48975	48980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294461
1050	NC_013946	CGG	2	6	49110	49115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294461
1051	NC_013946	TCT	2	6	49194	49199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294461
1052	NC_013946	GTG	2	6	49253	49258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294461
1053	NC_013946	GGT	2	6	49380	49385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294461
1054	NC_013946	CAC	2	6	49420	49425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294461
1055	NC_013946	TCG	2	6	49514	49519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294461
1056	NC_013946	GCC	2	6	49526	49531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294461
1057	NC_013946	TTC	2	6	49564	49569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294461
1058	NC_013946	AGA	2	6	49634	49639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294462
1059	NC_013946	GCA	3	9	49687	49695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294462
1060	NC_013946	CGG	2	6	49845	49850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294462
1061	NC_013946	CCA	2	6	49924	49929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294462
1062	NC_013946	GAA	2	6	49952	49957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294462
1063	NC_013946	GCA	2	6	49966	49971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294462
1064	NC_013946	CGG	2	6	50032	50037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294462
1065	NC_013946	CAGGG	2	10	50103	50112	20 %	0 %	60 %	20 %	291294462
1066	NC_013946	GGC	2	6	50139	50144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294462
1067	NC_013946	GGGC	2	8	50148	50155	0 %	0 %	75 %	25 %	291294462
1068	NC_013946	GCG	2	6	50201	50206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294462
1069	NC_013946	TGG	3	9	50343	50351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294462
1070	NC_013946	GTA	2	6	50360	50365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294462
1071	NC_013946	GTA	2	6	50396	50401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294462
1072	NC_013946	GC	3	6	50456	50461	0 %	0 %	50 %	50 %	291294462
1073	NC_013946	TGC	2	6	50496	50501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294462
1074	NC_013946	GGC	2	6	50534	50539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294462
1075	NC_013946	GCC	2	6	50571	50576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294462
1076	NC_013946	A	6	6	50583	50588	100 %	0 %	0 %	0 %	291294462
1077	NC_013946	TCC	2	6	50611	50616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_013946	CGC	2	6	50709	50714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_013946	GC	3	6	50771	50776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_013946	TG	3	6	50777	50782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_013946	G	6	6	50788	50793	0 %	0 %	100 %	0 %	291294463
1082	NC_013946	ACC	2	6	50814	50819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294463
1083	NC_013946	TGG	2	6	50824	50829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294463
1084	NC_013946	CTT	2	6	50877	50882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294463
1085	NC_013946	CTG	2	6	50895	50900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294463
1086	NC_013946	GCT	3	9	50960	50968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294463
1087	NC_013946	GCC	2	6	50984	50989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294463
1088	NC_013946	GGGC	2	8	51026	51033	0 %	0 %	75 %	25 %	291294463
1089	NC_013946	T	6	6	51050	51055	0 %	100 %	0 %	0 %	291294463
1090	NC_013946	GC	4	8	51059	51066	0 %	0 %	50 %	50 %	291294463
1091	NC_013946	TGG	2	6	51100	51105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294463
1092	NC_013946	CTGGGG	2	12	51108	51119	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	291294463
1093	NC_013946	TGC	2	6	51121	51126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294463
1094	NC_013946	G	7	7	51132	51138	0 %	0 %	100 %	0 %	291294463
1095	NC_013946	GTG	2	6	51195	51200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294463
1096	NC_013946	GCT	2	6	51206	51211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294463
1097	NC_013946	GCT	2	6	51230	51235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294463
1098	NC_013946	CTG	2	6	51309	51314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294463
1099	NC_013946	GCG	2	6	51344	51349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294463
1100	NC_013946	GGC	2	6	51395	51400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294463
1101	NC_013946	GGT	2	6	51458	51463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294463
1102	NC_013946	GCA	2	6	51524	51529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294463
1103	NC_013946	CGA	2	6	51536	51541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294463
1104	NC_013946	GCA	2	6	51559	51564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294463
1105	NC_013946	GGC	2	6	51668	51673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294463
1106	NC_013946	GCCA	2	8	51705	51712	25 %	0 %	25 %	50 %	291294463
1107	NC_013946	CAG	2	6	51723	51728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294463
1108	NC_013946	CT	3	6	51739	51744	0 %	50 %	0 %	50 %	291294463
1109	NC_013946	CGAT	2	8	51822	51829	25 %	25 %	25 %	25 %	291294463
1110	NC_013946	CAG	2	6	51852	51857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294463
1111	NC_013946	GGC	2	6	51982	51987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294463
1112	NC_013946	AGC	2	6	51993	51998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294463
1113	NC_013946	GCT	4	12	51999	52010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294463
1114	NC_013946	CAG	2	6	52027	52032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_013946	GCT	2	6	52034	52039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_013946	GCC	2	6	52045	52050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_013946	CTGGG	2	10	52099	52108	0 %	20 %	60 %	20 %	291294464
1118	NC_013946	CG	3	6	52123	52128	0 %	0 %	50 %	50 %	291294464
1119	NC_013946	CTGG	2	8	52134	52141	0 %	25 %	50 %	25 %	291294464
1120	NC_013946	C	6	6	52185	52190	0 %	0 %	0 %	100 %	291294464
1121	NC_013946	CG	3	6	52260	52265	0 %	0 %	50 %	50 %	291294464
1122	NC_013946	CTG	2	6	52303	52308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294464
1123	NC_013946	ATC	2	6	52312	52317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294464
1124	NC_013946	A	6	6	52385	52390	100 %	0 %	0 %	0 %	291294464
1125	NC_013946	G	6	6	52419	52424	0 %	0 %	100 %	0 %	291294464
1126	NC_013946	TTG	2	6	52438	52443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294464
1127	NC_013946	GCG	2	6	52447	52452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294464
1128	NC_013946	GGAT	2	8	52512	52519	25 %	25 %	50 %	0 %	291294464
1129	NC_013946	ACC	2	6	52520	52525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294464
1130	NC_013946	GCTG	2	8	52529	52536	0 %	25 %	50 %	25 %	291294464
1131	NC_013946	GCCCCT	2	12	52578	52589	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	291294464
1132	NC_013946	CCG	2	6	52646	52651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294464
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1134	NC_013946	GGT	2	6	52710	52715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294464
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1137	NC_013946	CGG	2	6	52781	52786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294464
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1143	NC_013946	G	6	6	53015	53020	0 %	0 %	100 %	0 %	291294464
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1152	NC_013946	TGGCC	2	10	53226	53235	0 %	20 %	40 %	40 %	291294464
1153	NC_013946	GCC	2	6	53338	53343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294464
1154	NC_013946	ATG	2	6	53494	53499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1158	NC_013946	G	6	6	53709	53714	0 %	0 %	100 %	0 %	291294465
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1160	NC_013946	GAG	2	6	53759	53764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294465
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1172	NC_013946	CTG	2	6	54206	54211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294465
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1175	NC_013946	CGA	2	6	54320	54325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294466
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1246	NC_013946	GCC	2	6	57922	57927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1247	NC_013946	TGA	2	6	57953	57958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_013946	CGA	2	6	57963	57968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1249	NC_013946	G	6	6	58033	58038	0 %	0 %	100 %	0 %	291294473
1250	NC_013946	AGG	2	6	58062	58067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294473
1251	NC_013946	GAA	2	6	58097	58102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294473
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1253	NC_013946	CAG	2	6	58151	58156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294473
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1497	NC_013946	T	7	7	68168	68174	0 %	100 %	0 %	0 %	291294486
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1499	NC_013946	GGC	2	6	68353	68358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294486
1500	NC_013946	GGCCT	2	10	68462	68471	0 %	20 %	40 %	40 %	291294487

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