MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_013946	CCAG	2	8	601999	602006	25 %	0 %	25 %	50 %	291295012
13502	NC_013946	GCCA	2	8	602010	602017	25 %	0 %	25 %	50 %	291295012
13503	NC_013946	AGC	2	6	602040	602045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295012
13504	NC_013946	G	6	6	602050	602055	0 %	0 %	100 %	0 %	291295012
13505	NC_013946	GCG	2	6	602100	602105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295012
13506	NC_013946	CAG	2	6	602123	602128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295012
13507	NC_013946	GGC	2	6	602134	602139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295012
13508	NC_013946	CAC	2	6	602171	602176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295012
13509	NC_013946	GAA	2	6	602255	602260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_013946	GCG	2	6	602279	602284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_013946	TGCAT	2	10	602344	602353	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13512	NC_013946	GAG	2	6	602356	602361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_013946	GGC	2	6	602397	602402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13514	NC_013946	GTG	2	6	602412	602417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_013946	C	6	6	602461	602466	0 %	0 %	0 %	100 %	291295013
13516	NC_013946	CAG	2	6	602552	602557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295013
13517	NC_013946	GGT	2	6	602563	602568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295013
13518	NC_013946	GTG	2	6	602597	602602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295013
13519	NC_013946	ACC	3	9	602604	602612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295013
13520	NC_013946	CTT	2	6	602627	602632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291295013
13521	NC_013946	GCT	3	9	602749	602757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295013
13522	NC_013946	GCC	2	6	602759	602764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295013
13523	NC_013946	GGT	2	6	602786	602791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295013
13524	NC_013946	CTCGCG	2	12	602834	602845	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291295013
13525	NC_013946	CGGGC	2	10	602846	602855	0 %	0 %	60 %	40 %	291295013
13526	NC_013946	CAT	2	6	602888	602893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295013
13527	NC_013946	TGG	2	6	602911	602916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295013
13528	NC_013946	A	6	6	602990	602995	100 %	0 %	0 %	0 %	291295013
13529	NC_013946	GCCC	2	8	603056	603063	0 %	0 %	25 %	75 %	291295013
13530	NC_013946	GGCT	2	8	603125	603132	0 %	25 %	50 %	25 %	291295013
13531	NC_013946	CTCC	2	8	603226	603233	0 %	25 %	0 %	75 %	291295014
13532	NC_013946	CAG	2	6	603235	603240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295014
13533	NC_013946	TGT	2	6	603261	603266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291295014
13534	NC_013946	CAT	2	6	603271	603276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295014
13535	NC_013946	A	6	6	603324	603329	100 %	0 %	0 %	0 %	291295014
13536	NC_013946	CCA	2	6	603375	603380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295014
13537	NC_013946	GC	3	6	603392	603397	0 %	0 %	50 %	50 %	291295014
13538	NC_013946	CGT	2	6	603555	603560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295014
13539	NC_013946	TGC	2	6	603581	603586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295014
13540	NC_013946	CCA	2	6	603788	603793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295014
13541	NC_013946	CAG	2	6	603859	603864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295014
13542	NC_013946	CCA	2	6	603867	603872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295014
13543	NC_013946	AGA	2	6	603900	603905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291295014
13544	NC_013946	CTG	2	6	603916	603921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295014
13545	NC_013946	CGCC	2	8	603936	603943	0 %	0 %	25 %	75 %	291295014
13546	NC_013946	C	6	6	604007	604012	0 %	0 %	0 %	100 %	291295014
13547	NC_013946	CTG	2	6	604015	604020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295014
13548	NC_013946	CAC	2	6	604051	604056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295014
13549	NC_013946	CTGG	2	8	604101	604108	0 %	25 %	50 %	25 %	291295014
13550	NC_013946	CAG	2	6	604138	604143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295014
13551	NC_013946	AGT	2	6	604148	604153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291295014
13552	NC_013946	GGT	2	6	604167	604172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295014
13553	NC_013946	TCC	2	6	604191	604196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295015
13554	NC_013946	TGG	2	6	604228	604233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295015
13555	NC_013946	GCA	2	6	604234	604239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295015
13556	NC_013946	CCT	2	6	604251	604256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295015
13557	NC_013946	AGC	2	6	604290	604295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295015
13558	NC_013946	CAG	2	6	604331	604336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295015
13559	NC_013946	GGC	2	6	604408	604413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295015
13560	NC_013946	GTG	2	6	604422	604427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295015
13561	NC_013946	G	6	6	604427	604432	0 %	0 %	100 %	0 %	291295015
13562	NC_013946	TCC	2	6	604563	604568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295015
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13564	NC_013946	CTT	2	6	604709	604714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291295015
13565	NC_013946	TCC	2	6	604788	604793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295015
13566	NC_013946	AGC	2	6	604821	604826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295015
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13568	NC_013946	GGTG	2	8	604873	604880	0 %	25 %	75 %	0 %	291295015
13569	NC_013946	CCCGAC	2	12	605115	605126	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	291295016
13570	NC_013946	GCT	2	6	605135	605140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295016
13571	NC_013946	TAC	2	6	605154	605159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291295016
13572	NC_013946	TGGG	2	8	605182	605189	0 %	25 %	75 %	0 %	291295016
13573	NC_013946	GGC	2	6	605203	605208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295016
13574	NC_013946	GCG	2	6	605235	605240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295016
13575	NC_013946	GCC	2	6	605244	605249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295016
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13578	NC_013946	CTGGC	2	10	605325	605334	0 %	20 %	40 %	40 %	291295016
13579	NC_013946	GAC	2	6	605337	605342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295016
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13582	NC_013946	ACA	2	6	605397	605402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13583	NC_013946	GGC	2	6	605422	605427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13584	NC_013946	CAG	2	6	605504	605509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13585	NC_013946	TGGT	2	8	605547	605554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13586	NC_013946	GCT	2	6	605574	605579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295017
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13591	NC_013946	CCA	2	6	605924	605929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295017
13592	NC_013946	CAG	2	6	605949	605954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295017
13593	NC_013946	CGG	2	6	605957	605962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295017
13594	NC_013946	CCA	2	6	605979	605984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295017
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13604	NC_013946	GCCA	2	8	606534	606541	25 %	0 %	25 %	50 %	291295017
13605	NC_013946	GGCT	2	8	606650	606657	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13606	NC_013946	ATA	2	6	606697	606702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_013946	TAT	2	6	606734	606739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_013946	ACC	2	6	606779	606784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295018
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13611	NC_013946	GC	3	6	606910	606915	0 %	0 %	50 %	50 %	291295018
13612	NC_013946	GCC	2	6	606937	606942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295018
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13616	NC_013946	GGCTG	2	10	607056	607065	0 %	20 %	60 %	20 %	291295018
13617	NC_013946	GGA	2	6	607071	607076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295018
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13982	NC_013946	T	7	7	622548	622554	0 %	100 %	0 %	0 %	291295030
13983	NC_013946	GTG	2	6	622571	622576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291295030
13984	NC_013946	GGC	2	6	622577	622582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295030
13985	NC_013946	GCG	2	6	622590	622595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295030
13986	NC_013946	GGC	2	6	622621	622626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291295030
13987	NC_013946	AGG	2	6	622707	622712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295030
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13991	NC_013946	TCC	2	6	623019	623024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291295030
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