MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013946	GCT	2	6	579921	579926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294993
13002	NC_013946	CTT	2	6	580020	580025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294993
13003	NC_013946	GCT	2	6	580038	580043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294993
13004	NC_013946	AGG	2	6	580082	580087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294993
13005	NC_013946	CTC	2	6	580135	580140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294993
13006	NC_013946	CACC	2	8	580143	580150	25 %	0 %	0 %	75 %	291294993
13007	NC_013946	G	6	6	580195	580200	0 %	0 %	100 %	0 %	291294993
13008	NC_013946	TGG	2	6	580205	580210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294993
13009	NC_013946	AGG	2	6	580211	580216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294993
13010	NC_013946	CTG	2	6	580231	580236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294993
13011	NC_013946	TAC	2	6	580355	580360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_013946	ACC	2	6	580363	580368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13013	NC_013946	ACC	3	9	580456	580464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294994
13014	NC_013946	GTT	2	6	580479	580484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294994
13015	NC_013946	GTG	2	6	580500	580505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294994
13016	NC_013946	TGG	2	6	580589	580594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294994
13017	NC_013946	TGG	2	6	580601	580606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294994
13018	NC_013946	CTG	2	6	580720	580725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294994
13019	NC_013946	TGG	2	6	580733	580738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294994
13020	NC_013946	CTTT	2	8	580766	580773	0 %	75 %	0 %	25 %	291294994
13021	NC_013946	GGC	2	6	580923	580928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294994
13022	NC_013946	GCT	2	6	580929	580934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294994
13023	NC_013946	CTG	2	6	580967	580972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294994
13024	NC_013946	CGG	2	6	580980	580985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294994
13025	NC_013946	GAA	2	6	580987	580992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294994
13026	NC_013946	C	6	6	581129	581134	0 %	0 %	0 %	100 %	291294994
13027	NC_013946	CTTGG	2	10	581167	581176	0 %	40 %	40 %	20 %	291294994
13028	NC_013946	G	6	6	581214	581219	0 %	0 %	100 %	0 %	291294994
13029	NC_013946	GCTG	2	8	581223	581230	0 %	25 %	50 %	25 %	291294994
13030	NC_013946	TGC	2	6	581237	581242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294994
13031	NC_013946	GGTGCT	2	12	581289	581300	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291294994
13032	NC_013946	CTG	2	6	581344	581349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294994
13033	NC_013946	ACGC	2	8	581396	581403	25 %	0 %	25 %	50 %	291294994
13034	NC_013946	CGC	2	6	581535	581540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294994
13035	NC_013946	T	6	6	581547	581552	0 %	100 %	0 %	0 %	291294994
13036	NC_013946	CCT	2	6	581693	581698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13037	NC_013946	CTG	2	6	581718	581723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_013946	CCT	2	6	581755	581760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13039	NC_013946	GCC	2	6	581790	581795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13040	NC_013946	CCT	2	6	581807	581812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13041	NC_013946	TGC	2	6	581822	581827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_013946	GCT	2	6	581864	581869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_013946	GCG	2	6	581906	581911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_013946	GGC	2	6	581918	581923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_013946	GGC	2	6	581951	581956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_013946	CCTGGC	2	12	581981	581992	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13047	NC_013946	TGG	3	9	582061	582069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_013946	T	6	6	582129	582134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_013946	CTT	2	6	582149	582154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_013946	TGG	2	6	582319	582324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_013946	ACC	2	6	582345	582350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13052	NC_013946	GCT	2	6	582359	582364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_013946	ACC	2	6	582484	582489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13054	NC_013946	GCC	2	6	582530	582535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13055	NC_013946	GAG	2	6	582552	582557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_013946	CTGGG	2	10	582603	582612	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13057	NC_013946	GGC	2	6	582625	582630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_013946	CGA	2	6	582635	582640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_013946	CGG	2	6	582659	582664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_013946	AGGCCG	2	12	582753	582764	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_013946	TCA	2	6	582813	582818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_013946	GGC	2	6	582869	582874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_013946	GGA	2	6	582883	582888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_013946	CAC	2	6	582896	582901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13065	NC_013946	ACT	2	6	582924	582929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_013946	TAC	2	6	582940	582945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_013946	GGA	2	6	582990	582995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_013946	CGA	2	6	583056	583061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_013946	TAG	2	6	583073	583078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_013946	AAT	2	6	583113	583118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_013946	ACGAA	2	10	583128	583137	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13072	NC_013946	TC	3	6	583141	583146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13073	NC_013946	T	6	6	583155	583160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_013946	TGG	2	6	583166	583171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_013946	CCT	2	6	583252	583257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13076	NC_013946	GCT	2	6	583265	583270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_013946	GCG	2	6	583407	583412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294995
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13079	NC_013946	TCG	2	6	583488	583493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294995
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13082	NC_013946	GTA	2	6	583613	583618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294995
13083	NC_013946	GAG	2	6	583634	583639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294995
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13087	NC_013946	GTA	2	6	583721	583726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294995
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13089	NC_013946	CG	3	6	583740	583745	0 %	0 %	50 %	50 %	291294995
13090	NC_013946	GCC	2	6	583754	583759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294995
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13092	NC_013946	CGG	2	6	583807	583812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294995
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13096	NC_013946	GGTG	2	8	583958	583965	0 %	25 %	75 %	0 %	291294995
13097	NC_013946	CTG	2	6	584018	584023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294995
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13099	NC_013946	TCCA	2	8	584048	584055	25 %	25 %	0 %	50 %	291294995
13100	NC_013946	AGA	2	6	584104	584109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294995
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13102	NC_013946	CTG	2	6	584258	584263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294995
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13105	NC_013946	AGCG	2	8	584433	584440	25 %	0 %	50 %	25 %	291294995
13106	NC_013946	GTG	2	6	584472	584477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294995
13107	NC_013946	AGCC	2	8	584508	584515	25 %	0 %	25 %	50 %	291294995
13108	NC_013946	CTGGCC	2	12	584564	584575	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291294995
13109	NC_013946	GCA	2	6	584605	584610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294995
13110	NC_013946	CAG	2	6	584621	584626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294995
13111	NC_013946	G	6	6	584626	584631	0 %	0 %	100 %	0 %	291294995
13112	NC_013946	GGT	2	6	584743	584748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294995
13113	NC_013946	GAA	2	6	584924	584929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294995
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13117	NC_013946	TCC	2	6	585219	585224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294996
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13119	NC_013946	ACC	2	6	585235	585240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294996
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13121	NC_013946	GCC	2	6	585302	585307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294996
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13123	NC_013946	AGGGG	2	10	585422	585431	20 %	0 %	80 %	0 %	291294996
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13233	NC_013946	TGC	2	6	589676	589681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295000
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13334	NC_013946	A	7	7	594533	594539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13361	NC_013946	CCA	2	6	595574	595579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295005
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13366	NC_013946	CTAC	2	8	595703	595710	25 %	25 %	0 %	50 %	291295005
13367	NC_013946	GCA	2	6	595721	595726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295005
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13401	NC_013946	GCCA	2	8	597532	597539	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13402	NC_013946	AAGA	2	8	597554	597561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13488	NC_013946	GCC	2	6	601617	601622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295012
13489	NC_013946	ACC	2	6	601629	601634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295012
13490	NC_013946	CCA	2	6	601651	601656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295012
13491	NC_013946	GAG	2	6	601682	601687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291295012
13492	NC_013946	AGC	2	6	601746	601751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295012
13493	NC_013946	CAC	2	6	601775	601780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291295012
13494	NC_013946	CAG	2	6	601781	601786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291295012
13495	NC_013946	CGC	2	6	601792	601797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291295012
13496	NC_013946	CTGG	2	8	601874	601881	0 %	25 %	50 %	25 %	291295012
13497	NC_013946	GTT	2	6	601883	601888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291295012
13498	NC_013946	A	6	6	601928	601933	100 %	0 %	0 %	0 %	291295012
13499	NC_013946	GCT	2	6	601934	601939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291295012
13500	NC_013946	CAGC	2	8	601990	601997	25 %	0 %	25 %	50 %	291295012

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