MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013946	CCA	2	6	556348	556353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294979
12502	NC_013946	GCA	2	6	556364	556369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294979
12503	NC_013946	GCA	2	6	556381	556386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294979
12504	NC_013946	TGG	2	6	556441	556446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294979
12505	NC_013946	CGCC	2	8	556483	556490	0 %	0 %	25 %	75 %	291294979
12506	NC_013946	GCG	2	6	556651	556656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294979
12507	NC_013946	AAGCGG	2	12	556694	556705	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	291294979
12508	NC_013946	GTA	2	6	556822	556827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294979
12509	NC_013946	GTT	2	6	556894	556899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294979
12510	NC_013946	GGT	2	6	556967	556972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294979
12511	NC_013946	TGA	2	6	556982	556987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294979
12512	NC_013946	CTT	2	6	557011	557016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294979
12513	NC_013946	TGG	2	6	557083	557088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294979
12514	NC_013946	GGT	2	6	557132	557137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294979
12515	NC_013946	CAG	2	6	557150	557155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294979
12516	NC_013946	CCA	2	6	557161	557166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294979
12517	NC_013946	CTT	2	6	557230	557235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294979
12518	NC_013946	CAGC	2	8	557266	557273	25 %	0 %	25 %	50 %	291294979
12519	NC_013946	CAA	2	6	557303	557308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294979
12520	NC_013946	CGAT	2	8	557342	557349	25 %	25 %	25 %	25 %	291294979
12521	NC_013946	TACTC	2	10	557427	557436	20 %	40 %	0 %	40 %	291294979
12522	NC_013946	GAGC	2	8	557548	557555	25 %	0 %	50 %	25 %	291294979
12523	NC_013946	CGG	2	6	557736	557741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294979
12524	NC_013946	CCT	2	6	557776	557781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294979
12525	NC_013946	CAA	2	6	557825	557830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294979
12526	NC_013946	CGG	2	6	557843	557848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294979
12527	NC_013946	AG	3	6	557904	557909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_013946	CGG	2	6	558033	558038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_013946	GGGT	2	8	558039	558046	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_013946	GCG	2	6	558047	558052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_013946	TGT	2	6	558065	558070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_013946	CTC	2	6	558080	558085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12533	NC_013946	GGT	2	6	558164	558169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_013946	CCA	2	6	558224	558229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12535	NC_013946	ACCC	2	8	558254	558261	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12536	NC_013946	CCT	2	6	558281	558286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12537	NC_013946	C	6	6	558305	558310	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12538	NC_013946	CCA	2	6	558332	558337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12539	NC_013946	CTCCAG	2	12	558339	558350	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12540	NC_013946	CCCAC	2	10	558456	558465	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
12541	NC_013946	C	6	6	558511	558516	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12542	NC_013946	TCC	2	6	558539	558544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12543	NC_013946	CTT	2	6	558552	558557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_013946	CGT	2	6	558563	558568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12545	NC_013946	C	6	6	558579	558584	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12546	NC_013946	TCC	2	6	558644	558649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12547	NC_013946	ACG	2	6	558662	558667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12548	NC_013946	CTTC	2	8	558700	558707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12549	NC_013946	AGT	2	6	558721	558726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_013946	AAC	2	6	558969	558974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12551	NC_013946	CTG	2	6	558993	558998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_013946	AAAAAC	2	12	559046	559057	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12553	NC_013946	TTAT	2	8	559089	559096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_013946	TTG	2	6	559101	559106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_013946	TG	3	6	559185	559190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_013946	GGT	2	6	559256	559261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294980
12557	NC_013946	TCC	2	6	559297	559302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294980
12558	NC_013946	GGC	2	6	559328	559333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294980
12559	NC_013946	CCT	3	9	559366	559374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294980
12560	NC_013946	ACT	2	6	559390	559395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294980
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12562	NC_013946	GC	3	6	559595	559600	0 %	0 %	50 %	50 %	291294980
12563	NC_013946	GGT	2	6	559637	559642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294980
12564	NC_013946	AGCG	2	8	559658	559665	25 %	0 %	50 %	25 %	291294980
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12568	NC_013946	CTC	2	6	559905	559910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294980
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12571	NC_013946	AAG	2	6	560019	560024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294980
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12574	NC_013946	G	6	6	560164	560169	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_013946	GC	3	6	560214	560219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12576	NC_013946	GCCG	2	8	560256	560263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12577	NC_013946	AGC	2	6	560317	560322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12579	NC_013946	GCG	2	6	560352	560357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12580	NC_013946	GCT	2	6	560368	560373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294981
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12582	NC_013946	CACG	2	8	560395	560402	25 %	0 %	25 %	50 %	291294981
12583	NC_013946	ACC	2	6	560433	560438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294981
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12588	NC_013946	GGC	2	6	560657	560662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294981
12589	NC_013946	ACC	2	6	560691	560696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294981
12590	NC_013946	CG	4	8	560700	560707	0 %	0 %	50 %	50 %	291294981
12591	NC_013946	AGATC	2	10	560773	560782	40 %	20 %	20 %	20 %	291294981
12592	NC_013946	CCT	2	6	560797	560802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294981
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12594	NC_013946	TCC	2	6	560865	560870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294981
12595	NC_013946	GCA	2	6	560944	560949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294981
12596	NC_013946	CTG	2	6	561005	561010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294981
12597	NC_013946	CGG	2	6	561031	561036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294981
12598	NC_013946	CGGG	2	8	561091	561098	0 %	0 %	75 %	25 %	291294981
12599	NC_013946	TGC	2	6	561155	561160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294981
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12603	NC_013946	AGG	2	6	561445	561450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294981
12604	NC_013946	AGC	2	6	561537	561542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294981
12605	NC_013946	GTG	3	9	561564	561572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294981
12606	NC_013946	GCCGG	2	10	561596	561605	0 %	0 %	60 %	40 %	291294981
12607	NC_013946	CCG	2	6	561663	561668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294981
12608	NC_013946	GCC	2	6	561691	561696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294981
12609	NC_013946	GGC	2	6	561748	561753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294981
12610	NC_013946	TCC	2	6	561765	561770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294981
12611	NC_013946	CAC	2	6	561788	561793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294981
12612	NC_013946	CCAGG	2	10	561820	561829	20 %	0 %	40 %	40 %	291294981
12613	NC_013946	GGCA	2	8	561866	561873	25 %	0 %	50 %	25 %	291294981
12614	NC_013946	GCAA	2	8	561888	561895	50 %	0 %	25 %	25 %	291294981
12615	NC_013946	GTC	3	9	561896	561904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294981
12616	NC_013946	GCT	2	6	561961	561966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294981
12617	NC_013946	CGG	2	6	561995	562000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294981
12618	NC_013946	CCT	2	6	562002	562007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294981
12619	NC_013946	GCG	2	6	562008	562013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294981
12620	NC_013946	TCC	2	6	562023	562028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294981
12621	NC_013946	ATC	2	6	562037	562042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294981
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12623	NC_013946	AGA	2	6	562162	562167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294981
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12635	NC_013946	CTG	2	6	562939	562944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294982
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12737	NC_013946	CAG	2	6	567853	567858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294984
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12740	NC_013946	TGC	2	6	568030	568035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294984
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12742	NC_013946	TCC	2	6	568073	568078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294984
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12860	NC_013946	GAGCTC	2	12	574224	574235	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291294988
12861	NC_013946	GC	4	8	574250	574257	0 %	0 %	50 %	50 %	291294988
12862	NC_013946	CAAG	2	8	574342	574349	50 %	0 %	25 %	25 %	291294989
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