MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_013946	G	6	6	534238	534243	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_013946	GAT	2	6	534329	534334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_013946	TGT	2	6	534427	534432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_013946	TGG	2	6	534472	534477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12005	NC_013946	AGA	2	6	534478	534483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_013946	CGC	2	6	534522	534527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12007	NC_013946	CTG	2	6	534561	534566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12008	NC_013946	ACG	2	6	534610	534615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12009	NC_013946	CGG	2	6	534628	534633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12010	NC_013946	GAA	2	6	534662	534667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12011	NC_013946	CCG	2	6	534722	534727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12012	NC_013946	AAC	2	6	534760	534765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12013	NC_013946	ACCCC	2	10	534811	534820	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
12014	NC_013946	C	6	6	534817	534822	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12015	NC_013946	TTCCC	2	10	534844	534853	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12016	NC_013946	CTG	2	6	534855	534860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12017	NC_013946	AGC	2	6	534918	534923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12018	NC_013946	ACC	2	6	534927	534932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12019	NC_013946	GAT	2	6	534947	534952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_013946	TCA	2	6	534989	534994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12021	NC_013946	ATCC	2	8	534995	535002	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12022	NC_013946	ACC	2	6	535044	535049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12023	NC_013946	CTC	2	6	535098	535103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12024	NC_013946	CCA	2	6	535106	535111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12025	NC_013946	ACT	2	6	535123	535128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12027	NC_013946	CAG	2	6	535185	535190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294954
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12029	NC_013946	GAG	2	6	535260	535265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294954
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12031	NC_013946	CT	3	6	535339	535344	0 %	50 %	0 %	50 %	291294954
12032	NC_013946	CTCC	2	8	535413	535420	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12033	NC_013946	CGG	2	6	535605	535610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294955
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12040	NC_013946	TGG	2	6	535952	535957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294955
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12042	NC_013946	GGC	2	6	536068	536073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12063	NC_013946	TGC	2	6	536828	536833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294958
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12072	NC_013946	AGGCC	2	10	537153	537162	20 %	0 %	40 %	40 %	291294959
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12244	NC_013946	CGACTG	2	12	543777	543788	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291294968
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12247	NC_013946	GCT	2	6	543858	543863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294968
12248	NC_013946	GCA	2	6	543952	543957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294968
12249	NC_013946	GGC	2	6	543970	543975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294968
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12260	NC_013946	TCGCA	2	10	544624	544633	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12261	NC_013946	GAG	2	6	544634	544639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12262	NC_013946	CCGC	2	8	544753	544760	0 %	0 %	25 %	75 %	291294969
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12273	NC_013946	GCC	2	6	545176	545181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12274	NC_013946	T	6	6	545185	545190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12275	NC_013946	CTG	3	9	545266	545274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294970
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12299	NC_013946	GGC	2	6	546205	546210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12322	NC_013946	CAGG	2	8	547180	547187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12323	NC_013946	ACG	2	6	547254	547259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294973
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12355	NC_013946	TCC	2	6	549018	549023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294973
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12368	NC_013946	GGC	2	6	549725	549730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294973
12369	NC_013946	TCG	2	6	549744	549749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294973
12370	NC_013946	CGT	2	6	549930	549935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294974
12371	NC_013946	CAC	2	6	549961	549966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294974
12372	NC_013946	TCC	2	6	550148	550153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294974
12373	NC_013946	CTAAA	2	10	550248	550257	60 %	20 %	0 %	20 %	291294974
12374	NC_013946	CTG	2	6	550302	550307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294974
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12376	NC_013946	CTG	2	6	550367	550372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294974
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12379	NC_013946	TCC	2	6	550442	550447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291294974
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12388	NC_013946	ATGA	2	8	550837	550844	50 %	25 %	25 %	0 %	291294974
12389	NC_013946	GGT	2	6	551062	551067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294974
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12399	NC_013946	TCG	2	6	551360	551365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294974
12400	NC_013946	ATC	2	6	551411	551416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294974
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12403	NC_013946	GGT	2	6	551491	551496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294974
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12408	NC_013946	ACCGA	2	10	551843	551852	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12409	NC_013946	CCT	2	6	551871	551876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12410	NC_013946	GGC	2	6	551922	551927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12411	NC_013946	TGA	2	6	551934	551939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12412	NC_013946	TGC	2	6	552161	552166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294975
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12416	NC_013946	GTG	3	9	552325	552333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294975
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12435	NC_013946	CGCT	2	8	553117	553124	0 %	25 %	25 %	50 %	291294976
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12447	NC_013946	CAG	2	6	553840	553845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12453	NC_013946	TTC	2	6	554212	554217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12476	NC_013946	CTT	2	6	555588	555593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294978
12477	NC_013946	G	6	6	555614	555619	0 %	0 %	100 %	0 %	291294978
12478	NC_013946	AGA	2	6	555686	555691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294978
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12480	NC_013946	CAG	2	6	555750	555755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294978
12481	NC_013946	CCA	2	6	555785	555790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294978
12482	NC_013946	CGG	2	6	555793	555798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294978
12483	NC_013946	GGGGC	2	10	555806	555815	0 %	0 %	80 %	20 %	291294978
12484	NC_013946	CAGC	2	8	555956	555963	25 %	0 %	25 %	50 %	291294978
12485	NC_013946	G	6	6	555968	555973	0 %	0 %	100 %	0 %	291294978
12486	NC_013946	GCT	2	6	556049	556054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12487	NC_013946	CGA	2	6	556074	556079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12491	NC_013946	GGC	2	6	556238	556243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294979
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