MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_013946	CAT	2	6	492820	492825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294906
11002	NC_013946	GGC	2	6	492841	492846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294906
11003	NC_013946	TGC	2	6	492855	492860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294906
11004	NC_013946	ACT	2	6	492897	492902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294906
11005	NC_013946	CGG	2	6	492905	492910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294906
11006	NC_013946	AAGG	2	8	492929	492936	50 %	0 %	50 %	0 %	291294906
11007	NC_013946	TGG	2	6	492951	492956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294906
11008	NC_013946	GAT	2	6	492985	492990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294906
11009	NC_013946	AGG	2	6	493086	493091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294906
11010	NC_013946	AGG	2	6	493140	493145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294906
11011	NC_013946	TGC	3	9	493152	493160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294906
11012	NC_013946	CGGCTG	2	12	493199	493210	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291294906
11013	NC_013946	GCT	2	6	493246	493251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294906
11014	NC_013946	AGG	2	6	493281	493286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294906
11015	NC_013946	GTG	2	6	493310	493315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294906
11016	NC_013946	A	6	6	493405	493410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_013946	C	6	6	493414	493419	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11018	NC_013946	AGG	2	6	493425	493430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_013946	GCT	2	6	493486	493491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_013946	CAG	2	6	493504	493509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_013946	AGG	2	6	493549	493554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_013946	GCTC	2	8	493614	493621	0 %	25 %	25 %	50 %	291294907
11023	NC_013946	CGG	2	6	493631	493636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294907
11024	NC_013946	GAG	2	6	493702	493707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294907
11025	NC_013946	GGC	2	6	493727	493732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294907
11026	NC_013946	GAA	2	6	493744	493749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294907
11027	NC_013946	GAG	2	6	493810	493815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294907
11028	NC_013946	GGA	2	6	493836	493841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294907
11029	NC_013946	GGC	2	6	493859	493864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294907
11030	NC_013946	GGC	2	6	493881	493886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294907
11031	NC_013946	CTG	2	6	493924	493929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294907
11032	NC_013946	GGC	2	6	493963	493968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294907
11033	NC_013946	ACCC	2	8	493986	493993	25 %	0 %	0 %	75 %	291294907
11034	NC_013946	TCT	2	6	494009	494014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294907
11035	NC_013946	GCT	2	6	494130	494135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294907
11036	NC_013946	CTGGG	2	10	494155	494164	0 %	20 %	60 %	20 %	291294907
11037	NC_013946	GGAA	2	8	494165	494172	50 %	0 %	50 %	0 %	291294907
11038	NC_013946	AAGC	2	8	494317	494324	50 %	0 %	25 %	25 %	291294908
11039	NC_013946	ACC	2	6	494352	494357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294908
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11041	NC_013946	GAG	2	6	494447	494452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294908
11042	NC_013946	G	7	7	494456	494462	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_013946	A	6	6	494474	494479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_013946	GGAAG	2	10	494508	494517	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_013946	GACG	2	8	494518	494525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11046	NC_013946	CAGCAT	2	12	494534	494545	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291294909
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11050	NC_013946	CCG	2	6	494755	494760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294909
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11052	NC_013946	CG	3	6	494840	494845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11053	NC_013946	GAT	2	6	494921	494926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_013946	TGG	2	6	494989	494994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294910
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11057	NC_013946	CGG	2	6	495120	495125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294910
11058	NC_013946	GCG	2	6	495159	495164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294910
11059	NC_013946	TGG	2	6	495166	495171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294910
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11061	NC_013946	C	7	7	495285	495291	0 %	0 %	0 %	100 %	291294910
11062	NC_013946	GGT	2	6	495320	495325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294910
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11065	NC_013946	TGG	2	6	495397	495402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294910
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11067	NC_013946	GAG	2	6	495450	495455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294910
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11070	NC_013946	GGC	2	6	495540	495545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294910
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11072	NC_013946	ACC	2	6	495662	495667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294911
11073	NC_013946	CAGC	2	8	495674	495681	25 %	0 %	25 %	50 %	291294911
11074	NC_013946	TCCA	2	8	495690	495697	25 %	25 %	0 %	50 %	291294911
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11083	NC_013946	CCGC	2	8	496070	496077	0 %	0 %	25 %	75 %	291294911
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11092	NC_013946	CTT	2	6	496297	496302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294912
11093	NC_013946	CTG	2	6	496306	496311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294912
11094	NC_013946	G	7	7	496356	496362	0 %	0 %	100 %	0 %	291294912
11095	NC_013946	GCA	2	6	496395	496400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294912
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11102	NC_013946	CACCCC	2	12	496696	496707	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	291294912
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11108	NC_013946	GCCC	2	8	496911	496918	0 %	0 %	25 %	75 %	291294912
11109	NC_013946	CTT	2	6	496960	496965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294912
11110	NC_013946	GCC	3	9	496975	496983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294912
11111	NC_013946	GCTGGC	2	12	496993	497004	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291294912
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11115	NC_013946	C	6	6	497143	497148	0 %	0 %	0 %	100 %	291294912
11116	NC_013946	GAC	2	6	497174	497179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294912
11117	NC_013946	GGTGTT	2	12	497191	497202	0 %	50 %	50 %	0 %	291294912
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11479	NC_013946	GAC	2	6	511444	511449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294927
11480	NC_013946	GGT	2	6	511477	511482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294927
11481	NC_013946	AGC	2	6	511487	511492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294927
11482	NC_013946	AACGAG	2	12	511493	511504	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	291294927
11483	NC_013946	GTG	2	6	511514	511519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294927
11484	NC_013946	TGG	2	6	511577	511582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294927
11485	NC_013946	TGG	2	6	511632	511637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294927
11486	NC_013946	ATCAG	2	10	511638	511647	40 %	20 %	20 %	20 %	291294927
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11490	NC_013946	CAG	2	6	511723	511728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294928
11491	NC_013946	CAG	2	6	511732	511737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294928
11492	NC_013946	G	6	6	511792	511797	0 %	0 %	100 %	0 %	291294928
11493	NC_013946	GGGT	2	8	511891	511898	0 %	25 %	75 %	0 %	291294928
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11497	NC_013946	G	6	6	512251	512256	0 %	0 %	100 %	0 %	291294929
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11499	NC_013946	GCTGG	2	10	512432	512441	0 %	20 %	60 %	20 %	291294929
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