MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013946	CTG	2	6	268715	268720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294701
6002	NC_013946	CTG	2	6	268741	268746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294701
6003	NC_013946	GGC	2	6	268752	268757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294701
6004	NC_013946	GCA	2	6	268776	268781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294701
6005	NC_013946	GCGG	2	8	268803	268810	0 %	0 %	75 %	25 %	291294701
6006	NC_013946	GGA	2	6	268842	268847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294701
6007	NC_013946	GTG	2	6	268873	268878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294701
6008	NC_013946	CAA	2	6	268911	268916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294701
6009	NC_013946	CTG	2	6	268979	268984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294701
6010	NC_013946	GCT	2	6	269023	269028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294701
6011	NC_013946	GTG	2	6	269032	269037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294701
6012	NC_013946	AGCG	2	8	269069	269076	25 %	0 %	50 %	25 %	291294701
6013	NC_013946	CCG	2	6	269130	269135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294701
6014	NC_013946	CCG	2	6	269138	269143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294701
6015	NC_013946	TGC	2	6	269189	269194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294701
6016	NC_013946	GGA	2	6	269196	269201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294701
6017	NC_013946	GCC	2	6	269206	269211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294701
6018	NC_013946	CCG	2	6	269342	269347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294701
6019	NC_013946	GGT	2	6	269349	269354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294701
6020	NC_013946	GAA	2	6	269361	269366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294701
6021	NC_013946	CCG	2	6	269372	269377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294701
6022	NC_013946	GGC	2	6	269442	269447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294701
6023	NC_013946	ACA	2	6	269492	269497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294701
6024	NC_013946	CTG	3	9	269506	269514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294701
6025	NC_013946	GCG	2	6	269527	269532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294701
6026	NC_013946	TGA	2	6	269537	269542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294701
6027	NC_013946	CTG	3	9	269575	269583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294701
6028	NC_013946	TGC	2	6	269690	269695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294702
6029	NC_013946	AAG	2	6	269747	269752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294702
6030	NC_013946	CCA	2	6	269771	269776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294702
6031	NC_013946	TGCTGA	2	12	269900	269911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291294702
6032	NC_013946	GAA	2	6	269923	269928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294702
6033	NC_013946	GAC	2	6	269962	269967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294702
6034	NC_013946	GGT	2	6	269997	270002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294702
6035	NC_013946	CTA	2	6	270019	270024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294702
6036	NC_013946	CTG	3	9	270139	270147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294702
6037	NC_013946	GTG	2	6	270235	270240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294702
6038	NC_013946	GCG	2	6	270314	270319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294702
6039	NC_013946	ATG	2	6	270342	270347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294702
6040	NC_013946	TGGT	2	8	270372	270379	0 %	50 %	50 %	0 %	291294703
6041	NC_013946	TGG	2	6	270385	270390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294703
6042	NC_013946	TGG	2	6	270394	270399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294703
6043	NC_013946	GAT	2	6	270458	270463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294703
6044	NC_013946	CTGG	2	8	270539	270546	0 %	25 %	50 %	25 %	291294703
6045	NC_013946	CTGG	2	8	270587	270594	0 %	25 %	50 %	25 %	291294703
6046	NC_013946	CGA	3	9	270689	270697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294703
6047	NC_013946	AAC	2	6	270754	270759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294703
6048	NC_013946	CTG	2	6	270771	270776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294703
6049	NC_013946	C	6	6	270802	270807	0 %	0 %	0 %	100 %	291294703
6050	NC_013946	GC	3	6	270811	270816	0 %	0 %	50 %	50 %	291294703
6051	NC_013946	GCC	2	6	270854	270859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294703
6052	NC_013946	GCC	2	6	270904	270909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294703
6053	NC_013946	GGT	2	6	270971	270976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294703
6054	NC_013946	CTT	2	6	271066	271071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294703
6055	NC_013946	ACA	2	6	271103	271108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291294703
6056	NC_013946	GGAGG	2	10	271155	271164	20 %	0 %	80 %	0 %	291294703
6057	NC_013946	CAC	2	6	271191	271196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294703
6058	NC_013946	TG	5	10	271206	271215	0 %	50 %	50 %	0 %	291294703
6059	NC_013946	GCC	2	6	271291	271296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294703
6060	NC_013946	GATA	2	8	271472	271479	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_013946	CA	3	6	271493	271498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6062	NC_013946	ACT	2	6	271542	271547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294704
6063	NC_013946	AGCC	2	8	271668	271675	25 %	0 %	25 %	50 %	291294704
6064	NC_013946	GCC	2	6	271678	271683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294704
6065	NC_013946	GGC	2	6	271705	271710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294704
6066	NC_013946	CTG	2	6	271723	271728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294704
6067	NC_013946	ACC	2	6	271799	271804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294704
6068	NC_013946	AACC	2	8	271815	271822	50 %	0 %	0 %	50 %	291294704
6069	NC_013946	CGG	2	6	271925	271930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294704
6070	NC_013946	AGG	2	6	272135	272140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294704
6071	NC_013946	CTA	2	6	272235	272240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294704
6072	NC_013946	CTG	2	6	272326	272331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294704
6073	NC_013946	CAGG	2	8	272371	272378	25 %	0 %	50 %	25 %	291294704
6074	NC_013946	GAT	3	9	272418	272426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294704
6075	NC_013946	GGGATG	2	12	272437	272448	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	291294704
6076	NC_013946	ATC	2	6	272453	272458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294704
6077	NC_013946	ATG	3	9	272515	272523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294704
6078	NC_013946	GCC	2	6	272537	272542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294704
6079	NC_013946	TCG	2	6	272561	272566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294704
6080	NC_013946	CTAC	2	8	272593	272600	25 %	25 %	0 %	50 %	291294704
6081	NC_013946	CGC	2	6	272650	272655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294704
6082	NC_013946	ATG	2	6	272674	272679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294704
6083	NC_013946	TCA	2	6	272693	272698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294704
6084	NC_013946	TAA	2	6	272772	272777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291294704
6085	NC_013946	AC	3	6	272805	272810	50 %	0 %	0 %	50 %	291294704
6086	NC_013946	GTG	2	6	272896	272901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294704
6087	NC_013946	CAC	2	6	272934	272939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294704
6088	NC_013946	TCG	2	6	272957	272962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294704
6089	NC_013946	ATG	2	6	272980	272985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294704
6090	NC_013946	AAAG	2	8	273011	273018	75 %	0 %	25 %	0 %	291294704
6091	NC_013946	GGA	2	6	273038	273043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_013946	ATG	2	6	273047	273052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294705
6093	NC_013946	CA	3	6	273107	273112	50 %	0 %	0 %	50 %	291294705
6094	NC_013946	ATG	2	6	273194	273199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294705
6095	NC_013946	ACC	2	6	273204	273209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294705
6096	NC_013946	GCC	2	6	273275	273280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294705
6097	NC_013946	CAGC	2	8	273358	273365	25 %	0 %	25 %	50 %	291294705
6098	NC_013946	GAT	2	6	273376	273381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294705
6099	NC_013946	GC	3	6	273382	273387	0 %	0 %	50 %	50 %	291294705
6100	NC_013946	ATG	2	6	273401	273406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294705
6101	NC_013946	ATG	2	6	273416	273421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294705
6102	NC_013946	ATG	2	6	273425	273430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294705
6103	NC_013946	T	6	6	273460	273465	0 %	100 %	0 %	0 %	291294705
6104	NC_013946	CAC	2	6	273482	273487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294705
6105	NC_013946	GGC	2	6	273526	273531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294705
6106	NC_013946	TCA	2	6	273564	273569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294705
6107	NC_013946	TG	3	6	273645	273650	0 %	50 %	50 %	0 %	291294706
6108	NC_013946	GAA	2	6	273657	273662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294706
6109	NC_013946	GTA	2	6	273720	273725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294706
6110	NC_013946	CCG	2	6	273745	273750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294706
6111	NC_013946	AGC	2	6	273763	273768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294706
6112	NC_013946	CAG	2	6	273852	273857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294706
6113	NC_013946	TCT	2	6	273859	273864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294706
6114	NC_013946	CGT	2	6	273899	273904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294706
6115	NC_013946	CGG	2	6	273935	273940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294706
6116	NC_013946	GCC	2	6	273957	273962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294706
6117	NC_013946	CCG	2	6	274179	274184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294707
6118	NC_013946	CCA	2	6	274225	274230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294707
6119	NC_013946	C	7	7	274237	274243	0 %	0 %	0 %	100 %	291294707
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6121	NC_013946	AGG	2	6	274299	274304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294707
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6243	NC_013946	CGG	2	6	279859	279864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294710
6244	NC_013946	CGGGGG	2	12	279883	279894	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	291294710
6245	NC_013946	GT	3	6	279901	279906	0 %	50 %	50 %	0 %	291294710
6246	NC_013946	G	6	6	279908	279913	0 %	0 %	100 %	0 %	291294710
6247	NC_013946	GCC	2	6	279929	279934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294710
6248	NC_013946	GCC	2	6	279939	279944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294710
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6251	NC_013946	AGC	2	6	279957	279962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294710
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6264	NC_013946	TGGG	2	8	280393	280400	0 %	25 %	75 %	0 %	291294711
6265	NC_013946	T	6	6	280417	280422	0 %	100 %	0 %	0 %	291294711
6266	NC_013946	CTGG	2	8	280435	280442	0 %	25 %	50 %	25 %	291294711
6267	NC_013946	GAAG	2	8	280580	280587	50 %	0 %	50 %	0 %	291294711
6268	NC_013946	AGG	2	6	280634	280639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6488	NC_013946	GGCC	2	8	289915	289922	0 %	0 %	50 %	50 %	291294721
6489	NC_013946	GCC	2	6	289958	289963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294721
6490	NC_013946	TGG	2	6	290028	290033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294721
6491	NC_013946	GTG	2	6	290111	290116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294721
6492	NC_013946	GCG	2	6	290117	290122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294721
6493	NC_013946	GGTGCT	2	12	290128	290139	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291294721
6494	NC_013946	GGGC	2	8	290200	290207	0 %	0 %	75 %	25 %	291294721
6495	NC_013946	AGG	2	6	290223	290228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6496	NC_013946	GTTG	2	8	290244	290251	0 %	50 %	50 %	0 %	291294722
6497	NC_013946	GGCA	2	8	290257	290264	25 %	0 %	50 %	25 %	291294722
6498	NC_013946	G	7	7	290272	290278	0 %	0 %	100 %	0 %	291294722
6499	NC_013946	CAG	2	6	290291	290296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294722
6500	NC_013946	ACG	3	9	290421	290429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294722

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