MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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62002	NC_013946	CCCG	2	8	2799919	2799926	0 %	0 %	25 %	75 %	291297128
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62004	NC_013946	CGA	2	6	2799960	2799965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297128
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62232	NC_013946	C	6	6	2808809	2808814	0 %	0 %	0 %	100 %	291297137
62233	NC_013946	TCCACC	2	12	2808853	2808864	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	291297137
62234	NC_013946	CAC	3	9	2809065	2809073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291297137
62235	NC_013946	CGGG	2	8	2809097	2809104	0 %	0 %	75 %	25 %	291297137
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62241	NC_013946	GCA	2	6	2809319	2809324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297138
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62344	NC_013946	GAC	2	6	2813974	2813979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297141
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62347	NC_013946	GAC	2	6	2814079	2814084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297141
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62349	NC_013946	G	6	6	2814206	2814211	0 %	0 %	100 %	0 %	291297141
62350	NC_013946	TTC	2	6	2814384	2814389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291297141
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62385	NC_013946	GTCACA	2	12	2816032	2816043	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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62388	NC_013946	G	6	6	2816137	2816142	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62389	NC_013946	CAAAA	2	10	2816153	2816162	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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62410	NC_013946	CTTG	2	8	2817871	2817878	0 %	50 %	25 %	25 %	291297147
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62459	NC_013946	TAGCG	2	10	2820135	2820144	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62460	NC_013946	AGA	2	6	2820176	2820181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62461	NC_013946	ACG	2	6	2820221	2820226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297150
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62463	NC_013946	T	6	6	2820275	2820280	0 %	100 %	0 %	0 %	291297150
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62467	NC_013946	AGC	2	6	2820706	2820711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297150
62468	NC_013946	C	6	6	2820831	2820836	0 %	0 %	0 %	100 %	291297151
62469	NC_013946	CGATA	2	10	2820911	2820920	40 %	20 %	20 %	20 %	291297151
62470	NC_013946	C	7	7	2820938	2820944	0 %	0 %	0 %	100 %	291297151
62471	NC_013946	CGC	2	6	2820997	2821002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297151
62472	NC_013946	A	6	6	2821073	2821078	100 %	0 %	0 %	0 %	291297151
62473	NC_013946	GCA	2	6	2821110	2821115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297152
62474	NC_013946	CAC	2	6	2821171	2821176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291297152
62475	NC_013946	CAG	2	6	2821177	2821182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297152
62476	NC_013946	GGATC	2	10	2821213	2821222	20 %	20 %	40 %	20 %	291297152
62477	NC_013946	GCC	2	6	2821272	2821277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297152
62478	NC_013946	CAG	2	6	2821306	2821311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297152
62479	NC_013946	GCC	2	6	2821466	2821471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297152
62480	NC_013946	ACC	2	6	2821472	2821477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291297152
62481	NC_013946	ACC	2	6	2821490	2821495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291297152
62482	NC_013946	AGT	2	6	2821569	2821574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291297152
62483	NC_013946	G	6	6	2821602	2821607	0 %	0 %	100 %	0 %	291297152
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62485	NC_013946	CAC	2	6	2821741	2821746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291297152
62486	NC_013946	TGAT	2	8	2821766	2821773	25 %	50 %	25 %	0 %	291297152
62487	NC_013946	CCCTG	2	10	2821948	2821957	0 %	20 %	20 %	60 %	291297152
62488	NC_013946	AGG	2	6	2821964	2821969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291297152
62489	NC_013946	CAC	2	6	2821999	2822004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291297152
62490	NC_013946	G	8	8	2822015	2822022	0 %	0 %	100 %	0 %	291297152
62491	NC_013946	GGT	2	6	2822128	2822133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291297152
62492	NC_013946	ACG	2	6	2822185	2822190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291297152
62493	NC_013946	C	6	6	2822290	2822295	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62494	NC_013946	GTT	2	6	2822390	2822395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291297153
62495	NC_013946	CAA	2	6	2822426	2822431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291297153
62496	NC_013946	GCC	2	6	2822475	2822480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291297153
62497	NC_013946	GAT	2	6	2822553	2822558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291297153
62498	NC_013946	GC	3	6	2822571	2822576	0 %	0 %	50 %	50 %	291297153
62499	NC_013946	TAA	2	6	2822588	2822593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291297153
62500	NC_013946	GAG	2	6	2822620	2822625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291297153

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