MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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58002	NC_013946	TGT	2	6	2618184	2618189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296945
58003	NC_013946	GCTA	2	8	2618194	2618201	25 %	25 %	25 %	25 %	291296945
58004	NC_013946	GAG	2	6	2618300	2618305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296945
58005	NC_013946	TCC	2	6	2618338	2618343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296945
58006	NC_013946	C	6	6	2618346	2618351	0 %	0 %	0 %	100 %	291296945
58007	NC_013946	GAG	2	6	2618384	2618389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296945
58008	NC_013946	GCA	2	6	2618403	2618408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296945
58009	NC_013946	GCG	3	9	2618439	2618447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296945
58010	NC_013946	GGT	2	6	2618473	2618478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296945
58011	NC_013946	GCT	2	6	2618509	2618514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296945
58012	NC_013946	GGCT	2	8	2618519	2618526	0 %	25 %	50 %	25 %	291296945
58013	NC_013946	CCTGG	2	10	2618536	2618545	0 %	20 %	40 %	40 %	291296945
58014	NC_013946	GCTGG	2	10	2618566	2618575	0 %	20 %	60 %	20 %	291296945
58015	NC_013946	GGC	2	6	2618578	2618583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296945
58016	NC_013946	TGG	2	6	2618612	2618617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296945
58017	NC_013946	GGGC	2	8	2618698	2618705	0 %	0 %	75 %	25 %	291296945
58018	NC_013946	TGG	2	6	2618706	2618711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296945
58019	NC_013946	TGG	2	6	2618751	2618756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296945
58020	NC_013946	CTGG	2	8	2618792	2618799	0 %	25 %	50 %	25 %	291296945
58021	NC_013946	CTG	3	9	2618852	2618860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296945
58022	NC_013946	CTG	2	6	2618975	2618980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296945
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58024	NC_013946	TGG	2	6	2618997	2619002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296945
58025	NC_013946	TGG	2	6	2619031	2619036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296945
58026	NC_013946	GGGCT	2	10	2619078	2619087	0 %	20 %	60 %	20 %	291296945
58027	NC_013946	CTT	2	6	2619121	2619126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296945
58028	NC_013946	CTG	2	6	2619128	2619133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296945
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58031	NC_013946	CCG	2	6	2619388	2619393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296946
58032	NC_013946	TACC	2	8	2619440	2619447	25 %	25 %	0 %	50 %	291296946
58033	NC_013946	CCG	2	6	2619480	2619485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296946
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58038	NC_013946	GAG	2	6	2619704	2619709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296946
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58042	NC_013946	TCT	2	6	2619783	2619788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296946
58043	NC_013946	ACCG	2	8	2619818	2619825	25 %	0 %	25 %	50 %	291296946
58044	NC_013946	TGGG	2	8	2619840	2619847	0 %	25 %	75 %	0 %	291296946
58045	NC_013946	GCTG	2	8	2619868	2619875	0 %	25 %	50 %	25 %	291296946
58046	NC_013946	TGG	2	6	2619882	2619887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296946
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58051	NC_013946	ACCGC	2	10	2620050	2620059	20 %	0 %	20 %	60 %	291296946
58052	NC_013946	GTC	2	6	2620205	2620210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296946
58053	NC_013946	TGA	2	6	2620248	2620253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296946
58054	NC_013946	GTT	2	6	2620392	2620397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296947
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58056	NC_013946	GCT	2	6	2620457	2620462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296947
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58058	NC_013946	GT	3	6	2620566	2620571	0 %	50 %	50 %	0 %	291296947
58059	NC_013946	CAT	2	6	2620640	2620645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296947
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58087	NC_013946	TCA	2	6	2623013	2623018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296949
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58089	NC_013946	TGT	2	6	2623043	2623048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296949
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58099	NC_013946	GGCC	2	8	2623534	2623541	0 %	0 %	50 %	50 %	291296949
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58128	NC_013946	AACG	2	8	2624608	2624615	50 %	0 %	25 %	25 %	291296950
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58226	NC_013946	G	7	7	2629069	2629075	0 %	0 %	100 %	0 %	291296953
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58469	NC_013946	ATC	2	6	2641047	2641052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296963
58470	NC_013946	GCA	2	6	2641084	2641089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296963
58471	NC_013946	GCA	2	6	2641108	2641113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296963
58472	NC_013946	GGTGCA	2	12	2641114	2641125	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291296963
58473	NC_013946	TGC	2	6	2641204	2641209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296963
58474	NC_013946	CGC	2	6	2641315	2641320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296963
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58480	NC_013946	TCC	2	6	2641621	2641626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296963
58481	NC_013946	TGG	2	6	2641640	2641645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296963
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58486	NC_013946	CCT	2	6	2641846	2641851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58487	NC_013946	GCGCG	2	10	2641866	2641875	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58488	NC_013946	GCT	2	6	2641909	2641914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296964
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58495	NC_013946	GCTTCT	2	12	2642323	2642334	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	291296964
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58499	NC_013946	GCCC	2	8	2642730	2642737	0 %	0 %	25 %	75 %	291296965
58500	NC_013946	ACC	2	6	2642749	2642754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296965

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