MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_013946	ACCG	2	8	2526888	2526895	25 %	0 %	25 %	50 %	291296847
56002	NC_013946	GCC	2	6	2526912	2526917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296847
56003	NC_013946	TGG	2	6	2526922	2526927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296847
56004	NC_013946	GCC	2	6	2526929	2526934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296847
56005	NC_013946	GCT	2	6	2526956	2526961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296847
56006	NC_013946	CCA	2	6	2526979	2526984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296847
56007	NC_013946	TGGA	2	8	2527083	2527090	25 %	25 %	50 %	0 %	291296847
56008	NC_013946	TGG	2	6	2527106	2527111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296848
56009	NC_013946	CCG	2	6	2527154	2527159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296848
56010	NC_013946	GGT	3	9	2527279	2527287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296848
56011	NC_013946	GTAA	2	8	2527328	2527335	50 %	25 %	25 %	0 %	291296848
56012	NC_013946	ACG	2	6	2527341	2527346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296848
56013	NC_013946	G	7	7	2527387	2527393	0 %	0 %	100 %	0 %	291296848
56014	NC_013946	CCAG	2	8	2527404	2527411	25 %	0 %	25 %	50 %	291296848
56015	NC_013946	GACC	2	8	2527489	2527496	25 %	0 %	25 %	50 %	291296848
56016	NC_013946	CGG	2	6	2527606	2527611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296848
56017	NC_013946	GGCC	2	8	2527699	2527706	0 %	0 %	50 %	50 %	291296848
56018	NC_013946	TCC	2	6	2527724	2527729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296848
56019	NC_013946	CCA	2	6	2527737	2527742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296848
56020	NC_013946	CCT	2	6	2527791	2527796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296848
56021	NC_013946	TGG	2	6	2527818	2527823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296848
56022	NC_013946	GGT	4	12	2527834	2527845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296848
56023	NC_013946	AGC	2	6	2527874	2527879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296848
56024	NC_013946	ACC	2	6	2527928	2527933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296848
56025	NC_013946	CAACCG	2	12	2527951	2527962	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	291296848
56026	NC_013946	CAC	2	6	2527963	2527968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296848
56027	NC_013946	ACT	2	6	2528025	2528030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296848
56028	NC_013946	GGCT	2	8	2528067	2528074	0 %	25 %	50 %	25 %	291296848
56029	NC_013946	TCA	2	6	2528127	2528132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296848
56030	NC_013946	CAA	2	6	2528149	2528154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296848
56031	NC_013946	CCG	2	6	2528160	2528165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296848
56032	NC_013946	GGCT	2	8	2528203	2528210	0 %	25 %	50 %	25 %	291296848
56033	NC_013946	GTA	2	6	2528349	2528354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56034	NC_013946	CAG	2	6	2528396	2528401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56035	NC_013946	CCGG	2	8	2528477	2528484	0 %	0 %	50 %	50 %	291296849
56036	NC_013946	C	6	6	2528507	2528512	0 %	0 %	0 %	100 %	291296849
56037	NC_013946	ACC	2	6	2528627	2528632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296849
56038	NC_013946	TGC	3	9	2528633	2528641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296849
56039	NC_013946	GGCCC	2	10	2528642	2528651	0 %	0 %	40 %	60 %	291296849
56040	NC_013946	TGGG	2	8	2528669	2528676	0 %	25 %	75 %	0 %	291296849
56041	NC_013946	CGC	2	6	2528688	2528693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296849
56042	NC_013946	ACG	2	6	2528696	2528701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296849
56043	NC_013946	TGA	2	6	2528735	2528740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296849
56044	NC_013946	ATC	2	6	2528863	2528868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296849
56045	NC_013946	CGA	2	6	2528877	2528882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296849
56046	NC_013946	C	7	7	2528886	2528892	0 %	0 %	0 %	100 %	291296849
56047	NC_013946	GGC	2	6	2529082	2529087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296849
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56049	NC_013946	CGG	2	6	2529122	2529127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296849
56050	NC_013946	GCT	2	6	2529144	2529149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296849
56051	NC_013946	TGG	2	6	2529200	2529205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296849
56052	NC_013946	GGC	2	6	2529290	2529295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296849
56053	NC_013946	CGA	2	6	2529321	2529326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296849
56054	NC_013946	GAG	2	6	2529409	2529414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296849
56055	NC_013946	C	6	6	2529422	2529427	0 %	0 %	0 %	100 %	291296849
56056	NC_013946	GCA	2	6	2529546	2529551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296849
56057	NC_013946	GTA	2	6	2529597	2529602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296849
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56059	NC_013946	GTA	2	6	2529636	2529641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296850
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56061	NC_013946	GCA	2	6	2529730	2529735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296850
56062	NC_013946	TGG	2	6	2529758	2529763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296850
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56065	NC_013946	AGCC	3	12	2529840	2529851	25 %	0 %	25 %	50 %	291296850
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56070	NC_013946	CAG	2	6	2530041	2530046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296850
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56075	NC_013946	CAG	2	6	2530239	2530244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296850
56076	NC_013946	C	6	6	2530249	2530254	0 %	0 %	0 %	100 %	291296850
56077	NC_013946	CAG	2	6	2530260	2530265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296850
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56088	NC_013946	CAG	2	6	2530677	2530682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296850
56089	NC_013946	A	6	6	2530802	2530807	100 %	0 %	0 %	0 %	291296851
56090	NC_013946	CAG	2	6	2530810	2530815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296851
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56100	NC_013946	CAG	2	6	2531374	2531379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296851
56101	NC_013946	CG	3	6	2531380	2531385	0 %	0 %	50 %	50 %	291296851
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56106	NC_013946	C	6	6	2531739	2531744	0 %	0 %	0 %	100 %	291296851
56107	NC_013946	C	8	8	2531748	2531755	0 %	0 %	0 %	100 %	291296851
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56112	NC_013946	CAT	2	6	2532325	2532330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296852
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56114	NC_013946	GCAG	2	8	2532409	2532416	25 %	0 %	50 %	25 %	291296852
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56116	NC_013946	CGG	2	6	2532507	2532512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296852
56117	NC_013946	CAG	2	6	2532545	2532550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296852
56118	NC_013946	GC	3	6	2532722	2532727	0 %	0 %	50 %	50 %	291296853
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56121	NC_013946	TCT	2	6	2532852	2532857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296853
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56123	NC_013946	CTGG	2	8	2533069	2533076	0 %	25 %	50 %	25 %	291296854
56124	NC_013946	CCTGC	2	10	2533079	2533088	0 %	20 %	20 %	60 %	291296854
56125	NC_013946	GT	3	6	2533140	2533145	0 %	50 %	50 %	0 %	291296854
56126	NC_013946	T	7	7	2533167	2533173	0 %	100 %	0 %	0 %	291296854
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56129	NC_013946	GCA	2	6	2533336	2533341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296854
56130	NC_013946	ATCG	2	8	2533385	2533392	25 %	25 %	25 %	25 %	291296854
56131	NC_013946	GGT	2	6	2533408	2533413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296854
56132	NC_013946	GTG	3	9	2533490	2533498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296854
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56134	NC_013946	CAT	2	6	2533652	2533657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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56168	NC_013946	GCCCC	2	10	2535117	2535126	0 %	0 %	20 %	80 %	291296855
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56181	NC_013946	CA	3	6	2535580	2535585	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56182	NC_013946	TA	3	6	2535596	2535601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56183	NC_013946	AATG	2	8	2535645	2535652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56184	NC_013946	GCCTG	2	10	2535716	2535725	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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56347	NC_013946	CGG	2	6	2543512	2543517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296862
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56351	NC_013946	CTG	2	6	2543759	2543764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296862
56352	NC_013946	GCCA	2	8	2543771	2543778	25 %	0 %	25 %	50 %	291296862
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56356	NC_013946	CTG	2	6	2544116	2544121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296863
56357	NC_013946	CCGCC	2	10	2544140	2544149	0 %	0 %	20 %	80 %	291296863
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