MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55121	NC_013946	G	6	6	2490687	2490692	0 %	0 %	100 %	0 %	291296811
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55231	NC_013946	AAC	2	6	2495118	2495123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55353	NC_013946	GCT	2	6	2499720	2499725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296822
55354	NC_013946	GCC	2	6	2499781	2499786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296822
55355	NC_013946	TGG	2	6	2499821	2499826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296822
55356	NC_013946	GCC	2	6	2499844	2499849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296822
55357	NC_013946	ATC	2	6	2499877	2499882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296822
55358	NC_013946	CACC	2	8	2499897	2499904	25 %	0 %	0 %	75 %	291296822
55359	NC_013946	GCC	2	6	2499922	2499927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296822
55360	NC_013946	CCA	2	6	2499965	2499970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296822
55361	NC_013946	TGC	2	6	2500022	2500027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296822
55362	NC_013946	ACCATC	2	12	2500114	2500125	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	291296822
55363	NC_013946	CGG	2	6	2500188	2500193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296822
55364	NC_013946	TGG	2	6	2500199	2500204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296822
55365	NC_013946	TGC	2	6	2500210	2500215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296822
55366	NC_013946	ACT	2	6	2500217	2500222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296822
55367	NC_013946	CGG	2	6	2500311	2500316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296822
55368	NC_013946	CGA	2	6	2500437	2500442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296822
55369	NC_013946	GAG	2	6	2500570	2500575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296822
55370	NC_013946	CTA	2	6	2500596	2500601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296822
55371	NC_013946	GCC	2	6	2500648	2500653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296822
55372	NC_013946	CCG	2	6	2500655	2500660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296822
55373	NC_013946	GTG	3	9	2500678	2500686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296822
55374	NC_013946	GCC	2	6	2500693	2500698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296822
55375	NC_013946	GAG	2	6	2500699	2500704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296822
55376	NC_013946	G	6	6	2500715	2500720	0 %	0 %	100 %	0 %	291296822
55377	NC_013946	CCG	2	6	2500811	2500816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55378	NC_013946	GGGT	2	8	2500918	2500925	0 %	25 %	75 %	0 %	291296823
55379	NC_013946	GCGT	2	8	2500941	2500948	0 %	25 %	50 %	25 %	291296823
55380	NC_013946	TTG	2	6	2501009	2501014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296823
55381	NC_013946	TTC	2	6	2501188	2501193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296823
55382	NC_013946	GGC	2	6	2501203	2501208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296823
55383	NC_013946	CGG	2	6	2501231	2501236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296823
55384	NC_013946	TTC	2	6	2501282	2501287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296823
55385	NC_013946	TC	3	6	2501304	2501309	0 %	50 %	0 %	50 %	291296823
55386	NC_013946	AGC	2	6	2501315	2501320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296823
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55388	NC_013946	CCA	2	6	2501436	2501441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296823
55389	NC_013946	TCC	2	6	2501495	2501500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296823
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55391	NC_013946	GC	3	6	2501520	2501525	0 %	0 %	50 %	50 %	291296823
55392	NC_013946	GAA	2	6	2501554	2501559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296823
55393	NC_013946	CGT	2	6	2501565	2501570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296823
55394	NC_013946	CAGC	2	8	2501601	2501608	25 %	0 %	25 %	50 %	291296823
55395	NC_013946	CG	3	6	2501628	2501633	0 %	0 %	50 %	50 %	291296823
55396	NC_013946	CGCA	2	8	2501635	2501642	25 %	0 %	25 %	50 %	291296823
55397	NC_013946	GGCA	2	8	2501689	2501696	25 %	0 %	50 %	25 %	291296823
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55399	NC_013946	A	6	6	2501754	2501759	100 %	0 %	0 %	0 %	291296823
55400	NC_013946	CTT	2	6	2501802	2501807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296823
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55402	NC_013946	GTAG	2	8	2501848	2501855	25 %	25 %	50 %	0 %	291296823
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55407	NC_013946	CGG	2	6	2502095	2502100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296823
55408	NC_013946	TTG	2	6	2502104	2502109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296823
55409	NC_013946	GGGT	2	8	2502130	2502137	0 %	25 %	75 %	0 %	291296823
55410	NC_013946	TCA	2	6	2502153	2502158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296823
55411	NC_013946	GTC	4	12	2502178	2502189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296823
55412	NC_013946	CCA	2	6	2502324	2502329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296823
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55418	NC_013946	TCC	2	6	2502518	2502523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296823
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55420	NC_013946	CG	3	6	2502568	2502573	0 %	0 %	50 %	50 %	291296823
55421	NC_013946	TCG	2	6	2502695	2502700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296823
55422	NC_013946	TGG	2	6	2502777	2502782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296823
55423	NC_013946	ACC	2	6	2502788	2502793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296823
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55425	NC_013946	CGG	2	6	2502850	2502855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296823
55426	NC_013946	GCA	2	6	2502861	2502866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296823
55427	NC_013946	GTC	2	6	2502901	2502906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296823
55428	NC_013946	CGGT	2	8	2502917	2502924	0 %	25 %	50 %	25 %	291296823
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55432	NC_013946	GCC	2	6	2503082	2503087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296823
55433	NC_013946	CAC	2	6	2503237	2503242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296823
55434	NC_013946	GCCA	2	8	2503279	2503286	25 %	0 %	25 %	50 %	291296823
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55437	NC_013946	GCT	2	6	2503416	2503421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296823
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55443	NC_013946	GCCA	2	8	2503592	2503599	25 %	0 %	25 %	50 %	291296823
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55449	NC_013946	GCT	2	6	2503827	2503832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296823
55450	NC_013946	CAC	2	6	2503837	2503842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296823
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55452	NC_013946	CGG	2	6	2503914	2503919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296823
55453	NC_013946	GCCAG	2	10	2503926	2503935	20 %	0 %	40 %	40 %	291296823
55454	NC_013946	GGC	2	6	2503936	2503941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296823
55455	NC_013946	TTC	2	6	2503942	2503947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296823
55456	NC_013946	ACCCC	2	10	2504003	2504012	20 %	0 %	0 %	80 %	291296824
55457	NC_013946	GAT	2	6	2504100	2504105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296824
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55459	NC_013946	ACGA	2	8	2504193	2504200	50 %	0 %	25 %	25 %	291296824
55460	NC_013946	GGAAT	2	10	2504206	2504215	40 %	20 %	40 %	0 %	291296824
55461	NC_013946	ATC	2	6	2504328	2504333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296824
55462	NC_013946	TGA	4	12	2504336	2504347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296824
55463	NC_013946	ACGG	2	8	2504392	2504399	25 %	0 %	50 %	25 %	291296824
55464	NC_013946	TTCA	2	8	2504448	2504455	25 %	50 %	0 %	25 %	291296824
55465	NC_013946	CCA	2	6	2504471	2504476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296824
55466	NC_013946	CAAA	2	8	2504483	2504490	75 %	0 %	0 %	25 %	291296824
55467	NC_013946	GC	3	6	2504504	2504509	0 %	0 %	50 %	50 %	291296824
55468	NC_013946	TGA	2	6	2504516	2504521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296824
55469	NC_013946	GCG	2	6	2504568	2504573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296824
55470	NC_013946	GTG	2	6	2504574	2504579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296824
55471	NC_013946	CTC	2	6	2504609	2504614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296825
55472	NC_013946	GCA	2	6	2504665	2504670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296825
55473	NC_013946	GCG	2	6	2504685	2504690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296825
55474	NC_013946	CATA	2	8	2504728	2504735	50 %	25 %	0 %	25 %	291296825
55475	NC_013946	TGGGAG	2	12	2504767	2504778	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	291296825
55476	NC_013946	TCG	2	6	2504856	2504861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296825
55477	NC_013946	GGC	2	6	2504864	2504869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296825
55478	NC_013946	GCA	2	6	2504881	2504886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296825
55479	NC_013946	TGA	2	6	2504987	2504992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296825
55480	NC_013946	ACC	2	6	2505170	2505175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296825
55481	NC_013946	GAC	2	6	2505176	2505181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296825
55482	NC_013946	C	6	6	2505208	2505213	0 %	0 %	0 %	100 %	291296825
55483	NC_013946	CCA	2	6	2505244	2505249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296825
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55485	NC_013946	GC	3	6	2505330	2505335	0 %	0 %	50 %	50 %	291296825
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55488	NC_013946	TGA	2	6	2505498	2505503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296825
55489	NC_013946	CGTA	2	8	2505612	2505619	25 %	25 %	25 %	25 %	291296825
55490	NC_013946	GTG	2	6	2505624	2505629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296825
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55492	NC_013946	AAC	2	6	2505692	2505697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296825
55493	NC_013946	CTG	2	6	2505782	2505787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296825
55494	NC_013946	C	6	6	2505849	2505854	0 %	0 %	0 %	100 %	291296825
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55497	NC_013946	GCT	2	6	2505914	2505919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296826
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55500	NC_013946	CGC	2	6	2506097	2506102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296826

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