MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53002	NC_013946	AGG	2	6	2397120	2397125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296719
53003	NC_013946	CTG	2	6	2397166	2397171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296720
53004	NC_013946	TC	3	6	2397177	2397182	0 %	50 %	0 %	50 %	291296720
53005	NC_013946	GCA	2	6	2397194	2397199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296720
53006	NC_013946	GAA	2	6	2397202	2397207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296720
53007	NC_013946	CTG	2	6	2397220	2397225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296720
53008	NC_013946	GCC	2	6	2397226	2397231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296720
53009	NC_013946	CAA	2	6	2397237	2397242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296720
53010	NC_013946	CAG	2	6	2397246	2397251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296720
53011	NC_013946	T	6	6	2397271	2397276	0 %	100 %	0 %	0 %	291296720
53012	NC_013946	CAC	2	6	2397282	2397287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296720
53013	NC_013946	C	6	6	2397311	2397316	0 %	0 %	0 %	100 %	291296720
53014	NC_013946	CAT	2	6	2397348	2397353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296720
53015	NC_013946	CCT	2	6	2397357	2397362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296720
53016	NC_013946	CCG	2	6	2397366	2397371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296720
53017	NC_013946	GCC	2	6	2397416	2397421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296720
53018	NC_013946	CAA	2	6	2397438	2397443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296720
53019	NC_013946	C	6	6	2397467	2397472	0 %	0 %	0 %	100 %	291296720
53020	NC_013946	CTG	2	6	2397547	2397552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296720
53021	NC_013946	CCGC	2	8	2397559	2397566	0 %	0 %	25 %	75 %	291296720
53022	NC_013946	CAC	2	6	2397570	2397575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296720
53023	NC_013946	C	7	7	2397575	2397581	0 %	0 %	0 %	100 %	291296720
53024	NC_013946	GAG	2	6	2397592	2397597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296720
53025	NC_013946	ACGGCC	2	12	2397622	2397633	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	291296720
53026	NC_013946	CCCGG	2	10	2397684	2397693	0 %	0 %	40 %	60 %	291296720
53027	NC_013946	GCT	2	6	2397717	2397722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296720
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53029	NC_013946	CGA	2	6	2397849	2397854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296720
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53032	NC_013946	GTT	2	6	2397951	2397956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296720
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53034	NC_013946	CG	3	6	2398028	2398033	0 %	0 %	50 %	50 %	291296720
53035	NC_013946	CGC	2	6	2398060	2398065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296720
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53043	NC_013946	ATTG	2	8	2398579	2398586	25 %	50 %	25 %	0 %	291296721
53044	NC_013946	C	6	6	2398593	2398598	0 %	0 %	0 %	100 %	291296721
53045	NC_013946	TGG	2	6	2398620	2398625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296721
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53052	NC_013946	TAG	2	6	2398813	2398818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296722
53053	NC_013946	CAG	2	6	2398821	2398826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296722
53054	NC_013946	CAG	2	6	2398857	2398862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296722
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53056	NC_013946	CAC	2	6	2398917	2398922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296722
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53059	NC_013946	GTT	2	6	2399073	2399078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296722
53060	NC_013946	A	7	7	2399095	2399101	100 %	0 %	0 %	0 %	291296722
53061	NC_013946	CAG	2	6	2399106	2399111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296722
53062	NC_013946	CAG	2	6	2399196	2399201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296722
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53065	NC_013946	CGG	2	6	2399444	2399449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296723
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53068	NC_013946	CCCCA	2	10	2399628	2399637	20 %	0 %	0 %	80 %	291296723
53069	NC_013946	GCT	3	9	2399644	2399652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296723
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53073	NC_013946	CG	3	6	2399905	2399910	0 %	0 %	50 %	50 %	291296723
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53084	NC_013946	CAT	2	6	2400376	2400381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296724
53085	NC_013946	GAG	2	6	2400440	2400445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296724
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53087	NC_013946	GC	3	6	2400520	2400525	0 %	0 %	50 %	50 %	291296724
53088	NC_013946	GTG	3	9	2400593	2400601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296724
53089	NC_013946	AGC	3	9	2400618	2400626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296724
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53091	NC_013946	CCCCT	2	10	2400652	2400661	0 %	20 %	0 %	80 %	291296725
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53101	NC_013946	CTC	2	6	2401174	2401179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296725
53102	NC_013946	GGGCAG	2	12	2401186	2401197	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	291296725
53103	NC_013946	GGCTCG	2	12	2401250	2401261	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291296725
53104	NC_013946	GCTG	2	8	2401298	2401305	0 %	25 %	50 %	25 %	291296725
53105	NC_013946	CGG	2	6	2401321	2401326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296725
53106	NC_013946	GCTG	2	8	2401328	2401335	0 %	25 %	50 %	25 %	291296725
53107	NC_013946	GGT	2	6	2401368	2401373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296725
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53112	NC_013946	CTC	3	9	2401510	2401518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296725
53113	NC_013946	CTG	2	6	2401534	2401539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296725
53114	NC_013946	CCAC	2	8	2401575	2401582	25 %	0 %	0 %	75 %	291296725
53115	NC_013946	C	6	6	2401594	2401599	0 %	0 %	0 %	100 %	291296725
53116	NC_013946	C	7	7	2401602	2401608	0 %	0 %	0 %	100 %	291296725
53117	NC_013946	CCA	2	6	2401677	2401682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296725
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53121	NC_013946	CG	5	10	2401859	2401868	0 %	0 %	50 %	50 %	291296725
53122	NC_013946	CCAT	2	8	2401895	2401902	25 %	25 %	0 %	50 %	291296725
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53189	NC_013946	TGC	2	6	2404641	2404646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296728
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53221	NC_013946	CTGG	2	8	2406197	2406204	0 %	25 %	50 %	25 %	291296730
53222	NC_013946	TGA	2	6	2406217	2406222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296730
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53227	NC_013946	CTT	2	6	2406404	2406409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296730
53228	NC_013946	CGG	2	6	2406458	2406463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296730
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53230	NC_013946	CAG	2	6	2406557	2406562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296730
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53232	NC_013946	CAG	2	6	2406605	2406610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296730
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53347	NC_013946	C	6	6	2411261	2411266	0 %	0 %	0 %	100 %	291296733
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53349	NC_013946	GC	3	6	2411309	2411314	0 %	0 %	50 %	50 %	291296733
53350	NC_013946	TCA	2	6	2411318	2411323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296733
53351	NC_013946	AAG	2	6	2411441	2411446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296733
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53359	NC_013946	TGG	2	6	2411873	2411878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53360	NC_013946	CG	3	6	2411948	2411953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53361	NC_013946	CGG	2	6	2412003	2412008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53362	NC_013946	ACA	2	6	2412052	2412057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53363	NC_013946	GGA	2	6	2412071	2412076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296734
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53449	NC_013946	CGT	2	6	2415853	2415858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296736
53450	NC_013946	GGGCC	2	10	2415881	2415890	0 %	0 %	60 %	40 %	291296736
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53452	NC_013946	GCCG	2	8	2415941	2415948	0 %	0 %	50 %	50 %	291296736
53453	NC_013946	GCCA	2	8	2415975	2415982	25 %	0 %	25 %	50 %	291296736
53454	NC_013946	TCGG	2	8	2416008	2416015	0 %	25 %	50 %	25 %	291296736
53455	NC_013946	CCA	2	6	2416030	2416035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296736
53456	NC_013946	G	6	6	2416053	2416058	0 %	0 %	100 %	0 %	291296736
53457	NC_013946	ACC	2	6	2416072	2416077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296736
53458	NC_013946	CTC	2	6	2416211	2416216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296736
53459	NC_013946	CAC	2	6	2416286	2416291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296736
53460	NC_013946	GCA	2	6	2416321	2416326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296736
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53462	NC_013946	C	6	6	2416390	2416395	0 %	0 %	0 %	100 %	291296737
53463	NC_013946	CG	3	6	2416433	2416438	0 %	0 %	50 %	50 %	291296737
53464	NC_013946	CCT	2	6	2416455	2416460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296737
53465	NC_013946	C	6	6	2416468	2416473	0 %	0 %	0 %	100 %	291296737
53466	NC_013946	CATCGG	2	12	2416623	2416634	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291296737
53467	NC_013946	CCA	2	6	2416680	2416685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296737
53468	NC_013946	GCA	2	6	2416686	2416691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296737
53469	NC_013946	CAC	3	9	2416705	2416713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296737
53470	NC_013946	GGT	2	6	2416848	2416853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296737
53471	NC_013946	GGTG	2	8	2416887	2416894	0 %	25 %	75 %	0 %	291296737
53472	NC_013946	GTA	2	6	2416903	2416908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296737
53473	NC_013946	GCA	2	6	2416920	2416925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296737
53474	NC_013946	GGT	2	6	2416972	2416977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296737
53475	NC_013946	CGG	2	6	2417111	2417116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53476	NC_013946	TGG	2	6	2417119	2417124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296738
53477	NC_013946	CCT	2	6	2417165	2417170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296738
53478	NC_013946	G	7	7	2417204	2417210	0 %	0 %	100 %	0 %	291296738
53479	NC_013946	CCG	2	6	2417224	2417229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296738
53480	NC_013946	T	6	6	2417285	2417290	0 %	100 %	0 %	0 %	291296738
53481	NC_013946	CAG	2	6	2417346	2417351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296738
53482	NC_013946	CG	3	6	2417405	2417410	0 %	0 %	50 %	50 %	291296738
53483	NC_013946	CG	3	6	2417424	2417429	0 %	0 %	50 %	50 %	291296738
53484	NC_013946	GGT	2	6	2417479	2417484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296738
53485	NC_013946	CTG	2	6	2417541	2417546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296738
53486	NC_013946	C	6	6	2417601	2417606	0 %	0 %	0 %	100 %	291296738
53487	NC_013946	GTT	2	6	2417627	2417632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296738
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53492	NC_013946	CAAG	2	8	2417897	2417904	50 %	0 %	25 %	25 %	291296738
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53495	NC_013946	C	7	7	2418014	2418020	0 %	0 %	0 %	100 %	291296738
53496	NC_013946	AGC	2	6	2418022	2418027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296738
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53499	NC_013946	CAC	2	6	2418136	2418141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53500	NC_013946	AAC	2	6	2418161	2418166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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