MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52117	NC_013946	GGC	2	6	2359981	2359986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52118	NC_013946	TGG	2	6	2360097	2360102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296683
52119	NC_013946	G	6	6	2360101	2360106	0 %	0 %	100 %	0 %	291296683
52120	NC_013946	G	6	6	2360111	2360116	0 %	0 %	100 %	0 %	291296683
52121	NC_013946	CTG	3	9	2360208	2360216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296683
52122	NC_013946	ACT	2	6	2360269	2360274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296683
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52125	NC_013946	G	6	6	2360407	2360412	0 %	0 %	100 %	0 %	291296683
52126	NC_013946	CGGG	2	8	2360458	2360465	0 %	0 %	75 %	25 %	291296684
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52137	NC_013946	G	6	6	2361112	2361117	0 %	0 %	100 %	0 %	291296684
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52143	NC_013946	A	6	6	2361460	2361465	100 %	0 %	0 %	0 %	291296685
52144	NC_013946	CGCC	2	8	2361507	2361514	0 %	0 %	25 %	75 %	291296685
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52146	NC_013946	AGCC	2	8	2361552	2361559	25 %	0 %	25 %	50 %	291296685
52147	NC_013946	CAG	2	6	2361613	2361618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296685
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52152	NC_013946	TAC	2	6	2361919	2361924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296685
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52176	NC_013946	GAT	2	6	2362830	2362835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296686
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52187	NC_013946	TGC	2	6	2363215	2363220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296687
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52209	NC_013946	AAGCG	2	10	2364201	2364210	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52210	NC_013946	TCC	2	6	2364247	2364252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52211	NC_013946	TACTGG	2	12	2364294	2364305	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291296688
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52216	NC_013946	GGCG	2	8	2364634	2364641	0 %	0 %	75 %	25 %	291296688
52217	NC_013946	AAC	2	6	2364648	2364653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296688
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52219	NC_013946	CGG	2	6	2364792	2364797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296688
52220	NC_013946	ACC	2	6	2364830	2364835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296688
52221	NC_013946	GGGGT	2	10	2364851	2364860	0 %	20 %	80 %	0 %	291296688
52222	NC_013946	GCC	2	6	2364945	2364950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296689
52223	NC_013946	GGTG	2	8	2364982	2364989	0 %	25 %	75 %	0 %	291296689
52224	NC_013946	A	8	8	2364995	2365002	100 %	0 %	0 %	0 %	291296689
52225	NC_013946	GC	3	6	2365006	2365011	0 %	0 %	50 %	50 %	291296689
52226	NC_013946	CGG	2	6	2365033	2365038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296689
52227	NC_013946	CCATC	2	10	2365054	2365063	20 %	20 %	0 %	60 %	291296689
52228	NC_013946	GCA	2	6	2365093	2365098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296689
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52230	NC_013946	GGCC	2	8	2365129	2365136	0 %	0 %	50 %	50 %	291296689
52231	NC_013946	GCCA	2	8	2365146	2365153	25 %	0 %	25 %	50 %	291296689
52232	NC_013946	AGC	2	6	2365158	2365163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296689
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52331	NC_013946	CCCA	2	8	2369308	2369315	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52332	NC_013946	GGT	2	6	2369475	2369480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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52339	NC_013946	GCT	2	6	2369729	2369734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296693
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52352	NC_013946	CTA	2	6	2370278	2370283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296693
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52465	NC_013946	CAAGGT	2	12	2374247	2374258	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	291296696
52466	NC_013946	CGGGC	2	10	2374282	2374291	0 %	0 %	60 %	40 %	291296696
52467	NC_013946	GACC	2	8	2374343	2374350	25 %	0 %	25 %	50 %	291296696
52468	NC_013946	G	6	6	2374358	2374363	0 %	0 %	100 %	0 %	291296696
52469	NC_013946	GCCCTG	2	12	2374407	2374418	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291296696
52470	NC_013946	CCCAC	2	10	2374462	2374471	20 %	0 %	0 %	80 %	291296696
52471	NC_013946	CAT	2	6	2374484	2374489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296696
52472	NC_013946	GCC	2	6	2374494	2374499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296696
52473	NC_013946	CTG	2	6	2374628	2374633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296697
52474	NC_013946	TCGAGG	2	12	2374668	2374679	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291296697
52475	NC_013946	GTG	2	6	2374688	2374693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296697
52476	NC_013946	GCC	2	6	2374753	2374758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296697
52477	NC_013946	GTG	2	6	2374877	2374882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296697
52478	NC_013946	CAT	2	6	2374894	2374899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296697
52479	NC_013946	GTG	2	6	2374901	2374906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296697
52480	NC_013946	GCC	2	6	2374955	2374960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296697
52481	NC_013946	CCA	2	6	2375002	2375007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296697
52482	NC_013946	GC	4	8	2375037	2375044	0 %	0 %	50 %	50 %	291296697
52483	NC_013946	C	7	7	2375173	2375179	0 %	0 %	0 %	100 %	291296698
52484	NC_013946	GCT	2	6	2375289	2375294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296698
52485	NC_013946	GGC	2	6	2375338	2375343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296698
52486	NC_013946	TAG	2	6	2375372	2375377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296698
52487	NC_013946	CTC	2	6	2375389	2375394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296698
52488	NC_013946	GTG	2	6	2375411	2375416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296698
52489	NC_013946	GCC	2	6	2375459	2375464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296698
52490	NC_013946	CAG	2	6	2375476	2375481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296698
52491	NC_013946	TGA	2	6	2375517	2375522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296698
52492	NC_013946	CAC	3	9	2375533	2375541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296698
52493	NC_013946	GCG	2	6	2375570	2375575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296698
52494	NC_013946	CCT	2	6	2375607	2375612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52495	NC_013946	ATCGC	2	10	2375681	2375690	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52496	NC_013946	GTCT	2	8	2375712	2375719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52497	NC_013946	CCA	2	6	2375734	2375739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52498	NC_013946	CTT	2	6	2375808	2375813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296699
52499	NC_013946	A	6	6	2375912	2375917	100 %	0 %	0 %	0 %	291296699
52500	NC_013946	CAT	2	6	2375983	2375988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296699

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