MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_013946	GGTGT	2	10	2331414	2331423	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
51502	NC_013946	GGT	2	6	2331427	2331432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51503	NC_013946	GCC	2	6	2331442	2331447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296653
51504	NC_013946	GCA	2	6	2331448	2331453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296653
51505	NC_013946	GCT	2	6	2331457	2331462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296653
51506	NC_013946	GCCGCA	2	12	2331508	2331519	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	291296653
51507	NC_013946	GAG	2	6	2331521	2331526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296653
51508	NC_013946	C	6	6	2331557	2331562	0 %	0 %	0 %	100 %	291296653
51509	NC_013946	CAG	2	6	2331598	2331603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296653
51510	NC_013946	CCA	3	9	2331621	2331629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296653
51511	NC_013946	C	6	6	2331713	2331718	0 %	0 %	0 %	100 %	291296653
51512	NC_013946	TGT	2	6	2331753	2331758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296653
51513	NC_013946	GC	3	6	2331779	2331784	0 %	0 %	50 %	50 %	291296653
51514	NC_013946	GCC	2	6	2331788	2331793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296653
51515	NC_013946	CCT	2	6	2331838	2331843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51516	NC_013946	CAGC	2	8	2331893	2331900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51517	NC_013946	AGT	2	6	2331914	2331919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51518	NC_013946	CAA	2	6	2331946	2331951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291296654
51519	NC_013946	AAG	2	6	2331959	2331964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296654
51520	NC_013946	GGTT	2	8	2331976	2331983	0 %	50 %	50 %	0 %	291296654
51521	NC_013946	CGCTGG	2	12	2332010	2332021	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291296654
51522	NC_013946	GCC	2	6	2332052	2332057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296654
51523	NC_013946	GTGG	2	8	2332146	2332153	0 %	25 %	75 %	0 %	291296654
51524	NC_013946	TCT	2	6	2332154	2332159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291296654
51525	NC_013946	ACC	2	6	2332229	2332234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296654
51526	NC_013946	G	6	6	2332240	2332245	0 %	0 %	100 %	0 %	291296654
51527	NC_013946	GCT	2	6	2332284	2332289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296654
51528	NC_013946	GGT	2	6	2332308	2332313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296654
51529	NC_013946	CAG	2	6	2332319	2332324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296654
51530	NC_013946	CTG	2	6	2332330	2332335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296654
51531	NC_013946	GC	3	6	2332377	2332382	0 %	0 %	50 %	50 %	291296654
51532	NC_013946	GCC	2	6	2332384	2332389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296654
51533	NC_013946	GGC	2	6	2332398	2332403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296654
51534	NC_013946	C	6	6	2332447	2332452	0 %	0 %	0 %	100 %	291296654
51535	NC_013946	ATC	2	6	2332514	2332519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296654
51536	NC_013946	TGG	2	6	2332526	2332531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296654
51537	NC_013946	CGC	2	6	2332545	2332550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296654
51538	NC_013946	TGAT	2	8	2332604	2332611	25 %	50 %	25 %	0 %	291296654
51539	NC_013946	CGG	2	6	2332629	2332634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296654
51540	NC_013946	GC	3	6	2332689	2332694	0 %	0 %	50 %	50 %	291296654
51541	NC_013946	GGT	2	6	2332701	2332706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296654
51542	NC_013946	GGC	2	6	2332760	2332765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296654
51543	NC_013946	TGC	2	6	2332835	2332840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296654
51544	NC_013946	CCA	2	6	2332851	2332856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296654
51545	NC_013946	ACGGCA	2	12	2332877	2332888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296654
51546	NC_013946	CGA	2	6	2332896	2332901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296654
51547	NC_013946	CCCG	2	8	2332919	2332926	0 %	0 %	25 %	75 %	291296654
51548	NC_013946	GGCCT	2	10	2332936	2332945	0 %	20 %	40 %	40 %	291296654
51549	NC_013946	ACC	2	6	2333032	2333037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296654
51550	NC_013946	CA	4	8	2333069	2333076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51551	NC_013946	ATC	2	6	2333337	2333342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296655
51552	NC_013946	C	7	7	2333353	2333359	0 %	0 %	0 %	100 %	291296655
51553	NC_013946	TGA	3	9	2333386	2333394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296655
51554	NC_013946	AGC	3	9	2333409	2333417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296655
51555	NC_013946	CGG	2	6	2333431	2333436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296655
51556	NC_013946	TTA	2	6	2333444	2333449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291296655
51557	NC_013946	A	6	6	2333469	2333474	100 %	0 %	0 %	0 %	291296655
51558	NC_013946	C	6	6	2333479	2333484	0 %	0 %	0 %	100 %	291296655
51559	NC_013946	GCC	2	6	2333526	2333531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296655
51560	NC_013946	ACC	2	6	2333602	2333607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296655
51561	NC_013946	CCG	2	6	2333611	2333616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296655
51562	NC_013946	ACT	2	6	2333632	2333637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296655
51563	NC_013946	GTA	2	6	2333673	2333678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296655
51564	NC_013946	CGC	2	6	2333721	2333726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296655
51565	NC_013946	AGC	2	6	2333755	2333760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296655
51566	NC_013946	GAC	2	6	2333832	2333837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296655
51567	NC_013946	GCC	2	6	2333868	2333873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296655
51568	NC_013946	GGC	2	6	2333981	2333986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296655
51569	NC_013946	CAG	2	6	2334017	2334022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296655
51570	NC_013946	AGC	2	6	2334031	2334036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296655
51571	NC_013946	G	6	6	2334082	2334087	0 %	0 %	100 %	0 %	291296655
51572	NC_013946	ACC	2	6	2334113	2334118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296655
51573	NC_013946	GCC	2	6	2334153	2334158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51574	NC_013946	TCGG	2	8	2334196	2334203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51575	NC_013946	CGG	2	6	2334274	2334279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51576	NC_013946	CAG	2	6	2334298	2334303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51577	NC_013946	GCAG	2	8	2334435	2334442	25 %	0 %	50 %	25 %	291296656
51578	NC_013946	G	7	7	2334507	2334513	0 %	0 %	100 %	0 %	291296656
51579	NC_013946	GCA	3	9	2334529	2334537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296656
51580	NC_013946	AGCCCC	2	12	2334543	2334554	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	291296656
51581	NC_013946	TGCGG	2	10	2334591	2334600	0 %	20 %	60 %	20 %	291296656
51582	NC_013946	CAC	2	6	2334608	2334613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296656
51583	NC_013946	TCC	2	6	2334633	2334638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296656
51584	NC_013946	GGCT	2	8	2334640	2334647	0 %	25 %	50 %	25 %	291296656
51585	NC_013946	TG	3	6	2334798	2334803	0 %	50 %	50 %	0 %	291296656
51586	NC_013946	TGC	2	6	2334885	2334890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296656
51587	NC_013946	CTG	2	6	2334911	2334916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296656
51588	NC_013946	GTT	2	6	2334991	2334996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296656
51589	NC_013946	C	6	6	2335077	2335082	0 %	0 %	0 %	100 %	291296656
51590	NC_013946	GCT	2	6	2335154	2335159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296656
51591	NC_013946	ACC	2	6	2335161	2335166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296656
51592	NC_013946	GCC	2	6	2335184	2335189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296656
51593	NC_013946	TTG	2	6	2335194	2335199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296656
51594	NC_013946	TGA	2	6	2335207	2335212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296656
51595	NC_013946	ACCA	2	8	2335216	2335223	50 %	0 %	0 %	50 %	291296656
51596	NC_013946	CAC	2	6	2335265	2335270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296656
51597	NC_013946	CAG	2	6	2335301	2335306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296656
51598	NC_013946	GC	3	6	2335341	2335346	0 %	0 %	50 %	50 %	291296656
51599	NC_013946	AGG	2	6	2335386	2335391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296656
51600	NC_013946	GCA	2	6	2335432	2335437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296656
51601	NC_013946	GCC	2	6	2335467	2335472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296656
51602	NC_013946	AGA	2	6	2335479	2335484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291296656
51603	NC_013946	GAC	2	6	2335502	2335507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296656
51604	NC_013946	CGC	2	6	2335509	2335514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296656
51605	NC_013946	CAA	2	6	2335535	2335540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51606	NC_013946	CGG	2	6	2335621	2335626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296657
51607	NC_013946	ATG	2	6	2335627	2335632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291296657
51608	NC_013946	CCT	2	6	2335718	2335723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296657
51609	NC_013946	GTT	2	6	2335746	2335751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291296657
51610	NC_013946	GAAT	2	8	2335828	2335835	50 %	25 %	25 %	0 %	291296657
51611	NC_013946	CGG	2	6	2335901	2335906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296657
51612	NC_013946	AGGCTC	2	12	2335929	2335940	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291296657
51613	NC_013946	GCA	2	6	2335964	2335969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296657
51614	NC_013946	GCT	2	6	2335991	2335996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296657
51615	NC_013946	GCA	2	6	2336102	2336107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291296657
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51968	NC_013946	GGCCCT	2	12	2353001	2353012	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291296672
51969	NC_013946	CCCCA	2	10	2353101	2353110	20 %	0 %	0 %	80 %	291296672
51970	NC_013946	CACC	2	8	2353172	2353179	25 %	0 %	0 %	75 %	291296672
51971	NC_013946	CG	3	6	2353181	2353186	0 %	0 %	50 %	50 %	291296672
51972	NC_013946	TGG	2	6	2353237	2353242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296672
51973	NC_013946	GGC	2	6	2353268	2353273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296672
51974	NC_013946	GCCG	2	8	2353335	2353342	0 %	0 %	50 %	50 %	291296672
51975	NC_013946	CCCA	2	8	2353356	2353363	25 %	0 %	0 %	75 %	291296672
51976	NC_013946	GCC	2	6	2353398	2353403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296672
51977	NC_013946	GGT	2	6	2353409	2353414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296672
51978	NC_013946	CGG	2	6	2353422	2353427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291296672
51979	NC_013946	GTG	2	6	2353428	2353433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296672
51980	NC_013946	TGG	2	6	2353435	2353440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296672
51981	NC_013946	CAC	2	6	2353460	2353465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291296672
51982	NC_013946	CTG	2	6	2353485	2353490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296672
51983	NC_013946	TCC	2	6	2353527	2353532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291296672
51984	NC_013946	CTA	2	6	2353553	2353558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291296672
51985	NC_013946	TGG	2	6	2353588	2353593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296672
51986	NC_013946	T	6	6	2353649	2353654	0 %	100 %	0 %	0 %	291296672
51987	NC_013946	G	6	6	2353683	2353688	0 %	0 %	100 %	0 %	291296672
51988	NC_013946	GCCTG	2	10	2353696	2353705	0 %	20 %	40 %	40 %	291296672
51989	NC_013946	CGGC	2	8	2353723	2353730	0 %	0 %	50 %	50 %	291296672
51990	NC_013946	AGG	2	6	2353753	2353758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291296672
51991	NC_013946	TC	3	6	2353776	2353781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51992	NC_013946	CTA	2	6	2353807	2353812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51993	NC_013946	GCGCC	2	10	2353844	2353853	0 %	0 %	40 %	60 %	291296673
51994	NC_013946	CTG	2	6	2353959	2353964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291296673
51995	NC_013946	CGC	2	6	2353986	2353991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291296673
51996	NC_013946	T	6	6	2354043	2354048	0 %	100 %	0 %	0 %	291296673
51997	NC_013946	TGG	2	6	2354083	2354088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296673
51998	NC_013946	CGGGG	2	10	2354094	2354103	0 %	0 %	80 %	20 %	291296673
51999	NC_013946	TG	3	6	2354254	2354259	0 %	50 %	50 %	0 %	291296673
52000	NC_013946	GGT	2	6	2354273	2354278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291296673

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