MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 chromosome

Total Repeats: 68587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013946	G	6	6	203511	203516	0 %	0 %	100 %	0 %	291294631
4502	NC_013946	G	8	8	203550	203557	0 %	0 %	100 %	0 %	291294631
4503	NC_013946	TGC	3	9	203561	203569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294631
4504	NC_013946	TGG	2	6	203597	203602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294631
4505	NC_013946	CGG	2	6	203606	203611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294631
4506	NC_013946	GCT	2	6	203637	203642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294631
4507	NC_013946	G	7	7	203643	203649	0 %	0 %	100 %	0 %	291294631
4508	NC_013946	CTTT	2	8	203651	203658	0 %	75 %	0 %	25 %	291294631
4509	NC_013946	CTG	2	6	203665	203670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294631
4510	NC_013946	GGC	2	6	203737	203742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294632
4511	NC_013946	TGGC	2	8	203816	203823	0 %	25 %	50 %	25 %	291294632
4512	NC_013946	CTG	2	6	203858	203863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294632
4513	NC_013946	CGG	2	6	203980	203985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294632
4514	NC_013946	AGG	2	6	204009	204014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294632
4515	NC_013946	TGG	2	6	204015	204020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294632
4516	NC_013946	GACCCA	2	12	204097	204108	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	291294632
4517	NC_013946	GGC	2	6	204112	204117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294632
4518	NC_013946	CGG	2	6	204128	204133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294632
4519	NC_013946	CGG	2	6	204148	204153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294632
4520	NC_013946	ACCA	2	8	204224	204231	50 %	0 %	0 %	50 %	291294632
4521	NC_013946	CTG	2	6	204266	204271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294632
4522	NC_013946	TGC	2	6	204309	204314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294632
4523	NC_013946	CTG	2	6	204371	204376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294632
4524	NC_013946	CCG	2	6	204390	204395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294632
4525	NC_013946	TGC	2	6	204414	204419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294632
4526	NC_013946	GGTGCA	2	12	204439	204450	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291294632
4527	NC_013946	GACC	2	8	204461	204468	25 %	0 %	25 %	50 %	291294632
4528	NC_013946	GGT	2	6	204469	204474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294632
4529	NC_013946	GGA	2	6	204481	204486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294632
4530	NC_013946	GCT	2	6	204520	204525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294633
4531	NC_013946	TGA	2	6	204555	204560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291294633
4532	NC_013946	GC	3	6	204581	204586	0 %	0 %	50 %	50 %	291294633
4533	NC_013946	TA	3	6	204587	204592	50 %	50 %	0 %	0 %	291294633
4534	NC_013946	AGG	2	6	204603	204608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294633
4535	NC_013946	CTG	2	6	204677	204682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294633
4536	NC_013946	TGC	2	6	204735	204740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294633
4537	NC_013946	G	6	6	204809	204814	0 %	0 %	100 %	0 %	291294633
4538	NC_013946	AGCC	2	8	204828	204835	25 %	0 %	25 %	50 %	291294633
4539	NC_013946	GCC	2	6	204988	204993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294634
4540	NC_013946	GGCC	2	8	204996	205003	0 %	0 %	50 %	50 %	291294634
4541	NC_013946	GT	3	6	205081	205086	0 %	50 %	50 %	0 %	291294634
4542	NC_013946	GCGG	2	8	205191	205198	0 %	0 %	75 %	25 %	291294634
4543	NC_013946	GCA	2	6	205201	205206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294634
4544	NC_013946	GAG	2	6	205237	205242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294634
4545	NC_013946	GCG	2	6	205266	205271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294634
4546	NC_013946	C	6	6	205324	205329	0 %	0 %	0 %	100 %	291294634
4547	NC_013946	GGC	2	6	205336	205341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294634
4548	NC_013946	GCC	2	6	205366	205371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294634
4549	NC_013946	CAC	2	6	205416	205421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294634
4550	NC_013946	GGA	2	6	205425	205430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294634
4551	NC_013946	GGT	2	6	205452	205457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294634
4552	NC_013946	AGC	2	6	205488	205493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294634
4553	NC_013946	C	6	6	205577	205582	0 %	0 %	0 %	100 %	291294634
4554	NC_013946	GGT	2	6	205584	205589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294634
4555	NC_013946	GCGCCC	2	12	205639	205650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294634
4556	NC_013946	ACC	2	6	205708	205713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294635
4557	NC_013946	AGC	2	6	205772	205777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294635
4558	NC_013946	GCTG	2	8	205796	205803	0 %	25 %	50 %	25 %	291294635
4559	NC_013946	GCC	2	6	205804	205809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294635
4560	NC_013946	GTG	2	6	205825	205830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294635
4561	NC_013946	CGG	2	6	205895	205900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294635
4562	NC_013946	GCG	2	6	205969	205974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294635
4563	NC_013946	G	7	7	206005	206011	0 %	0 %	100 %	0 %	291294635
4564	NC_013946	CTT	2	6	206046	206051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291294635
4565	NC_013946	CGG	2	6	206063	206068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294635
4566	NC_013946	GCC	2	6	206069	206074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294635
4567	NC_013946	G	7	7	206092	206098	0 %	0 %	100 %	0 %	291294635
4568	NC_013946	TGC	2	6	206099	206104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294635
4569	NC_013946	TGC	2	6	206111	206116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294635
4570	NC_013946	GCC	2	6	206142	206147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294635
4571	NC_013946	GGT	2	6	206154	206159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294635
4572	NC_013946	G	8	8	206253	206260	0 %	0 %	100 %	0 %	291294636
4573	NC_013946	GCCCAG	3	18	206284	206301	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	291294636
4574	NC_013946	C	7	7	206394	206400	0 %	0 %	0 %	100 %	291294636
4575	NC_013946	GCA	2	6	206445	206450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294636
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4577	NC_013946	CTG	2	6	206470	206475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294636
4578	NC_013946	TGC	2	6	206525	206530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294636
4579	NC_013946	CTG	2	6	206578	206583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294636
4580	NC_013946	CTG	2	6	206650	206655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294636
4581	NC_013946	GGC	2	6	206658	206663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294636
4582	NC_013946	AGG	2	6	206681	206686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294636
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4584	NC_013946	CAAAT	2	10	206725	206734	60 %	20 %	0 %	20 %	291294636
4585	NC_013946	CTTCA	2	10	206745	206754	20 %	40 %	0 %	40 %	291294637
4586	NC_013946	TGGC	2	8	206778	206785	0 %	25 %	50 %	25 %	291294637
4587	NC_013946	CCA	2	6	206798	206803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294637
4588	NC_013946	GCC	2	6	206819	206824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294637
4589	NC_013946	GGA	2	6	206843	206848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291294637
4590	NC_013946	GCC	2	6	206865	206870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294637
4591	NC_013946	CAG	2	6	206874	206879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294637
4592	NC_013946	GCC	2	6	206922	206927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294637
4593	NC_013946	CCG	2	6	206941	206946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294637
4594	NC_013946	TGC	2	6	206986	206991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294637
4595	NC_013946	CGGG	2	8	207000	207007	0 %	0 %	75 %	25 %	291294637
4596	NC_013946	G	6	6	207005	207010	0 %	0 %	100 %	0 %	291294637
4597	NC_013946	GCC	2	6	207036	207041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294637
4598	NC_013946	GCC	2	6	207135	207140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294637
4599	NC_013946	GCC	2	6	207186	207191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294637
4600	NC_013946	GCC	2	6	207225	207230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294637
4601	NC_013946	ACC	2	6	207252	207257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294637
4602	NC_013946	CGG	2	6	207274	207279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294637
4603	NC_013946	G	7	7	207443	207449	0 %	0 %	100 %	0 %	291294637
4604	NC_013946	CGG	2	6	207460	207465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294637
4605	NC_013946	GGCC	2	8	207494	207501	0 %	0 %	50 %	50 %	291294637
4606	NC_013946	GCT	2	6	207542	207547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294637
4607	NC_013946	CGCT	2	8	207597	207604	0 %	25 %	25 %	50 %	291294637
4608	NC_013946	CAG	2	6	207617	207622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294637
4609	NC_013946	GCGG	2	8	207713	207720	0 %	0 %	75 %	25 %	291294637
4610	NC_013946	GGCA	2	8	207734	207741	25 %	0 %	50 %	25 %	291294637
4611	NC_013946	CAGAG	2	10	207903	207912	40 %	0 %	40 %	20 %	291294638
4612	NC_013946	TAC	2	6	207931	207936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291294638
4613	NC_013946	ACC	2	6	207971	207976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291294638
4614	NC_013946	GGC	2	6	207977	207982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294638
4615	NC_013946	GCC	2	6	208007	208012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294638
4616	NC_013946	AGA	2	6	208086	208091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294638
4617	NC_013946	CTGG	2	8	208144	208151	0 %	25 %	50 %	25 %	291294639
4618	NC_013946	GCC	2	6	208217	208222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294639
4619	NC_013946	TGG	2	6	208272	208277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291294639
4620	NC_013946	CTGCC	2	10	208290	208299	0 %	20 %	20 %	60 %	291294639
4621	NC_013946	CTG	2	6	208322	208327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294639
4622	NC_013946	CTGG	2	8	208333	208340	0 %	25 %	50 %	25 %	291294639
4623	NC_013946	CTG	2	6	208370	208375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294639
4624	NC_013946	CCG	2	6	208380	208385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291294639
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4626	NC_013946	TGGGG	2	10	208462	208471	0 %	20 %	80 %	0 %	291294639
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4643	NC_013946	A	7	7	208879	208885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4644	NC_013946	TGGCT	2	10	208926	208935	0 %	40 %	40 %	20 %	291294640
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4661	NC_013946	GTA	2	6	210103	210108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4871	NC_013946	CGCAC	2	10	218243	218252	20 %	0 %	20 %	60 %	291294648
4872	NC_013946	CTGGGC	2	12	218257	218268	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291294648
4873	NC_013946	CAAA	2	8	218310	218317	75 %	0 %	0 %	25 %	291294648
4874	NC_013946	GTT	2	6	218335	218340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294648
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4881	NC_013946	CTG	2	6	218566	218571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294648
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4889	NC_013946	CTGG	2	8	219174	219181	0 %	25 %	50 %	25 %	291294649
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4898	NC_013946	GAT	2	6	219479	219484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4900	NC_013946	GCT	2	6	219646	219651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4901	NC_013946	CTG	2	6	219654	219659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4902	NC_013946	GCA	2	6	219680	219685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4973	NC_013946	CGG	2	6	222216	222221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291294653
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4989	NC_013946	AGCC	2	8	222758	222765	25 %	0 %	25 %	50 %	291294653
4990	NC_013946	AAG	2	6	222774	222779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291294653
4991	NC_013946	T	6	6	222794	222799	0 %	100 %	0 %	0 %	291294653
4992	NC_013946	CATT	2	8	222800	222807	25 %	50 %	0 %	25 %	291294653
4993	NC_013946	CGT	2	6	222852	222857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294654
4994	NC_013946	AGC	2	6	222901	222906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294654
4995	NC_013946	TTG	2	6	222941	222946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291294654
4996	NC_013946	GCT	2	6	222948	222953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294654
4997	NC_013946	GCT	2	6	222977	222982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291294654
4998	NC_013946	GCCCG	2	10	222999	223008	0 %	0 %	40 %	60 %	291294654
4999	NC_013946	AGC	2	6	223022	223027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291294654
5000	NC_013946	AGCTC	2	10	223131	223140	20 %	20 %	20 %	40 %	291294654

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