MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 chromosome

Total Repeats: 47737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_013887	TATTGA	2	12	39093	39104	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289191543
1003	NC_013887	TCA	2	6	39113	39118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191543
1004	NC_013887	TCT	2	6	39131	39136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191543
1005	NC_013887	ACTAT	2	10	39290	39299	40 %	40 %	0 %	20 %	289191543
1006	NC_013887	TAA	2	6	39300	39305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191543
1007	NC_013887	GTTAA	2	10	39314	39323	40 %	40 %	20 %	0 %	289191543
1008	NC_013887	AAC	2	6	39337	39342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191543
1009	NC_013887	CATT	2	8	39371	39378	25 %	50 %	0 %	25 %	289191543
1010	NC_013887	TA	3	6	39451	39456	50 %	50 %	0 %	0 %	289191543
1011	NC_013887	CAA	2	6	39489	39494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191543
1012	NC_013887	AT	3	6	39495	39500	50 %	50 %	0 %	0 %	289191543
1013	NC_013887	T	6	6	39500	39505	0 %	100 %	0 %	0 %	289191543
1014	NC_013887	TAA	2	6	39517	39522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191543
1015	NC_013887	GGA	2	6	39523	39528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191543
1016	NC_013887	TAT	2	6	39552	39557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191543
1017	NC_013887	ACC	2	6	39604	39609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289191543
1018	NC_013887	TTAT	2	8	39644	39651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_013887	TTA	2	6	39666	39671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013887	TTAAA	2	10	39678	39687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_013887	GTT	2	6	39706	39711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_013887	TAA	3	9	39715	39723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013887	A	6	6	39722	39727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_013887	GA	3	6	39751	39756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_013887	AAT	2	6	39775	39780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191544
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1027	NC_013887	ATG	2	6	39821	39826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191544
1028	NC_013887	TTG	2	6	39863	39868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191544
1029	NC_013887	GAT	2	6	39872	39877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191544
1030	NC_013887	TA	3	6	39883	39888	50 %	50 %	0 %	0 %	289191544
1031	NC_013887	CAA	2	6	39892	39897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191544
1032	NC_013887	AGG	3	9	39921	39929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191544
1033	NC_013887	GAT	2	6	39931	39936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191544
1034	NC_013887	TA	3	6	40052	40057	50 %	50 %	0 %	0 %	289191544
1035	NC_013887	GA	3	6	40063	40068	50 %	0 %	50 %	0 %	289191544
1036	NC_013887	GACA	2	8	40096	40103	50 %	0 %	25 %	25 %	289191544
1037	NC_013887	GAA	2	6	40148	40153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191544
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1041	NC_013887	GA	4	8	40325	40332	50 %	0 %	50 %	0 %	289191544
1042	NC_013887	TAT	2	6	40388	40393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191544
1043	NC_013887	GAT	2	6	40397	40402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191544
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1050	NC_013887	ATTG	2	8	40576	40583	25 %	50 %	25 %	0 %	289191544
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1052	NC_013887	ATTTA	2	10	40647	40656	40 %	60 %	0 %	0 %	289191544
1053	NC_013887	AAGA	2	8	40693	40700	75 %	0 %	25 %	0 %	289191544
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1061	NC_013887	GTTGA	2	10	41009	41018	20 %	40 %	40 %	0 %	289191544
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1073	NC_013887	TACC	2	8	41511	41518	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1078	NC_013887	TAA	2	6	42037	42042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013887	AAAG	2	8	42053	42060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_013887	TA	3	6	42114	42119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1083	NC_013887	ATTG	2	8	42197	42204	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013887	ATT	2	6	42223	42228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013887	AGAAT	2	10	42264	42273	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_013887	AAT	2	6	42310	42315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_013887	ATA	2	6	42682	42687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_013887	AT	3	6	42692	42697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_013887	A	6	6	42717	42722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_013887	TAA	2	6	42733	42738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013887	A	6	6	42760	42765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_013887	TTATTT	2	12	42766	42777	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_013887	T	6	6	42775	42780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_013887	T	7	7	42822	42828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_013887	AT	3	6	42911	42916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_013887	T	6	6	42945	42950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1112	NC_013887	AGA	2	6	43053	43058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_013887	AGAA	2	8	43061	43068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1116	NC_013887	A	6	6	43190	43195	100 %	0 %	0 %	0 %	289191545
1117	NC_013887	A	6	6	43253	43258	100 %	0 %	0 %	0 %	289191545
1118	NC_013887	AGG	3	9	43311	43319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191545
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1123	NC_013887	A	6	6	43484	43489	100 %	0 %	0 %	0 %	289191545
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1128	NC_013887	TTG	2	6	43689	43694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191545
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1130	NC_013887	AG	3	6	43770	43775	50 %	0 %	50 %	0 %	289191545
1131	NC_013887	TA	4	8	43870	43877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_013887	TA	3	6	43958	43963	50 %	50 %	0 %	0 %	289191546
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