MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 chromosome

Total Repeats: 47737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013887	TATAT	2	10	20267	20276	40 %	60 %	0 %	0 %	289191520
502	NC_013887	TATC	2	8	20307	20314	25 %	50 %	0 %	25 %	289191520
503	NC_013887	TTC	2	6	20318	20323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191520
504	NC_013887	T	7	7	20337	20343	0 %	100 %	0 %	0 %	289191520
505	NC_013887	TTA	2	6	20377	20382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191520
506	NC_013887	AATT	2	8	20395	20402	50 %	50 %	0 %	0 %	289191520
507	NC_013887	TTC	2	6	20444	20449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191520
508	NC_013887	GATTAA	2	12	20474	20485	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289191520
509	NC_013887	CT	3	6	20499	20504	0 %	50 %	0 %	50 %	289191520
510	NC_013887	GGC	2	6	20538	20543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289191520
511	NC_013887	ATC	2	6	20546	20551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191520
512	NC_013887	TTG	3	9	20608	20616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191520
513	NC_013887	GTA	2	6	20625	20630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191520
514	NC_013887	TAA	2	6	20675	20680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191520
515	NC_013887	TC	3	6	20731	20736	0 %	50 %	0 %	50 %	289191520
516	NC_013887	CT	3	6	20762	20767	0 %	50 %	0 %	50 %	289191520
517	NC_013887	CTTT	2	8	20780	20787	0 %	75 %	0 %	25 %	289191520
518	NC_013887	GTA	2	6	20819	20824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191520
519	NC_013887	TCC	2	6	20849	20854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289191520
520	NC_013887	TC	3	6	20893	20898	0 %	50 %	0 %	50 %	289191520
521	NC_013887	TAA	2	6	21056	21061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191520
522	NC_013887	ACT	2	6	21168	21173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191520
523	NC_013887	TTC	2	6	21215	21220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191520
524	NC_013887	CTCTT	2	10	21268	21277	0 %	60 %	0 %	40 %	289191520
525	NC_013887	TCT	2	6	21280	21285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191520
526	NC_013887	CTCC	2	8	21286	21293	0 %	25 %	0 %	75 %	289191520
527	NC_013887	T	6	6	21302	21307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013887	ATT	2	6	21415	21420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191521
529	NC_013887	CTC	2	6	21429	21434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289191521
530	NC_013887	CTT	2	6	21490	21495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191521
531	NC_013887	GTA	2	6	21536	21541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191521
532	NC_013887	GCA	2	6	21571	21576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191521
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535	NC_013887	CAA	2	6	21734	21739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191521
536	NC_013887	AAAT	2	8	21777	21784	75 %	25 %	0 %	0 %	289191521
537	NC_013887	ATT	2	6	21786	21791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289191521
538	NC_013887	T	6	6	21858	21863	0 %	100 %	0 %	0 %	289191521
539	NC_013887	TTG	2	6	21896	21901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191521
540	NC_013887	CTA	2	6	21908	21913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289191521
541	NC_013887	GAT	2	6	21952	21957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191521
542	NC_013887	CTT	2	6	21960	21965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289191521
543	NC_013887	TA	3	6	21998	22003	50 %	50 %	0 %	0 %	289191521
544	NC_013887	TA	4	8	22061	22068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013887	GTT	2	6	22090	22095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013887	AT	3	6	22100	22105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013887	AAGT	2	8	22109	22116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013887	TA	5	10	22134	22143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013887	TA	3	6	22175	22180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013887	CCT	2	6	22181	22186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_013887	TAG	2	6	22203	22208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013887	AATT	2	8	22236	22243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013887	GAT	2	6	22261	22266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191522
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555	NC_013887	ATA	3	9	22301	22309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191522
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557	NC_013887	A	6	6	22338	22343	100 %	0 %	0 %	0 %	289191522
558	NC_013887	AGA	2	6	22354	22359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191522
559	NC_013887	GAG	2	6	22424	22429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191522
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561	NC_013887	AT	3	6	22509	22514	50 %	50 %	0 %	0 %	289191522
562	NC_013887	AAAG	2	8	22552	22559	75 %	0 %	25 %	0 %	289191522
563	NC_013887	ACA	2	6	22689	22694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191522
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571	NC_013887	A	6	6	22957	22962	100 %	0 %	0 %	0 %	289191522
572	NC_013887	AAG	2	6	23021	23026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191522
573	NC_013887	AAAAT	2	10	23053	23062	80 %	20 %	0 %	0 %	289191522
574	NC_013887	TTAA	2	8	23063	23070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013887	AAC	2	6	23091	23096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289191523
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579	NC_013887	ATA	2	6	23262	23267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191523
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585	NC_013887	T	7	7	23600	23606	0 %	100 %	0 %	0 %	289191523
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600	NC_013887	CAGC	2	8	24268	24275	25 %	0 %	25 %	50 %	289191524
601	NC_013887	TAGT	2	8	24320	24327	25 %	50 %	25 %	0 %	289191524
602	NC_013887	GAG	2	6	24394	24399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191524
603	NC_013887	TAA	2	6	24401	24406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191524
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611	NC_013887	TGA	2	6	24632	24637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191525
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617	NC_013887	GGTATT	2	12	24855	24866	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	289191525
618	NC_013887	GA	3	6	24881	24886	50 %	0 %	50 %	0 %	289191525
619	NC_013887	GGA	2	6	24960	24965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289191525
620	NC_013887	CAG	2	6	24969	24974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289191525
621	NC_013887	TTG	2	6	25020	25025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289191525
622	NC_013887	AAT	2	6	25169	25174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289191525
623	NC_013887	TGA	2	6	25208	25213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289191525
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625	NC_013887	AAG	2	6	25287	25292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289191525
626	NC_013887	A	6	6	25428	25433	100 %	0 %	0 %	0 %	289191525
627	NC_013887	TTTA	2	8	25516	25523	25 %	75 %	0 %	0 %	289191525
628	NC_013887	A	6	6	25565	25570	100 %	0 %	0 %	0 %	289191525
629	NC_013887	TCT	3	9	25595	25603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_013887	TTA	2	6	25608	25613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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