MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella paludicola SANAE chromosome

Total Repeats: 60015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013665	ATC	2	6	2	7	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013665	A	6	6	65	70	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013665	A	6	6	78	83	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013665	A	6	6	86	91	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013665	A	6	6	95	100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013665	AT	3	6	139	144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013665	AC	3	6	146	151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013665	AGTT	2	8	171	178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013665	ACA	2	6	205	210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013665	ATG	2	6	272	277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013665	ATG	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013665	TCATT	2	10	507	516	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013665	ACAT	2	8	539	546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013665	CCG	2	6	569	574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013665	TGA	2	6	622	627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162671
16	NC_013665	GAG	2	6	647	652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162671
17	NC_013665	TCGA	2	8	656	663	25 %	25 %	25 %	25 %	282162671
18	NC_013665	T	6	6	699	704	0 %	100 %	0 %	0 %	282162671
19	NC_013665	GCC	2	6	794	799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162671
20	NC_013665	AAG	2	6	881	886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162671
21	NC_013665	AAG	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162671
22	NC_013665	CAT	3	9	1081	1089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162671
23	NC_013665	GAA	2	6	1114	1119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162671
24	NC_013665	GCG	2	6	1122	1127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162671
25	NC_013665	CAT	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162671
26	NC_013665	AGC	2	6	1311	1316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162671
27	NC_013665	CGG	2	6	1353	1358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162671
28	NC_013665	GCG	2	6	1373	1378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162671
29	NC_013665	GGT	2	6	1465	1470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162671
30	NC_013665	GAG	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162671
31	NC_013665	AGATCG	2	12	1503	1514	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	282162671
32	NC_013665	GGT	2	6	1528	1533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162671
33	NC_013665	GAT	2	6	1651	1656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162671
34	NC_013665	GACC	2	8	1687	1694	25 %	0 %	25 %	50 %	282162671
35	NC_013665	CAT	2	6	1720	1725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162671
36	NC_013665	GTG	2	6	1736	1741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162671
37	NC_013665	CCG	2	6	1788	1793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162671
38	NC_013665	CGA	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162671
39	NC_013665	CGCC	2	8	1846	1853	0 %	0 %	25 %	75 %	282162671
40	NC_013665	CAG	2	6	1868	1873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162671
41	NC_013665	AGCC	2	8	1886	1893	25 %	0 %	25 %	50 %	282162671
42	NC_013665	GCC	2	6	1990	1995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162672
43	NC_013665	CTT	2	6	1996	2001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162672
44	NC_013665	CCG	2	6	2003	2008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162672
45	NC_013665	GCC	2	6	2086	2091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162672
46	NC_013665	TCT	2	6	2151	2156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162672
47	NC_013665	TCT	2	6	2211	2216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162672
48	NC_013665	CCT	2	6	2235	2240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162672
49	NC_013665	TCA	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013665	TCC	2	6	2299	2304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013665	AAG	2	6	2358	2363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162673
52	NC_013665	GTT	2	6	2471	2476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	282162673
53	NC_013665	GCC	2	6	2516	2521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162673
54	NC_013665	CCAG	2	8	2793	2800	25 %	0 %	25 %	50 %	282162673
55	NC_013665	C	6	6	2872	2877	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_013665	TTG	2	6	2925	2930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013665	AAG	2	6	2951	2956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013665	TGC	2	6	2989	2994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162674
59	NC_013665	GGT	2	6	3188	3193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162674
60	NC_013665	CGA	2	6	3286	3291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162674
61	NC_013665	ACG	2	6	3298	3303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162674
62	NC_013665	GTG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162674
63	NC_013665	GCCC	2	8	3391	3398	0 %	0 %	25 %	75 %	282162674
64	NC_013665	CGC	2	6	3448	3453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162674
65	NC_013665	GCC	2	6	3462	3467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162674
66	NC_013665	CG	3	6	3496	3501	0 %	0 %	50 %	50 %	282162675
67	NC_013665	CGCC	2	8	3539	3546	0 %	0 %	25 %	75 %	282162675
68	NC_013665	GCAG	2	8	3633	3640	25 %	0 %	50 %	25 %	282162675
69	NC_013665	C	6	6	3710	3715	0 %	0 %	0 %	100 %	282162675
70	NC_013665	ACG	2	6	3823	3828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162675
71	NC_013665	TCG	2	6	3838	3843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162675
72	NC_013665	CGC	2	6	3950	3955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162675
73	NC_013665	A	6	6	3998	4003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013665	GGC	2	6	4034	4039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162676
75	NC_013665	CAG	2	6	4087	4092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162676
76	NC_013665	ACGT	2	8	4136	4143	25 %	25 %	25 %	25 %	282162676
77	NC_013665	GAC	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162676
78	NC_013665	TCAGGG	2	12	4215	4226	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	282162676
79	NC_013665	CCCG	2	8	4255	4262	0 %	0 %	25 %	75 %	282162676
80	NC_013665	CGC	2	6	4359	4364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162676
81	NC_013665	ATG	2	6	4412	4417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162676
82	NC_013665	GCC	2	6	4442	4447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162676
83	NC_013665	GTA	2	6	4549	4554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162676
84	NC_013665	CCTG	2	8	4580	4587	0 %	25 %	25 %	50 %	282162676
85	NC_013665	CGT	2	6	4638	4643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162676
86	NC_013665	AT	3	6	4654	4659	50 %	50 %	0 %	0 %	282162676
87	NC_013665	CGT	2	6	4665	4670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162676
88	NC_013665	TCA	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162676
89	NC_013665	GCG	2	6	4914	4919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162676
90	NC_013665	GTCCC	2	10	5111	5120	0 %	20 %	20 %	60 %	282162676
91	NC_013665	AC	3	6	5125	5130	50 %	0 %	0 %	50 %	282162676
92	NC_013665	GTT	2	6	5143	5148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	282162676
93	NC_013665	CCT	2	6	5181	5186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162676
94	NC_013665	CCG	2	6	5223	5228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162676
95	NC_013665	CGGCG	2	10	5236	5245	0 %	0 %	60 %	40 %	282162676
96	NC_013665	GAT	2	6	5257	5262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162676
97	NC_013665	TG	3	6	5286	5291	0 %	50 %	50 %	0 %	282162676
98	NC_013665	G	6	6	5391	5396	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013665	GCG	2	6	5416	5421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162677
100	NC_013665	CCAGG	2	10	5475	5484	20 %	0 %	40 %	40 %	282162677
101	NC_013665	GCA	2	6	5486	5491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162677
102	NC_013665	CAC	2	6	5560	5565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162677
103	NC_013665	TTAT	2	8	5593	5600	25 %	75 %	0 %	0 %	282162677
104	NC_013665	GCCA	2	8	5617	5624	25 %	0 %	25 %	50 %	282162677
105	NC_013665	CGC	2	6	5687	5692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162677
106	NC_013665	GGC	2	6	5721	5726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162677
107	NC_013665	CGC	2	6	5736	5741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162677
108	NC_013665	GGC	2	6	5778	5783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162677
109	NC_013665	GTC	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162677
110	NC_013665	C	6	6	5816	5821	0 %	0 %	0 %	100 %	282162677
111	NC_013665	CGG	3	9	5879	5887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162677
112	NC_013665	CTC	2	6	6000	6005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162677
113	NC_013665	GCC	2	6	6033	6038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162677
114	NC_013665	CGG	3	9	6062	6070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162677
115	NC_013665	TCG	2	6	6163	6168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162677
116	NC_013665	CGCC	2	8	6209	6216	0 %	0 %	25 %	75 %	282162677
117	NC_013665	ATT	2	6	6253	6258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	282162677
118	NC_013665	T	7	7	6257	6263	0 %	100 %	0 %	0 %	282162677
119	NC_013665	CCCG	2	8	6301	6308	0 %	0 %	25 %	75 %	282162677
120	NC_013665	GCC	2	6	6322	6327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162677
121	NC_013665	CAG	2	6	6346	6351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162677
122	NC_013665	CTG	2	6	6372	6377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162677
123	NC_013665	ACG	2	6	6395	6400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162677
124	NC_013665	GAT	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162677
125	NC_013665	CAG	2	6	6441	6446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162677
126	NC_013665	GTA	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162677
127	NC_013665	CTGA	2	8	6466	6473	25 %	25 %	25 %	25 %	282162677
128	NC_013665	CGA	2	6	6698	6703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162677
129	NC_013665	TCC	2	6	6724	6729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162677
130	NC_013665	CCG	2	6	6773	6778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162677
131	NC_013665	TCA	2	6	6839	6844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162677
132	NC_013665	GTT	2	6	6876	6881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	282162677
133	NC_013665	GAA	2	6	6966	6971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162677
134	NC_013665	TGACGG	2	12	6998	7009	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	282162677
135	NC_013665	GAG	2	6	7054	7059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162677
136	NC_013665	CCAG	2	8	7091	7098	25 %	0 %	25 %	50 %	282162677
137	NC_013665	CTT	2	6	7104	7109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162677
138	NC_013665	TCG	2	6	7201	7206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162677
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396	NC_013665	GAG	2	6	18065	18070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162695
397	NC_013665	ACG	2	6	18082	18087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162696
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399	NC_013665	GAG	2	6	18226	18231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162696
400	NC_013665	CGCC	2	8	18234	18241	0 %	0 %	25 %	75 %	282162696
401	NC_013665	GGA	2	6	18252	18257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162696
402	NC_013665	CAT	2	6	18294	18299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162696
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404	NC_013665	GAG	2	6	18406	18411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162696
405	NC_013665	ACC	2	6	18416	18421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162696
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413	NC_013665	ATT	2	6	18914	18919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_013665	GGCG	2	8	19380	19387	0 %	0 %	75 %	25 %	282162697
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471	NC_013665	TCA	2	6	21671	21676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162699
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496	NC_013665	CCA	2	6	22547	22552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162700
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