MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella paludicola SANAE chromosome

Total Repeats: 60015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013665	ACCGC	2	10	162482	162491	20 %	0 %	20 %	60 %	282162837
3502	NC_013665	GGC	2	6	162498	162503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162837
3503	NC_013665	ACC	2	6	162604	162609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162837
3504	NC_013665	GGACC	2	10	162624	162633	20 %	0 %	40 %	40 %	282162837
3505	NC_013665	GCC	2	6	162643	162648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162837
3506	NC_013665	CTC	2	6	162706	162711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162837
3507	NC_013665	AGG	2	6	162713	162718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162837
3508	NC_013665	GGC	2	6	162723	162728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162837
3509	NC_013665	GCC	2	6	162807	162812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162837
3510	NC_013665	GAG	2	6	162828	162833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162837
3511	NC_013665	TCG	2	6	162858	162863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162838
3512	NC_013665	CGG	2	6	162874	162879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162838
3513	NC_013665	GGT	2	6	162888	162893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162838
3514	NC_013665	GCT	2	6	163093	163098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162838
3515	NC_013665	CGGAG	2	10	163239	163248	20 %	0 %	60 %	20 %	282162838
3516	NC_013665	ATC	2	6	163265	163270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162838
3517	NC_013665	CGT	2	6	163342	163347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162838
3518	NC_013665	CG	3	6	163385	163390	0 %	0 %	50 %	50 %	282162838
3519	NC_013665	GCT	2	6	163462	163467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162838
3520	NC_013665	GTC	2	6	163513	163518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162838
3521	NC_013665	AGG	2	6	163538	163543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162838
3522	NC_013665	TCG	2	6	163548	163553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162838
3523	NC_013665	GAG	2	6	163562	163567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162838
3524	NC_013665	TCG	2	6	163571	163576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162838
3525	NC_013665	CCG	2	6	163623	163628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162838
3526	NC_013665	CTA	2	6	163633	163638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162838
3527	NC_013665	GTC	2	6	163757	163762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162838
3528	NC_013665	CGA	2	6	163789	163794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162838
3529	NC_013665	TCC	2	6	163932	163937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162838
3530	NC_013665	GC	3	6	163969	163974	0 %	0 %	50 %	50 %	282162838
3531	NC_013665	CAG	2	6	163986	163991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162838
3532	NC_013665	CCG	2	6	164040	164045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162838
3533	NC_013665	CGA	2	6	164053	164058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162838
3534	NC_013665	TGC	2	6	164061	164066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162838
3535	NC_013665	AT	3	6	164133	164138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_013665	CGT	2	6	164169	164174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_013665	T	7	7	164222	164228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013665	CTG	2	6	164297	164302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_013665	ATT	2	6	164316	164321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_013665	TAAA	2	8	164408	164415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_013665	GTA	2	6	164545	164550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_013665	TGC	2	6	164615	164620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162839
3543	NC_013665	GAT	2	6	164638	164643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162839
3544	NC_013665	ACG	2	6	164714	164719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162839
3545	NC_013665	ATC	2	6	164734	164739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162839
3546	NC_013665	CCTT	2	8	164753	164760	0 %	50 %	0 %	50 %	282162839
3547	NC_013665	CTT	3	9	164758	164766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162839
3548	NC_013665	CAG	2	6	164806	164811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162839
3549	NC_013665	CTT	2	6	164853	164858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162839
3550	NC_013665	ATG	2	6	164867	164872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162839
3551	NC_013665	TGT	2	6	164900	164905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	282162840
3552	NC_013665	GAC	2	6	164938	164943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162840
3553	NC_013665	GGC	2	6	164946	164951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162840
3554	NC_013665	GCC	2	6	165043	165048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162840
3555	NC_013665	CTT	2	6	165207	165212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162840
3556	NC_013665	GAT	2	6	165225	165230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162840
3557	NC_013665	CAG	2	6	165258	165263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162840
3558	NC_013665	ACG	2	6	165286	165291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162840
3559	NC_013665	CGT	2	6	165317	165322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162840
3560	NC_013665	GCC	2	6	165358	165363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162840
3561	NC_013665	GGA	2	6	165453	165458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162840
3562	NC_013665	CGC	2	6	165572	165577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162840
3563	NC_013665	GT	3	6	165731	165736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_013665	ATC	2	6	165877	165882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162841
3565	NC_013665	CGAC	2	8	165884	165891	25 %	0 %	25 %	50 %	282162841
3566	NC_013665	GGC	2	6	165899	165904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162841
3567	NC_013665	TCA	2	6	165914	165919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162841
3568	NC_013665	C	6	6	165930	165935	0 %	0 %	0 %	100 %	282162841
3569	NC_013665	GCT	2	6	165950	165955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162841
3570	NC_013665	CGA	2	6	166008	166013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162841
3571	NC_013665	CGA	2	6	166026	166031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162841
3572	NC_013665	AG	3	6	166164	166169	50 %	0 %	50 %	0 %	282162841
3573	NC_013665	TC	4	8	166283	166290	0 %	50 %	0 %	50 %	282162841
3574	NC_013665	TCGC	2	8	166321	166328	0 %	25 %	25 %	50 %	282162841
3575	NC_013665	GGC	2	6	166387	166392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162841
3576	NC_013665	CA	3	6	166454	166459	50 %	0 %	0 %	50 %	282162841
3577	NC_013665	GGA	2	6	166526	166531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162841
3578	NC_013665	GACG	2	8	166545	166552	25 %	0 %	50 %	25 %	282162841
3579	NC_013665	GAC	2	6	166561	166566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162841
3580	NC_013665	GCT	2	6	166608	166613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162841
3581	NC_013665	GAC	2	6	166654	166659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162841
3582	NC_013665	ATT	2	6	166804	166809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_013665	CTT	2	6	166847	166852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162842
3584	NC_013665	CCG	2	6	166866	166871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162842
3585	NC_013665	TGG	2	6	166876	166881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162842
3586	NC_013665	ACG	2	6	166936	166941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162842
3587	NC_013665	AAC	2	6	166959	166964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	282162842
3588	NC_013665	GGC	2	6	166965	166970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162842
3589	NC_013665	GGT	2	6	166985	166990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162842
3590	NC_013665	CCT	2	6	167036	167041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162842
3591	NC_013665	CAT	2	6	167102	167107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162842
3592	NC_013665	CTGTG	2	10	167121	167130	0 %	40 %	40 %	20 %	282162842
3593	NC_013665	CGT	2	6	167246	167251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162842
3594	NC_013665	GCG	2	6	167284	167289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162842
3595	NC_013665	CGA	2	6	167342	167347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162842
3596	NC_013665	GAAG	2	8	167372	167379	50 %	0 %	50 %	0 %	282162842
3597	NC_013665	GGCC	2	8	167384	167391	0 %	0 %	50 %	50 %	282162842
3598	NC_013665	CCG	2	6	167401	167406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162842
3599	NC_013665	CGT	2	6	167417	167422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162842
3600	NC_013665	AGA	2	6	167518	167523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	282162842
3601	NC_013665	CAT	2	6	167561	167566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162842
3602	NC_013665	CCG	2	6	167587	167592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162842
3603	NC_013665	GAG	2	6	167643	167648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162842
3604	NC_013665	A	6	6	167686	167691	100 %	0 %	0 %	0 %	282162842
3605	NC_013665	GGCCAT	2	12	167807	167818	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	282162842
3606	NC_013665	GCG	2	6	167845	167850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162842
3607	NC_013665	GGT	2	6	167870	167875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162842
3608	NC_013665	CGG	2	6	167923	167928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162842
3609	NC_013665	GCC	2	6	167991	167996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162842
3610	NC_013665	GGC	2	6	168032	168037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162842
3611	NC_013665	AAT	2	6	168160	168165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	282162843
3612	NC_013665	CCT	2	6	168224	168229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162843
3613	NC_013665	CCG	2	6	168270	168275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162843
3614	NC_013665	CCTTT	2	10	168354	168363	0 %	60 %	0 %	40 %	282162844
3615	NC_013665	AGC	2	6	168364	168369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162844
3616	NC_013665	GCCCC	2	10	168407	168416	0 %	0 %	20 %	80 %	282162844
3617	NC_013665	ACG	3	9	168436	168444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162844
3618	NC_013665	ATG	2	6	168529	168534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162844
3619	NC_013665	AGC	2	6	168616	168621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162844
3620	NC_013665	CCG	2	6	168658	168663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162844
3621	NC_013665	CTT	2	6	168753	168758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162844
3622	NC_013665	A	6	6	168797	168802	100 %	0 %	0 %	0 %	282162844
3623	NC_013665	CTC	2	6	168822	168827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	282162844
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3725	NC_013665	GTTA	2	8	173622	173629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3869	NC_013665	A	7	7	180446	180452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3872	NC_013665	CTT	3	9	180515	180523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3984	NC_013665	CTCGC	2	10	185232	185241	0 %	20 %	20 %	60 %	282162861
3985	NC_013665	TTC	2	6	185286	185291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162861
3986	NC_013665	CGG	2	6	185357	185362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162861
3987	NC_013665	TGT	2	6	185368	185373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	282162861
3988	NC_013665	CCG	2	6	185428	185433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162861
3989	NC_013665	GCT	2	6	185462	185467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162861
3990	NC_013665	TCG	2	6	185554	185559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162861
3991	NC_013665	TCA	2	6	185578	185583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162861
3992	NC_013665	GC	3	6	185587	185592	0 %	0 %	50 %	50 %	282162861
3993	NC_013665	AGA	2	6	185625	185630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3994	NC_013665	AT	3	6	185633	185638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3995	NC_013665	GAG	2	6	185676	185681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3996	NC_013665	GCC	2	6	185759	185764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162862
3997	NC_013665	GA	3	6	185827	185832	50 %	0 %	50 %	0 %	282162862
3998	NC_013665	CAT	2	6	185836	185841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162862
3999	NC_013665	GGA	2	6	185854	185859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162862
4000	NC_013665	CGC	2	6	185865	185870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162862

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