MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 chromosome

Total Repeats: 48965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013407	TAAC	2	8	18061	18068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
502	NC_013407	ACA	2	6	18098	18103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402149
503	NC_013407	AAC	2	6	18119	18124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402149
504	NC_013407	C	6	6	18139	18144	0 %	0 %	0 %	100 %	261402149
505	NC_013407	TCT	2	6	18164	18169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402149
506	NC_013407	GA	3	6	18189	18194	50 %	0 %	50 %	0 %	261402149
507	NC_013407	ATAG	2	8	18222	18229	50 %	25 %	25 %	0 %	261402149
508	NC_013407	CAA	2	6	18249	18254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402149
509	NC_013407	AGA	2	6	18268	18273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261402149
510	NC_013407	AAC	2	6	18375	18380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402149
511	NC_013407	TCA	2	6	18389	18394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402149
512	NC_013407	GAG	2	6	18471	18476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261402149
513	NC_013407	CAAA	2	8	18490	18497	75 %	0 %	0 %	25 %	261402149
514	NC_013407	ATTAC	2	10	18521	18530	40 %	40 %	0 %	20 %	261402149
515	NC_013407	AT	3	6	18560	18565	50 %	50 %	0 %	0 %	261402149
516	NC_013407	T	6	6	18578	18583	0 %	100 %	0 %	0 %	261402149
517	NC_013407	TAA	2	6	18604	18609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402149
518	NC_013407	ATC	2	6	18622	18627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402149
519	NC_013407	CATC	2	8	18680	18687	25 %	25 %	0 %	50 %	261402149
520	NC_013407	CTA	2	6	18743	18748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402149
521	NC_013407	CAA	3	9	18750	18758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402149
522	NC_013407	T	6	6	18770	18775	0 %	100 %	0 %	0 %	261402149
523	NC_013407	TCTA	2	8	18835	18842	25 %	50 %	0 %	25 %	261402149
524	NC_013407	CATG	2	8	18848	18855	25 %	25 %	25 %	25 %	261402149
525	NC_013407	CAA	2	6	18867	18872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402149
526	NC_013407	CCA	2	6	18884	18889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261402149
527	NC_013407	AG	3	6	18898	18903	50 %	0 %	50 %	0 %	261402149
528	NC_013407	T	6	6	18931	18936	0 %	100 %	0 %	0 %	261402149
529	NC_013407	TAT	2	6	18951	18956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402149
530	NC_013407	TC	3	6	18974	18979	0 %	50 %	0 %	50 %	261402149
531	NC_013407	CTG	2	6	19008	19013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261402149
532	NC_013407	AT	3	6	19019	19024	50 %	50 %	0 %	0 %	261402149
533	NC_013407	CAA	2	6	19124	19129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402149
534	NC_013407	ACA	2	6	19154	19159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402149
535	NC_013407	CTC	2	6	19191	19196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402149
536	NC_013407	CAAC	2	8	19212	19219	50 %	0 %	0 %	50 %	261402149
537	NC_013407	CAAC	2	8	19245	19252	50 %	0 %	0 %	50 %	261402149
538	NC_013407	A	7	7	19268	19274	100 %	0 %	0 %	0 %	261402149
539	NC_013407	TTA	2	6	19322	19327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013407	ATA	2	6	19359	19364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402150
541	NC_013407	ATC	2	6	19371	19376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402150
542	NC_013407	ACA	2	6	19390	19395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402150
543	NC_013407	ATTAAA	2	12	19413	19424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402150
544	NC_013407	CTTT	2	8	19432	19439	0 %	75 %	0 %	25 %	261402150
545	NC_013407	AT	3	6	19504	19509	50 %	50 %	0 %	0 %	261402150
546	NC_013407	CAT	2	6	19613	19618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402150
547	NC_013407	AAG	2	6	19628	19633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261402150
548	NC_013407	TGA	2	6	19679	19684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402150
549	NC_013407	GAT	2	6	19722	19727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402150
550	NC_013407	AT	3	6	19790	19795	50 %	50 %	0 %	0 %	261402150
551	NC_013407	A	7	7	19797	19803	100 %	0 %	0 %	0 %	261402150
552	NC_013407	AAC	2	6	19836	19841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402150
553	NC_013407	A	7	7	19850	19856	100 %	0 %	0 %	0 %	261402150
554	NC_013407	TCC	2	6	19883	19888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402150
555	NC_013407	CAT	2	6	19927	19932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402150
556	NC_013407	CTAAAA	2	12	19960	19971	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	261402150
557	NC_013407	TAA	2	6	20111	20116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402151
558	NC_013407	TAA	2	6	20126	20131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402151
559	NC_013407	T	6	6	20136	20141	0 %	100 %	0 %	0 %	261402151
560	NC_013407	AAC	2	6	20196	20201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402151
561	NC_013407	TAA	2	6	20213	20218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402151
562	NC_013407	ACA	2	6	20284	20289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402151
563	NC_013407	TCA	2	6	20299	20304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402151
564	NC_013407	ATC	2	6	20319	20324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402151
565	NC_013407	AAAAT	2	10	20420	20429	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_013407	TTAAA	2	10	20431	20440	60 %	40 %	0 %	0 %	261402152
567	NC_013407	GTT	2	6	20501	20506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402152
568	NC_013407	ATC	2	6	20539	20544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402152
569	NC_013407	CAT	2	6	20574	20579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402152
570	NC_013407	CCT	2	6	20634	20639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402152
571	NC_013407	TA	3	6	20665	20670	50 %	50 %	0 %	0 %	261402152
572	NC_013407	TCC	2	6	20674	20679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402152
573	NC_013407	AATC	2	8	20680	20687	50 %	25 %	0 %	25 %	261402152
574	NC_013407	ATC	2	6	20707	20712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402152
575	NC_013407	ATT	2	6	20912	20917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402152
576	NC_013407	CTT	2	6	20927	20932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402152
577	NC_013407	CA	3	6	20973	20978	50 %	0 %	0 %	50 %	261402152
578	NC_013407	ATG	2	6	20986	20991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402152
579	NC_013407	GTATT	2	10	21012	21021	20 %	60 %	20 %	0 %	261402152
580	NC_013407	TTG	2	6	21069	21074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402152
581	NC_013407	CAA	2	6	21168	21173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402152
582	NC_013407	ATGC	2	8	21197	21204	25 %	25 %	25 %	25 %	261402152
583	NC_013407	TCA	2	6	21224	21229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402152
584	NC_013407	T	6	6	21274	21279	0 %	100 %	0 %	0 %	261402152
585	NC_013407	CAA	2	6	21291	21296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402152
586	NC_013407	CTC	2	6	21325	21330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402152
587	NC_013407	CAA	2	6	21345	21350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402152
588	NC_013407	ACAG	2	8	21358	21365	50 %	0 %	25 %	25 %	261402152
589	NC_013407	TTCT	2	8	21406	21413	0 %	75 %	0 %	25 %	261402152
590	NC_013407	GGT	2	6	21464	21469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261402152
591	NC_013407	CATA	2	8	21528	21535	50 %	25 %	0 %	25 %	261402152
592	NC_013407	TATC	2	8	21549	21556	25 %	50 %	0 %	25 %	261402152
593	NC_013407	CT	3	6	21610	21615	0 %	50 %	0 %	50 %	261402152
594	NC_013407	AT	3	6	21645	21650	50 %	50 %	0 %	0 %	261402152
595	NC_013407	AGTTAA	2	12	21700	21711	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	261402152
596	NC_013407	GAT	2	6	21713	21718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402152
597	NC_013407	TTC	2	6	21796	21801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402152
598	NC_013407	ATC	2	6	21811	21816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402152
599	NC_013407	CAA	2	6	21825	21830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402152
600	NC_013407	CT	3	6	21845	21850	0 %	50 %	0 %	50 %	261402152
601	NC_013407	T	7	7	21871	21877	0 %	100 %	0 %	0 %	261402152
602	NC_013407	TCCC	2	8	21974	21981	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
603	NC_013407	TCT	2	6	22016	22021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_013407	TTC	2	6	22028	22033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_013407	ACTA	2	8	22128	22135	50 %	25 %	0 %	25 %	261402153
606	NC_013407	AATCA	2	10	22137	22146	60 %	20 %	0 %	20 %	261402153
607	NC_013407	TCT	2	6	22156	22161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402153
608	NC_013407	AAT	2	6	22163	22168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402153
609	NC_013407	CTCTTG	2	12	22172	22183	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	261402153
610	NC_013407	ATT	2	6	22195	22200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402153
611	NC_013407	TGA	2	6	22232	22237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402153
612	NC_013407	CT	3	6	22239	22244	0 %	50 %	0 %	50 %	261402153
613	NC_013407	T	6	6	22247	22252	0 %	100 %	0 %	0 %	261402153
614	NC_013407	T	6	6	22281	22286	0 %	100 %	0 %	0 %	261402154
615	NC_013407	ATTT	2	8	22296	22303	25 %	75 %	0 %	0 %	261402154
616	NC_013407	TG	3	6	22356	22361	0 %	50 %	50 %	0 %	261402154
617	NC_013407	AAAT	2	8	22399	22406	75 %	25 %	0 %	0 %	261402154
618	NC_013407	ATT	2	6	22415	22420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402154
619	NC_013407	CAA	2	6	22458	22463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402154
620	NC_013407	T	6	6	22465	22470	0 %	100 %	0 %	0 %	261402154
621	NC_013407	T	7	7	22528	22534	0 %	100 %	0 %	0 %	261402154
622	NC_013407	TTAT	2	8	22571	22578	25 %	75 %	0 %	0 %	261402154
623	NC_013407	T	6	6	22578	22583	0 %	100 %	0 %	0 %	261402154
624	NC_013407	T	7	7	22603	22609	0 %	100 %	0 %	0 %	261402154
625	NC_013407	TTC	2	6	22612	22617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402154
626	NC_013407	TTAA	2	8	22625	22632	50 %	50 %	0 %	0 %	261402154
627	NC_013407	T	6	6	22685	22690	0 %	100 %	0 %	0 %	261402154
628	NC_013407	CT	4	8	22692	22699	0 %	50 %	0 %	50 %	261402154
629	NC_013407	A	6	6	22721	22726	100 %	0 %	0 %	0 %	261402154
630	NC_013407	TGT	2	6	22743	22748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402154
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632	NC_013407	TC	3	6	22923	22928	0 %	50 %	0 %	50 %	261402155
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