MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 plasmid pMEFER01

Total Repeats: 596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013157	TC	3	6	37	42	0 %	50 %	0 %	50 %	256811521
2	NC_013157	ATAA	2	8	58	65	75 %	25 %	0 %	0 %	256811521
3	NC_013157	CAT	2	6	130	135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811521
4	NC_013157	TCA	2	6	140	145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811521
5	NC_013157	CAA	2	6	207	212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811521
6	NC_013157	CATG	2	8	219	226	25 %	25 %	25 %	25 %	256811521
7	NC_013157	TCAA	2	8	233	240	50 %	25 %	0 %	25 %	256811521
8	NC_013157	CT	3	6	304	309	0 %	50 %	0 %	50 %	256811521
9	NC_013157	TGC	2	6	325	330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256811521
10	NC_013157	TCA	2	6	365	370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811521
11	NC_013157	GAA	2	6	373	378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256811521
12	NC_013157	CAA	2	6	423	428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811521
13	NC_013157	TCT	2	6	449	454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811521
14	NC_013157	TCT	2	6	575	580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811521
15	NC_013157	ATGT	2	8	587	594	25 %	50 %	25 %	0 %	256811521
16	NC_013157	GTTCCA	2	12	707	718	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	256811521
17	NC_013157	CTG	2	6	755	760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256811521
18	NC_013157	TCT	2	6	826	831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811521
19	NC_013157	T	7	7	985	991	0 %	100 %	0 %	0 %	256811521
20	NC_013157	TTG	2	6	994	999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811521
21	NC_013157	T	6	6	1039	1044	0 %	100 %	0 %	0 %	256811521
22	NC_013157	ATA	2	6	1081	1086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811521
23	NC_013157	T	6	6	1098	1103	0 %	100 %	0 %	0 %	256811521
24	NC_013157	TTTC	2	8	1124	1131	0 %	75 %	0 %	25 %	256811521
25	NC_013157	AAC	2	6	1238	1243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811521
26	NC_013157	CTT	2	6	1254	1259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811521
27	NC_013157	AT	3	6	1333	1338	50 %	50 %	0 %	0 %	256811521
28	NC_013157	TCA	2	6	1353	1358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811521
29	NC_013157	A	6	6	1372	1377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013157	TATT	2	8	1387	1394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013157	A	7	7	1440	1446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013157	TA	3	6	1447	1452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013157	GAA	2	6	1469	1474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013157	A	6	6	1473	1478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013157	ATTC	2	8	1488	1495	25 %	50 %	0 %	25 %	256811522
36	NC_013157	TA	3	6	1518	1523	50 %	50 %	0 %	0 %	256811522
37	NC_013157	TCT	2	6	1524	1529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811522
38	NC_013157	ATC	2	6	1534	1539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811522
39	NC_013157	CAC	2	6	1557	1562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811522
40	NC_013157	TTC	2	6	1629	1634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811522
41	NC_013157	TTC	2	6	1759	1764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811522
42	NC_013157	CAT	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811522
43	NC_013157	ATG	2	6	1933	1938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811522
44	NC_013157	TAT	2	6	1947	1952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811522
45	NC_013157	TCT	2	6	1963	1968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811522
46	NC_013157	GTA	2	6	1995	2000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811522
47	NC_013157	T	6	6	2029	2034	0 %	100 %	0 %	0 %	256811522
48	NC_013157	TA	3	6	2069	2074	50 %	50 %	0 %	0 %	256811522
49	NC_013157	ACT	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811522
50	NC_013157	CCA	2	6	2161	2166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811523
51	NC_013157	CTAA	2	8	2203	2210	50 %	25 %	0 %	25 %	256811523
52	NC_013157	CAG	2	6	2231	2236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256811523
53	NC_013157	TTCT	2	8	2352	2359	0 %	75 %	0 %	25 %	256811523
54	NC_013157	T	7	7	2362	2368	0 %	100 %	0 %	0 %	256811523
55	NC_013157	T	6	6	2385	2390	0 %	100 %	0 %	0 %	256811523
56	NC_013157	T	6	6	2419	2424	0 %	100 %	0 %	0 %	256811523
57	NC_013157	GGT	2	6	2425	2430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256811523
58	NC_013157	AGG	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256811523
59	NC_013157	TAT	2	6	2529	2534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811523
60	NC_013157	CTC	2	6	2535	2540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811523
61	NC_013157	A	6	6	2590	2595	100 %	0 %	0 %	0 %	256811523
62	NC_013157	A	6	6	2598	2603	100 %	0 %	0 %	0 %	256811523
63	NC_013157	TGT	2	6	2630	2635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811524
64	NC_013157	TGT	2	6	2638	2643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811524
65	NC_013157	CAA	2	6	2737	2742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811524
66	NC_013157	CTT	2	6	2767	2772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811524
67	NC_013157	ATT	2	6	2792	2797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811524
68	NC_013157	ATG	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811524
69	NC_013157	ATCAA	2	10	2817	2826	60 %	20 %	0 %	20 %	256811524
70	NC_013157	TTG	2	6	2869	2874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811524
71	NC_013157	TTG	2	6	2971	2976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811524
72	NC_013157	GTA	2	6	2991	2996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811524
73	NC_013157	T	6	6	3009	3014	0 %	100 %	0 %	0 %	256811524
74	NC_013157	AAAG	2	8	3025	3032	75 %	0 %	25 %	0 %	256811524
75	NC_013157	A	6	6	3060	3065	100 %	0 %	0 %	0 %	256811524
76	NC_013157	TCA	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811525
77	NC_013157	TTTA	2	8	3163	3170	25 %	75 %	0 %	0 %	256811525
78	NC_013157	TAA	2	6	3181	3186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811525
79	NC_013157	T	6	6	3244	3249	0 %	100 %	0 %	0 %	256811525
80	NC_013157	ATT	2	6	3266	3271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811525
81	NC_013157	TCA	2	6	3290	3295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811525
82	NC_013157	A	6	6	3319	3324	100 %	0 %	0 %	0 %	256811525
83	NC_013157	CTT	3	9	3336	3344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811525
84	NC_013157	AT	3	6	3356	3361	50 %	50 %	0 %	0 %	256811525
85	NC_013157	T	7	7	3368	3374	0 %	100 %	0 %	0 %	256811525
86	NC_013157	CTC	2	6	3388	3393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811526
87	NC_013157	T	6	6	3400	3405	0 %	100 %	0 %	0 %	256811526
88	NC_013157	GAT	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811526
89	NC_013157	T	6	6	3411	3416	0 %	100 %	0 %	0 %	256811526
90	NC_013157	TA	3	6	3512	3517	50 %	50 %	0 %	0 %	256811526
91	NC_013157	TC	3	6	3521	3526	0 %	50 %	0 %	50 %	256811526
92	NC_013157	ACC	2	6	3541	3546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811527
93	NC_013157	TTG	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811527
94	NC_013157	AATCA	2	10	3592	3601	60 %	20 %	0 %	20 %	256811527
95	NC_013157	A	7	7	3698	3704	100 %	0 %	0 %	0 %	256811527
96	NC_013157	TGT	3	9	3782	3790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811527
97	NC_013157	CACC	2	8	3822	3829	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_013157	ATC	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811528
99	NC_013157	TCC	2	6	3910	3915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811528
100	NC_013157	TG	3	6	3924	3929	0 %	50 %	50 %	0 %	256811528
101	NC_013157	ATT	2	6	3939	3944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811528
102	NC_013157	AGAA	2	8	3950	3957	75 %	0 %	25 %	0 %	256811528
103	NC_013157	TGCT	2	8	3994	4001	0 %	50 %	25 %	25 %	256811528
104	NC_013157	TAA	2	6	4024	4029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811528
105	NC_013157	C	6	6	4039	4044	0 %	0 %	0 %	100 %	256811528
106	NC_013157	TTA	2	6	4059	4064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811528
107	NC_013157	A	6	6	4119	4124	100 %	0 %	0 %	0 %	256811528
108	NC_013157	TGT	2	6	4146	4151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811528
109	NC_013157	CAC	2	6	4154	4159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811528
110	NC_013157	ACC	2	6	4165	4170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_013157	TGT	2	6	4178	4183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811529
112	NC_013157	TCA	2	6	4266	4271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811529
113	NC_013157	AT	4	8	4291	4298	50 %	50 %	0 %	0 %	256811529
114	NC_013157	TAA	2	6	4304	4309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811529
115	NC_013157	TGC	2	6	4310	4315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256811529
116	NC_013157	AAC	2	6	4316	4321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811529
117	NC_013157	A	7	7	4388	4394	100 %	0 %	0 %	0 %	256811529
118	NC_013157	CCA	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811529
119	NC_013157	ACA	2	6	4512	4517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811529
120	NC_013157	ACT	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811529
121	NC_013157	ACTG	2	8	4572	4579	25 %	25 %	25 %	25 %	256811529
122	NC_013157	ATA	2	6	4589	4594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811529
123	NC_013157	TTTAA	2	10	4641	4650	40 %	60 %	0 %	0 %	256811529
124	NC_013157	A	6	6	4682	4687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013157	A	6	6	4695	4700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013157	A	6	6	4721	4726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013157	AGT	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811530
128	NC_013157	CAA	2	6	4764	4769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811530
129	NC_013157	AAC	2	6	4777	4782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811530
130	NC_013157	TTG	2	6	4837	4842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811530
131	NC_013157	CTG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256811530
132	NC_013157	CTGC	2	8	4920	4927	0 %	25 %	25 %	50 %	256811530
133	NC_013157	CTG	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256811530
134	NC_013157	AGT	2	6	5076	5081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811530
135	NC_013157	AAC	2	6	5097	5102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811530
136	NC_013157	T	6	6	5110	5115	0 %	100 %	0 %	0 %	256811530
137	NC_013157	GCTT	2	8	5158	5165	0 %	50 %	25 %	25 %	256811530
138	NC_013157	CTTT	2	8	5175	5182	0 %	75 %	0 %	25 %	256811530
139	NC_013157	ATC	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811530
140	NC_013157	AAGC	2	8	5260	5267	50 %	0 %	25 %	25 %	256811530
141	NC_013157	TTTC	2	8	5274	5281	0 %	75 %	0 %	25 %	256811530
142	NC_013157	TC	3	6	5284	5289	0 %	50 %	0 %	50 %	256811530
143	NC_013157	TAAC	2	8	5340	5347	50 %	25 %	0 %	25 %	256811530
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145	NC_013157	TCCT	2	8	5459	5466	0 %	50 %	0 %	50 %	256811530
146	NC_013157	CATGG	2	10	5640	5649	20 %	20 %	40 %	20 %	256811530
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157	NC_013157	TCA	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811530
158	NC_013157	ATTT	2	8	6223	6230	25 %	75 %	0 %	0 %	256811530
159	NC_013157	TTCA	2	8	6409	6416	25 %	50 %	0 %	25 %	256811530
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162	NC_013157	ATT	2	6	6596	6601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811530
163	NC_013157	CCA	2	6	6609	6614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811530
164	NC_013157	GCA	2	6	6617	6622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256811530
165	NC_013157	TCT	2	6	6657	6662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811530
166	NC_013157	A	6	6	6664	6669	100 %	0 %	0 %	0 %	256811530
167	NC_013157	A	6	6	6673	6678	100 %	0 %	0 %	0 %	256811530
168	NC_013157	ACC	2	6	6686	6691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_013157	A	7	7	6695	6701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_013157	TA	3	6	9441	9446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_013157	TAA	2	6	9466	9471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_013157	A	7	7	10028	10034	100 %	0 %	0 %	0 %	256811536
261	NC_013157	CCT	2	6	10063	10068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811536
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272	NC_013157	CTT	2	6	10400	10405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811537
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309	NC_013157	CAT	2	6	12188	12193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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352	NC_013157	ATC	2	6	13446	13451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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402	NC_013157	ATA	2	6	14831	14836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811545
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410	NC_013157	GATTT	2	10	15098	15107	20 %	60 %	20 %	0 %	256811545
411	NC_013157	TGA	2	6	15195	15200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811545
412	NC_013157	TA	3	6	15220	15225	50 %	50 %	0 %	0 %	256811545
413	NC_013157	AGTTGA	2	12	15228	15239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811545
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464	NC_013157	A	7	7	17173	17179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_013157	AATA	2	8	17724	17731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_013157	CAA	2	6	18980	18985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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