MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 108910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_012207	CTG	2	6	610574	610579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988907
15002	NC_012207	GCTG	2	8	610611	610618	0 %	25 %	50 %	25 %	224988907
15003	NC_012207	CGC	2	6	610639	610644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988907
15004	NC_012207	GCC	2	6	610661	610666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988907
15005	NC_012207	CCGA	2	8	610682	610689	25 %	0 %	25 %	50 %	224988907
15006	NC_012207	CGC	2	6	610697	610702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988907
15007	NC_012207	GCG	2	6	610794	610799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988907
15008	NC_012207	GGT	2	6	610801	610806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988907
15009	NC_012207	GTTC	2	8	610816	610823	0 %	50 %	25 %	25 %	224988907
15010	NC_012207	CAA	2	6	610964	610969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224988907
15011	NC_012207	CGT	2	6	611008	611013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988907
15012	NC_012207	TCG	2	6	611061	611066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988907
15013	NC_012207	GCC	2	6	611076	611081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988907
15014	NC_012207	GATG	2	8	611082	611089	25 %	25 %	50 %	0 %	224988907
15015	NC_012207	GCA	2	6	611148	611153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988907
15016	NC_012207	CGA	2	6	611167	611172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988907
15017	NC_012207	CG	3	6	611195	611200	0 %	0 %	50 %	50 %	224988907
15018	NC_012207	GTC	2	6	611389	611394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988908
15019	NC_012207	ACC	2	6	611479	611484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988908
15020	NC_012207	GCC	2	6	611578	611583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988908
15021	NC_012207	GGGCC	2	10	611586	611595	0 %	0 %	60 %	40 %	224988908
15022	NC_012207	CGA	2	6	611661	611666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988908
15023	NC_012207	TGG	2	6	611672	611677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988908
15024	NC_012207	GC	3	6	611764	611769	0 %	0 %	50 %	50 %	224988908
15025	NC_012207	CCG	2	6	611806	611811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988908
15026	NC_012207	CCG	2	6	611819	611824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988908
15027	NC_012207	TGC	2	6	611840	611845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988908
15028	NC_012207	CGC	2	6	612002	612007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988908
15029	NC_012207	GTTG	2	8	612021	612028	0 %	50 %	50 %	0 %	224988908
15030	NC_012207	GAC	2	6	612069	612074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15031	NC_012207	GC	3	6	612124	612129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15032	NC_012207	CGG	2	6	612168	612173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15033	NC_012207	CAG	2	6	612184	612189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15034	NC_012207	TCG	3	9	612238	612246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15035	NC_012207	GGT	2	6	612250	612255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_012207	GTCC	2	8	612271	612278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15037	NC_012207	ACG	2	6	612369	612374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988909
15038	NC_012207	CGT	2	6	612375	612380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988909
15039	NC_012207	TCC	2	6	612382	612387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224988909
15040	NC_012207	GTTG	2	8	612420	612427	0 %	50 %	50 %	0 %	224988909
15041	NC_012207	TGC	2	6	612521	612526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988909
15042	NC_012207	GTC	2	6	612532	612537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988909
15043	NC_012207	TGC	2	6	612561	612566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988909
15044	NC_012207	ACG	2	6	612573	612578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988909
15045	NC_012207	AGC	2	6	612644	612649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988909
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15047	NC_012207	C	6	6	612659	612664	0 %	0 %	0 %	100 %	224988909
15048	NC_012207	ACC	2	6	612669	612674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988909
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15050	NC_012207	TCG	2	6	612731	612736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988909
15051	NC_012207	CCG	2	6	612758	612763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988909
15052	NC_012207	GCC	2	6	612790	612795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988909
15053	NC_012207	ACC	2	6	612806	612811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988909
15054	NC_012207	CCT	2	6	612828	612833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224988909
15055	NC_012207	CAT	2	6	612874	612879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988909
15056	NC_012207	GGC	2	6	612941	612946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988909
15057	NC_012207	GCC	2	6	612983	612988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988909
15058	NC_012207	GCT	2	6	613021	613026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988909
15059	NC_012207	CCG	2	6	613029	613034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988909
15060	NC_012207	GCC	2	6	613058	613063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988909
15061	NC_012207	CCA	2	6	613080	613085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988909
15062	NC_012207	CGG	2	6	613107	613112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988909
15063	NC_012207	CGCCGG	2	12	613119	613130	0 %	0 %	50 %	50 %	224988909
15064	NC_012207	CGG	2	6	613151	613156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988909
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15068	NC_012207	ATG	2	6	613369	613374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_012207	GTC	2	6	613391	613396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15074	NC_012207	GAG	2	6	613609	613614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224988910
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15082	NC_012207	TCGAC	2	10	614019	614028	20 %	20 %	20 %	40 %	224988911
15083	NC_012207	GTC	2	6	614034	614039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988911
15084	NC_012207	CGG	2	6	614093	614098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15085	NC_012207	CGG	2	6	614199	614204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988912
15086	NC_012207	TCG	2	6	614225	614230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988912
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15088	NC_012207	GCG	2	6	614288	614293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988912
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15090	NC_012207	GGC	2	6	614386	614391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988912
15091	NC_012207	TGGC	2	8	614409	614416	0 %	25 %	50 %	25 %	224988912
15092	NC_012207	TCG	2	6	614438	614443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988912
15093	NC_012207	CGG	2	6	614463	614468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988912
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15099	NC_012207	GCT	2	6	614652	614657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988912
15100	NC_012207	CATGG	2	10	614665	614674	20 %	20 %	40 %	20 %	224988912
15101	NC_012207	GC	3	6	614690	614695	0 %	0 %	50 %	50 %	224988912
15102	NC_012207	CTT	2	6	614703	614708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988912
15103	NC_012207	TCT	2	6	614753	614758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988912
15104	NC_012207	AGT	2	6	614775	614780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988912
15105	NC_012207	CGC	2	6	614787	614792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988912
15106	NC_012207	CG	3	6	614827	614832	0 %	0 %	50 %	50 %	224988912
15107	NC_012207	GGT	2	6	614841	614846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988912
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15109	NC_012207	TCG	2	6	614867	614872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988912
15110	NC_012207	GATCA	2	10	614974	614983	40 %	20 %	20 %	20 %	224988912
15111	NC_012207	CGT	2	6	614991	614996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988912
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15115	NC_012207	CATGG	2	10	615168	615177	20 %	20 %	40 %	20 %	224988912
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15117	NC_012207	CGC	2	6	615387	615392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988912
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15119	NC_012207	CTG	2	6	615415	615420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988912
15120	NC_012207	CAC	2	6	615453	615458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988912
15121	NC_012207	TCG	2	6	615504	615509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988913
15122	NC_012207	GCC	2	6	615532	615537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988913
15123	NC_012207	GCT	2	6	615542	615547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988913
15124	NC_012207	GCC	2	6	615558	615563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988913
15125	NC_012207	GCC	2	6	615577	615582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988913
15126	NC_012207	GCG	2	6	615614	615619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988913
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15130	NC_012207	GTACG	2	10	615738	615747	20 %	20 %	40 %	20 %	224988913
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15132	NC_012207	AGCC	2	8	615795	615802	25 %	0 %	25 %	50 %	224988913
15133	NC_012207	AGCC	2	8	615848	615855	25 %	0 %	25 %	50 %	224988913
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15136	NC_012207	GTC	2	6	615979	615984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15149	NC_012207	GCT	2	6	616445	616450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988914
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15174	NC_012207	GCCA	2	8	617191	617198	25 %	0 %	25 %	50 %	224988914
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15229	NC_012207	CGT	2	6	618813	618818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988917
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15238	NC_012207	GCTG	2	8	619274	619281	0 %	25 %	50 %	25 %	224988917
15239	NC_012207	CGG	2	6	619311	619316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988917
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15244	NC_012207	GC	3	6	619446	619451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15245	NC_012207	TGC	2	6	619492	619497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988918
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15346	NC_012207	TCG	3	9	623320	623328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15348	NC_012207	GAG	2	6	623415	623420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15349	NC_012207	CCT	2	6	623439	623444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15350	NC_012207	GCT	3	9	623547	623555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988921
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15352	NC_012207	CAGCG	2	10	623568	623577	20 %	0 %	40 %	40 %	224988921
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15354	NC_012207	ATC	2	6	623647	623652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988921
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15477	NC_012207	CGGC	2	8	626424	626431	0 %	0 %	50 %	50 %	224988923
15478	NC_012207	TGG	2	6	626454	626459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988923
15479	NC_012207	GCC	2	6	626483	626488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988923
15480	NC_012207	GCC	2	6	626540	626545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988923
15481	NC_012207	TCG	3	9	626549	626557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988923
15482	NC_012207	GCG	2	6	626558	626563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988923
15483	NC_012207	CGG	2	6	626567	626572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988923
15484	NC_012207	TCG	2	6	626603	626608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988923
15485	NC_012207	TCG	2	6	626633	626638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988923
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15487	NC_012207	TCG	2	6	626742	626747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15488	NC_012207	CGA	2	6	626763	626768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15489	NC_012207	GCCC	2	8	626781	626788	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15490	NC_012207	CCGCCA	2	12	626835	626846	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	224988924
15491	NC_012207	CGCC	2	8	626900	626907	0 %	0 %	25 %	75 %	224988924
15492	NC_012207	GC	3	6	626933	626938	0 %	0 %	50 %	50 %	224988924
15493	NC_012207	CCA	2	6	626955	626960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988924
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15495	NC_012207	AC	3	6	626969	626974	50 %	0 %	0 %	50 %	224988924
15496	NC_012207	CAG	2	6	627022	627027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988924
15497	NC_012207	TCCGGG	2	12	627042	627053	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	224988924
15498	NC_012207	CG	3	6	627092	627097	0 %	0 %	50 %	50 %	224988924
15499	NC_012207	GTT	2	6	627118	627123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988924
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