MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 108910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_012207	CGC	2	6	550197	550202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988844
13502	NC_012207	TCC	2	6	550235	550240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224988844
13503	NC_012207	CGA	2	6	550284	550289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988844
13504	NC_012207	GCC	2	6	550336	550341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988844
13505	NC_012207	GC	4	8	550359	550366	0 %	0 %	50 %	50 %	224988844
13506	NC_012207	GCC	2	6	550393	550398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988844
13507	NC_012207	GTC	2	6	550414	550419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988844
13508	NC_012207	TCA	2	6	550433	550438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988844
13509	NC_012207	GTG	2	6	550490	550495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988844
13510	NC_012207	CGC	2	6	550496	550501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988844
13511	NC_012207	GGC	2	6	550519	550524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988844
13512	NC_012207	CGC	2	6	550642	550647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988844
13513	NC_012207	TTG	2	6	550658	550663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988844
13514	NC_012207	CG	4	8	550664	550671	0 %	0 %	50 %	50 %	224988844
13515	NC_012207	TAGG	2	8	550714	550721	25 %	25 %	50 %	0 %	224988844
13516	NC_012207	CGG	2	6	550773	550778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_012207	GAG	2	6	550808	550813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_012207	TCCCG	2	10	550835	550844	0 %	20 %	20 %	60 %	224988845
13519	NC_012207	CCG	2	6	550848	550853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988845
13520	NC_012207	CGC	2	6	551014	551019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988845
13521	NC_012207	CGG	2	6	551025	551030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988845
13522	NC_012207	GCG	2	6	551066	551071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988845
13523	NC_012207	CGC	3	9	551107	551115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988845
13524	NC_012207	GCC	2	6	551168	551173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988845
13525	NC_012207	CGC	2	6	551209	551214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988845
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13527	NC_012207	GC	3	6	551235	551240	0 %	0 %	50 %	50 %	224988845
13528	NC_012207	CGA	2	6	551251	551256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988845
13529	NC_012207	GTG	2	6	551294	551299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988845
13530	NC_012207	GGC	2	6	551335	551340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988845
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13532	NC_012207	CGG	2	6	551376	551381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988845
13533	NC_012207	CCG	2	6	551391	551396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988845
13534	NC_012207	GCC	2	6	551449	551454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988845
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13538	NC_012207	CGG	2	6	551614	551619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988845
13539	NC_012207	TCT	2	6	551634	551639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988845
13540	NC_012207	GCC	2	6	551654	551659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988845
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13543	NC_012207	GGC	2	6	551785	551790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988845
13544	NC_012207	GCAA	2	8	551901	551908	50 %	0 %	25 %	25 %	224988845
13545	NC_012207	GC	3	6	551938	551943	0 %	0 %	50 %	50 %	224988845
13546	NC_012207	GGC	2	6	551951	551956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988845
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13548	NC_012207	TTA	2	6	551971	551976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224988845
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13550	NC_012207	CAA	2	6	552004	552009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224988845
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13552	NC_012207	GGT	2	6	552043	552048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988845
13553	NC_012207	CGT	2	6	552057	552062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988845
13554	NC_012207	ACG	3	9	552072	552080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988845
13555	NC_012207	GT	3	6	552123	552128	0 %	50 %	50 %	0 %	224988845
13556	NC_012207	CGGGC	2	10	552155	552164	0 %	0 %	60 %	40 %	224988845
13557	NC_012207	GGCC	2	8	552175	552182	0 %	0 %	50 %	50 %	224988845
13558	NC_012207	ACC	2	6	552201	552206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988845
13559	NC_012207	CGG	2	6	552229	552234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988845
13560	NC_012207	CCA	2	6	552265	552270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988845
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13562	NC_012207	GCA	2	6	552280	552285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988845
13563	NC_012207	CTG	2	6	552305	552310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988845
13564	NC_012207	TTC	2	6	552338	552343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988845
13565	NC_012207	TGA	2	6	552344	552349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988845
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13568	NC_012207	GCC	2	6	552382	552387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988846
13569	NC_012207	GCT	2	6	552390	552395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988846
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13572	NC_012207	CTG	2	6	552447	552452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988846
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13578	NC_012207	CGA	2	6	552789	552794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988846
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13581	NC_012207	TCCG	2	8	552964	552971	0 %	25 %	25 %	50 %	224988847
13582	NC_012207	GCT	2	6	553016	553021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988847
13583	NC_012207	TTGGT	2	10	553091	553100	0 %	60 %	40 %	0 %	224988847
13584	NC_012207	GGCC	2	8	553221	553228	0 %	0 %	50 %	50 %	224988848
13585	NC_012207	AGG	2	6	553277	553282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224988848
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13587	NC_012207	TACC	2	8	553377	553384	25 %	25 %	0 %	50 %	224988848
13588	NC_012207	GTG	2	6	553389	553394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988848
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13592	NC_012207	GCC	2	6	553489	553494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988848
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13598	NC_012207	TAGGG	2	10	553749	553758	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_012207	CGT	3	9	553776	553784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988849
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13601	NC_012207	CGC	2	6	553824	553829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988849
13602	NC_012207	TCG	2	6	553853	553858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988849
13603	NC_012207	GCG	2	6	553976	553981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988849
13604	NC_012207	TGA	2	6	554060	554065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988849
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13613	NC_012207	GACC	2	8	554616	554623	25 %	0 %	25 %	50 %	224988849
13614	NC_012207	CGA	2	6	554640	554645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988849
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13620	NC_012207	TGG	2	6	554951	554956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988849
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13734	NC_012207	GAG	2	6	560032	560037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13735	NC_012207	GCGAT	2	10	560047	560056	20 %	20 %	40 %	20 %	224988855
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13737	NC_012207	CGAGCG	2	12	560228	560239	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	224988855
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13980	NC_012207	CCCG	2	8	570690	570697	0 %	0 %	25 %	75 %	224988868
13981	NC_012207	ACC	2	6	570845	570850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988868
13982	NC_012207	GGC	2	6	570868	570873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988868
13983	NC_012207	GGC	2	6	570907	570912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988868
13984	NC_012207	GC	3	6	570955	570960	0 %	0 %	50 %	50 %	224988868
13985	NC_012207	CGA	2	6	570975	570980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988868
13986	NC_012207	GC	3	6	570981	570986	0 %	0 %	50 %	50 %	224988868
13987	NC_012207	GC	4	8	570994	571001	0 %	0 %	50 %	50 %	224988868
13988	NC_012207	CGA	2	6	571031	571036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988868
13989	NC_012207	GC	3	6	571037	571042	0 %	0 %	50 %	50 %	224988868
13990	NC_012207	GC	4	8	571050	571057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13991	NC_012207	GTT	2	6	571086	571091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988869
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13993	NC_012207	CGG	2	6	571253	571258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988869
13994	NC_012207	CGAT	2	8	571286	571293	25 %	25 %	25 %	25 %	224988869
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13996	NC_012207	TG	3	6	571378	571383	0 %	50 %	50 %	0 %	224988869
13997	NC_012207	GAC	2	6	571425	571430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988869
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14000	NC_012207	CCT	2	6	571553	571558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224988869

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